MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_013501	GCT	2	6	378843	378848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315917
9002	NC_013501	ATG	2	6	378865	378870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315917
9003	NC_013501	CGA	2	6	378873	378878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315917
9004	NC_013501	CGT	2	6	378899	378904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315917
9005	NC_013501	GCC	2	6	378936	378941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315917
9006	NC_013501	TTC	2	6	378942	378947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315917
9007	NC_013501	TTC	2	6	379026	379031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315917
9008	NC_013501	GCT	2	6	379067	379072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315917
9009	NC_013501	GGC	2	6	379205	379210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315917
9010	NC_013501	CGT	2	6	379217	379222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315917
9011	NC_013501	CTG	5	15	379314	379328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315917
9012	NC_013501	GCG	2	6	379344	379349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315917
9013	NC_013501	CTT	2	6	379364	379369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315917
9014	NC_013501	GCC	2	6	379427	379432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315917
9015	NC_013501	GCG	2	6	379476	379481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315917
9016	NC_013501	ACG	2	6	379482	379487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315917
9017	NC_013501	GAC	2	6	379497	379502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315917
9018	NC_013501	CACC	2	8	379514	379521	25 %	0 %	0 %	75 %	268315917
9019	NC_013501	ACC	2	6	379547	379552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315917
9020	NC_013501	GCG	2	6	379568	379573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315917
9021	NC_013501	CGT	2	6	379616	379621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315917
9022	NC_013501	TCCAG	2	10	379703	379712	20 %	20 %	20 %	40 %	268315917
9023	NC_013501	T	6	6	379744	379749	0 %	100 %	0 %	0 %	268315917
9024	NC_013501	CAC	2	6	379905	379910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315917
9025	NC_013501	G	6	6	379911	379916	0 %	0 %	100 %	0 %	268315917
9026	NC_013501	CCG	2	6	379972	379977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315917
9027	NC_013501	CGT	2	6	380081	380086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315917
9028	NC_013501	TGG	2	6	380105	380110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315917
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9030	NC_013501	CCCA	2	8	380239	380246	25 %	0 %	0 %	75 %	268315917
9031	NC_013501	TGT	2	6	380285	380290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315917
9032	NC_013501	GAA	2	6	380420	380425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315917
9033	NC_013501	TGC	2	6	380432	380437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315917
9034	NC_013501	CCA	2	6	380543	380548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315917
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9038	NC_013501	GGCGTT	2	12	380835	380846	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268315917
9039	NC_013501	C	6	6	380919	380924	0 %	0 %	0 %	100 %	268315917
9040	NC_013501	GTT	2	6	380985	380990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315917
9041	NC_013501	CCG	2	6	381064	381069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315917
9042	NC_013501	CCG	3	9	381214	381222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315917
9043	NC_013501	CCA	2	6	381257	381262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315917
9044	NC_013501	C	6	6	381357	381362	0 %	0 %	0 %	100 %	268315917
9045	NC_013501	CAG	2	6	381399	381404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315917
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9047	NC_013501	CGG	2	6	381449	381454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315917
9048	NC_013501	GCC	2	6	381558	381563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9049	NC_013501	CG	3	6	381716	381721	0 %	0 %	50 %	50 %	268315918
9050	NC_013501	CGT	2	6	381752	381757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315918
9051	NC_013501	CCG	2	6	381769	381774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315918
9052	NC_013501	CGT	2	6	381842	381847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315918
9053	NC_013501	CAG	2	6	381909	381914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315918
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9055	NC_013501	GAA	2	6	382052	382057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_013501	GCT	2	6	382208	382213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315919
9057	NC_013501	CGG	2	6	382231	382236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315919
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9059	NC_013501	GCC	2	6	382254	382259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315919
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9107	NC_013501	GTA	3	9	383857	383865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9121	NC_013501	CCA	3	9	384469	384477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315920
9122	NC_013501	CAG	2	6	384500	384505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315920
9123	NC_013501	TGA	2	6	384508	384513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315920
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9125	NC_013501	CCT	2	6	384547	384552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315920
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9134	NC_013501	GCG	3	9	384813	384821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315920
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9206	NC_013501	AGAA	2	8	387498	387505	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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9231	NC_013501	GC	3	6	388572	388577	0 %	0 %	50 %	50 %	268315925
9232	NC_013501	CTG	2	6	388710	388715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315925
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9239	NC_013501	CGGGC	2	10	389034	389043	0 %	0 %	60 %	40 %	268315925
9240	NC_013501	GCTGGT	2	12	389060	389071	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268315925
9241	NC_013501	CTG	2	6	389124	389129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315925
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9365	NC_013501	TCT	2	6	394565	394570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315929
9366	NC_013501	ACGA	2	8	394585	394592	50 %	0 %	25 %	25 %	268315929
9367	NC_013501	TCT	2	6	394616	394621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315929
9368	NC_013501	CGA	2	6	394656	394661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315929
9369	NC_013501	ACA	2	6	394685	394690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315929
9370	NC_013501	ACGG	2	8	394801	394808	25 %	0 %	50 %	25 %	268315929
9371	NC_013501	CGA	2	6	394836	394841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315929
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9373	NC_013501	AGC	2	6	394904	394909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315929
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9377	NC_013501	ACCTG	2	10	395000	395009	20 %	20 %	20 %	40 %	268315929
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9382	NC_013501	CGACG	2	10	395169	395178	20 %	0 %	40 %	40 %	268315929
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9402	NC_013501	GAAC	2	8	396267	396274	50 %	0 %	25 %	25 %	268315929
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9418	NC_013501	GCG	2	6	396954	396959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315929
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9420	NC_013501	CGG	2	6	397044	397049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315929
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9423	NC_013501	ACC	2	6	397186	397191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9424	NC_013501	TGGC	2	8	397219	397226	0 %	25 %	50 %	25 %	268315930
9425	NC_013501	TCGT	2	8	397351	397358	0 %	50 %	25 %	25 %	268315930
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9429	NC_013501	GCTG	2	8	397448	397455	0 %	25 %	50 %	25 %	268315930
9430	NC_013501	CCGG	2	8	397569	397576	0 %	0 %	50 %	50 %	268315930
9431	NC_013501	GCC	2	6	397600	397605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315930
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9444	NC_013501	CTG	2	6	398290	398295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315931
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9472	NC_013501	CCGA	2	8	399278	399285	25 %	0 %	25 %	50 %	268315931
9473	NC_013501	GCT	2	6	399288	399293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315931
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9481	NC_013501	CGC	2	6	399514	399519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315931
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9485	NC_013501	CTG	2	6	399638	399643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315932
9486	NC_013501	GCT	2	6	399670	399675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315932
9487	NC_013501	GAA	2	6	399739	399744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315932
9488	NC_013501	GCT	2	6	399784	399789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315932
9489	NC_013501	T	6	6	399845	399850	0 %	100 %	0 %	0 %	268315932
9490	NC_013501	GCT	2	6	399856	399861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315932
9491	NC_013501	GGGGC	2	10	399877	399886	0 %	0 %	80 %	20 %	268315932
9492	NC_013501	CG	3	6	399893	399898	0 %	0 %	50 %	50 %	268315932
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9494	NC_013501	TCA	2	6	399933	399938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315932
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