MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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76502	NC_013501	GCT	2	6	3205672	3205677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318303
76503	NC_013501	GCA	3	9	3205678	3205686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318303
76504	NC_013501	CGG	2	6	3205711	3205716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318303
76505	NC_013501	CTG	2	6	3205724	3205729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318303
76506	NC_013501	ATG	2	6	3205733	3205738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318303
76507	NC_013501	CTG	2	6	3205748	3205753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318303
76508	NC_013501	GAG	2	6	3205808	3205813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318303
76509	NC_013501	GAA	2	6	3205859	3205864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318303
76510	NC_013501	GCT	2	6	3205891	3205896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318303
76511	NC_013501	ACG	2	6	3205904	3205909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318303
76512	NC_013501	ACC	2	6	3205986	3205991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318303
76513	NC_013501	CCA	2	6	3205995	3206000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318303
76514	NC_013501	ACG	2	6	3206010	3206015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318303
76515	NC_013501	GTG	2	6	3206024	3206029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318303
76516	NC_013501	CG	3	6	3206037	3206042	0 %	0 %	50 %	50 %	268318303
76517	NC_013501	ACG	2	6	3206087	3206092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318303
76518	NC_013501	GCG	3	9	3206151	3206159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318303
76519	NC_013501	CGG	2	6	3206196	3206201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318303
76520	NC_013501	CCG	2	6	3206202	3206207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318303
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76525	NC_013501	CG	3	6	3206420	3206425	0 %	0 %	50 %	50 %	268318303
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76529	NC_013501	CTG	2	6	3206567	3206572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318304
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76533	NC_013501	GCG	2	6	3206640	3206645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318304
76534	NC_013501	TGA	2	6	3206658	3206663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318304
76535	NC_013501	GGCCG	2	10	3206666	3206675	0 %	0 %	60 %	40 %	268318304
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76539	NC_013501	CGC	2	6	3206950	3206955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318304
76540	NC_013501	CGGC	2	8	3206979	3206986	0 %	0 %	50 %	50 %	268318304
76541	NC_013501	CGA	2	6	3207052	3207057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318305
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76544	NC_013501	CGT	2	6	3207236	3207241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318305
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76550	NC_013501	AGG	2	6	3207565	3207570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318305
76551	NC_013501	CGT	3	9	3207575	3207583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318305
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76559	NC_013501	CATCGC	2	12	3207830	3207841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268318305
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76598	NC_013501	CGT	2	6	3209294	3209299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318305
76599	NC_013501	GCC	2	6	3209411	3209416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76600	NC_013501	ACGG	2	8	3209425	3209432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76601	NC_013501	ACC	2	6	3209502	3209507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318306
76602	NC_013501	ACCT	2	8	3209553	3209560	25 %	25 %	0 %	50 %	268318306
76603	NC_013501	GGT	2	6	3209576	3209581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318306
76604	NC_013501	CGA	2	6	3209618	3209623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318306
76605	NC_013501	CG	4	8	3209750	3209757	0 %	0 %	50 %	50 %	268318306
76606	NC_013501	GAC	2	6	3209805	3209810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318306
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76608	NC_013501	GCT	2	6	3209936	3209941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318306
76609	NC_013501	GGCG	2	8	3209942	3209949	0 %	0 %	75 %	25 %	268318306
76610	NC_013501	AAGG	2	8	3209997	3210004	50 %	0 %	50 %	0 %	268318306
76611	NC_013501	TTC	2	6	3210027	3210032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318306
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76615	NC_013501	GCCG	2	8	3210162	3210169	0 %	0 %	50 %	50 %	268318307
76616	NC_013501	CTG	2	6	3210395	3210400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318307
76617	NC_013501	GCT	2	6	3210409	3210414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318307
76618	NC_013501	TGC	2	6	3210447	3210452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318307
76619	NC_013501	CGA	2	6	3210457	3210462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318307
76620	NC_013501	CGA	2	6	3210475	3210480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318307
76621	NC_013501	CTG	2	6	3210497	3210502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318307
76622	NC_013501	CTG	2	6	3210506	3210511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318307
76623	NC_013501	CGCC	2	8	3210553	3210560	0 %	0 %	25 %	75 %	268318307
76624	NC_013501	GTG	2	6	3210572	3210577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318307
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76626	NC_013501	CGA	2	6	3210652	3210657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318307
76627	NC_013501	CAT	2	6	3210673	3210678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318307
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76633	NC_013501	CTG	2	6	3210920	3210925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318307
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76639	NC_013501	GCA	2	6	3211297	3211302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318308
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76645	NC_013501	CGG	2	6	3211463	3211468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318308
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76650	NC_013501	GCG	2	6	3211536	3211541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318308
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76684	NC_013501	CCGG	2	8	3212787	3212794	0 %	0 %	50 %	50 %	268318309
76685	NC_013501	GGA	2	6	3212819	3212824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318309
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76701	NC_013501	GGCG	2	8	3213397	3213404	0 %	0 %	75 %	25 %	268318310
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76703	NC_013501	CGG	2	6	3213417	3213422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318310
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76711	NC_013501	CGCTT	2	10	3213818	3213827	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76712	NC_013501	CCG	2	6	3213877	3213882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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76715	NC_013501	CCG	2	6	3214048	3214053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76716	NC_013501	C	8	8	3214080	3214087	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76717	NC_013501	GTA	2	6	3214166	3214171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76718	NC_013501	ATG	2	6	3214207	3214212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76719	NC_013501	TG	3	6	3214220	3214225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76720	NC_013501	CGC	2	6	3214226	3214231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76721	NC_013501	GCG	2	6	3214267	3214272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318311
76722	NC_013501	TGCGT	2	10	3214292	3214301	0 %	40 %	40 %	20 %	268318311
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76724	NC_013501	CG	3	6	3214417	3214422	0 %	0 %	50 %	50 %	268318311
76725	NC_013501	GCTC	2	8	3214462	3214469	0 %	25 %	25 %	50 %	268318311
76726	NC_013501	AGC	2	6	3214533	3214538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318311
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76728	NC_013501	GCG	2	6	3214595	3214600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318311
76729	NC_013501	TGC	2	6	3214614	3214619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318311
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76731	NC_013501	CGG	2	6	3214688	3214693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318311
76732	NC_013501	CGG	2	6	3214695	3214700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318311
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