MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75002	NC_013501	CGA	2	6	3145054	3145059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318254
75003	NC_013501	GTA	2	6	3145088	3145093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318254
75004	NC_013501	CCGG	2	8	3145135	3145142	0 %	0 %	50 %	50 %	268318254
75005	NC_013501	CGGC	2	8	3145144	3145151	0 %	0 %	50 %	50 %	268318254
75006	NC_013501	CGC	2	6	3145179	3145184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318254
75007	NC_013501	GCA	2	6	3145213	3145218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318254
75008	NC_013501	A	6	6	3145223	3145228	100 %	0 %	0 %	0 %	268318254
75009	NC_013501	GCA	2	6	3145237	3145242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318254
75010	NC_013501	GC	3	6	3145352	3145357	0 %	0 %	50 %	50 %	268318255
75011	NC_013501	GGC	2	6	3145359	3145364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318255
75012	NC_013501	ACG	2	6	3145412	3145417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318255
75013	NC_013501	CAGC	2	8	3145422	3145429	25 %	0 %	25 %	50 %	268318255
75014	NC_013501	GC	3	6	3145428	3145433	0 %	0 %	50 %	50 %	268318255
75015	NC_013501	CGG	2	6	3145444	3145449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318255
75016	NC_013501	CAC	2	6	3145477	3145482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318255
75017	NC_013501	CAC	3	9	3145507	3145515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318255
75018	NC_013501	ACG	2	6	3145544	3145549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318255
75019	NC_013501	CAC	2	6	3145579	3145584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318255
75020	NC_013501	CCG	3	9	3145590	3145598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318255
75021	NC_013501	ACC	2	6	3145610	3145615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318255
75022	NC_013501	CGTGCA	2	12	3145638	3145649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268318255
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75024	NC_013501	CGCC	2	8	3145713	3145720	0 %	0 %	25 %	75 %	268318255
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75028	NC_013501	GC	3	6	3145855	3145860	0 %	0 %	50 %	50 %	268318255
75029	NC_013501	CG	3	6	3145864	3145869	0 %	0 %	50 %	50 %	268318255
75030	NC_013501	GGCG	2	8	3145947	3145954	0 %	0 %	75 %	25 %	268318255
75031	NC_013501	GCGG	2	8	3146176	3146183	0 %	0 %	75 %	25 %	268318255
75032	NC_013501	GGC	2	6	3146224	3146229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318255
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75034	NC_013501	GACC	2	8	3146400	3146407	25 %	0 %	25 %	50 %	268318255
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75052	NC_013501	CGT	2	6	3147260	3147265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318256
75053	NC_013501	GAAGC	2	10	3147335	3147344	40 %	0 %	40 %	20 %	268318256
75054	NC_013501	TCG	2	6	3147349	3147354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318256
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75115	NC_013501	CGA	2	6	3149716	3149721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318258
75116	NC_013501	AGC	2	6	3149733	3149738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318258
75117	NC_013501	CCG	2	6	3149762	3149767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318258
75118	NC_013501	GGT	2	6	3149805	3149810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318258
75119	NC_013501	CGG	3	9	3149830	3149838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318258
75120	NC_013501	CAG	2	6	3149867	3149872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318258
75121	NC_013501	TCC	2	6	3149925	3149930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75122	NC_013501	GC	3	6	3149952	3149957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75123	NC_013501	TG	3	6	3149977	3149982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75124	NC_013501	ACC	2	6	3150013	3150018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75125	NC_013501	CTG	2	6	3150051	3150056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318259
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75135	NC_013501	CAT	2	6	3150521	3150526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318259
75136	NC_013501	GGGC	2	8	3150527	3150534	0 %	0 %	75 %	25 %	268318259
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75142	NC_013501	GCC	2	6	3150783	3150788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318259
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75145	NC_013501	GACCA	2	10	3150867	3150876	40 %	0 %	20 %	40 %	268318259
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75150	NC_013501	GGT	2	6	3150974	3150979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318259
75151	NC_013501	GCG	2	6	3150992	3150997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318259
75152	NC_013501	GCC	2	6	3151133	3151138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318259
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75155	NC_013501	CTG	2	6	3151179	3151184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318259
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75158	NC_013501	T	6	6	3151396	3151401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75159	NC_013501	TTC	2	6	3151469	3151474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318260
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75162	NC_013501	GGC	2	6	3151493	3151498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318260
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75171	NC_013501	CGCC	2	8	3151960	3151967	0 %	0 %	25 %	75 %	268318260
75172	NC_013501	TCG	2	6	3151968	3151973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318260
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75175	NC_013501	T	6	6	3152251	3152256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75176	NC_013501	CGCA	2	8	3152266	3152273	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75177	NC_013501	ACG	2	6	3152299	3152304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318261
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75185	NC_013501	TCCAGC	2	12	3152517	3152528	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268318261
75186	NC_013501	GCTTCG	2	12	3152529	3152540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318261
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75189	NC_013501	GCA	2	6	3152635	3152640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318261
75190	NC_013501	GTCT	2	8	3152656	3152663	0 %	50 %	25 %	25 %	268318261
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75200	NC_013501	GCC	2	6	3153118	3153123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318261
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75204	NC_013501	CG	3	6	3153396	3153401	0 %	0 %	50 %	50 %	268318261
75205	NC_013501	CCA	2	6	3153403	3153408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318261
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75210	NC_013501	CGT	2	6	3153557	3153562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318261
75211	NC_013501	ACG	2	6	3153573	3153578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318261
75212	NC_013501	CCA	2	6	3153580	3153585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318261
75213	NC_013501	TTTTC	2	10	3153655	3153664	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75214	NC_013501	CTG	2	6	3153735	3153740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318262
75215	NC_013501	GCCGTC	2	12	3153827	3153838	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	268318262
75216	NC_013501	GAT	2	6	3153960	3153965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318262
75217	NC_013501	CCAG	2	8	3154010	3154017	25 %	0 %	25 %	50 %	268318262
75218	NC_013501	GCT	2	6	3154064	3154069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318262
75219	NC_013501	ACG	2	6	3154099	3154104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318262
75220	NC_013501	AGC	2	6	3154105	3154110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318262
75221	NC_013501	CGA	2	6	3154138	3154143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318262
75222	NC_013501	ACG	2	6	3154192	3154197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318262
75223	NC_013501	A	7	7	3154198	3154204	100 %	0 %	0 %	0 %	268318262
75224	NC_013501	GAA	2	6	3154253	3154258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318262
75225	NC_013501	TGC	2	6	3154280	3154285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75226	NC_013501	CCA	2	6	3154361	3154366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318263
75227	NC_013501	GCC	2	6	3154447	3154452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318263
75228	NC_013501	GCG	2	6	3154463	3154468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318263
75229	NC_013501	CAG	2	6	3154485	3154490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318263
75230	NC_013501	CCG	2	6	3154571	3154576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318263
75231	NC_013501	CAC	2	6	3154596	3154601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318263
75232	NC_013501	TCGG	2	8	3154738	3154745	0 %	25 %	50 %	25 %	268318263
75233	NC_013501	GCGG	2	8	3154764	3154771	0 %	0 %	75 %	25 %	268318263
75234	NC_013501	GCCG	2	8	3154776	3154783	0 %	0 %	50 %	50 %	268318263
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75236	NC_013501	GCTC	2	8	3154871	3154878	0 %	25 %	25 %	50 %	268318263
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75277	NC_013501	CCG	2	6	3156459	3156464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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75322	NC_013501	A	7	7	3158330	3158336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75323	NC_013501	CA	3	6	3158344	3158349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75324	NC_013501	CCT	2	6	3158351	3158356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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75328	NC_013501	CAA	2	6	3158543	3158548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75329	NC_013501	CCGCT	2	10	3158572	3158581	0 %	20 %	20 %	60 %	268318266
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75335	NC_013501	ACG	2	6	3158862	3158867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318266
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75339	NC_013501	GCG	2	6	3159135	3159140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318266
75340	NC_013501	TCG	2	6	3159180	3159185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318266
75341	NC_013501	GC	3	6	3159192	3159197	0 %	0 %	50 %	50 %	268318266
75342	NC_013501	CGG	2	6	3159234	3159239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318266
75343	NC_013501	ACG	2	6	3159354	3159359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318266
75344	NC_013501	GGCCG	2	10	3159403	3159412	0 %	0 %	60 %	40 %	268318266
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75346	NC_013501	TGG	2	6	3159462	3159467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318266
75347	NC_013501	GAC	2	6	3159688	3159693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318266
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75349	NC_013501	TGC	2	6	3159714	3159719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318266
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75359	NC_013501	CACTG	2	10	3160088	3160097	20 %	20 %	20 %	40 %	268318267
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75366	NC_013501	TCG	2	6	3160277	3160282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318267
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75395	NC_013501	GTTG	2	8	3161401	3161408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75396	NC_013501	GCA	2	6	3161461	3161466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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75400	NC_013501	GCA	3	9	3161642	3161650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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75433	NC_013501	GC	3	6	3163160	3163165	0 %	0 %	50 %	50 %	268318270
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75435	NC_013501	CGT	2	6	3163219	3163224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318270
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75437	NC_013501	ACGCA	2	10	3163277	3163286	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75438	NC_013501	CGA	2	6	3163381	3163386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318271
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75445	NC_013501	CGCC	2	8	3163582	3163589	0 %	0 %	25 %	75 %	268318271
75446	NC_013501	CGCCAT	2	12	3163645	3163656	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268318271
75447	NC_013501	GCT	2	6	3163729	3163734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318271
75448	NC_013501	GCG	2	6	3163770	3163775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318271
75449	NC_013501	AGG	2	6	3163776	3163781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318271
75450	NC_013501	GCG	2	6	3163783	3163788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318271
75451	NC_013501	CAC	2	6	3163798	3163803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318271
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75456	NC_013501	TGG	2	6	3164061	3164066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318271
75457	NC_013501	CGA	2	6	3164077	3164082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318271
75458	NC_013501	GGC	2	6	3164135	3164140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318271
75459	NC_013501	GCCGC	2	10	3164161	3164170	0 %	0 %	40 %	60 %	268318271
75460	NC_013501	GAG	2	6	3164243	3164248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318271
75461	NC_013501	CGC	2	6	3164253	3164258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318271
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75494	NC_013501	GCT	2	6	3165547	3165552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318271
75495	NC_013501	GC	3	6	3165569	3165574	0 %	0 %	50 %	50 %	268318271
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