MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013501	A	6	6	462334	462339	100 %	0 %	0 %	0 %	268315993
11002	NC_013501	ACT	2	6	462349	462354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315993
11003	NC_013501	AAG	2	6	462360	462365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315993
11004	NC_013501	A	6	6	462376	462381	100 %	0 %	0 %	0 %	268315993
11005	NC_013501	GAAT	2	8	462400	462407	50 %	25 %	25 %	0 %	268315993
11006	NC_013501	A	7	7	462463	462469	100 %	0 %	0 %	0 %	268315993
11007	NC_013501	AGA	3	9	462476	462484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315993
11008	NC_013501	TAA	2	6	462498	462503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268315993
11009	NC_013501	GTTT	2	8	462537	462544	0 %	75 %	25 %	0 %	268315993
11010	NC_013501	CAAC	2	8	462687	462694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11011	NC_013501	CTG	2	6	462713	462718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315994
11012	NC_013501	GCGG	2	8	462850	462857	0 %	0 %	75 %	25 %	268315994
11013	NC_013501	AGC	2	6	462864	462869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315994
11014	NC_013501	GGT	2	6	462895	462900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315994
11015	NC_013501	GAG	2	6	462902	462907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315994
11016	NC_013501	ACG	2	6	462915	462920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315994
11017	NC_013501	TGA	2	6	462930	462935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315994
11018	NC_013501	CTT	2	6	462937	462942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315994
11019	NC_013501	CGG	2	6	462944	462949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315994
11020	NC_013501	ACG	2	6	462993	462998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315994
11021	NC_013501	TTC	2	6	463010	463015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315994
11022	NC_013501	GCC	2	6	463022	463027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315994
11023	NC_013501	CGC	2	6	463047	463052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315994
11024	NC_013501	GGC	2	6	463088	463093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315994
11025	NC_013501	TGG	2	6	463101	463106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315994
11026	NC_013501	GGT	2	6	463115	463120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315994
11027	NC_013501	TTC	2	6	463151	463156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315994
11028	NC_013501	TCT	2	6	463182	463187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315994
11029	NC_013501	CTG	2	6	463226	463231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315994
11030	NC_013501	GCCG	2	8	463243	463250	0 %	0 %	50 %	50 %	268315994
11031	NC_013501	GAG	2	6	463259	463264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315994
11032	NC_013501	GCC	2	6	463286	463291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315994
11033	NC_013501	GTG	2	6	463328	463333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315994
11034	NC_013501	TG	3	6	463332	463337	0 %	50 %	50 %	0 %	268315994
11035	NC_013501	GGC	2	6	463346	463351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315994
11036	NC_013501	AGC	2	6	463365	463370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315994
11037	NC_013501	TGG	2	6	463383	463388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315994
11038	NC_013501	ATC	2	6	463424	463429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315994
11039	NC_013501	CGC	2	6	463491	463496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11040	NC_013501	GCC	2	6	463591	463596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315995
11041	NC_013501	TCGGCC	2	12	463609	463620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	268315995
11042	NC_013501	TTC	2	6	463650	463655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315995
11043	NC_013501	TGA	2	6	463799	463804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315995
11044	NC_013501	TCG	2	6	463816	463821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315995
11045	NC_013501	GCG	2	6	463851	463856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315995
11046	NC_013501	TTC	2	6	463902	463907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315995
11047	NC_013501	CTC	2	6	463953	463958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315995
11048	NC_013501	GATGGC	2	12	464160	464171	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268315996
11049	NC_013501	ACG	2	6	464172	464177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315996
11050	NC_013501	TCG	2	6	464194	464199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315996
11051	NC_013501	GAAT	2	8	464207	464214	50 %	25 %	25 %	0 %	268315996
11052	NC_013501	ATA	2	6	464271	464276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268315996
11053	NC_013501	TC	3	6	464351	464356	0 %	50 %	0 %	50 %	268315996
11054	NC_013501	GAT	2	6	464367	464372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315996
11055	NC_013501	AGC	2	6	464410	464415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315996
11056	NC_013501	GGT	2	6	464486	464491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315996
11057	NC_013501	AGC	2	6	464506	464511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315996
11058	NC_013501	CA	3	6	464571	464576	50 %	0 %	0 %	50 %	268315996
11059	NC_013501	TCCT	2	8	464586	464593	0 %	50 %	0 %	50 %	268315996
11060	NC_013501	CGT	2	6	464594	464599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315996
11061	NC_013501	GAT	2	6	464628	464633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315996
11062	NC_013501	CGG	2	6	464651	464656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315996
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11064	NC_013501	CGGG	2	8	464789	464796	0 %	0 %	75 %	25 %	268315996
11065	NC_013501	CTC	2	6	464847	464852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315996
11066	NC_013501	TGC	2	6	464951	464956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315996
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11068	NC_013501	CGG	2	6	464995	465000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315996
11069	NC_013501	A	6	6	465050	465055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_013501	ATG	2	6	465060	465065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_013501	TTG	2	6	465068	465073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_013501	GCC	2	6	465102	465107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11073	NC_013501	CAGA	2	8	465122	465129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11074	NC_013501	CTT	2	6	465133	465138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_013501	GGC	2	6	465193	465198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_013501	CAG	2	6	465222	465227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_013501	GTGCTG	2	12	465267	465278	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268315997
11078	NC_013501	TGGC	2	8	465294	465301	0 %	25 %	50 %	25 %	268315997
11079	NC_013501	CTG	2	6	465372	465377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315997
11080	NC_013501	CGTT	2	8	465412	465419	0 %	50 %	25 %	25 %	268315997
11081	NC_013501	ATC	2	6	465435	465440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315997
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11084	NC_013501	GACCG	2	10	465617	465626	20 %	0 %	40 %	40 %	268315997
11085	NC_013501	CGAT	2	8	465703	465710	25 %	25 %	25 %	25 %	268315997
11086	NC_013501	GTGCTG	2	12	465732	465743	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268315997
11087	NC_013501	CTG	3	9	465753	465761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315997
11088	NC_013501	GGC	2	6	465764	465769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315997
11089	NC_013501	CGGGCG	2	12	465772	465783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315997
11090	NC_013501	CTG	3	9	465822	465830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315997
11091	NC_013501	CTG	2	6	465873	465878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315997
11092	NC_013501	CTG	2	6	465882	465887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315997
11093	NC_013501	TGA	2	6	465934	465939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315997
11094	NC_013501	TGG	2	6	465943	465948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315997
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11099	NC_013501	CAT	2	6	466013	466018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315997
11100	NC_013501	GCG	2	6	466046	466051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315997
11101	NC_013501	CTG	2	6	466161	466166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315997
11102	NC_013501	GGC	2	6	466172	466177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315997
11103	NC_013501	GCTGGT	2	12	466178	466189	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268315997
11104	NC_013501	TGGC	2	8	466263	466270	0 %	25 %	50 %	25 %	268315997
11105	NC_013501	GGC	3	9	466286	466294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315997
11106	NC_013501	GCG	2	6	466490	466495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315997
11107	NC_013501	CGA	2	6	466501	466506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315997
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11109	NC_013501	ACG	2	6	466675	466680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315997
11110	NC_013501	GGC	2	6	466694	466699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315997
11111	NC_013501	GCCC	2	8	466778	466785	0 %	0 %	25 %	75 %	268315997
11112	NC_013501	CGG	2	6	466808	466813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315997
11113	NC_013501	GCG	2	6	466855	466860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315997
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11115	NC_013501	GGA	2	6	466910	466915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315997
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11235	NC_013501	TCAT	2	8	471907	471914	25 %	50 %	0 %	25 %	268316001
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11242	NC_013501	TCGTC	2	10	472269	472278	0 %	40 %	20 %	40 %	268316001
11243	NC_013501	GA	3	6	472337	472342	50 %	0 %	50 %	0 %	268316001
11244	NC_013501	ATC	2	6	472343	472348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316001
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11250	NC_013501	TCG	2	6	472541	472546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316001
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11331	NC_013501	GCAG	2	8	476373	476380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11332	NC_013501	GCTTT	2	10	476400	476409	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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11482	NC_013501	CG	3	6	483222	483227	0 %	0 %	50 %	50 %	268316009
11483	NC_013501	CTG	2	6	483257	483262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316009
11484	NC_013501	GAG	2	6	483323	483328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316009
11485	NC_013501	ATCG	2	8	483335	483342	25 %	25 %	25 %	25 %	268316009
11486	NC_013501	GTG	2	6	483344	483349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316009
11487	NC_013501	GCA	2	6	483351	483356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316009
11488	NC_013501	GCC	2	6	483375	483380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316009
11489	NC_013501	GCA	2	6	483388	483393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316009
11490	NC_013501	GCT	2	6	483409	483414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316009
11491	NC_013501	GCT	2	6	483418	483423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316009
11492	NC_013501	GCGG	2	8	483460	483467	0 %	0 %	75 %	25 %	268316009
11493	NC_013501	CTT	2	6	483566	483571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316010
11494	NC_013501	T	7	7	483583	483589	0 %	100 %	0 %	0 %	268316010
11495	NC_013501	GGT	2	6	483620	483625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316010
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11497	NC_013501	GGC	2	6	483681	483686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316010
11498	NC_013501	TCG	2	6	483804	483809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316010
11499	NC_013501	TTC	2	6	483816	483821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316010
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