MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013501	CGG	2	6	316401	316406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315863
7502	NC_013501	TGA	2	6	316437	316442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315863
7503	NC_013501	TCGA	2	8	316489	316496	25 %	25 %	25 %	25 %	268315863
7504	NC_013501	TCG	2	6	316497	316502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7505	NC_013501	TGC	2	6	316541	316546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7506	NC_013501	TGT	2	6	316574	316579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315863
7507	NC_013501	AGC	2	6	316592	316597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7508	NC_013501	GCG	2	6	316610	316615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315863
7509	NC_013501	CAG	2	6	316696	316701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7510	NC_013501	CAG	2	6	316705	316710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7511	NC_013501	CAG	2	6	316735	316740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7512	NC_013501	CGT	2	6	316779	316784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7513	NC_013501	GCA	2	6	316785	316790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7514	NC_013501	CAG	2	6	316894	316899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7515	NC_013501	CAG	2	6	316918	316923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7516	NC_013501	AGC	2	6	316940	316945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7517	NC_013501	ACG	2	6	316955	316960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7518	NC_013501	GCC	2	6	316961	316966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315863
7519	NC_013501	GTC	2	6	316969	316974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7520	NC_013501	CAG	2	6	316984	316989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7521	NC_013501	CGGT	3	12	317024	317035	0 %	25 %	50 %	25 %	268315863
7522	NC_013501	GC	4	8	317106	317113	0 %	0 %	50 %	50 %	268315864
7523	NC_013501	CGCA	2	8	317134	317141	25 %	0 %	25 %	50 %	268315864
7524	NC_013501	TGTGGC	2	12	317234	317245	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268315864
7525	NC_013501	GCG	2	6	317284	317289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315864
7526	NC_013501	CGCC	2	8	317314	317321	0 %	0 %	25 %	75 %	268315864
7527	NC_013501	A	6	6	317529	317534	100 %	0 %	0 %	0 %	268315864
7528	NC_013501	CGTG	2	8	317537	317544	0 %	25 %	50 %	25 %	268315864
7529	NC_013501	GA	3	6	317548	317553	50 %	0 %	50 %	0 %	268315864
7530	NC_013501	ATC	2	6	317563	317568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315864
7531	NC_013501	GTG	2	6	317576	317581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_013501	ACG	2	6	317600	317605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_013501	ATT	2	6	317608	317613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_013501	CAACG	2	10	317652	317661	40 %	0 %	20 %	40 %	268315865
7535	NC_013501	GCCT	2	8	317672	317679	0 %	25 %	25 %	50 %	268315865
7536	NC_013501	CGCGG	2	10	317685	317694	0 %	0 %	60 %	40 %	268315865
7537	NC_013501	CTT	2	6	317695	317700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315865
7538	NC_013501	CAG	2	6	317720	317725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7539	NC_013501	AGG	2	6	317755	317760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315865
7540	NC_013501	GCC	2	6	317798	317803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315865
7541	NC_013501	GTA	2	6	317900	317905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315865
7542	NC_013501	TGC	2	6	317938	317943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7543	NC_013501	AGC	2	6	317955	317960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7544	NC_013501	TCA	2	6	317971	317976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315865
7545	NC_013501	CTG	2	6	318002	318007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7546	NC_013501	GCG	2	6	318025	318030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315865
7547	NC_013501	CGG	2	6	318037	318042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315865
7548	NC_013501	GCG	2	6	318051	318056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315865
7549	NC_013501	CCA	2	6	318139	318144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315865
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7551	NC_013501	AGC	2	6	318171	318176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7552	NC_013501	TGC	2	6	318313	318318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7553	NC_013501	GCT	2	6	318410	318415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7554	NC_013501	GCA	2	6	318449	318454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7555	NC_013501	GAA	2	6	318485	318490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315865
7556	NC_013501	CGG	2	6	318495	318500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315865
7557	NC_013501	CGT	2	6	318523	318528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7558	NC_013501	GGGC	2	8	318535	318542	0 %	0 %	75 %	25 %	268315865
7559	NC_013501	CTGCG	2	10	318545	318554	0 %	20 %	40 %	40 %	268315865
7560	NC_013501	AGC	4	12	318579	318590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7561	NC_013501	TGC	2	6	318592	318597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7562	NC_013501	TGG	2	6	318643	318648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_013501	CCT	2	6	318782	318787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315866
7564	NC_013501	GGC	2	6	318882	318887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315866
7565	NC_013501	CACC	2	8	318923	318930	25 %	0 %	0 %	75 %	268315866
7566	NC_013501	TGT	2	6	318950	318955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315866
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7568	NC_013501	GAC	2	6	319078	319083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315866
7569	NC_013501	GCC	2	6	319134	319139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315866
7570	NC_013501	CAG	2	6	319209	319214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315866
7571	NC_013501	GCG	2	6	319224	319229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315866
7572	NC_013501	ACG	2	6	319312	319317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315866
7573	NC_013501	TGA	2	6	319340	319345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315866
7574	NC_013501	AGC	2	6	319357	319362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315866
7575	NC_013501	ATCC	2	8	319448	319455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7576	NC_013501	TAA	2	6	319460	319465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_013501	ATT	2	6	319536	319541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_013501	GA	3	6	319625	319630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_013501	AAC	2	6	319850	319855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7580	NC_013501	GGC	2	6	319934	319939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315867
7581	NC_013501	TTC	2	6	320003	320008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315867
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7583	NC_013501	ATG	2	6	320085	320090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315867
7584	NC_013501	GGA	2	6	320191	320196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_013501	CAC	2	6	320198	320203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7586	NC_013501	GAT	2	6	320220	320225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315868
7587	NC_013501	TACG	2	8	320226	320233	25 %	25 %	25 %	25 %	268315868
7588	NC_013501	CGCGA	2	10	320234	320243	20 %	0 %	40 %	40 %	268315868
7589	NC_013501	GCA	2	6	320323	320328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315868
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7591	NC_013501	CAG	2	6	320411	320416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315868
7592	NC_013501	CG	3	6	320419	320424	0 %	0 %	50 %	50 %	268315868
7593	NC_013501	CCG	2	6	320439	320444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315868
7594	NC_013501	ACGAG	2	10	320464	320473	40 %	0 %	40 %	20 %	268315868
7595	NC_013501	AAG	2	6	320481	320486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315868
7596	NC_013501	CACGGC	2	12	320522	320533	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268315868
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7600	NC_013501	GTCCA	2	10	320628	320637	20 %	20 %	20 %	40 %	268315868
7601	NC_013501	CGC	2	6	320734	320739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315868
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7604	NC_013501	CTG	2	6	320822	320827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315868
7605	NC_013501	CCA	2	6	320845	320850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315868
7606	NC_013501	TGT	2	6	320875	320880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315868
7607	NC_013501	GCA	2	6	320900	320905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315868
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7609	NC_013501	TGGCGG	2	12	320926	320937	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	268315868
7610	NC_013501	GCC	2	6	320940	320945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315868
7611	NC_013501	CAG	2	6	320987	320992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315868
7612	NC_013501	CAG	2	6	321002	321007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315868
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7616	NC_013501	CGA	2	6	321092	321097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315868
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7618	NC_013501	GATC	2	8	321184	321191	25 %	25 %	25 %	25 %	268315868
7619	NC_013501	AATG	2	8	321250	321257	50 %	25 %	25 %	0 %	268315868
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7621	NC_013501	CGGA	2	8	321350	321357	25 %	0 %	50 %	25 %	268315868
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7744	NC_013501	GCGG	2	8	326232	326239	0 %	0 %	75 %	25 %	268315872
7745	NC_013501	CGC	2	6	326253	326258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315872
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7987	NC_013501	CTG	2	6	336076	336081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315883
7988	NC_013501	GCTG	2	8	336086	336093	0 %	25 %	50 %	25 %	268315883
7989	NC_013501	CGT	2	6	336123	336128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315883
7990	NC_013501	TGG	2	6	336137	336142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315883
7991	NC_013501	GCT	2	6	336174	336179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315883
7992	NC_013501	CGG	2	6	336193	336198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315883
7993	NC_013501	TATT	2	8	336235	336242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7994	NC_013501	GC	3	6	336303	336308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7995	NC_013501	GC	3	6	336449	336454	0 %	0 %	50 %	50 %	268315884
7996	NC_013501	CGG	2	6	336472	336477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315884
7997	NC_013501	GAT	2	6	336490	336495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315884
7998	NC_013501	GC	3	6	336498	336503	0 %	0 %	50 %	50 %	268315884
7999	NC_013501	TGC	2	6	336507	336512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315884
8000	NC_013501	ACG	2	6	336545	336550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315884

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