MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20003	NC_013501	TCG	2	6	836099	836104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316289
20004	NC_013501	GCT	2	6	836124	836129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316289
20005	NC_013501	ATC	2	6	836185	836190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316289
20006	NC_013501	G	6	6	836264	836269	0 %	0 %	100 %	0 %	268316289
20007	NC_013501	TGGA	2	8	836314	836321	25 %	25 %	50 %	0 %	268316289
20008	NC_013501	TGG	2	6	836356	836361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316289
20009	NC_013501	TAC	2	6	836383	836388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316289
20010	NC_013501	CGA	2	6	836409	836414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316289
20011	NC_013501	GTG	2	6	836428	836433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316289
20012	NC_013501	TCGA	2	8	836434	836441	25 %	25 %	25 %	25 %	268316289
20013	NC_013501	AGCCCG	2	12	836444	836455	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268316289
20014	NC_013501	GCTGG	2	10	836520	836529	0 %	20 %	60 %	20 %	268316289
20015	NC_013501	ACG	2	6	836566	836571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316289
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20122	NC_013501	GCC	2	6	841490	841495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316294
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20357	NC_013501	GTG	2	6	850744	850749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316300
20358	NC_013501	GGA	3	9	850782	850790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316300
20359	NC_013501	GC	3	6	850795	850800	0 %	0 %	50 %	50 %	268316300
20360	NC_013501	GCT	2	6	850824	850829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316300
20361	NC_013501	CTGG	2	8	850860	850867	0 %	25 %	50 %	25 %	268316300
20362	NC_013501	GACC	2	8	850939	850946	25 %	0 %	25 %	50 %	268316300
20363	NC_013501	CG	3	6	850961	850966	0 %	0 %	50 %	50 %	268316300
20364	NC_013501	GC	3	6	850976	850981	0 %	0 %	50 %	50 %	268316300
20365	NC_013501	CTGGC	2	10	851056	851065	0 %	20 %	40 %	40 %	268316300
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20367	NC_013501	GCGCC	2	10	851139	851148	0 %	0 %	40 %	60 %	268316300
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20369	NC_013501	CGGT	2	8	851169	851176	0 %	25 %	50 %	25 %	268316300
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20415	NC_013501	GCT	2	6	852774	852779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316301
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20459	NC_013501	CTTT	2	8	854664	854671	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20460	NC_013501	TGT	2	6	854689	854694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20461	NC_013501	A	7	7	854727	854733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20462	NC_013501	TCTT	2	8	854751	854758	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20463	NC_013501	TAA	2	6	854763	854768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20464	NC_013501	TGA	2	6	854794	854799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20465	NC_013501	GAT	2	6	854810	854815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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20467	NC_013501	CGT	2	6	854967	854972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20468	NC_013501	CG	3	6	855001	855006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20469	NC_013501	CAG	2	6	855011	855016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20470	NC_013501	AGC	2	6	855029	855034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20471	NC_013501	GCT	2	6	855055	855060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20472	NC_013501	ATT	2	6	855083	855088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20473	NC_013501	CGG	2	6	855110	855115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20474	NC_013501	CGG	2	6	855401	855406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316303
20475	NC_013501	ACG	2	6	855424	855429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316303
20476	NC_013501	CGCC	2	8	855434	855441	0 %	0 %	25 %	75 %	268316303
20477	NC_013501	GCAC	2	8	855487	855494	25 %	0 %	25 %	50 %	268316303
20478	NC_013501	GGTAC	2	10	855531	855540	20 %	20 %	40 %	20 %	268316303
20479	NC_013501	CCA	2	6	855562	855567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316303
20480	NC_013501	CCA	2	6	855637	855642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316303
20481	NC_013501	ACG	2	6	855655	855660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316303
20482	NC_013501	GCC	2	6	855756	855761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316303
20483	NC_013501	GC	3	6	855771	855776	0 %	0 %	50 %	50 %	268316303
20484	NC_013501	TGG	3	9	855796	855804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316303
20485	NC_013501	GGA	2	6	855851	855856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316303
20486	NC_013501	GCC	2	6	855887	855892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316303
20487	NC_013501	GCG	2	6	855915	855920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316303
20488	NC_013501	CGC	2	6	855929	855934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316303
20489	NC_013501	GCT	2	6	855947	855952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316303
20490	NC_013501	G	6	6	855959	855964	0 %	0 %	100 %	0 %	268316303
20491	NC_013501	AACGCG	2	12	855975	855986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316303
20492	NC_013501	CTG	2	6	855993	855998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316303
20493	NC_013501	GCA	2	6	856130	856135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316303
20494	NC_013501	ATC	2	6	856146	856151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316303
20495	NC_013501	GC	4	8	856159	856166	0 %	0 %	50 %	50 %	268316303
20496	NC_013501	CGA	2	6	856169	856174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316303
20497	NC_013501	CATCGA	2	12	856226	856237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268316303
20498	NC_013501	GAA	2	6	856253	856258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316303
20499	NC_013501	TGG	2	6	856321	856326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316303
20500	NC_013501	TGGC	2	8	856347	856354	0 %	25 %	50 %	25 %	268316303

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