MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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60002	NC_013501	TA	3	6	2532427	2532432	50 %	50 %	0 %	0 %	268317725
60003	NC_013501	GCCA	2	8	2532503	2532510	25 %	0 %	25 %	50 %	268317725
60004	NC_013501	GAA	2	6	2532539	2532544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317725
60005	NC_013501	GAC	2	6	2532568	2532573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317725
60006	NC_013501	CTT	2	6	2532601	2532606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317725
60007	NC_013501	GCC	2	6	2532670	2532675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317725
60008	NC_013501	ACG	2	6	2532683	2532688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317725
60009	NC_013501	TGG	2	6	2532738	2532743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317725
60010	NC_013501	TGG	2	6	2532792	2532797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317725
60011	NC_013501	CCG	2	6	2532804	2532809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317725
60012	NC_013501	GCA	2	6	2532823	2532828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317725
60013	NC_013501	TCA	2	6	2532867	2532872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317725
60014	NC_013501	ATC	2	6	2532887	2532892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317725
60015	NC_013501	TGG	2	6	2532894	2532899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317725
60016	NC_013501	CGT	2	6	2532913	2532918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317725
60017	NC_013501	CAG	2	6	2532995	2533000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317725
60018	NC_013501	GGC	2	6	2533018	2533023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317725
60019	NC_013501	GCCA	2	8	2533046	2533053	25 %	0 %	25 %	50 %	268317725
60020	NC_013501	AGC	2	6	2533077	2533082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317725
60021	NC_013501	GCC	2	6	2533088	2533093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317725
60022	NC_013501	GCC	2	6	2533097	2533102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317725
60023	NC_013501	GCC	2	6	2533125	2533130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317725
60024	NC_013501	GAA	2	6	2533136	2533141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317725
60025	NC_013501	CCAG	2	8	2533143	2533150	25 %	0 %	25 %	50 %	268317725
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60032	NC_013501	CAG	2	6	2533400	2533405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317725
60033	NC_013501	GAG	2	6	2533430	2533435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317725
60034	NC_013501	CCT	3	9	2533452	2533460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317725
60035	NC_013501	GC	3	6	2533467	2533472	0 %	0 %	50 %	50 %	268317725
60036	NC_013501	GCC	2	6	2533511	2533516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317725
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60039	NC_013501	GCAT	2	8	2533551	2533558	25 %	25 %	25 %	25 %	268317725
60040	NC_013501	GC	3	6	2533617	2533622	0 %	0 %	50 %	50 %	268317725
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60051	NC_013501	GTC	2	6	2533835	2533840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317725
60052	NC_013501	CGA	2	6	2533891	2533896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317725
60053	NC_013501	TGA	2	6	2533947	2533952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317725
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60058	NC_013501	GCA	2	6	2534101	2534106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317725
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60091	NC_013501	GTT	3	9	2535917	2535925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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60113	NC_013501	CAC	2	6	2537066	2537071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317728
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60115	NC_013501	CAC	2	6	2537144	2537149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317728
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60143	NC_013501	GCA	2	6	2538240	2538245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317730
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60145	NC_013501	GC	3	6	2538322	2538327	0 %	0 %	50 %	50 %	268317730
60146	NC_013501	GGC	3	9	2538370	2538378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317730
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60148	NC_013501	CAG	2	6	2538436	2538441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317730
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60150	NC_013501	GTG	2	6	2538682	2538687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60151	NC_013501	AGC	2	6	2538713	2538718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60152	NC_013501	ACG	2	6	2538754	2538759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317731
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60200	NC_013501	GAC	2	6	2540626	2540631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317731
60201	NC_013501	GC	3	6	2540647	2540652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60202	NC_013501	CCG	2	6	2540668	2540673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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60208	NC_013501	GCC	2	6	2540964	2540969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317732
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60213	NC_013501	CCGGT	2	10	2541237	2541246	0 %	20 %	40 %	40 %	268317732
60214	NC_013501	GCC	2	6	2541290	2541295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317732
60215	NC_013501	CTC	2	6	2541298	2541303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317732
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60217	NC_013501	CTG	2	6	2541403	2541408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317732
60218	NC_013501	TAA	2	6	2541434	2541439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268317732
60219	NC_013501	CCA	2	6	2541462	2541467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317732
60220	NC_013501	GTC	2	6	2541475	2541480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317732
60221	NC_013501	GCC	2	6	2541545	2541550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317732
60222	NC_013501	AGCGCC	2	12	2541581	2541592	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268317732
60223	NC_013501	CCA	2	6	2541633	2541638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317732
60224	NC_013501	CCA	2	6	2541660	2541665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317732
60225	NC_013501	TCG	2	6	2541668	2541673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317732
60226	NC_013501	TCG	2	6	2541680	2541685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317732
60227	NC_013501	CGTG	2	8	2541708	2541715	0 %	25 %	50 %	25 %	268317732
60228	NC_013501	TGC	2	6	2541758	2541763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60229	NC_013501	CACC	2	8	2541889	2541896	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60230	NC_013501	GTC	2	6	2541911	2541916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317733
60231	NC_013501	TC	3	6	2541915	2541920	0 %	50 %	0 %	50 %	268317733
60232	NC_013501	CGT	2	6	2541924	2541929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317733
60233	NC_013501	CTG	2	6	2541942	2541947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317733
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60238	NC_013501	GCC	2	6	2542220	2542225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317733
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60243	NC_013501	TTC	2	6	2542467	2542472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317733
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60247	NC_013501	GCT	3	9	2542595	2542603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317733
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60334	NC_013501	GCA	2	6	2546233	2546238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317735
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60342	NC_013501	GTA	2	6	2546612	2546617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317735
60343	NC_013501	GTTCT	2	10	2546626	2546635	0 %	60 %	20 %	20 %	268317736
60344	NC_013501	CGCA	2	8	2546704	2546711	25 %	0 %	25 %	50 %	268317736
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60347	NC_013501	GCCG	2	8	2546816	2546823	0 %	0 %	50 %	50 %	268317736
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60459	NC_013501	A	6	6	2551873	2551878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60460	NC_013501	T	6	6	2551886	2551891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60461	NC_013501	CGG	2	6	2551944	2551949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60462	NC_013501	TCA	2	6	2552002	2552007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60463	NC_013501	ATT	2	6	2552032	2552037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268317740
60464	NC_013501	GAG	2	6	2552050	2552055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317740
60465	NC_013501	GAAAT	2	10	2552056	2552065	60 %	20 %	20 %	0 %	268317740
60466	NC_013501	CCT	2	6	2552066	2552071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317740
60467	NC_013501	CGC	2	6	2552146	2552151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317740
60468	NC_013501	TCG	2	6	2552216	2552221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317740
60469	NC_013501	ACC	2	6	2552240	2552245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317740
60470	NC_013501	TCGA	2	8	2552341	2552348	25 %	25 %	25 %	25 %	268317740
60471	NC_013501	CGC	2	6	2552361	2552366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317740
60472	NC_013501	GC	3	6	2552383	2552388	0 %	0 %	50 %	50 %	268317740
60473	NC_013501	GAA	2	6	2552404	2552409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317740
60474	NC_013501	TGC	2	6	2552411	2552416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317740
60475	NC_013501	GCCG	2	8	2552487	2552494	0 %	0 %	50 %	50 %	268317740
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60477	NC_013501	GCT	2	6	2552631	2552636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317740
60478	NC_013501	CAT	2	6	2552673	2552678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317740
60479	NC_013501	CGGCCG	2	12	2552715	2552726	0 %	0 %	50 %	50 %	268317740
60480	NC_013501	CGCA	2	8	2552739	2552746	25 %	0 %	25 %	50 %	268317740
60481	NC_013501	CCGG	2	8	2552763	2552770	0 %	0 %	50 %	50 %	268317740
60482	NC_013501	TCA	2	6	2552786	2552791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317740
60483	NC_013501	CAA	2	6	2552811	2552816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268317740
60484	NC_013501	AGC	2	6	2552818	2552823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317740
60485	NC_013501	CGT	2	6	2552913	2552918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317740
60486	NC_013501	CAG	2	6	2552986	2552991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317740
60487	NC_013501	TGG	2	6	2553008	2553013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317740
60488	NC_013501	CGGC	2	8	2553024	2553031	0 %	0 %	50 %	50 %	268317740
60489	NC_013501	CACGCT	2	12	2553036	2553047	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268317740
60490	NC_013501	GAG	2	6	2553127	2553132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317740
60491	NC_013501	ACCTCG	2	12	2553173	2553184	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268317740
60492	NC_013501	TCA	2	6	2553185	2553190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317740
60493	NC_013501	CAT	2	6	2553192	2553197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317740
60494	NC_013501	GC	3	6	2553223	2553228	0 %	0 %	50 %	50 %	268317740
60495	NC_013501	TGC	2	6	2553248	2553253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317740
60496	NC_013501	GCC	2	6	2553365	2553370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317740
60497	NC_013501	GAA	3	9	2553397	2553405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317740
60498	NC_013501	GCT	2	6	2553414	2553419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317740
60499	NC_013501	ATC	2	6	2553475	2553480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317740
60500	NC_013501	GCT	2	6	2553489	2553494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317740

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