MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_013501	CGC	2	6	710236	710241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316194
17002	NC_013501	CCA	2	6	710455	710460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316194
17003	NC_013501	GGCA	2	8	710501	710508	25 %	0 %	50 %	25 %	268316194
17004	NC_013501	A	6	6	710563	710568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_013501	ACA	2	6	710578	710583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17006	NC_013501	ATCG	2	8	710588	710595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17007	NC_013501	GCC	2	6	710615	710620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316195
17008	NC_013501	GCG	2	6	710674	710679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316195
17009	NC_013501	CGAG	2	8	710724	710731	25 %	0 %	50 %	25 %	268316195
17010	NC_013501	GCG	2	6	710746	710751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316195
17011	NC_013501	CTT	2	6	710757	710762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316195
17012	NC_013501	GCC	2	6	710776	710781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316195
17013	NC_013501	ACA	2	6	710829	710834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316195
17014	NC_013501	CCG	2	6	710873	710878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316195
17015	NC_013501	GC	3	6	710887	710892	0 %	0 %	50 %	50 %	268316195
17016	NC_013501	GC	3	6	710967	710972	0 %	0 %	50 %	50 %	268316195
17017	NC_013501	CGA	2	6	710982	710987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316195
17018	NC_013501	GCTG	2	8	710997	711004	0 %	25 %	50 %	25 %	268316195
17019	NC_013501	G	6	6	711025	711030	0 %	0 %	100 %	0 %	268316195
17020	NC_013501	GCA	2	6	711096	711101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316195
17021	NC_013501	CAG	2	6	711193	711198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316195
17022	NC_013501	GCGCC	2	10	711307	711316	0 %	0 %	40 %	60 %	268316195
17023	NC_013501	CGT	2	6	711330	711335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316195
17024	NC_013501	CGCGGG	2	12	711389	711400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316195
17025	NC_013501	TCGG	2	8	711411	711418	0 %	25 %	50 %	25 %	268316195
17026	NC_013501	GGCG	2	8	711477	711484	0 %	0 %	75 %	25 %	268316195
17027	NC_013501	GCC	2	6	711500	711505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316195
17028	NC_013501	CTC	2	6	711562	711567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316195
17029	NC_013501	CCA	2	6	711582	711587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316195
17030	NC_013501	GC	3	6	711613	711618	0 %	0 %	50 %	50 %	268316195
17031	NC_013501	GGC	2	6	711619	711624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316195
17032	NC_013501	GC	3	6	711641	711646	0 %	0 %	50 %	50 %	268316195
17033	NC_013501	CAG	2	6	711664	711669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316195
17034	NC_013501	CGGA	2	8	711670	711677	25 %	0 %	50 %	25 %	268316195
17035	NC_013501	CGGT	2	8	711742	711749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17036	NC_013501	GCC	2	6	711872	711877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316196
17037	NC_013501	GGC	2	6	711925	711930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316196
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17039	NC_013501	GCCAC	2	10	712026	712035	20 %	0 %	20 %	60 %	268316196
17040	NC_013501	GC	3	6	712044	712049	0 %	0 %	50 %	50 %	268316196
17041	NC_013501	CGA	2	6	712081	712086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316196
17042	NC_013501	TTC	2	6	712097	712102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316196
17043	NC_013501	GCGG	2	8	712110	712117	0 %	0 %	75 %	25 %	268316196
17044	NC_013501	TGGA	2	8	712151	712158	25 %	25 %	50 %	0 %	268316196
17045	NC_013501	ACC	2	6	712171	712176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316196
17046	NC_013501	GCC	2	6	712189	712194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316196
17047	NC_013501	CTG	2	6	712202	712207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316196
17048	NC_013501	TGC	2	6	712266	712271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316196
17049	NC_013501	CCG	2	6	712374	712379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316196
17050	NC_013501	CGC	2	6	712401	712406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316196
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17053	NC_013501	GGC	2	6	712520	712525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316196
17054	NC_013501	GGCCG	2	10	712568	712577	0 %	0 %	60 %	40 %	268316196
17055	NC_013501	TGC	2	6	712584	712589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316196
17056	NC_013501	GCT	2	6	712597	712602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316196
17057	NC_013501	CGTG	2	8	712922	712929	0 %	25 %	50 %	25 %	268316197
17058	NC_013501	CCA	2	6	712931	712936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316197
17059	NC_013501	GCGG	2	8	713138	713145	0 %	0 %	75 %	25 %	268316197
17060	NC_013501	AAG	2	6	713146	713151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316197
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17062	NC_013501	GTA	2	6	713361	713366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316197
17063	NC_013501	CGT	2	6	713375	713380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316197
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17065	NC_013501	TAG	2	6	713443	713448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316197
17066	NC_013501	TCG	2	6	713464	713469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316197
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17069	NC_013501	TGGC	2	8	713572	713579	0 %	25 %	50 %	25 %	268316197
17070	NC_013501	TGAT	2	8	713608	713615	25 %	50 %	25 %	0 %	268316197
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17079	NC_013501	TGT	2	6	713993	713998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316197
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17083	NC_013501	CTG	2	6	714207	714212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316197
17084	NC_013501	GTC	2	6	714387	714392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316197
17085	NC_013501	CAG	2	6	714426	714431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316197
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17087	NC_013501	CCAGG	2	10	714492	714501	20 %	0 %	40 %	40 %	268316197
17088	NC_013501	GCG	2	6	714534	714539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316197
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17091	NC_013501	GAG	2	6	714640	714645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316197
17092	NC_013501	TGA	2	6	714647	714652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316197
17093	NC_013501	ACT	2	6	714684	714689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316197
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17096	NC_013501	GATC	2	8	714737	714744	25 %	25 %	25 %	25 %	268316197
17097	NC_013501	AAGG	2	8	714765	714772	50 %	0 %	50 %	0 %	268316197
17098	NC_013501	TCCG	2	8	714848	714855	0 %	25 %	25 %	50 %	268316197
17099	NC_013501	AGGT	2	8	714892	714899	25 %	25 %	50 %	0 %	268316197
17100	NC_013501	GCC	2	6	715032	715037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316197
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17102	NC_013501	TGG	2	6	715106	715111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316197
17103	NC_013501	TCG	2	6	715117	715122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316197
17104	NC_013501	CGA	2	6	715199	715204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316197
17105	NC_013501	GCA	2	6	715214	715219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316197
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17107	NC_013501	CGC	2	6	715394	715399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316197
17108	NC_013501	CGT	2	6	715427	715432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316197
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17110	NC_013501	GTA	3	9	715551	715559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316197
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17112	NC_013501	GCA	2	6	715580	715585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316197
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17116	NC_013501	GC	3	6	715693	715698	0 %	0 %	50 %	50 %	268316197
17117	NC_013501	GAC	2	6	715726	715731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17118	NC_013501	CTT	2	6	715759	715764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17119	NC_013501	TGT	2	6	715814	715819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17121	NC_013501	GCGT	2	8	715912	715919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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17351	NC_013501	GGC	2	6	724963	724968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17354	NC_013501	CCG	2	6	725110	725115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17355	NC_013501	ATGCGC	2	12	725179	725190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268316207
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17478	NC_013501	CAG	2	6	730430	730435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316211
17479	NC_013501	GCT	3	9	730525	730533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316211
17480	NC_013501	CAG	2	6	730607	730612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316211
17481	NC_013501	GC	4	8	730678	730685	0 %	0 %	50 %	50 %	268316211
17482	NC_013501	TCG	2	6	730689	730694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316211
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17486	NC_013501	GCC	2	6	730857	730862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316211
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17490	NC_013501	GCG	3	9	731132	731140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316211
17491	NC_013501	GCCGT	2	10	731142	731151	0 %	20 %	40 %	40 %	268316211
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17493	NC_013501	GCT	2	6	731197	731202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316211
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17496	NC_013501	GCC	2	6	731369	731374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17497	NC_013501	ATA	2	6	731452	731457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17499	NC_013501	TGTTT	2	10	731562	731571	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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