MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
69001	NC_013501	CGGC	2	8	2898196	2898203	0 %	0 %	50 %	50 %	268318033
69002	NC_013501	GCC	2	6	2898229	2898234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318033
69003	NC_013501	CTG	2	6	2898241	2898246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318033
69004	NC_013501	GCAC	2	8	2898248	2898255	25 %	0 %	25 %	50 %	268318033
69005	NC_013501	CAC	2	6	2898261	2898266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318033
69006	NC_013501	CA	3	6	2898276	2898281	50 %	0 %	0 %	50 %	268318033
69007	NC_013501	AGC	2	6	2898447	2898452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318033
69008	NC_013501	GCT	2	6	2898462	2898467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318033
69009	NC_013501	CGG	2	6	2898481	2898486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318033
69010	NC_013501	GCC	2	6	2898499	2898504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318033
69011	NC_013501	GAC	2	6	2898544	2898549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318033
69012	NC_013501	CTG	2	6	2898585	2898590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318034
69013	NC_013501	GGT	2	6	2898650	2898655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318034
69014	NC_013501	TCGAC	2	10	2898682	2898691	20 %	20 %	20 %	40 %	268318034
69015	NC_013501	CGT	2	6	2898715	2898720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318034
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69019	NC_013501	GACG	2	8	2898960	2898967	25 %	0 %	50 %	25 %	268318034
69020	NC_013501	GCT	2	6	2898968	2898973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318034
69021	NC_013501	GCGG	2	8	2898978	2898985	0 %	0 %	75 %	25 %	268318034
69022	NC_013501	CCGGC	2	10	2899000	2899009	0 %	0 %	40 %	60 %	268318034
69023	NC_013501	CTG	2	6	2899104	2899109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318034
69024	NC_013501	TGC	3	9	2899123	2899131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318034
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69027	NC_013501	GCC	2	6	2899203	2899208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318034
69028	NC_013501	GCT	2	6	2899220	2899225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318034
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69038	NC_013501	CCGG	2	8	2899548	2899555	0 %	0 %	50 %	50 %	268318034
69039	NC_013501	GCT	2	6	2899568	2899573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318034
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69042	NC_013501	TGC	2	6	2899639	2899644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318034
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69115	NC_013501	ATC	2	6	2902265	2902270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318038
69116	NC_013501	CTG	2	6	2902348	2902353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318039
69117	NC_013501	TGGA	2	8	2902369	2902376	25 %	25 %	50 %	0 %	268318039
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69122	NC_013501	GCC	2	6	2902531	2902536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318039
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69125	NC_013501	CGA	2	6	2902659	2902664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318039
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69130	NC_013501	CGGT	2	8	2902849	2902856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69131	NC_013501	GTC	2	6	2902921	2902926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318040
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69177	NC_013501	GTAGCC	2	12	2904988	2904999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268318043
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69185	NC_013501	CGGATT	2	12	2905232	2905243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69186	NC_013501	GCC	2	6	2905317	2905322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318044
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69201	NC_013501	GCC	2	6	2905988	2905993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318044
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69206	NC_013501	GGTT	2	8	2906149	2906156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69207	NC_013501	AGC	2	6	2906229	2906234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318045
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69227	NC_013501	GCGG	2	8	2906993	2907000	0 %	0 %	75 %	25 %	268318045
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69346	NC_013501	TCGC	2	8	2911974	2911981	0 %	25 %	25 %	50 %	268318051
69347	NC_013501	CCGC	2	8	2912035	2912042	0 %	0 %	25 %	75 %	268318051
69348	NC_013501	GT	3	6	2912122	2912127	0 %	50 %	50 %	0 %	268318051
69349	NC_013501	ACGCG	2	10	2912254	2912263	20 %	0 %	40 %	40 %	268318051
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69452	NC_013501	TACC	2	8	2917786	2917793	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69453	NC_013501	TCT	2	6	2917818	2917823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69454	NC_013501	TCA	2	6	2917935	2917940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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69456	NC_013501	TGA	2	6	2918002	2918007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69457	NC_013501	GC	3	6	2918025	2918030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69458	NC_013501	GCC	2	6	2918043	2918048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69459	NC_013501	CTG	3	9	2918114	2918122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69460	NC_013501	TTG	2	6	2918151	2918156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69461	NC_013501	CGATCA	2	12	2918173	2918184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69462	NC_013501	CGC	2	6	2918251	2918256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69463	NC_013501	CGC	2	6	2918279	2918284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69464	NC_013501	TC	3	6	2918314	2918319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69465	NC_013501	GCT	2	6	2918332	2918337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69466	NC_013501	TCA	2	6	2918370	2918375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69467	NC_013501	GGCG	2	8	2918440	2918447	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69468	NC_013501	CGT	2	6	2918456	2918461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69469	NC_013501	CGG	2	6	2918537	2918542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69470	NC_013501	CCGT	2	8	2918561	2918568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69471	NC_013501	CAC	2	6	2918615	2918620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69472	NC_013501	CAG	2	6	2918726	2918731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69473	NC_013501	CCT	2	6	2918768	2918773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69474	NC_013501	GTT	2	6	2918776	2918781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69475	NC_013501	GTCGG	2	10	2918800	2918809	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
69476	NC_013501	A	6	6	2918837	2918842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69477	NC_013501	GTT	2	6	2918875	2918880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318053
69478	NC_013501	GCC	2	6	2918916	2918921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318053
69479	NC_013501	GCT	2	6	2918935	2918940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318053
69480	NC_013501	TCCA	2	8	2918948	2918955	25 %	25 %	0 %	50 %	268318053
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69482	NC_013501	GTA	2	6	2918990	2918995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318053
69483	NC_013501	ATT	2	6	2919024	2919029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318053
69484	NC_013501	CTT	2	6	2919052	2919057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318053
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69487	NC_013501	GC	3	6	2919187	2919192	0 %	0 %	50 %	50 %	268318053
69488	NC_013501	CGT	2	6	2919203	2919208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318053
69489	NC_013501	GCTG	2	8	2919226	2919233	0 %	25 %	50 %	25 %	268318053
69490	NC_013501	CCAG	2	8	2919267	2919274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69491	NC_013501	ACA	2	6	2919276	2919281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69492	NC_013501	CAG	2	6	2919284	2919289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69493	NC_013501	TCC	2	6	2919295	2919300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69494	NC_013501	AG	3	6	2919476	2919481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69495	NC_013501	GC	3	6	2919578	2919583	0 %	0 %	50 %	50 %	268318054
69496	NC_013501	ACG	2	6	2919629	2919634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318054
69497	NC_013501	CGG	2	6	2919643	2919648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318054
69498	NC_013501	CGG	2	6	2919651	2919656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318054
69499	NC_013501	CG	3	6	2919678	2919683	0 %	0 %	50 %	50 %	268318054
69500	NC_013501	GCC	2	6	2919707	2919712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318054

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