MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013501	CGC	2	6	273916	273921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315833
6502	NC_013501	CGG	2	6	273928	273933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315833
6503	NC_013501	CTG	3	9	273952	273960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6504	NC_013501	CTG	2	6	274006	274011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6505	NC_013501	AGG	2	6	274013	274018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315833
6506	NC_013501	TGG	2	6	274024	274029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315833
6507	NC_013501	GCCG	2	8	274035	274042	0 %	0 %	50 %	50 %	268315833
6508	NC_013501	TACCTG	2	12	274069	274080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	268315833
6509	NC_013501	TGC	2	6	274121	274126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6510	NC_013501	GGCC	2	8	274164	274171	0 %	0 %	50 %	50 %	268315833
6511	NC_013501	TCG	2	6	274172	274177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6512	NC_013501	ATC	2	6	274216	274221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315833
6513	NC_013501	CCCG	2	8	274245	274252	0 %	0 %	25 %	75 %	268315833
6514	NC_013501	CGG	2	6	274282	274287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315833
6515	NC_013501	GCTGG	2	10	274290	274299	0 %	20 %	60 %	20 %	268315833
6516	NC_013501	CTGAT	2	10	274348	274357	20 %	40 %	20 %	20 %	268315833
6517	NC_013501	T	6	6	274377	274382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_013501	CCGC	2	8	274400	274407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6519	NC_013501	GCT	2	6	274434	274439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_013501	TCT	2	6	274474	274479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315834
6521	NC_013501	GGCG	2	8	274493	274500	0 %	0 %	75 %	25 %	268315834
6522	NC_013501	GC	3	6	274531	274536	0 %	0 %	50 %	50 %	268315834
6523	NC_013501	TCC	2	6	274553	274558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315834
6524	NC_013501	GGT	2	6	274559	274564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315834
6525	NC_013501	CCTTT	2	10	274571	274580	0 %	60 %	0 %	40 %	268315834
6526	NC_013501	ACCTT	2	10	274605	274614	20 %	40 %	0 %	40 %	268315834
6527	NC_013501	GC	3	6	274668	274673	0 %	0 %	50 %	50 %	268315834
6528	NC_013501	TCG	2	6	274705	274710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315834
6529	NC_013501	ACC	2	6	274728	274733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315834
6530	NC_013501	GAC	2	6	274790	274795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315834
6531	NC_013501	GAC	2	6	274851	274856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315834
6532	NC_013501	GAG	2	6	274857	274862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315834
6533	NC_013501	CGG	2	6	274907	274912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315834
6534	NC_013501	GAG	2	6	274926	274931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315834
6535	NC_013501	GCC	2	6	274973	274978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315834
6536	NC_013501	GGT	2	6	274991	274996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315834
6537	NC_013501	CAA	2	6	275054	275059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315834
6538	NC_013501	GC	3	6	275062	275067	0 %	0 %	50 %	50 %	268315834
6539	NC_013501	CTG	2	6	275073	275078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315834
6540	NC_013501	CGA	2	6	275081	275086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315834
6541	NC_013501	GCG	2	6	275104	275109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315834
6542	NC_013501	GCG	2	6	275122	275127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315834
6543	NC_013501	ATCG	2	8	275217	275224	25 %	25 %	25 %	25 %	268315834
6544	NC_013501	GAG	2	6	275241	275246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315834
6545	NC_013501	TGGG	2	8	275284	275291	0 %	25 %	75 %	0 %	268315835
6546	NC_013501	TGC	2	6	275294	275299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6547	NC_013501	CGGC	2	8	275309	275316	0 %	0 %	50 %	50 %	268315835
6548	NC_013501	CGGG	2	8	275319	275326	0 %	0 %	75 %	25 %	268315835
6549	NC_013501	GCC	2	6	275410	275415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315835
6550	NC_013501	TGGG	2	8	275431	275438	0 %	25 %	75 %	0 %	268315835
6551	NC_013501	GACCT	2	10	275449	275458	20 %	20 %	20 %	40 %	268315835
6552	NC_013501	TCGAT	2	10	275492	275501	20 %	40 %	20 %	20 %	268315835
6553	NC_013501	GCT	2	6	275529	275534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6554	NC_013501	ACGGCG	2	12	275591	275602	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	268315835
6555	NC_013501	GAC	3	9	275605	275613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6556	NC_013501	CGG	2	6	275649	275654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315835
6557	NC_013501	CCG	2	6	275677	275682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315835
6558	NC_013501	CACC	2	8	275690	275697	25 %	0 %	0 %	75 %	268315835
6559	NC_013501	GTC	2	6	275743	275748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6560	NC_013501	CAC	2	6	275760	275765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315835
6561	NC_013501	CGG	2	6	275788	275793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315835
6562	NC_013501	CGGC	2	8	275796	275803	0 %	0 %	50 %	50 %	268315835
6563	NC_013501	GCG	2	6	275809	275814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315835
6564	NC_013501	CGG	2	6	275823	275828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315835
6565	NC_013501	GAC	2	6	275842	275847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6566	NC_013501	CCCG	2	8	275877	275884	0 %	0 %	25 %	75 %	268315835
6567	NC_013501	CTCG	2	8	275886	275893	0 %	25 %	25 %	50 %	268315835
6568	NC_013501	TTC	2	6	275920	275925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315835
6569	NC_013501	GCC	2	6	275934	275939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315835
6570	NC_013501	GC	3	6	275945	275950	0 %	0 %	50 %	50 %	268315835
6571	NC_013501	ACT	2	6	275966	275971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315835
6572	NC_013501	GAC	2	6	275992	275997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6573	NC_013501	CGG	2	6	276048	276053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315835
6574	NC_013501	CTT	2	6	276069	276074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315835
6575	NC_013501	ACG	2	6	276077	276082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315835
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6577	NC_013501	AGC	2	6	276128	276133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6578	NC_013501	CGGC	3	12	276172	276183	0 %	0 %	50 %	50 %	268315835
6579	NC_013501	CAG	2	6	276241	276246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6580	NC_013501	TGC	2	6	276248	276253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6581	NC_013501	CGC	2	6	276300	276305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315835
6582	NC_013501	TGGCCG	2	12	276416	276427	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268315835
6583	NC_013501	CGA	2	6	276477	276482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6584	NC_013501	CGG	2	6	276483	276488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315835
6585	NC_013501	GGC	2	6	276497	276502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315835
6586	NC_013501	GCCG	2	8	276543	276550	0 %	0 %	50 %	50 %	268315835
6587	NC_013501	GCCG	2	8	276708	276715	0 %	0 %	50 %	50 %	268315835
6588	NC_013501	GGAC	2	8	276735	276742	25 %	0 %	50 %	25 %	268315835
6589	NC_013501	GCGT	2	8	276755	276762	0 %	25 %	50 %	25 %	268315835
6590	NC_013501	GCT	2	6	276851	276856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315836
6591	NC_013501	GGCGCT	2	12	276932	276943	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268315836
6592	NC_013501	TGG	2	6	276955	276960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315836
6593	NC_013501	TGC	2	6	276974	276979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315836
6594	NC_013501	CTA	2	6	276983	276988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315836
6595	NC_013501	GCC	2	6	277094	277099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315836
6596	NC_013501	GC	3	6	277100	277105	0 %	0 %	50 %	50 %	268315836
6597	NC_013501	GACG	2	8	277149	277156	25 %	0 %	50 %	25 %	268315836
6598	NC_013501	GCT	2	6	277205	277210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315836
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6601	NC_013501	CGA	2	6	277373	277378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315836
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6603	NC_013501	GCA	2	6	277424	277429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315836
6604	NC_013501	GCA	2	6	277432	277437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315836
6605	NC_013501	CCGG	2	8	277491	277498	0 %	0 %	50 %	50 %	268315836
6606	NC_013501	GCT	2	6	277508	277513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315836
6607	NC_013501	CGT	2	6	277528	277533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315836
6608	NC_013501	CGTC	2	8	277537	277544	0 %	25 %	25 %	50 %	268315836
6609	NC_013501	GCG	2	6	277556	277561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315836
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6611	NC_013501	GCT	2	6	277673	277678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315836
6612	NC_013501	CGG	2	6	277715	277720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315836
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6614	NC_013501	GTT	2	6	277841	277846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315836
6615	NC_013501	CGC	2	6	277980	277985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6617	NC_013501	GCC	2	6	278071	278076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315837
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6620	NC_013501	CG	3	6	278184	278189	0 %	0 %	50 %	50 %	268315837
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6622	NC_013501	CTC	2	6	278320	278325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315837
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6867	NC_013501	TGC	2	6	288921	288926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315847
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6873	NC_013501	GTA	2	6	289129	289134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6875	NC_013501	AGCGCC	2	12	289341	289352	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268315848
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6979	NC_013501	GCCT	2	8	293931	293938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6980	NC_013501	ACGC	2	8	293946	293953	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6981	NC_013501	GCC	2	6	293954	293959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6982	NC_013501	GCC	2	6	293973	293978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6983	NC_013501	GCG	2	6	293991	293996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6984	NC_013501	CGACTA	2	12	294066	294077	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268315851
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6986	NC_013501	CCG	2	6	294109	294114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315851
6987	NC_013501	GTC	2	6	294115	294120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315851
6988	NC_013501	CAC	2	6	294171	294176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315851
6989	NC_013501	GCT	2	6	294183	294188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315851
6990	NC_013501	TCA	2	6	294257	294262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315851
6991	NC_013501	TTC	2	6	294298	294303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315851
6992	NC_013501	TAC	2	6	294373	294378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315851
6993	NC_013501	TG	3	6	294385	294390	0 %	50 %	50 %	0 %	268315851
6994	NC_013501	GGGC	2	8	294395	294402	0 %	0 %	75 %	25 %	268315851
6995	NC_013501	TCG	2	6	294416	294421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315851
6996	NC_013501	GCG	2	6	294464	294469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315851
6997	NC_013501	GAT	2	6	294495	294500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315851
6998	NC_013501	G	6	6	294636	294641	0 %	0 %	100 %	0 %	268315851
6999	NC_013501	CTG	2	6	294658	294663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315851
7000	NC_013501	GGC	2	6	294692	294697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315851

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