MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013501	CCGT	2	8	294736	294743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7002	NC_013501	ACA	2	6	294751	294756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_013501	ACC	2	6	294770	294775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7004	NC_013501	TCTGG	2	10	294802	294811	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7005	NC_013501	GCC	2	6	294823	294828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315852
7006	NC_013501	CTG	2	6	294869	294874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315852
7007	NC_013501	GGCC	2	8	294948	294955	0 %	0 %	50 %	50 %	268315852
7008	NC_013501	GCT	2	6	295021	295026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315852
7009	NC_013501	CTGG	2	8	295048	295055	0 %	25 %	50 %	25 %	268315852
7010	NC_013501	GAG	2	6	295076	295081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315852
7011	NC_013501	CGG	3	9	295129	295137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315852
7012	NC_013501	TGC	3	9	295149	295157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315852
7013	NC_013501	G	6	6	295187	295192	0 %	0 %	100 %	0 %	268315852
7014	NC_013501	GCGTCG	2	12	295205	295216	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268315852
7015	NC_013501	CGG	3	9	295345	295353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315852
7016	NC_013501	AGC	2	6	295413	295418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315852
7017	NC_013501	GC	3	6	295442	295447	0 %	0 %	50 %	50 %	268315852
7018	NC_013501	TCT	2	6	295449	295454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315852
7019	NC_013501	CCGCG	2	10	295460	295469	0 %	0 %	40 %	60 %	268315852
7020	NC_013501	CG	4	8	295466	295473	0 %	0 %	50 %	50 %	268315852
7021	NC_013501	TGC	2	6	295512	295517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315852
7022	NC_013501	TGGA	2	8	295532	295539	25 %	25 %	50 %	0 %	268315852
7023	NC_013501	AGC	2	6	295571	295576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315852
7024	NC_013501	CGCT	2	8	295589	295596	0 %	25 %	25 %	50 %	268315852
7025	NC_013501	GGA	2	6	295597	295602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315852
7026	NC_013501	GC	3	6	295632	295637	0 %	0 %	50 %	50 %	268315852
7027	NC_013501	GAA	2	6	295658	295663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315852
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7029	NC_013501	GAC	2	6	295825	295830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315853
7030	NC_013501	TGC	2	6	296088	296093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315853
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7032	NC_013501	GCTC	2	8	296142	296149	0 %	25 %	25 %	50 %	268315853
7033	NC_013501	CTA	2	6	296281	296286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315853
7034	NC_013501	ATCGGG	2	12	296390	296401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268315853
7035	NC_013501	CCG	2	6	296510	296515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315853
7036	NC_013501	CAT	2	6	296524	296529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315853
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7039	NC_013501	AAG	2	6	296615	296620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315853
7040	NC_013501	GGC	2	6	296668	296673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315853
7041	NC_013501	GTG	2	6	296744	296749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315853
7042	NC_013501	TCG	2	6	296763	296768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315853
7043	NC_013501	GAG	2	6	296798	296803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315853
7044	NC_013501	CGT	2	6	296871	296876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_013501	GGCT	2	8	296909	296916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7046	NC_013501	A	7	7	296954	296960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_013501	T	6	6	296987	296992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_013501	CGG	2	6	297007	297012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_013501	AGG	2	6	297020	297025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_013501	GT	3	6	297152	297157	0 %	50 %	50 %	0 %	268315854
7051	NC_013501	CAA	2	6	297159	297164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315854
7052	NC_013501	ACT	2	6	297305	297310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315854
7053	NC_013501	TGC	2	6	297323	297328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315854
7054	NC_013501	CTG	2	6	297367	297372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315854
7055	NC_013501	GCC	2	6	297379	297384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315854
7056	NC_013501	CGGC	2	8	297440	297447	0 %	0 %	50 %	50 %	268315854
7057	NC_013501	TGA	2	6	297449	297454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315854
7058	NC_013501	T	6	6	297455	297460	0 %	100 %	0 %	0 %	268315854
7059	NC_013501	GCAGC	2	10	297495	297504	20 %	0 %	40 %	40 %	268315854
7060	NC_013501	GTG	2	6	297514	297519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315854
7061	NC_013501	TGG	2	6	297521	297526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315854
7062	NC_013501	TCGA	2	8	297556	297563	25 %	25 %	25 %	25 %	268315854
7063	NC_013501	GGC	2	6	297585	297590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315854
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7065	NC_013501	GGCC	2	8	297699	297706	0 %	0 %	50 %	50 %	268315854
7066	NC_013501	TCG	2	6	297728	297733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315854
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7069	NC_013501	CAT	2	6	297843	297848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315854
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7071	NC_013501	GAG	2	6	297874	297879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315854
7072	NC_013501	GAC	2	6	297898	297903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315854
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7074	NC_013501	GAGCTG	2	12	298024	298035	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268315854
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7077	NC_013501	CT	3	6	298126	298131	0 %	50 %	0 %	50 %	268315854
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7088	NC_013501	GAG	2	6	298617	298622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315855
7089	NC_013501	GCC	2	6	298626	298631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315855
7090	NC_013501	GCG	3	9	298663	298671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315855
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7092	NC_013501	GACCGA	2	12	298820	298831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315855
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7108	NC_013501	CCGGC	2	10	299373	299382	0 %	0 %	40 %	60 %	268315855
7109	NC_013501	GCT	2	6	299438	299443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315855
7110	NC_013501	GAG	2	6	299460	299465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315855
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7112	NC_013501	GCG	3	9	299496	299504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315855
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7118	NC_013501	CTTT	2	8	299704	299711	0 %	75 %	0 %	25 %	268315855
7119	NC_013501	CG	3	6	299750	299755	0 %	0 %	50 %	50 %	268315855
7120	NC_013501	TGC	2	6	299845	299850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7122	NC_013501	TAT	2	6	299873	299878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268315856
7123	NC_013501	ACT	2	6	299906	299911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315856
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7153	NC_013501	ACC	2	6	301348	301353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315856
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7242	NC_013501	TCG	2	6	305606	305611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315857
7243	NC_013501	TCT	2	6	305627	305632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315857
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7250	NC_013501	GCG	2	6	306054	306059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315857
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7252	NC_013501	CGG	2	6	306149	306154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315857
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7254	NC_013501	TCGC	2	8	306168	306175	0 %	25 %	25 %	50 %	268315857
7255	NC_013501	GTG	2	6	306193	306198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315857
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7260	NC_013501	ACG	2	6	306365	306370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315857
7261	NC_013501	TGA	2	6	306389	306394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315857
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7263	NC_013501	A	6	6	306488	306493	100 %	0 %	0 %	0 %	268315857
7264	NC_013501	CAT	2	6	306507	306512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315857
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7269	NC_013501	CGA	2	6	306710	306715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315858
7270	NC_013501	CCGG	2	8	306738	306745	0 %	0 %	50 %	50 %	268315858
7271	NC_013501	CG	3	6	306760	306765	0 %	0 %	50 %	50 %	268315858
7272	NC_013501	TGGC	2	8	306792	306799	0 %	25 %	50 %	25 %	268315858
7273	NC_013501	CGTGGC	2	12	306818	306829	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268315858
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7294	NC_013501	CAA	2	6	307586	307591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7342	NC_013501	GCT	2	6	309948	309953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315860
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7362	NC_013501	TCGT	2	8	310795	310802	0 %	50 %	25 %	25 %	268315860
7363	NC_013501	TGG	2	6	310888	310893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315860
7364	NC_013501	AGC	2	6	311020	311025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315860
7365	NC_013501	TGC	2	6	311081	311086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315860
7366	NC_013501	GC	3	6	311093	311098	0 %	0 %	50 %	50 %	268315860
7367	NC_013501	GCC	2	6	311133	311138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315860
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7372	NC_013501	GTC	2	6	311407	311412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315860
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7374	NC_013501	TCA	2	6	311477	311482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315860
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7376	NC_013501	CTGG	2	8	311574	311581	0 %	25 %	50 %	25 %	268315860
7377	NC_013501	ACG	2	6	311648	311653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315860
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7399	NC_013501	CTG	2	6	312739	312744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315860
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7480	NC_013501	GAC	2	6	315775	315780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7481	NC_013501	GCAG	2	8	315837	315844	25 %	0 %	50 %	25 %	268315863
7482	NC_013501	GCG	2	6	315869	315874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315863
7483	NC_013501	CAT	2	6	315939	315944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315863
7484	NC_013501	AAT	2	6	315945	315950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268315863
7485	NC_013501	CGC	2	6	315951	315956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315863
7486	NC_013501	CCT	2	6	315960	315965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315863
7487	NC_013501	GGGCA	2	10	315970	315979	20 %	0 %	60 %	20 %	268315863
7488	NC_013501	GGC	2	6	315982	315987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315863
7489	NC_013501	GCA	2	6	316023	316028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7490	NC_013501	GCT	2	6	316032	316037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7491	NC_013501	CTG	2	6	316051	316056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7492	NC_013501	GGC	2	6	316123	316128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315863
7493	NC_013501	GC	3	6	316176	316181	0 %	0 %	50 %	50 %	268315863
7494	NC_013501	GGCCCA	2	12	316194	316205	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268315863
7495	NC_013501	GCA	2	6	316239	316244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7496	NC_013501	CAGG	2	8	316277	316284	25 %	0 %	50 %	25 %	268315863
7497	NC_013501	CTT	2	6	316290	316295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315863
7498	NC_013501	GGC	2	6	316317	316322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315863
7499	NC_013501	GTT	2	6	316326	316331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315863
7500	NC_013501	GGC	2	6	316343	316348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315863

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