MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013501	TCCGA	2	10	524867	524876	20 %	20 %	20 %	40 %	268316047
12502	NC_013501	CGGG	2	8	524888	524895	0 %	0 %	75 %	25 %	268316047
12503	NC_013501	GGT	2	6	524928	524933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316047
12504	NC_013501	TGG	2	6	524948	524953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316047
12505	NC_013501	CGAA	2	8	524984	524991	50 %	0 %	25 %	25 %	268316047
12506	NC_013501	GCT	2	6	525024	525029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316047
12507	NC_013501	GGT	2	6	525033	525038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316047
12508	NC_013501	TCGCG	2	10	525042	525051	0 %	20 %	40 %	40 %	268316047
12509	NC_013501	ACG	2	6	525053	525058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316047
12510	NC_013501	GAA	2	6	525115	525120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316047
12511	NC_013501	GC	3	6	525146	525151	0 %	0 %	50 %	50 %	268316047
12512	NC_013501	GCCGA	2	10	525172	525181	20 %	0 %	40 %	40 %	268316047
12513	NC_013501	TAC	2	6	525220	525225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316047
12514	NC_013501	CGGT	2	8	525239	525246	0 %	25 %	50 %	25 %	268316047
12515	NC_013501	GCG	2	6	525344	525349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316047
12516	NC_013501	ATCGG	2	10	525383	525392	20 %	20 %	40 %	20 %	268316047
12517	NC_013501	GC	3	6	525443	525448	0 %	0 %	50 %	50 %	268316047
12518	NC_013501	TCG	2	6	525500	525505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316047
12519	NC_013501	CCGG	2	8	525564	525571	0 %	0 %	50 %	50 %	268316047
12520	NC_013501	CCT	2	6	525578	525583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316047
12521	NC_013501	GCT	2	6	525594	525599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316047
12522	NC_013501	CGA	2	6	525698	525703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316047
12523	NC_013501	GCC	2	6	525739	525744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316047
12524	NC_013501	CG	3	6	525746	525751	0 %	0 %	50 %	50 %	268316047
12525	NC_013501	GCTCTG	2	12	525759	525770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316047
12526	NC_013501	TCG	2	6	525778	525783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316047
12527	NC_013501	ACC	2	6	525799	525804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316047
12528	NC_013501	GCT	2	6	525822	525827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316047
12529	NC_013501	GCC	2	6	525865	525870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316047
12530	NC_013501	CTT	2	6	525897	525902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316047
12531	NC_013501	GAT	2	6	525921	525926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316047
12532	NC_013501	CTA	2	6	525930	525935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316047
12533	NC_013501	CG	3	6	526001	526006	0 %	0 %	50 %	50 %	268316047
12534	NC_013501	TGA	2	6	526031	526036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316047
12535	NC_013501	AGGA	2	8	526079	526086	50 %	0 %	50 %	0 %	268316047
12536	NC_013501	GTG	2	6	526186	526191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316047
12537	NC_013501	ACG	2	6	526198	526203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316047
12538	NC_013501	GAG	2	6	526333	526338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316047
12539	NC_013501	CGGT	2	8	526362	526369	0 %	25 %	50 %	25 %	268316047
12540	NC_013501	GTG	2	6	526372	526377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316047
12541	NC_013501	GGCGA	2	10	526426	526435	20 %	0 %	60 %	20 %	268316047
12542	NC_013501	GCC	2	6	526548	526553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316047
12543	NC_013501	CGG	2	6	526578	526583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316047
12544	NC_013501	AAG	2	6	526656	526661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316048
12545	NC_013501	GTC	2	6	526767	526772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316048
12546	NC_013501	GTC	2	6	526805	526810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316048
12547	NC_013501	GAT	2	6	526817	526822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316048
12548	NC_013501	CCA	2	6	526882	526887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316048
12549	NC_013501	CGG	2	6	526913	526918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316048
12550	NC_013501	AGGCC	2	10	526942	526951	20 %	0 %	40 %	40 %	268316048
12551	NC_013501	CCG	2	6	527033	527038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316048
12552	NC_013501	TTC	2	6	527054	527059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316048
12553	NC_013501	GAT	2	6	527093	527098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316048
12554	NC_013501	CTT	2	6	527134	527139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316048
12555	NC_013501	GCC	2	6	527145	527150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316048
12556	NC_013501	GTCCAC	2	12	527156	527167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268316048
12557	NC_013501	GCG	2	6	527219	527224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316048
12558	NC_013501	AGC	2	6	527265	527270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316048
12559	NC_013501	TGA	2	6	527275	527280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316048
12560	NC_013501	CAG	2	6	527306	527311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316048
12561	NC_013501	CGA	2	6	527314	527319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316048
12562	NC_013501	TGA	2	6	527356	527361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316048
12563	NC_013501	GAC	2	6	527441	527446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316048
12564	NC_013501	CGG	2	6	527484	527489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316048
12565	NC_013501	GCG	2	6	527490	527495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316048
12566	NC_013501	CGA	2	6	527538	527543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316048
12567	NC_013501	TTG	3	9	527568	527576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316048
12568	NC_013501	GAGG	2	8	527754	527761	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_013501	GCA	2	6	527806	527811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_013501	TTGA	2	8	527817	527824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_013501	TATTTT	2	12	527854	527865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_013501	T	7	7	527862	527868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_013501	TAT	2	6	527896	527901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_013501	ACC	2	6	528024	528029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12575	NC_013501	TG	3	6	528038	528043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_013501	CTT	2	6	528088	528093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_013501	CTG	2	6	528131	528136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316049
12578	NC_013501	CTG	3	9	528153	528161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316049
12579	NC_013501	GCCTTC	2	12	528228	528239	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	268316049
12580	NC_013501	CCG	2	6	528240	528245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316049
12581	NC_013501	GCT	2	6	528257	528262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316049
12582	NC_013501	TCCTT	2	10	528269	528278	0 %	60 %	0 %	40 %	268316049
12583	NC_013501	CGAC	2	8	528323	528330	25 %	0 %	25 %	50 %	268316049
12584	NC_013501	TCG	2	6	528344	528349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316049
12585	NC_013501	CGG	2	6	528383	528388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316049
12586	NC_013501	TAC	2	6	528450	528455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316049
12587	NC_013501	CGA	2	6	528467	528472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316049
12588	NC_013501	GC	3	6	528483	528488	0 %	0 %	50 %	50 %	268316049
12589	NC_013501	GGC	2	6	528696	528701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316049
12590	NC_013501	GGT	2	6	528719	528724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316049
12591	NC_013501	CGCC	2	8	528769	528776	0 %	0 %	25 %	75 %	268316049
12592	NC_013501	GCA	2	6	528782	528787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316049
12593	NC_013501	CGG	2	6	528806	528811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316049
12594	NC_013501	CGC	2	6	528904	528909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316049
12595	NC_013501	GTG	2	6	528975	528980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316049
12596	NC_013501	TTC	2	6	529029	529034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316049
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12599	NC_013501	CGG	2	6	529070	529075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316049
12600	NC_013501	CG	3	6	529102	529107	0 %	0 %	50 %	50 %	268316049
12601	NC_013501	CCG	2	6	529138	529143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316049
12602	NC_013501	ACA	2	6	529159	529164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316049
12603	NC_013501	TGC	2	6	529165	529170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316049
12604	NC_013501	GCG	2	6	529466	529471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316049
12605	NC_013501	TGG	2	6	529555	529560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316049
12606	NC_013501	GCCG	2	8	529636	529643	0 %	0 %	50 %	50 %	268316049
12607	NC_013501	CGA	2	6	529682	529687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316049
12608	NC_013501	GCG	2	6	529813	529818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316049
12609	NC_013501	GGCC	2	8	529852	529859	0 %	0 %	50 %	50 %	268316049
12610	NC_013501	CCG	2	6	529860	529865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316049
12611	NC_013501	CGG	2	6	529925	529930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316049
12612	NC_013501	GTCG	2	8	529956	529963	0 %	25 %	50 %	25 %	268316049
12613	NC_013501	CCG	2	6	529966	529971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316049
12614	NC_013501	CAC	2	6	530001	530006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316049
12615	NC_013501	AGC	2	6	530042	530047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316049
12616	NC_013501	CGG	2	6	530048	530053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_013501	GCT	2	6	530176	530181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316050
12618	NC_013501	TTC	2	6	530183	530188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316050
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12620	NC_013501	GCT	2	6	530245	530250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316050
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12622	NC_013501	GC	3	6	530289	530294	0 %	0 %	50 %	50 %	268316050
12623	NC_013501	GC	3	6	530305	530310	0 %	0 %	50 %	50 %	268316050
12624	NC_013501	TCG	2	6	530352	530357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316050
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12739	NC_013501	GGC	2	6	534979	534984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316053
12740	NC_013501	GC	3	6	535021	535026	0 %	0 %	50 %	50 %	268316053
12741	NC_013501	CGA	2	6	535096	535101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316053
12742	NC_013501	CGA	2	6	535123	535128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316053
12743	NC_013501	GCT	2	6	535140	535145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316053
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12749	NC_013501	AAACC	2	10	535487	535496	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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12984	NC_013501	CAC	2	6	548317	548322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316061
12985	NC_013501	GCC	2	6	548329	548334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316061
12986	NC_013501	GC	4	8	548353	548360	0 %	0 %	50 %	50 %	268316061
12987	NC_013501	GC	3	6	548380	548385	0 %	0 %	50 %	50 %	268316061
12988	NC_013501	CGA	2	6	548391	548396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316061
12989	NC_013501	CGA	2	6	548499	548504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316061
12990	NC_013501	CCA	2	6	548532	548537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316061
12991	NC_013501	GGC	2	6	548541	548546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316061
12992	NC_013501	GCG	2	6	548548	548553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316061
12993	NC_013501	TCG	2	6	548559	548564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316061
12994	NC_013501	AGC	2	6	548591	548596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316061
12995	NC_013501	GCG	2	6	548638	548643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316061
12996	NC_013501	CGTT	2	8	548678	548685	0 %	50 %	25 %	25 %	268316061
12997	NC_013501	GGC	2	6	548695	548700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316061
12998	NC_013501	GAT	2	6	548725	548730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316061
12999	NC_013501	GCG	2	6	548825	548830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316061
13000	NC_013501	ATG	2	6	548840	548845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316061

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