MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_013501	TGC	2	6	590653	590658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316094
14002	NC_013501	GCT	2	6	590678	590683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316094
14003	NC_013501	GGT	2	6	590700	590705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316094
14004	NC_013501	CCAG	2	8	590795	590802	25 %	0 %	25 %	50 %	268316094
14005	NC_013501	CGA	2	6	590819	590824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316094
14006	NC_013501	CCA	2	6	590883	590888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316094
14007	NC_013501	CAG	2	6	590907	590912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316094
14008	NC_013501	CGT	2	6	590918	590923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316094
14009	NC_013501	GGC	2	6	590944	590949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316094
14010	NC_013501	CGTGAC	2	12	590970	590981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268316094
14011	NC_013501	CGT	2	6	590988	590993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316094
14012	NC_013501	CCA	3	9	591005	591013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316094
14013	NC_013501	GCA	2	6	591014	591019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316094
14014	NC_013501	GC	3	6	591032	591037	0 %	0 %	50 %	50 %	268316094
14015	NC_013501	AGC	2	6	591048	591053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_013501	T	7	7	591058	591064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_013501	TGC	2	6	591124	591129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_013501	CCT	2	6	591215	591220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14019	NC_013501	GCA	2	6	591233	591238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_013501	CTGC	2	8	591332	591339	0 %	25 %	25 %	50 %	268316095
14021	NC_013501	CGA	2	6	591464	591469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14022	NC_013501	ACC	2	6	591522	591527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316095
14023	NC_013501	GGC	2	6	591662	591667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316095
14024	NC_013501	ACG	2	6	591702	591707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14025	NC_013501	CG	3	6	591706	591711	0 %	0 %	50 %	50 %	268316095
14026	NC_013501	ACGC	2	8	591714	591721	25 %	0 %	25 %	50 %	268316095
14027	NC_013501	GCCG	2	8	591725	591732	0 %	0 %	50 %	50 %	268316095
14028	NC_013501	CGC	2	6	591737	591742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316095
14029	NC_013501	CCAG	2	8	591796	591803	25 %	0 %	25 %	50 %	268316095
14030	NC_013501	GAA	2	6	591804	591809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316095
14031	NC_013501	TGC	2	6	591862	591867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14032	NC_013501	GGT	2	6	592013	592018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316095
14033	NC_013501	GCC	2	6	592027	592032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316095
14034	NC_013501	GCT	2	6	592103	592108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14035	NC_013501	TC	3	6	592135	592140	0 %	50 %	0 %	50 %	268316095
14036	NC_013501	ACG	2	6	592147	592152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14037	NC_013501	CTG	2	6	592158	592163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14038	NC_013501	CAG	2	6	592172	592177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14039	NC_013501	CAG	2	6	592206	592211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14040	NC_013501	TGG	2	6	592249	592254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316095
14041	NC_013501	CTT	2	6	592289	592294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316095
14042	NC_013501	TGG	2	6	592297	592302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316095
14043	NC_013501	ATC	2	6	592321	592326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316095
14044	NC_013501	GGC	2	6	592344	592349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316095
14045	NC_013501	CGA	2	6	592406	592411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14046	NC_013501	AAG	2	6	592471	592476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316095
14047	NC_013501	ACG	2	6	592522	592527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14048	NC_013501	GGC	2	6	592575	592580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316095
14049	NC_013501	GGT	2	6	592586	592591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316095
14050	NC_013501	GAT	2	6	592710	592715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316095
14051	NC_013501	TGG	2	6	592747	592752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316095
14052	NC_013501	GCCG	2	8	592778	592785	0 %	0 %	50 %	50 %	268316095
14053	NC_013501	CAACGG	2	12	592835	592846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14054	NC_013501	CAC	2	6	592859	592864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316095
14055	NC_013501	CGC	2	6	592879	592884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316095
14056	NC_013501	CGA	2	6	592904	592909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14057	NC_013501	GCT	2	6	592952	592957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14058	NC_013501	ACC	3	9	593004	593012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316095
14059	NC_013501	CGAT	2	8	593107	593114	25 %	25 %	25 %	25 %	268316095
14060	NC_013501	GCGCGT	2	12	593159	593170	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268316095
14061	NC_013501	GACG	2	8	593220	593227	25 %	0 %	50 %	25 %	268316095
14062	NC_013501	GAC	2	6	593229	593234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14063	NC_013501	GCGTC	2	10	593245	593254	0 %	20 %	40 %	40 %	268316095
14064	NC_013501	TGG	3	9	593266	593274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316095
14065	NC_013501	GCG	2	6	593281	593286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316095
14066	NC_013501	GTC	2	6	593292	593297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316095
14067	NC_013501	CGTA	2	8	593309	593316	25 %	25 %	25 %	25 %	268316095
14068	NC_013501	CTTT	2	8	593374	593381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14069	NC_013501	T	6	6	593379	593384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_013501	TGCG	2	8	593404	593411	0 %	25 %	50 %	25 %	268316096
14071	NC_013501	GGC	2	6	593437	593442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316096
14072	NC_013501	GCC	2	6	593518	593523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316096
14073	NC_013501	GCC	2	6	593536	593541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316096
14074	NC_013501	GCC	2	6	593560	593565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316096
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14078	NC_013501	CGG	2	6	593721	593726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316096
14079	NC_013501	TGCG	2	8	593745	593752	0 %	25 %	50 %	25 %	268316096
14080	NC_013501	GCC	2	6	593756	593761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316096
14081	NC_013501	AGCC	2	8	593767	593774	25 %	0 %	25 %	50 %	268316096
14082	NC_013501	CCA	2	6	593791	593796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316096
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14084	NC_013501	GAA	3	9	593821	593829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316096
14085	NC_013501	GCG	2	6	593839	593844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316096
14086	NC_013501	GGT	2	6	593848	593853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316096
14087	NC_013501	GGCG	2	8	593868	593875	0 %	0 %	75 %	25 %	268316096
14088	NC_013501	GAC	2	6	593890	593895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14089	NC_013501	ACC	2	6	593936	593941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316096
14090	NC_013501	CGGT	3	12	594034	594045	0 %	25 %	50 %	25 %	268316096
14091	NC_013501	GTC	2	6	594046	594051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14092	NC_013501	GC	3	6	594091	594096	0 %	0 %	50 %	50 %	268316096
14093	NC_013501	CGA	2	6	594113	594118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14094	NC_013501	CGG	2	6	594120	594125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316096
14095	NC_013501	GGC	2	6	594169	594174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316096
14096	NC_013501	CAG	2	6	594175	594180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14097	NC_013501	GTC	2	6	594190	594195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14098	NC_013501	TC	3	6	594204	594209	0 %	50 %	0 %	50 %	268316096
14099	NC_013501	CGT	2	6	594213	594218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14100	NC_013501	TGC	2	6	594236	594241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14101	NC_013501	AAAGGC	2	12	594247	594258	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	268316096
14102	NC_013501	GCC	2	6	594266	594271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316096
14103	NC_013501	AGGT	2	8	594275	594282	25 %	25 %	50 %	0 %	268316096
14104	NC_013501	GCG	2	6	594332	594337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316096
14105	NC_013501	CCCGG	2	10	594352	594361	0 %	0 %	40 %	60 %	268316096
14106	NC_013501	CGT	2	6	594369	594374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14107	NC_013501	CCTGCT	2	12	594405	594416	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	268316096
14108	NC_013501	GGT	2	6	594424	594429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316096
14109	NC_013501	CCGGG	2	10	594492	594501	0 %	0 %	60 %	40 %	268316096
14110	NC_013501	GCC	2	6	594503	594508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316096
14111	NC_013501	ACCG	2	8	594509	594516	25 %	0 %	25 %	50 %	268316096
14112	NC_013501	GAA	2	6	594517	594522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316096
14113	NC_013501	AGC	2	6	594629	594634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14114	NC_013501	CAG	2	6	594646	594651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14115	NC_013501	GAC	2	6	594658	594663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14116	NC_013501	CTG	2	6	594673	594678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316096
14117	NC_013501	CGT	2	6	594738	594743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316096
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14239	NC_013501	CGA	2	6	599153	599158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316098
14240	NC_013501	CCCG	2	8	599164	599171	0 %	0 %	25 %	75 %	268316098
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14261	NC_013501	GCCC	2	8	599944	599951	0 %	0 %	25 %	75 %	268316098
14262	NC_013501	CGC	2	6	599973	599978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316098
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14265	NC_013501	CGG	2	6	600130	600135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14266	NC_013501	CCG	2	6	600207	600212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14267	NC_013501	CCT	2	6	600233	600238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14268	NC_013501	AAGGC	2	10	600292	600301	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14269	NC_013501	GAAGT	2	10	600342	600351	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14270	NC_013501	CAG	2	6	600361	600366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14477	NC_013501	GTC	2	6	609359	609364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316106
14478	NC_013501	GGA	2	6	609366	609371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316106
14479	NC_013501	GCG	2	6	609400	609405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316106
14480	NC_013501	TGG	2	6	609473	609478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316106
14481	NC_013501	CGG	2	6	609479	609484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316106
14482	NC_013501	GAGGCG	2	12	609514	609525	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	268316106
14483	NC_013501	GC	3	6	609529	609534	0 %	0 %	50 %	50 %	268316106
14484	NC_013501	GGT	2	6	609543	609548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316106
14485	NC_013501	GGC	2	6	609588	609593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316106
14486	NC_013501	GCTGGC	2	12	609627	609638	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268316106
14487	NC_013501	CTG	2	6	609646	609651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316106
14488	NC_013501	GGT	4	12	609666	609677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316106
14489	NC_013501	TGA	2	6	609680	609685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316106
14490	NC_013501	GGC	2	6	609689	609694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316106
14491	NC_013501	TGC	2	6	609785	609790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316106
14492	NC_013501	G	7	7	609807	609813	0 %	0 %	100 %	0 %	268316106
14493	NC_013501	GCC	2	6	609885	609890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316106
14494	NC_013501	GAG	2	6	609898	609903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316106
14495	NC_013501	CGC	2	6	609938	609943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316106
14496	NC_013501	ACG	2	6	609973	609978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316106
14497	NC_013501	GGC	2	6	610010	610015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316106
14498	NC_013501	GAC	2	6	610024	610029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316106
14499	NC_013501	GGT	3	9	610038	610046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316106
14500	NC_013501	G	6	6	610073	610078	0 %	0 %	100 %	0 %	268316106

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