MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_013501	GTG	2	6	879530	879535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316323
21002	NC_013501	TGC	2	6	879566	879571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21003	NC_013501	TCT	2	6	879609	879614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316323
21004	NC_013501	AC	3	6	879624	879629	50 %	0 %	0 %	50 %	268316323
21005	NC_013501	GCGG	2	8	879630	879637	0 %	0 %	75 %	25 %	268316323
21006	NC_013501	CGA	2	6	879687	879692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21007	NC_013501	GCA	2	6	879696	879701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21008	NC_013501	GTC	2	6	879712	879717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21009	NC_013501	TCG	2	6	879746	879751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21010	NC_013501	CTG	2	6	879805	879810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21011	NC_013501	TCT	2	6	879812	879817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316323
21012	NC_013501	CCTGCA	2	12	879831	879842	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268316323
21013	NC_013501	TGCGC	2	10	879849	879858	0 %	20 %	40 %	40 %	268316323
21014	NC_013501	CTC	2	6	879880	879885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316323
21015	NC_013501	GTA	2	6	879889	879894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316323
21016	NC_013501	GAT	2	6	880011	880016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316323
21017	NC_013501	CAC	2	6	880042	880047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316323
21018	NC_013501	GCC	2	6	880070	880075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316323
21019	NC_013501	CGGCCG	2	12	880097	880108	0 %	0 %	50 %	50 %	268316323
21020	NC_013501	CGC	3	9	880122	880130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316323
21021	NC_013501	TCG	2	6	880148	880153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21022	NC_013501	CGG	2	6	880235	880240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316323
21023	NC_013501	TTC	2	6	880297	880302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316323
21024	NC_013501	CCG	2	6	880343	880348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316323
21025	NC_013501	CAC	2	6	880363	880368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316323
21026	NC_013501	TCG	2	6	880385	880390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21027	NC_013501	GAC	2	6	880393	880398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21028	NC_013501	GAA	2	6	880432	880437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316323
21029	NC_013501	CGG	2	6	880554	880559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316323
21030	NC_013501	GGGCA	2	10	880570	880579	20 %	0 %	60 %	20 %	268316323
21031	NC_013501	GAC	2	6	880585	880590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21032	NC_013501	TGCGCT	2	12	880599	880610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21033	NC_013501	GTA	2	6	880633	880638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316323
21034	NC_013501	GCG	2	6	880639	880644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316323
21035	NC_013501	GTC	2	6	880672	880677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21036	NC_013501	GC	3	6	880708	880713	0 %	0 %	50 %	50 %	268316323
21037	NC_013501	GCC	2	6	880731	880736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316323
21038	NC_013501	CTT	2	6	880743	880748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316323
21039	NC_013501	CAG	2	6	880780	880785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21040	NC_013501	GCT	2	6	880788	880793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21041	NC_013501	TTC	2	6	880828	880833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316323
21042	NC_013501	GGC	2	6	880855	880860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316323
21043	NC_013501	AGC	2	6	880883	880888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21044	NC_013501	TCG	2	6	880910	880915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21045	NC_013501	TGA	2	6	880929	880934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316323
21046	NC_013501	TGGGG	2	10	880935	880944	0 %	20 %	80 %	0 %	268316323
21047	NC_013501	TCG	3	9	880973	880981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21048	NC_013501	CTG	2	6	881011	881016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21049	NC_013501	CTC	2	6	881026	881031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316323
21050	NC_013501	CTG	3	9	881098	881106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21051	NC_013501	GCA	2	6	881226	881231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316323
21052	NC_013501	GAT	2	6	881236	881241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316323
21053	NC_013501	TCA	2	6	881298	881303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316323
21054	NC_013501	GC	3	6	881311	881316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21055	NC_013501	TTGG	2	8	881326	881333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21056	NC_013501	AAAG	2	8	881366	881373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21057	NC_013501	A	6	6	881388	881393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21058	NC_013501	GGA	2	6	881427	881432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21059	NC_013501	CGA	2	6	881439	881444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21060	NC_013501	CAG	2	6	881491	881496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316324
21061	NC_013501	GC	3	6	881521	881526	0 %	0 %	50 %	50 %	268316324
21062	NC_013501	AGC	2	6	881540	881545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316324
21063	NC_013501	GTA	3	9	881575	881583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316324
21064	NC_013501	CAG	2	6	881779	881784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316324
21065	NC_013501	GTA	2	6	881788	881793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316324
21066	NC_013501	CGC	2	6	881844	881849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316324
21067	NC_013501	GCG	3	9	881899	881907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316324
21068	NC_013501	TCGA	2	8	881924	881931	25 %	25 %	25 %	25 %	268316324
21069	NC_013501	CGA	2	6	881943	881948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316324
21070	NC_013501	AGC	2	6	882026	882031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316324
21071	NC_013501	ACG	2	6	882134	882139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316324
21072	NC_013501	CGA	2	6	882154	882159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316324
21073	NC_013501	GCA	2	6	882232	882237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316325
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21075	NC_013501	TTCGG	2	10	882321	882330	0 %	40 %	40 %	20 %	268316325
21076	NC_013501	G	7	7	882329	882335	0 %	0 %	100 %	0 %	268316325
21077	NC_013501	CAG	2	6	882417	882422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316325
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21079	NC_013501	AGA	2	6	882478	882483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316325
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21081	NC_013501	ATGC	2	8	882567	882574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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21083	NC_013501	AGG	2	6	882598	882603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316326
21084	NC_013501	GTT	2	6	882607	882612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316326
21085	NC_013501	CGA	2	6	882613	882618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316326
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21087	NC_013501	CGGC	2	8	882682	882689	0 %	0 %	50 %	50 %	268316326
21088	NC_013501	CCCAG	2	10	882733	882742	20 %	0 %	20 %	60 %	268316326
21089	NC_013501	TGG	2	6	882753	882758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316326
21090	NC_013501	GTG	2	6	882767	882772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316326
21091	NC_013501	AGC	2	6	882873	882878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316326
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21093	NC_013501	GCCG	2	8	882980	882987	0 %	0 %	50 %	50 %	268316326
21094	NC_013501	TG	3	6	883007	883012	0 %	50 %	50 %	0 %	268316326
21095	NC_013501	GTG	2	6	883064	883069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316326
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21102	NC_013501	GAC	2	6	883454	883459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316327
21103	NC_013501	CCA	2	6	883474	883479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316327
21104	NC_013501	CCGAC	2	10	883497	883506	20 %	0 %	20 %	60 %	268316327
21105	NC_013501	CGG	2	6	883571	883576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316327
21106	NC_013501	CAG	2	6	883640	883645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316327
21107	NC_013501	GCA	3	9	883657	883665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316327
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21111	NC_013501	ACG	2	6	883796	883801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316327
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21113	NC_013501	GAGCAC	2	12	883853	883864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316327
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21116	NC_013501	GAC	2	6	883949	883954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316327
21117	NC_013501	GCG	2	6	883975	883980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316327
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21119	NC_013501	GCT	2	6	884029	884034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316327
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21216	NC_013501	CGTAGG	2	12	887663	887674	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268316329
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21219	NC_013501	GCGA	2	8	887735	887742	25 %	0 %	50 %	25 %	268316329
21220	NC_013501	CTT	2	6	887753	887758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316329
21221	NC_013501	GACG	2	8	887897	887904	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21222	NC_013501	GGC	2	6	887928	887933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316330
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21229	NC_013501	CAG	2	6	888122	888127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316330
21230	NC_013501	CAG	2	6	888194	888199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316330
21231	NC_013501	GGCT	2	8	888201	888208	0 %	25 %	50 %	25 %	268316330
21232	NC_013501	GAC	2	6	888236	888241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316330
21233	NC_013501	GC	3	6	888261	888266	0 %	0 %	50 %	50 %	268316330
21234	NC_013501	CAC	2	6	888269	888274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316330
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21471	NC_013501	CAG	2	6	897361	897366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316340
21472	NC_013501	GAG	2	6	897403	897408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316340
21473	NC_013501	CCT	2	6	897445	897450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316340
21474	NC_013501	TCC	2	6	897483	897488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316340
21475	NC_013501	CTC	2	6	897512	897517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316340
21476	NC_013501	TGG	2	6	897522	897527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316340
21477	NC_013501	GTT	2	6	897532	897537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316340
21478	NC_013501	TCA	2	6	897538	897543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316340
21479	NC_013501	CAT	2	6	897569	897574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316340
21480	NC_013501	GTG	2	6	897629	897634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316340
21481	NC_013501	AGG	2	6	897639	897644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316340
21482	NC_013501	GTT	2	6	897649	897654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316340
21483	NC_013501	CGA	2	6	897712	897717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316340
21484	NC_013501	GTCG	2	8	897721	897728	0 %	25 %	50 %	25 %	268316340
21485	NC_013501	T	6	6	897736	897741	0 %	100 %	0 %	0 %	268316340
21486	NC_013501	CG	3	6	897781	897786	0 %	0 %	50 %	50 %	268316340
21487	NC_013501	CGA	2	6	897790	897795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316340
21488	NC_013501	TCC	2	6	897822	897827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316340
21489	NC_013501	A	6	6	897829	897834	100 %	0 %	0 %	0 %	268316340
21490	NC_013501	GCTC	2	8	897841	897848	0 %	25 %	25 %	50 %	268316340
21491	NC_013501	CAC	2	6	897853	897858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21492	NC_013501	TGG	2	6	897870	897875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21493	NC_013501	CCG	2	6	897954	897959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316341
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21495	NC_013501	GCT	2	6	898046	898051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316341
21496	NC_013501	TGC	2	6	898170	898175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316341
21497	NC_013501	GGC	3	9	898207	898215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316341
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21499	NC_013501	GGT	2	6	898351	898356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316341
21500	NC_013501	CGG	2	6	898360	898365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316341

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