MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_013501	GCG	2	6	3105221	3105226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318220
74002	NC_013501	CGC	2	6	3105266	3105271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318220
74003	NC_013501	ATG	2	6	3105304	3105309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318220
74004	NC_013501	CCGG	2	8	3105557	3105564	0 %	0 %	50 %	50 %	268318220
74005	NC_013501	TCC	2	6	3105622	3105627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318220
74006	NC_013501	AGC	2	6	3105670	3105675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318220
74007	NC_013501	CGC	2	6	3105676	3105681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318220
74008	NC_013501	CGGC	2	8	3105704	3105711	0 %	0 %	50 %	50 %	268318220
74009	NC_013501	AGC	2	6	3105728	3105733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318220
74010	NC_013501	CCT	2	6	3105794	3105799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318220
74011	NC_013501	TGTC	2	8	3105835	3105842	0 %	50 %	25 %	25 %	268318220
74012	NC_013501	AGCAGG	2	12	3105928	3105939	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74013	NC_013501	CA	3	6	3105948	3105953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74014	NC_013501	CTG	2	6	3106001	3106006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318221
74015	NC_013501	TGC	2	6	3106011	3106016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318221
74016	NC_013501	TGGCCG	2	12	3106017	3106028	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268318221
74017	NC_013501	CTA	2	6	3106057	3106062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318221
74018	NC_013501	CA	4	8	3106082	3106089	50 %	0 %	0 %	50 %	268318221
74019	NC_013501	CG	3	6	3106098	3106103	0 %	0 %	50 %	50 %	268318221
74020	NC_013501	CCG	2	6	3106145	3106150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318221
74021	NC_013501	CGGC	2	8	3106177	3106184	0 %	0 %	50 %	50 %	268318221
74022	NC_013501	CA	3	6	3106214	3106219	50 %	0 %	0 %	50 %	268318222
74023	NC_013501	CGC	2	6	3106254	3106259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318222
74024	NC_013501	CG	3	6	3106292	3106297	0 %	0 %	50 %	50 %	268318222
74025	NC_013501	CGCGC	2	10	3106363	3106372	0 %	0 %	40 %	60 %	268318222
74026	NC_013501	GGCC	2	8	3106432	3106439	0 %	0 %	50 %	50 %	268318222
74027	NC_013501	CGGGC	2	10	3106608	3106617	0 %	0 %	60 %	40 %	268318222
74028	NC_013501	CGT	2	6	3106677	3106682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318222
74029	NC_013501	GCG	2	6	3106740	3106745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318223
74030	NC_013501	GAA	2	6	3106746	3106751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318223
74031	NC_013501	TCG	2	6	3106753	3106758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318223
74032	NC_013501	TCG	3	9	3106771	3106779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318223
74033	NC_013501	CGA	2	6	3106791	3106796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318223
74034	NC_013501	ATG	2	6	3106810	3106815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318223
74035	NC_013501	AGC	2	6	3106855	3106860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318223
74036	NC_013501	CAT	2	6	3106893	3106898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318223
74037	NC_013501	CGG	2	6	3106975	3106980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318223
74038	NC_013501	TCG	2	6	3106987	3106992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318223
74039	NC_013501	GCCC	2	8	3107062	3107069	0 %	0 %	25 %	75 %	268318223
74040	NC_013501	GC	3	6	3107122	3107127	0 %	0 %	50 %	50 %	268318223
74041	NC_013501	CGA	2	6	3107129	3107134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318223
74042	NC_013501	GGT	2	6	3107238	3107243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318223
74043	NC_013501	CAG	2	6	3107259	3107264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318223
74044	NC_013501	CGC	2	6	3107269	3107274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318223
74045	NC_013501	GCC	2	6	3107278	3107283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318223
74046	NC_013501	GCC	2	6	3107302	3107307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318223
74047	NC_013501	GC	3	6	3107358	3107363	0 %	0 %	50 %	50 %	268318223
74048	NC_013501	GAT	2	6	3107382	3107387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318223
74049	NC_013501	GAA	2	6	3107394	3107399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318223
74050	NC_013501	CCT	2	6	3107444	3107449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318223
74051	NC_013501	TGA	2	6	3107495	3107500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318223
74052	NC_013501	TGA	2	6	3107531	3107536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318223
74053	NC_013501	TCC	2	6	3107557	3107562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318223
74054	NC_013501	CTC	2	6	3107634	3107639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318223
74055	NC_013501	CTT	2	6	3107744	3107749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318223
74056	NC_013501	CGG	2	6	3107767	3107772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318223
74057	NC_013501	GCC	2	6	3107776	3107781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318223
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74059	NC_013501	CCA	2	6	3107900	3107905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318223
74060	NC_013501	TGA	2	6	3107963	3107968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318223
74061	NC_013501	TCG	2	6	3107980	3107985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318223
74062	NC_013501	AGC	2	6	3107986	3107991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318223
74063	NC_013501	GAT	2	6	3108006	3108011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318223
74064	NC_013501	TGGCC	2	10	3108020	3108029	0 %	20 %	40 %	40 %	268318223
74065	NC_013501	GCC	2	6	3108056	3108061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318223
74066	NC_013501	GAT	2	6	3108108	3108113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318223
74067	NC_013501	CGC	2	6	3108131	3108136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318223
74068	NC_013501	GCCT	2	8	3108195	3108202	0 %	25 %	25 %	50 %	268318223
74069	NC_013501	GCA	2	6	3108274	3108279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74070	NC_013501	CACGGT	2	12	3108290	3108301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268318224
74071	NC_013501	GCG	2	6	3108302	3108307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318224
74072	NC_013501	CCGG	2	8	3108315	3108322	0 %	0 %	50 %	50 %	268318224
74073	NC_013501	CAC	3	9	3108364	3108372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318224
74074	NC_013501	CAG	2	6	3108373	3108378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318224
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74077	NC_013501	G	6	6	3108446	3108451	0 %	0 %	100 %	0 %	268318224
74078	NC_013501	GCCG	2	8	3108468	3108475	0 %	0 %	50 %	50 %	268318224
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74080	NC_013501	CGA	2	6	3108556	3108561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318224
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74083	NC_013501	GCCG	2	8	3108657	3108664	0 %	0 %	50 %	50 %	268318224
74084	NC_013501	CCA	2	6	3108670	3108675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318224
74085	NC_013501	CAG	2	6	3108709	3108714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318224
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74087	NC_013501	ACG	2	6	3108782	3108787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318224
74088	NC_013501	GTCG	2	8	3108795	3108802	0 %	25 %	50 %	25 %	268318224
74089	NC_013501	CGC	2	6	3108816	3108821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318224
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74099	NC_013501	ACG	2	6	3109269	3109274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318224
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74103	NC_013501	GCCGG	2	10	3109416	3109425	0 %	0 %	60 %	40 %	268318225
74104	NC_013501	GTC	2	6	3109449	3109454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318225
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74108	NC_013501	GC	3	6	3109571	3109576	0 %	0 %	50 %	50 %	268318225
74109	NC_013501	GTA	2	6	3109626	3109631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318225
74110	NC_013501	GCC	2	6	3109719	3109724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318225
74111	NC_013501	GCCG	2	8	3109841	3109848	0 %	0 %	50 %	50 %	268318225
74112	NC_013501	GGGC	2	8	3109853	3109860	0 %	0 %	75 %	25 %	268318225
74113	NC_013501	CACCGT	2	12	3109890	3109901	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268318225
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74115	NC_013501	GCC	2	6	3109909	3109914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318225
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74232	NC_013501	CAGC	2	8	3114512	3114519	25 %	0 %	25 %	50 %	268318228
74233	NC_013501	CCG	2	6	3114521	3114526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318228
74234	NC_013501	GCT	2	6	3114539	3114544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318228
74235	NC_013501	GCTG	2	8	3114554	3114561	0 %	25 %	50 %	25 %	268318228
74236	NC_013501	GTA	2	6	3114573	3114578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318228
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74241	NC_013501	CGT	3	9	3114794	3114802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318228
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74260	NC_013501	A	7	7	3115670	3115676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74261	NC_013501	GCC	2	6	3115679	3115684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74262	NC_013501	TTC	2	6	3115751	3115756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318229
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74290	NC_013501	AGG	2	6	3117137	3117142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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74296	NC_013501	CTCG	2	8	3117265	3117272	0 %	25 %	25 %	50 %	268318230
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74300	NC_013501	CGA	2	6	3117492	3117497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318231
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74335	NC_013501	A	6	6	3119100	3119105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74336	NC_013501	TGC	3	9	3119130	3119138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318233
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74348	NC_013501	CAG	2	6	3119954	3119959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318233
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74359	NC_013501	TGC	2	6	3120462	3120467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318233
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74363	NC_013501	TGC	3	9	3120590	3120598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318234
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74439	NC_013501	TTCT	2	8	3123985	3123992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74440	NC_013501	AAACC	2	10	3124019	3124028	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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74459	NC_013501	CG	3	6	3124841	3124846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74460	NC_013501	A	6	6	3124872	3124877	100 %	0 %	0 %	0 %	268318237
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