MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_013501	GGT	3	9	400225	400233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315932
9502	NC_013501	CGA	2	6	400239	400244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315932
9503	NC_013501	CGG	2	6	400246	400251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315932
9504	NC_013501	GCG	2	6	400287	400292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315932
9505	NC_013501	TCG	2	6	400404	400409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315932
9506	NC_013501	TGG	2	6	400500	400505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315933
9507	NC_013501	GCT	2	6	400576	400581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315933
9508	NC_013501	TGG	3	9	400659	400667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315933
9509	NC_013501	GCC	2	6	400709	400714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315933
9510	NC_013501	GAT	2	6	400777	400782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315933
9511	NC_013501	CTG	3	9	400793	400801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315933
9512	NC_013501	TGG	2	6	400821	400826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315933
9513	NC_013501	GCT	2	6	400849	400854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315933
9514	NC_013501	ATG	2	6	400874	400879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315933
9515	NC_013501	CG	3	6	400926	400931	0 %	0 %	50 %	50 %	268315933
9516	NC_013501	GCG	2	6	400962	400967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315933
9517	NC_013501	ATC	2	6	400988	400993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315933
9518	NC_013501	GCT	2	6	401029	401034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315933
9519	NC_013501	GTG	2	6	401078	401083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315933
9520	NC_013501	TGG	2	6	401115	401120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315933
9521	NC_013501	GCG	2	6	401136	401141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315933
9522	NC_013501	GGC	3	9	401170	401178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315933
9523	NC_013501	CTG	2	6	401183	401188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315933
9524	NC_013501	TTC	2	6	401216	401221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315933
9525	NC_013501	ATC	2	6	401298	401303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315934
9526	NC_013501	T	6	6	401310	401315	0 %	100 %	0 %	0 %	268315934
9527	NC_013501	GGC	3	9	401321	401329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315934
9528	NC_013501	CCGTC	2	10	401354	401363	0 %	20 %	20 %	60 %	268315934
9529	NC_013501	GTG	2	6	401415	401420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315934
9530	NC_013501	TGC	2	6	401434	401439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9531	NC_013501	GAC	2	6	401484	401489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9532	NC_013501	CGA	2	6	401492	401497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9533	NC_013501	GAC	2	6	401514	401519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9534	NC_013501	GGC	2	6	401528	401533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315934
9535	NC_013501	CGA	2	6	401567	401572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9536	NC_013501	GCG	2	6	401579	401584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315934
9537	NC_013501	GCT	2	6	401597	401602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9538	NC_013501	ACG	2	6	401679	401684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9539	NC_013501	TGG	2	6	401715	401720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315934
9540	NC_013501	CGG	2	6	401749	401754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315934
9541	NC_013501	TGC	2	6	401761	401766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9542	NC_013501	GGC	2	6	401795	401800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315934
9543	NC_013501	CGG	2	6	401803	401808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315934
9544	NC_013501	CGG	2	6	401811	401816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315934
9545	NC_013501	CTGG	2	8	401840	401847	0 %	25 %	50 %	25 %	268315934
9546	NC_013501	GCT	3	9	401933	401941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9547	NC_013501	GC	3	6	402018	402023	0 %	0 %	50 %	50 %	268315934
9548	NC_013501	GC	3	6	402042	402047	0 %	0 %	50 %	50 %	268315934
9549	NC_013501	GC	3	6	402058	402063	0 %	0 %	50 %	50 %	268315934
9550	NC_013501	GCT	2	6	402176	402181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9551	NC_013501	GCTG	2	8	402343	402350	0 %	25 %	50 %	25 %	268315934
9552	NC_013501	CAA	2	6	402356	402361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315934
9553	NC_013501	GGCG	2	8	402365	402372	0 %	0 %	75 %	25 %	268315934
9554	NC_013501	ACG	2	6	402406	402411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9555	NC_013501	CCGGC	2	10	402504	402513	0 %	0 %	40 %	60 %	268315934
9556	NC_013501	CCCG	2	8	402536	402543	0 %	0 %	25 %	75 %	268315934
9557	NC_013501	CACG	2	8	402551	402558	25 %	0 %	25 %	50 %	268315934
9558	NC_013501	GACGC	2	10	402603	402612	20 %	0 %	40 %	40 %	268315934
9559	NC_013501	CGT	2	6	402623	402628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9560	NC_013501	GCGGA	2	10	402642	402651	20 %	0 %	60 %	20 %	268315934
9561	NC_013501	GCT	2	6	402656	402661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315934
9562	NC_013501	CAC	2	6	402714	402719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315934
9563	NC_013501	GTT	2	6	402763	402768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315935
9564	NC_013501	ACG	2	6	402852	402857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315935
9565	NC_013501	CG	3	6	402861	402866	0 %	0 %	50 %	50 %	268315935
9566	NC_013501	CTG	2	6	402872	402877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315935
9567	NC_013501	GCG	2	6	402882	402887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315935
9568	NC_013501	TCCG	2	8	403007	403014	0 %	25 %	25 %	50 %	268315935
9569	NC_013501	CGA	2	6	403087	403092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315935
9570	NC_013501	TGCG	2	8	403148	403155	0 %	25 %	50 %	25 %	268315935
9571	NC_013501	GGCT	2	8	403161	403168	0 %	25 %	50 %	25 %	268315935
9572	NC_013501	ACG	2	6	403220	403225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315935
9573	NC_013501	TGC	2	6	403275	403280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315935
9574	NC_013501	TCCA	2	8	403295	403302	25 %	25 %	0 %	50 %	268315935
9575	NC_013501	CGA	2	6	403315	403320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315935
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9577	NC_013501	TCCA	2	8	403335	403342	25 %	25 %	0 %	50 %	268315935
9578	NC_013501	CGT	2	6	403387	403392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315935
9579	NC_013501	GCTG	2	8	403464	403471	0 %	25 %	50 %	25 %	268315935
9580	NC_013501	GCA	2	6	403495	403500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315935
9581	NC_013501	GCATGG	2	12	403509	403520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268315935
9582	NC_013501	GCT	2	6	403522	403527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315935
9583	NC_013501	GTG	2	6	403643	403648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315935
9584	NC_013501	GCT	2	6	403660	403665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315935
9585	NC_013501	CTA	2	6	403669	403674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315935
9586	NC_013501	GGC	2	6	403678	403683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315935
9587	NC_013501	GT	3	6	403755	403760	0 %	50 %	50 %	0 %	268315935
9588	NC_013501	GTA	2	6	403782	403787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9589	NC_013501	C	6	6	403829	403834	0 %	0 %	0 %	100 %	268315936
9590	NC_013501	ATG	2	6	403854	403859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315936
9591	NC_013501	GCC	2	6	403860	403865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315936
9592	NC_013501	CG	3	6	403902	403907	0 %	0 %	50 %	50 %	268315936
9593	NC_013501	GCC	2	6	403922	403927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315936
9594	NC_013501	TGGC	2	8	403958	403965	0 %	25 %	50 %	25 %	268315936
9595	NC_013501	GTG	3	9	404021	404029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315936
9596	NC_013501	TGA	2	6	404100	404105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315936
9597	NC_013501	GCG	2	6	404153	404158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315936
9598	NC_013501	T	6	6	404223	404228	0 %	100 %	0 %	0 %	268315936
9599	NC_013501	CTA	2	6	404236	404241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315936
9600	NC_013501	ACA	2	6	404361	404366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315936
9601	NC_013501	GACG	2	8	404396	404403	25 %	0 %	50 %	25 %	268315936
9602	NC_013501	GCT	3	9	404407	404415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315936
9603	NC_013501	CGG	2	6	404554	404559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315936
9604	NC_013501	GCC	2	6	404560	404565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315936
9605	NC_013501	TGA	2	6	404592	404597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315936
9606	NC_013501	GGC	3	9	404647	404655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315936
9607	NC_013501	CTG	2	6	404657	404662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315936
9608	NC_013501	GGAG	2	8	404673	404680	25 %	0 %	75 %	0 %	268315936
9609	NC_013501	GGT	2	6	404686	404691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315936
9610	NC_013501	GCGA	2	8	404730	404737	25 %	0 %	50 %	25 %	268315936
9611	NC_013501	AGC	2	6	404886	404891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315936
9612	NC_013501	CTG	2	6	405097	405102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315937
9613	NC_013501	GAA	2	6	405115	405120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315937
9614	NC_013501	GCG	2	6	405141	405146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315937
9615	NC_013501	GGA	2	6	405183	405188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315937
9616	NC_013501	CT	3	6	405215	405220	0 %	50 %	0 %	50 %	268315937
9617	NC_013501	GCG	2	6	405351	405356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315937
9618	NC_013501	GGCA	2	8	405362	405369	25 %	0 %	50 %	25 %	268315937
9619	NC_013501	CCGAT	2	10	405371	405380	20 %	20 %	20 %	40 %	268315937
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9621	NC_013501	CAGG	2	8	405415	405422	25 %	0 %	50 %	25 %	268315937
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