MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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76002	NC_013501	GCA	2	6	3184379	3184384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318289
76003	NC_013501	TTC	2	6	3184443	3184448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318289
76004	NC_013501	CGGC	2	8	3184475	3184482	0 %	0 %	50 %	50 %	268318289
76005	NC_013501	CAC	2	6	3184488	3184493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318289
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76007	NC_013501	GCG	2	6	3184532	3184537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318289
76008	NC_013501	A	7	7	3184635	3184641	100 %	0 %	0 %	0 %	268318289
76009	NC_013501	GCC	2	6	3184675	3184680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318289
76010	NC_013501	CAG	2	6	3184719	3184724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318289
76011	NC_013501	GT	3	6	3184787	3184792	0 %	50 %	50 %	0 %	268318289
76012	NC_013501	GTC	2	6	3184915	3184920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318290
76013	NC_013501	AGG	2	6	3184954	3184959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318290
76014	NC_013501	GTA	2	6	3185009	3185014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76015	NC_013501	AAAG	2	8	3185042	3185049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76016	NC_013501	CTA	2	6	3185094	3185099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76017	NC_013501	CCCA	2	8	3185110	3185117	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
76018	NC_013501	ACGCG	2	10	3185234	3185243	20 %	0 %	40 %	40 %	268318291
76019	NC_013501	AGC	2	6	3185314	3185319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318291
76020	NC_013501	TGG	2	6	3185389	3185394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318291
76021	NC_013501	ATG	2	6	3185433	3185438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318291
76022	NC_013501	TAC	2	6	3185472	3185477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318291
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76029	NC_013501	ACG	2	6	3185739	3185744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318291
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76031	NC_013501	CG	4	8	3185841	3185848	0 %	0 %	50 %	50 %	268318291
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76035	NC_013501	TATC	2	8	3186356	3186363	25 %	50 %	0 %	25 %	268318291
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76118	NC_013501	CGA	2	6	3189795	3189800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318293
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76123	NC_013501	AACCTG	2	12	3189946	3189957	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268318293
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76136	NC_013501	A	6	6	3190480	3190485	100 %	0 %	0 %	0 %	268318293
76137	NC_013501	CG	4	8	3190500	3190507	0 %	0 %	50 %	50 %	268318293
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76143	NC_013501	CGCC	2	8	3190871	3190878	0 %	0 %	25 %	75 %	268318293
76144	NC_013501	GCC	2	6	3190906	3190911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318293
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76194	NC_013501	AGC	2	6	3193006	3193011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318294
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76197	NC_013501	GCC	3	9	3193074	3193082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318294
76198	NC_013501	GCG	2	6	3193143	3193148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318294
76199	NC_013501	GGCCG	2	10	3193187	3193196	0 %	0 %	60 %	40 %	268318294
76200	NC_013501	GCA	3	9	3193202	3193210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318294
76201	NC_013501	CGG	2	6	3193271	3193276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76202	NC_013501	ACCGA	2	10	3193307	3193316	40 %	0 %	20 %	40 %	268318295
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76204	NC_013501	CAG	2	6	3193380	3193385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318295
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76206	NC_013501	CGC	2	6	3193460	3193465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318295
76207	NC_013501	CAG	2	6	3193476	3193481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318295
76208	NC_013501	GGC	2	6	3193486	3193491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318295
76209	NC_013501	CGC	2	6	3193506	3193511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318295
76210	NC_013501	CGG	2	6	3193528	3193533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318295
76211	NC_013501	GCGCC	2	10	3193586	3193595	0 %	0 %	40 %	60 %	268318295
76212	NC_013501	GC	4	8	3193609	3193616	0 %	0 %	50 %	50 %	268318295
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76217	NC_013501	CCA	2	6	3193769	3193774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318295
76218	NC_013501	CGG	2	6	3193785	3193790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318295
76219	NC_013501	GCA	2	6	3193820	3193825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318295
76220	NC_013501	GGC	2	6	3193829	3193834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318295
76221	NC_013501	GCC	2	6	3193877	3193882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318295
76222	NC_013501	GCT	2	6	3193940	3193945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318295
76223	NC_013501	GGC	2	6	3194028	3194033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318296
76224	NC_013501	CGA	2	6	3194050	3194055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318296
76225	NC_013501	AGC	2	6	3194056	3194061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318296
76226	NC_013501	CCGG	2	8	3194126	3194133	0 %	0 %	50 %	50 %	268318296
76227	NC_013501	CCT	2	6	3194156	3194161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318296
76228	NC_013501	CGG	2	6	3194196	3194201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318296
76229	NC_013501	TCC	2	6	3194212	3194217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318296
76230	NC_013501	TCT	2	6	3194228	3194233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318296
76231	NC_013501	GCTCCC	2	12	3194240	3194251	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	268318296
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76463	NC_013501	GCCA	2	8	3204163	3204170	25 %	0 %	25 %	50 %	268318300
76464	NC_013501	CTT	2	6	3204242	3204247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76465	NC_013501	AGT	2	6	3204319	3204324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318301
76466	NC_013501	GT	3	6	3204323	3204328	0 %	50 %	50 %	0 %	268318301
76467	NC_013501	ATC	2	6	3204418	3204423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318301
76468	NC_013501	AGCGTG	2	12	3204424	3204435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268318301
76469	NC_013501	AAC	2	6	3204451	3204456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318301
76470	NC_013501	CCA	2	6	3204458	3204463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318301
76471	NC_013501	GGC	2	6	3204500	3204505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318301
76472	NC_013501	CAC	2	6	3204519	3204524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318301
76473	NC_013501	CAC	2	6	3204597	3204602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318301
76474	NC_013501	AGC	2	6	3204610	3204615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318301
76475	NC_013501	CGCA	2	8	3204616	3204623	25 %	0 %	25 %	50 %	268318301
76476	NC_013501	CGC	2	6	3204688	3204693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76477	NC_013501	GC	3	6	3204703	3204708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76478	NC_013501	C	9	9	3204733	3204741	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76479	NC_013501	GCG	2	6	3204759	3204764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76480	NC_013501	T	6	6	3204827	3204832	0 %	100 %	0 %	0 %	268318302
76481	NC_013501	GCG	3	9	3204833	3204841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318302
76482	NC_013501	CGTG	2	8	3204889	3204896	0 %	25 %	50 %	25 %	268318302
76483	NC_013501	CGGCT	2	10	3204912	3204921	0 %	20 %	40 %	40 %	268318302
76484	NC_013501	TACG	2	8	3204924	3204931	25 %	25 %	25 %	25 %	268318302
76485	NC_013501	GCT	2	6	3204986	3204991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76486	NC_013501	CGCC	2	8	3204996	3205003	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76487	NC_013501	GCGG	2	8	3205028	3205035	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76488	NC_013501	ACGA	2	8	3205158	3205165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76489	NC_013501	C	6	6	3205260	3205265	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76490	NC_013501	T	6	6	3205288	3205293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76491	NC_013501	GCGG	2	8	3205303	3205310	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76492	NC_013501	GCCT	2	8	3205331	3205338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76493	NC_013501	AGG	2	6	3205346	3205351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76494	NC_013501	CCT	2	6	3205396	3205401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76495	NC_013501	T	8	8	3205428	3205435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76496	NC_013501	CTT	4	12	3205458	3205469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76497	NC_013501	TCA	2	6	3205525	3205530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76498	NC_013501	ATT	2	6	3205557	3205562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76499	NC_013501	TCA	2	6	3205597	3205602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76500	NC_013501	CAT	2	6	3205612	3205617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318303

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