MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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71002	NC_013501	GTGCTC	2	12	2981960	2981971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318107
71003	NC_013501	CGG	2	6	2981996	2982001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318107
71004	NC_013501	GGT	2	6	2982088	2982093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318107
71005	NC_013501	CGT	2	6	2982124	2982129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318107
71006	NC_013501	TGG	2	6	2982219	2982224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318107
71007	NC_013501	GACG	2	8	2982233	2982240	25 %	0 %	50 %	25 %	268318107
71008	NC_013501	CGCC	2	8	2982261	2982268	0 %	0 %	25 %	75 %	268318107
71009	NC_013501	TCCG	2	8	2982283	2982290	0 %	25 %	25 %	50 %	268318107
71010	NC_013501	CGGC	2	8	2982295	2982302	0 %	0 %	50 %	50 %	268318107
71011	NC_013501	GCCC	2	8	2982331	2982338	0 %	0 %	25 %	75 %	268318107
71012	NC_013501	GTT	2	6	2982366	2982371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318108
71013	NC_013501	GTG	2	6	2982373	2982378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318108
71014	NC_013501	GCTG	2	8	2982425	2982432	0 %	25 %	50 %	25 %	268318108
71015	NC_013501	GGC	2	6	2982453	2982458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318108
71016	NC_013501	TTCT	2	8	2982499	2982506	0 %	75 %	0 %	25 %	268318108
71017	NC_013501	A	6	6	2982509	2982514	100 %	0 %	0 %	0 %	268318108
71018	NC_013501	TCGA	2	8	2982557	2982564	25 %	25 %	25 %	25 %	268318108
71019	NC_013501	CGGCC	2	10	2982580	2982589	0 %	0 %	40 %	60 %	268318108
71020	NC_013501	CGT	2	6	2982594	2982599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318108
71021	NC_013501	CTG	2	6	2982607	2982612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318108
71022	NC_013501	TCG	2	6	2982680	2982685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318108
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71035	NC_013501	A	6	6	2983154	2983159	100 %	0 %	0 %	0 %	268318108
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71042	NC_013501	TTC	2	6	2983415	2983420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318108
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71044	NC_013501	CGC	2	6	2983537	2983542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318109
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71089	NC_013501	GC	3	6	2985326	2985331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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71117	NC_013501	GC	3	6	2986523	2986528	0 %	0 %	50 %	50 %	268318112
71118	NC_013501	GCT	2	6	2986542	2986547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318112
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71122	NC_013501	CCG	2	6	2986617	2986622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318112
71123	NC_013501	GAT	2	6	2986644	2986649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318112
71124	NC_013501	GGCT	2	8	2986660	2986667	0 %	25 %	50 %	25 %	268318112
71125	NC_013501	TGC	2	6	2986688	2986693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318112
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71175	NC_013501	CCGA	2	8	2988762	2988769	25 %	0 %	25 %	50 %	268318113
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71469	NC_013501	CAA	2	6	3000851	3000856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318123
71470	NC_013501	CAA	2	6	3001074	3001079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71471	NC_013501	GCC	2	6	3001142	3001147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71472	NC_013501	CCA	2	6	3001158	3001163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71473	NC_013501	GACG	2	8	3001232	3001239	25 %	0 %	50 %	25 %	268318124
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71477	NC_013501	GC	4	8	3001420	3001427	0 %	0 %	50 %	50 %	268318124
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71483	NC_013501	CGG	2	6	3001688	3001693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318124
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71488	NC_013501	ACG	2	6	3001840	3001845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318124
71489	NC_013501	GCTGGA	2	12	3001883	3001894	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268318124
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71491	NC_013501	GTG	3	9	3001980	3001988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318124
71492	NC_013501	CGG	2	6	3001991	3001996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318124
71493	NC_013501	GC	3	6	3002019	3002024	0 %	0 %	50 %	50 %	268318124
71494	NC_013501	GCT	2	6	3002162	3002167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318124
71495	NC_013501	CGGG	2	8	3002227	3002234	0 %	0 %	75 %	25 %	268318124
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71499	NC_013501	GTC	2	6	3002289	3002294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318124
71500	NC_013501	CGG	3	9	3002432	3002440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318124

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