MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013501	CAGC	2	8	504162	504169	25 %	0 %	25 %	50 %	268316031
12003	NC_013501	CAG	2	6	504189	504194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316031
12004	NC_013501	GCC	2	6	504208	504213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316031
12005	NC_013501	GCA	2	6	504245	504250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316031
12006	NC_013501	CAG	3	9	504279	504287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316031
12007	NC_013501	CGA	2	6	504313	504318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316031
12008	NC_013501	CGA	2	6	504410	504415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316031
12009	NC_013501	CAG	2	6	504468	504473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316031
12010	NC_013501	AAC	2	6	504478	504483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316031
12011	NC_013501	GCAA	2	8	504531	504538	50 %	0 %	25 %	25 %	268316032
12012	NC_013501	CAT	2	6	504548	504553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316032
12013	NC_013501	GCCGT	2	10	504558	504567	0 %	20 %	40 %	40 %	268316032
12014	NC_013501	GCC	2	6	504596	504601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316032
12015	NC_013501	GC	3	6	504610	504615	0 %	0 %	50 %	50 %	268316032
12016	NC_013501	GCC	2	6	504621	504626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316032
12017	NC_013501	GCGG	2	8	504630	504637	0 %	0 %	75 %	25 %	268316032
12018	NC_013501	GCCA	2	8	504668	504675	25 %	0 %	25 %	50 %	268316032
12019	NC_013501	GCCG	2	8	504689	504696	0 %	0 %	50 %	50 %	268316032
12020	NC_013501	CAC	2	6	504752	504757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316032
12021	NC_013501	CGCC	2	8	504844	504851	0 %	0 %	25 %	75 %	268316032
12022	NC_013501	GT	3	6	504870	504875	0 %	50 %	50 %	0 %	268316032
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12025	NC_013501	GGC	2	6	505018	505023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316032
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12028	NC_013501	CCAG	2	8	505060	505067	25 %	0 %	25 %	50 %	268316032
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12033	NC_013501	GC	3	6	505243	505248	0 %	0 %	50 %	50 %	268316032
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12051	NC_013501	GTT	2	6	505880	505885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316032
12052	NC_013501	ACG	2	6	505905	505910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316032
12053	NC_013501	GCGG	2	8	505937	505944	0 %	0 %	75 %	25 %	268316032
12054	NC_013501	GCCGC	2	10	505953	505962	0 %	0 %	40 %	60 %	268316032
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12227	NC_013501	GTC	2	6	512711	512716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316038
12228	NC_013501	G	6	6	512740	512745	0 %	0 %	100 %	0 %	268316038
12229	NC_013501	GC	3	6	512770	512775	0 %	0 %	50 %	50 %	268316038
12230	NC_013501	GACG	2	8	512810	512817	25 %	0 %	50 %	25 %	268316038
12231	NC_013501	GAGCAG	2	12	512843	512854	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	268316038
12232	NC_013501	AGC	2	6	512859	512864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316038
12233	NC_013501	GGCGGT	2	12	512895	512906	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12234	NC_013501	CTA	2	6	512921	512926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12235	NC_013501	CATT	2	8	512932	512939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12236	NC_013501	TCT	2	6	512952	512957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12237	NC_013501	GCTT	2	8	513014	513021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12238	NC_013501	TAT	2	6	513039	513044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12239	NC_013501	TCGCT	2	10	513049	513058	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12240	NC_013501	GCC	2	6	513187	513192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316039
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12345	NC_013501	G	7	7	517472	517478	0 %	0 %	100 %	0 %	268316042
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12351	NC_013501	GC	3	6	517596	517601	0 %	0 %	50 %	50 %	268316042
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12355	NC_013501	GGT	2	6	517779	517784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316042
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12359	NC_013501	GTT	2	6	517928	517933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316042
12360	NC_013501	GTC	2	6	517956	517961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316042
12361	NC_013501	GGC	2	6	517962	517967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316042
12362	NC_013501	GTC	2	6	517985	517990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316042
12363	NC_013501	TCG	2	6	517995	518000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316042
12364	NC_013501	CGGAGC	2	12	518065	518076	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	268316042
12365	NC_013501	CGG	2	6	518101	518106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316042
12366	NC_013501	TGG	3	9	518107	518115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316042
12367	NC_013501	GCC	2	6	518210	518215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316042
12368	NC_013501	CGG	2	6	518221	518226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316042
12369	NC_013501	CTG	2	6	518232	518237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316042
12370	NC_013501	GTC	2	6	518248	518253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316042
12371	NC_013501	TGG	2	6	518437	518442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316042
12372	NC_013501	GT	3	6	518443	518448	0 %	50 %	50 %	0 %	268316042
12373	NC_013501	GCC	2	6	518465	518470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316042
12374	NC_013501	GGA	2	6	518471	518476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316042
12375	NC_013501	GGT	3	9	518567	518575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316042
12376	NC_013501	CGATT	2	10	518728	518737	20 %	40 %	20 %	20 %	268316043
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12378	NC_013501	CG	3	6	518845	518850	0 %	0 %	50 %	50 %	268316043
12379	NC_013501	GCT	2	6	518918	518923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316043
12380	NC_013501	GGA	2	6	518951	518956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316043
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12383	NC_013501	ACGT	2	8	519144	519151	25 %	25 %	25 %	25 %	268316043
12384	NC_013501	GGC	2	6	519194	519199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
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12386	NC_013501	GAC	2	6	519345	519350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316043
12387	NC_013501	GCG	2	6	519375	519380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
12388	NC_013501	TCA	2	6	519418	519423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316043
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12390	NC_013501	CGCC	2	8	519469	519476	0 %	0 %	25 %	75 %	268316043
12391	NC_013501	GC	3	6	519484	519489	0 %	0 %	50 %	50 %	268316043
12392	NC_013501	AGGAC	2	10	519541	519550	40 %	0 %	40 %	20 %	268316043
12393	NC_013501	GCA	2	6	519605	519610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316043
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12396	NC_013501	GCTG	2	8	519685	519692	0 %	25 %	50 %	25 %	268316043
12397	NC_013501	CGG	2	6	519696	519701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
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12408	NC_013501	GCC	2	6	520276	520281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316043
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12411	NC_013501	CTG	2	6	520353	520358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316043
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12418	NC_013501	A	6	6	520733	520738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12419	NC_013501	TTCT	2	8	520757	520764	0 %	75 %	0 %	25 %	268316044
12420	NC_013501	GCG	2	6	520796	520801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316044
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12433	NC_013501	T	6	6	521477	521482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12434	NC_013501	CGG	2	6	521535	521540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12437	NC_013501	ATG	2	6	521738	521743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12440	NC_013501	A	6	6	521834	521839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12441	NC_013501	CCA	2	6	521875	521880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12442	NC_013501	AGC	2	6	521888	521893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12444	NC_013501	CTG	2	6	521928	521933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316045
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12449	NC_013501	CGG	2	6	522233	522238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316045
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12462	NC_013501	GCC	2	6	522783	522788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316045
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12465	NC_013501	ACC	2	6	522831	522836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316045
12466	NC_013501	GGC	2	6	522894	522899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316045
12467	NC_013501	TCTG	2	8	522925	522932	0 %	50 %	25 %	25 %	268316045
12468	NC_013501	GCA	2	6	522938	522943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316045
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12472	NC_013501	TGC	2	6	523126	523131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316046
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12476	NC_013501	GCAC	2	8	523483	523490	25 %	0 %	25 %	50 %	268316046
12477	NC_013501	GCG	2	6	523693	523698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316046
12478	NC_013501	CCG	2	6	523733	523738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316046
12479	NC_013501	ACCT	2	8	523746	523753	25 %	25 %	0 %	50 %	268316046
12480	NC_013501	GGC	2	6	523764	523769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316046
12481	NC_013501	GCC	2	6	523788	523793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316046
12482	NC_013501	GCCG	2	8	523796	523803	0 %	0 %	50 %	50 %	268316046
12483	NC_013501	TGC	2	6	523999	524004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316046
12484	NC_013501	GCA	2	6	524120	524125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316046
12485	NC_013501	GGC	2	6	524150	524155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316046
12486	NC_013501	ACC	2	6	524176	524181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316046
12487	NC_013501	TGC	2	6	524227	524232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316046
12488	NC_013501	GACGC	2	10	524319	524328	20 %	0 %	40 %	40 %	268316046
12489	NC_013501	CGA	2	6	524369	524374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316046
12490	NC_013501	GCTTCG	2	12	524394	524405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316046
12491	NC_013501	GTG	2	6	524466	524471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316046
12492	NC_013501	CCG	2	6	524524	524529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316046
12493	NC_013501	ACA	2	6	524545	524550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316046
12494	NC_013501	CCGTG	2	10	524597	524606	0 %	20 %	40 %	40 %	268316046
12495	NC_013501	GGTC	2	8	524641	524648	0 %	25 %	50 %	25 %	268316046
12496	NC_013501	GCG	2	6	524679	524684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316047
12497	NC_013501	GCT	2	6	524709	524714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316047
12498	NC_013501	GGC	2	6	524715	524720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316047
12499	NC_013501	GCC	2	6	524722	524727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316047
12500	NC_013501	CGGA	2	8	524762	524769	25 %	0 %	50 %	25 %	268316047

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