MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_013501	GAG	2	6	792251	792256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316256
19003	NC_013501	CGAC	2	8	792378	792385	25 %	0 %	25 %	50 %	268316256
19004	NC_013501	CCA	2	6	792422	792427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316256
19005	NC_013501	CG	4	8	792441	792448	0 %	0 %	50 %	50 %	268316256
19006	NC_013501	GCC	2	6	792530	792535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316256
19007	NC_013501	CTA	2	6	792540	792545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316256
19008	NC_013501	GCGCGT	2	12	792549	792560	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268316256
19009	NC_013501	GAGC	2	8	792591	792598	25 %	0 %	50 %	25 %	268316256
19010	NC_013501	GCT	2	6	792618	792623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316256
19011	NC_013501	GGCG	2	8	792638	792645	0 %	0 %	75 %	25 %	268316256
19012	NC_013501	GAA	2	6	792667	792672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316256
19013	NC_013501	TGC	2	6	792701	792706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316256
19014	NC_013501	GCGCC	2	10	792735	792744	0 %	0 %	40 %	60 %	268316256
19015	NC_013501	ACC	2	6	792836	792841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316256
19016	NC_013501	CTG	2	6	792877	792882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316256
19017	NC_013501	GATG	2	8	792919	792926	25 %	25 %	50 %	0 %	268316256
19018	NC_013501	CGCA	2	8	793021	793028	25 %	0 %	25 %	50 %	268316256
19019	NC_013501	CGA	2	6	793058	793063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316256
19020	NC_013501	ACG	2	6	793106	793111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316256
19021	NC_013501	AAG	2	6	793124	793129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316256
19022	NC_013501	ACG	2	6	793148	793153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316256
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19025	NC_013501	GGT	2	6	793284	793289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316256
19026	NC_013501	TGG	2	6	793307	793312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316256
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19028	NC_013501	CAGA	2	8	793422	793429	50 %	0 %	25 %	25 %	268316256
19029	NC_013501	GCT	2	6	793608	793613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316256
19030	NC_013501	CGA	2	6	793689	793694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316256
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19033	NC_013501	GGC	2	6	793791	793796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316256
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19044	NC_013501	GCT	2	6	794463	794468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316256
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19050	NC_013501	CCG	2	6	794803	794808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316256
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19052	NC_013501	GC	3	6	794837	794842	0 %	0 %	50 %	50 %	268316256
19053	NC_013501	TGG	2	6	794924	794929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316256
19054	NC_013501	CGG	2	6	794972	794977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316256
19055	NC_013501	TCC	2	6	795071	795076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19056	NC_013501	GGC	2	6	795091	795096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316257
19057	NC_013501	TCG	2	6	795228	795233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316257
19058	NC_013501	CGG	2	6	795262	795267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316257
19059	NC_013501	TGC	2	6	795270	795275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316257
19060	NC_013501	CTG	2	6	795284	795289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316257
19061	NC_013501	CTG	2	6	795383	795388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316257
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19088	NC_013501	GCCG	2	8	796575	796582	0 %	0 %	50 %	50 %	268316258
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19102	NC_013501	GTC	2	6	797169	797174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316259
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19121	NC_013501	GCTGG	2	10	798030	798039	0 %	20 %	60 %	20 %	268316260
19122	NC_013501	GCA	2	6	798159	798164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316260
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19124	NC_013501	TGC	2	6	798227	798232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316260
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19237	NC_013501	TCG	2	6	802983	802988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316263
19238	NC_013501	ACGA	2	8	802994	803001	50 %	0 %	25 %	25 %	268316263
19239	NC_013501	GC	3	6	803111	803116	0 %	0 %	50 %	50 %	268316263
19240	NC_013501	ACG	2	6	803147	803152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316263
19241	NC_013501	TCGG	2	8	803157	803164	0 %	25 %	50 %	25 %	268316263
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19243	NC_013501	GGT	2	6	803306	803311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316263
19244	NC_013501	GT	3	6	803429	803434	0 %	50 %	50 %	0 %	268316263
19245	NC_013501	ATCGAC	2	12	803444	803455	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268316263
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19274	NC_013501	CGCT	2	8	804593	804600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19275	NC_013501	AAG	2	6	804683	804688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19276	NC_013501	C	6	6	804737	804742	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19277	NC_013501	CG	3	6	804755	804760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19299	NC_013501	GAAG	2	8	805975	805982	50 %	0 %	50 %	0 %	268316266
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19352	NC_013501	GCAG	2	8	808215	808222	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19353	NC_013501	GAC	2	6	808270	808275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316268
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19358	NC_013501	CGA	2	6	808479	808484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316268
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19362	NC_013501	CTG	2	6	808759	808764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316268
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19382	NC_013501	GGC	2	6	809621	809626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316269
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19477	NC_013501	CTG	2	6	813621	813626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316271
19478	NC_013501	CGG	2	6	813758	813763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316271
19479	NC_013501	CGG	2	6	813766	813771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316271
19480	NC_013501	GCC	2	6	813772	813777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316271
19481	NC_013501	GCG	2	6	813949	813954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316271
19482	NC_013501	TGC	2	6	814021	814026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316271
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19484	NC_013501	TGC	2	6	814135	814140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316271
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19492	NC_013501	GCC	2	6	814606	814611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316271
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