MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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62002	NC_013501	ACGC	2	8	2613844	2613851	25 %	0 %	25 %	50 %	268317797
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62004	NC_013501	CCGGG	2	10	2613871	2613880	0 %	0 %	60 %	40 %	268317797
62005	NC_013501	CTG	2	6	2614013	2614018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317797
62006	NC_013501	CGT	2	6	2614035	2614040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317797
62007	NC_013501	CGA	2	6	2614060	2614065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317797
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62117	NC_013501	GC	3	6	2618565	2618570	0 %	0 %	50 %	50 %	268317802
62118	NC_013501	CCA	2	6	2618580	2618585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317802
62119	NC_013501	GCA	2	6	2618658	2618663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317802
62120	NC_013501	GC	3	6	2618713	2618718	0 %	0 %	50 %	50 %	268317802
62121	NC_013501	CGGC	2	8	2618781	2618788	0 %	0 %	50 %	50 %	268317802
62122	NC_013501	GCGA	2	8	2618817	2618824	25 %	0 %	50 %	25 %	268317802
62123	NC_013501	GCA	2	6	2618832	2618837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317802
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62142	NC_013501	TCCC	2	8	2619591	2619598	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62143	NC_013501	A	7	7	2619610	2619616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62144	NC_013501	CCA	2	6	2619693	2619698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317803
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62147	NC_013501	AGCG	2	8	2619773	2619780	25 %	0 %	50 %	25 %	268317803
62148	NC_013501	CGT	2	6	2619784	2619789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317803
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62192	NC_013501	CGA	2	6	2621523	2621528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317803
62193	NC_013501	GCA	2	6	2621586	2621591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317803
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62196	NC_013501	CCT	2	6	2621793	2621798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62197	NC_013501	TGCT	2	8	2621944	2621951	0 %	50 %	25 %	25 %	268317804
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62202	NC_013501	CGGC	2	8	2622259	2622266	0 %	0 %	50 %	50 %	268317804
62203	NC_013501	CGT	3	9	2622269	2622277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317804
62204	NC_013501	GCT	2	6	2622281	2622286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317804
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62209	NC_013501	GGCAC	2	10	2622444	2622453	20 %	0 %	40 %	40 %	268317804
62210	NC_013501	GGC	2	6	2622458	2622463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317804
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62214	NC_013501	TGGG	2	8	2622531	2622538	0 %	25 %	75 %	0 %	268317804
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62216	NC_013501	CG	3	6	2622636	2622641	0 %	0 %	50 %	50 %	268317804
62217	NC_013501	GCT	2	6	2622645	2622650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317804
62218	NC_013501	TCC	2	6	2622657	2622662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317804
62219	NC_013501	GCA	2	6	2622702	2622707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62220	NC_013501	CGA	2	6	2622754	2622759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317805
62221	NC_013501	CAT	2	6	2622866	2622871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317805
62222	NC_013501	ACT	2	6	2622891	2622896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317805
62223	NC_013501	CGA	2	6	2622910	2622915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317805
62224	NC_013501	TCG	2	6	2622969	2622974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
62225	NC_013501	GAA	2	6	2623001	2623006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317805
62226	NC_013501	GGC	2	6	2623033	2623038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317805
62227	NC_013501	GGC	2	6	2623061	2623066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317805
62228	NC_013501	CGG	2	6	2623077	2623082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317805
62229	NC_013501	GGT	2	6	2623123	2623128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317805
62230	NC_013501	TCG	2	6	2623137	2623142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
62231	NC_013501	GCT	2	6	2623180	2623185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
62232	NC_013501	ATC	2	6	2623187	2623192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317805
62233	NC_013501	GCG	2	6	2623200	2623205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317805
62234	NC_013501	ATG	2	6	2623214	2623219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317805
62235	NC_013501	GCT	2	6	2623261	2623266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
62236	NC_013501	TC	3	6	2623299	2623304	0 %	50 %	0 %	50 %	268317805
62237	NC_013501	TGA	2	6	2623305	2623310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317805
62238	NC_013501	CAC	2	6	2623318	2623323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317805
62239	NC_013501	GCG	2	6	2623326	2623331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317805
62240	NC_013501	TTCG	2	8	2623339	2623346	0 %	50 %	25 %	25 %	268317805
62241	NC_013501	CG	3	6	2623404	2623409	0 %	0 %	50 %	50 %	268317805
62242	NC_013501	GCC	2	6	2623438	2623443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317805
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62244	NC_013501	TCG	2	6	2623501	2623506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
62245	NC_013501	CTG	2	6	2623532	2623537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
62246	NC_013501	CTG	3	9	2623541	2623549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
62247	NC_013501	CGT	4	12	2623578	2623589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
62248	NC_013501	CG	3	6	2623656	2623661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62249	NC_013501	ATC	2	6	2623678	2623683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62250	NC_013501	CTG	3	9	2623813	2623821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
62251	NC_013501	TGC	2	6	2623832	2623837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
62252	NC_013501	CGC	2	6	2623937	2623942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317806
62253	NC_013501	GC	3	6	2623941	2623946	0 %	0 %	50 %	50 %	268317806
62254	NC_013501	CGC	2	6	2623963	2623968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317806
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62258	NC_013501	GCG	2	6	2624223	2624228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317806
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62292	NC_013501	CGGG	2	8	2625262	2625269	0 %	0 %	75 %	25 %	268317806
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62302	NC_013501	GCA	2	6	2625813	2625818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317806
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62462	NC_013501	TCG	2	6	2633024	2633029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317809
62463	NC_013501	TGGT	2	8	2633036	2633043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62464	NC_013501	CGA	2	6	2633072	2633077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62465	NC_013501	TTC	2	6	2633096	2633101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317810
62466	NC_013501	ACC	2	6	2633205	2633210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317810
62467	NC_013501	CCGT	2	8	2633269	2633276	0 %	25 %	25 %	50 %	268317810
62468	NC_013501	ATCG	2	8	2633405	2633412	25 %	25 %	25 %	25 %	268317810
62469	NC_013501	GGA	2	6	2633448	2633453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317810
62470	NC_013501	GTC	2	6	2633513	2633518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317810
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62484	NC_013501	TTCG	2	8	2634079	2634086	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62485	NC_013501	CTG	2	6	2634167	2634172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317812
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62488	NC_013501	CGAT	2	8	2634240	2634247	25 %	25 %	25 %	25 %	268317812
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62494	NC_013501	CAG	2	6	2634440	2634445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317812
62495	NC_013501	CAG	2	6	2634464	2634469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317812
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62498	NC_013501	GC	3	6	2634578	2634583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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