MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
77001	NC_013501	GCTGGA	2	12	3224522	3224533	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268318315
77002	NC_013501	GCA	2	6	3224555	3224560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318315
77003	NC_013501	GCC	2	6	3224576	3224581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318315
77004	NC_013501	GCT	2	6	3224602	3224607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318315
77005	NC_013501	GGGGC	2	10	3224615	3224624	0 %	0 %	80 %	20 %	268318315
77006	NC_013501	CAG	2	6	3224724	3224729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318315
77007	NC_013501	CGG	2	6	3224755	3224760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318315
77008	NC_013501	GCG	2	6	3224790	3224795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318316
77009	NC_013501	CGA	2	6	3224909	3224914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318316
77010	NC_013501	CAG	3	9	3224919	3224927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318316
77011	NC_013501	CGTG	2	8	3224952	3224959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77012	NC_013501	A	8	8	3224989	3224996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77013	NC_013501	TCA	2	6	3224998	3225003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77014	NC_013501	CAA	2	6	3225028	3225033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77015	NC_013501	A	6	6	3225032	3225037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77016	NC_013501	GCTC	2	8	3225077	3225084	0 %	25 %	25 %	50 %	268318317
77017	NC_013501	GGC	2	6	3225125	3225130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318317
77018	NC_013501	CCG	2	6	3225158	3225163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318317
77019	NC_013501	GC	3	6	3225221	3225226	0 %	0 %	50 %	50 %	268318317
77020	NC_013501	TCG	2	6	3225276	3225281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318317
77021	NC_013501	GTC	2	6	3225314	3225319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318317
77022	NC_013501	CGA	2	6	3225346	3225351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318317
77023	NC_013501	GCG	2	6	3225400	3225405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318317
77024	NC_013501	AGT	2	6	3225427	3225432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318317
77025	NC_013501	GTG	2	6	3225482	3225487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318317
77026	NC_013501	GCT	2	6	3225517	3225522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318317
77027	NC_013501	TCA	2	6	3225565	3225570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318317
77028	NC_013501	GCC	2	6	3225636	3225641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318317
77029	NC_013501	TCA	2	6	3225781	3225786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318317
77030	NC_013501	GC	3	6	3225878	3225883	0 %	0 %	50 %	50 %	268318317
77031	NC_013501	TCG	2	6	3225891	3225896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318317
77032	NC_013501	CTG	2	6	3225914	3225919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318317
77033	NC_013501	GAA	2	6	3226172	3226177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318317
77034	NC_013501	GTT	2	6	3226187	3226192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318317
77035	NC_013501	CTT	2	6	3226213	3226218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318317
77036	NC_013501	CGCC	2	8	3226279	3226286	0 %	0 %	25 %	75 %	268318317
77037	NC_013501	GCC	2	6	3226341	3226346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318317
77038	NC_013501	CGT	2	6	3226363	3226368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318317
77039	NC_013501	ACG	2	6	3226413	3226418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318317
77040	NC_013501	CAG	2	6	3226460	3226465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318317
77041	NC_013501	AGC	2	6	3226482	3226487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318317
77042	NC_013501	CCG	2	6	3226501	3226506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318317
77043	NC_013501	TTG	2	6	3226593	3226598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77044	NC_013501	CAAT	2	8	3226645	3226652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77045	NC_013501	TGACGC	2	12	3226690	3226701	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268318318
77046	NC_013501	GGC	2	6	3226748	3226753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318318
77047	NC_013501	GGA	2	6	3226805	3226810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318318
77048	NC_013501	GC	3	6	3226890	3226895	0 %	0 %	50 %	50 %	268318318
77049	NC_013501	CTG	2	6	3226929	3226934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318318
77050	NC_013501	ACC	2	6	3227070	3227075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318318
77051	NC_013501	ACCG	2	8	3227100	3227107	25 %	0 %	25 %	50 %	268318318
77052	NC_013501	GAA	2	6	3227133	3227138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318318
77053	NC_013501	GCG	2	6	3227153	3227158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318318
77054	NC_013501	CTG	2	6	3227211	3227216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318318
77055	NC_013501	CGGCTC	2	12	3227241	3227252	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	268318318
77056	NC_013501	GCT	2	6	3227264	3227269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318318
77057	NC_013501	GAG	2	6	3227322	3227327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318318
77058	NC_013501	C	6	6	3227338	3227343	0 %	0 %	0 %	100 %	268318318
77059	NC_013501	GCT	2	6	3227381	3227386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318318
77060	NC_013501	TCGGC	2	10	3227393	3227402	0 %	20 %	40 %	40 %	268318318
77061	NC_013501	GCT	2	6	3227411	3227416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318318
77062	NC_013501	GCCG	2	8	3227441	3227448	0 %	0 %	50 %	50 %	268318318
77063	NC_013501	GC	3	6	3227451	3227456	0 %	0 %	50 %	50 %	268318318
77064	NC_013501	ATCT	2	8	3227499	3227506	25 %	50 %	0 %	25 %	268318318
77065	NC_013501	GCT	2	6	3227537	3227542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318318
77066	NC_013501	GTAC	2	8	3227639	3227646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77067	NC_013501	CGG	2	6	3227654	3227659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77068	NC_013501	AACC	2	8	3227687	3227694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77069	NC_013501	TCG	2	6	3227726	3227731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318319
77070	NC_013501	CCCTG	2	10	3227734	3227743	0 %	20 %	20 %	60 %	268318319
77071	NC_013501	CTGG	2	8	3227759	3227766	0 %	25 %	50 %	25 %	268318319
77072	NC_013501	CAG	2	6	3227804	3227809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318319
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77076	NC_013501	GCCC	2	8	3228002	3228009	0 %	0 %	25 %	75 %	268318319
77077	NC_013501	CCGG	2	8	3228011	3228018	0 %	0 %	50 %	50 %	268318319
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77081	NC_013501	CGGC	2	8	3228184	3228191	0 %	0 %	50 %	50 %	268318319
77082	NC_013501	CAC	2	6	3228257	3228262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318319
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77089	NC_013501	TCA	2	6	3228749	3228754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318320
77090	NC_013501	CGT	2	6	3228762	3228767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318320
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77118	NC_013501	CG	4	8	3229751	3229758	0 %	0 %	50 %	50 %	268318320
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