MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_013501	GGA	2	6	336560	336565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315884
8003	NC_013501	G	7	7	336569	336575	0 %	0 %	100 %	0 %	268315884
8004	NC_013501	GATT	2	8	336588	336595	25 %	50 %	25 %	0 %	268315884
8005	NC_013501	AACG	2	8	336630	336637	50 %	0 %	25 %	25 %	268315884
8006	NC_013501	CAG	2	6	336660	336665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315885
8007	NC_013501	CGT	2	6	336695	336700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315885
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8009	NC_013501	GCT	2	6	336728	336733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315885
8010	NC_013501	GCC	2	6	336735	336740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315885
8011	NC_013501	CAT	2	6	336783	336788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315885
8012	NC_013501	TAC	2	6	336801	336806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315885
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8015	NC_013501	CAT	2	6	336993	336998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315885
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8017	NC_013501	CGC	2	6	337082	337087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315885
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8022	NC_013501	CTG	2	6	337263	337268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315885
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8028	NC_013501	TGG	2	6	337603	337608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315885
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8032	NC_013501	GCT	2	6	337700	337705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315885
8033	NC_013501	GTC	2	6	337827	337832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315885
8034	NC_013501	CAAC	2	8	337845	337852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_013501	ACCA	2	8	337880	337887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8036	NC_013501	GCC	2	6	337928	337933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315886
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8040	NC_013501	CTG	2	6	338111	338116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315886
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8042	NC_013501	CAA	2	6	338233	338238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315887
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8044	NC_013501	CTG	3	9	338310	338318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315887
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8053	NC_013501	CAG	2	6	338562	338567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315887
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8126	NC_013501	CAT	2	6	341570	341575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315890
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8241	NC_013501	AGCC	2	8	345976	345983	25 %	0 %	25 %	50 %	268315893
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8365	NC_013501	GCA	2	6	350814	350819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315897
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8484	NC_013501	GCA	2	6	355686	355691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315900
8485	NC_013501	GCA	2	6	355707	355712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315900
8486	NC_013501	CAG	2	6	355719	355724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315900
8487	NC_013501	GC	3	6	355747	355752	0 %	0 %	50 %	50 %	268315900
8488	NC_013501	GCA	2	6	355768	355773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315900
8489	NC_013501	GCA	3	9	355776	355784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315900
8490	NC_013501	GCT	2	6	355803	355808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315900
8491	NC_013501	TGC	2	6	355812	355817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315900
8492	NC_013501	TGG	2	6	355843	355848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315900
8493	NC_013501	TCC	2	6	355905	355910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315900
8494	NC_013501	GGC	2	6	355980	355985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315900
8495	NC_013501	TGCAG	2	10	356031	356040	20 %	20 %	40 %	20 %	268315900
8496	NC_013501	GC	3	6	356043	356048	0 %	0 %	50 %	50 %	268315900
8497	NC_013501	GCT	2	6	356085	356090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315900
8498	NC_013501	GCTG	2	8	356153	356160	0 %	25 %	50 %	25 %	268315900
8499	NC_013501	GTT	2	6	356166	356171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315900
8500	NC_013501	GCC	2	6	356227	356232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315900

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