MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59501	NC_013501	CCG	2	6	2512392	2512397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317704
59502	NC_013501	CAC	2	6	2512404	2512409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317704
59503	NC_013501	CG	3	6	2512452	2512457	0 %	0 %	50 %	50 %	268317705
59504	NC_013501	TCG	2	6	2512488	2512493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317705
59505	NC_013501	CGCC	2	8	2512501	2512508	0 %	0 %	25 %	75 %	268317705
59506	NC_013501	TCC	2	6	2512530	2512535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317705
59507	NC_013501	CCAG	2	8	2512554	2512561	25 %	0 %	25 %	50 %	268317705
59508	NC_013501	CTG	2	6	2512577	2512582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317705
59509	NC_013501	CCA	2	6	2512613	2512618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317705
59510	NC_013501	CGCTGG	2	12	2512644	2512655	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268317705
59511	NC_013501	CGT	2	6	2512687	2512692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317705
59512	NC_013501	GCGCC	2	10	2512700	2512709	0 %	0 %	40 %	60 %	268317705
59513	NC_013501	CGA	2	6	2512717	2512722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317705
59514	NC_013501	TCG	2	6	2512730	2512735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317705
59515	NC_013501	TGG	3	9	2512743	2512751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317705
59516	NC_013501	GAT	2	6	2512983	2512988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317706
59517	NC_013501	CGCC	2	8	2513064	2513071	0 %	0 %	25 %	75 %	268317706
59518	NC_013501	TCG	2	6	2513078	2513083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317706
59519	NC_013501	TCC	2	6	2513093	2513098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317706
59520	NC_013501	CCG	2	6	2513139	2513144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317706
59521	NC_013501	GAA	2	6	2513149	2513154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317706
59522	NC_013501	ACG	2	6	2513186	2513191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317706
59523	NC_013501	CGCTGG	2	12	2513207	2513218	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268317706
59524	NC_013501	CGAGCC	2	12	2513229	2513240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268317706
59525	NC_013501	CGT	2	6	2513250	2513255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317706
59526	NC_013501	CGA	2	6	2513268	2513273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317706
59527	NC_013501	CGG	2	6	2513297	2513302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317706
59528	NC_013501	TGG	3	9	2513306	2513314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317706
59529	NC_013501	ACT	2	6	2513387	2513392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317706
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59531	NC_013501	TACC	2	8	2513448	2513455	25 %	25 %	0 %	50 %	268317706
59532	NC_013501	TGC	2	6	2513468	2513473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317706
59533	NC_013501	CCGG	2	8	2513502	2513509	0 %	0 %	50 %	50 %	268317706
59534	NC_013501	CG	3	6	2513574	2513579	0 %	0 %	50 %	50 %	268317707
59535	NC_013501	TCG	2	6	2513610	2513615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317707
59536	NC_013501	CGCC	2	8	2513623	2513630	0 %	0 %	25 %	75 %	268317707
59537	NC_013501	TCC	2	6	2513652	2513657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317707
59538	NC_013501	CGC	2	6	2513686	2513691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317707
59539	NC_013501	TCG	2	6	2513698	2513703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317707
59540	NC_013501	CTT	2	6	2513725	2513730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317707
59541	NC_013501	CGT	2	6	2513809	2513814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317707
59542	NC_013501	CGA	2	6	2513827	2513832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317707
59543	NC_013501	CGG	2	6	2513856	2513861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317707
59544	NC_013501	TGG	3	9	2513865	2513873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317707
59545	NC_013501	ACT	2	6	2513946	2513951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317707
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59547	NC_013501	GTT	2	6	2514091	2514096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317707
59548	NC_013501	CTG	2	6	2514117	2514122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59549	NC_013501	AACG	2	8	2514133	2514140	50 %	0 %	25 %	25 %	268317708
59550	NC_013501	TGC	2	6	2514183	2514188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317708
59551	NC_013501	GAA	2	6	2514299	2514304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317708
59552	NC_013501	GCG	2	6	2514333	2514338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317708
59553	NC_013501	TGC	2	6	2514404	2514409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317708
59554	NC_013501	CGA	2	6	2514415	2514420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317708
59555	NC_013501	CCA	2	6	2514469	2514474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317708
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59557	NC_013501	GCG	2	6	2514681	2514686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317708
59558	NC_013501	GTCG	2	8	2514706	2514713	0 %	25 %	50 %	25 %	268317708
59559	NC_013501	GCC	2	6	2514742	2514747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317708
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59564	NC_013501	GC	3	6	2514861	2514866	0 %	0 %	50 %	50 %	268317708
59565	NC_013501	CCGGT	2	10	2514876	2514885	0 %	20 %	40 %	40 %	268317708
59566	NC_013501	GAT	2	6	2515102	2515107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317708
59567	NC_013501	CGGC	2	8	2515113	2515120	0 %	0 %	50 %	50 %	268317708
59568	NC_013501	TGCTCG	2	12	2515122	2515133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317708
59569	NC_013501	GGCT	2	8	2515229	2515236	0 %	25 %	50 %	25 %	268317708
59570	NC_013501	CGA	2	6	2515258	2515263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317708
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59572	NC_013501	GACCTG	2	12	2515283	2515294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268317708
59573	NC_013501	CTG	3	9	2515292	2515300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317708
59574	NC_013501	CGC	3	9	2515348	2515356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317708
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59577	NC_013501	GGC	2	6	2515547	2515552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317709
59578	NC_013501	ATGCGG	2	12	2515554	2515565	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268317709
59579	NC_013501	TCG	2	6	2515600	2515605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317709
59580	NC_013501	GCG	2	6	2515607	2515612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317709
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59582	NC_013501	GACC	2	8	2515883	2515890	25 %	0 %	25 %	50 %	268317709
59583	NC_013501	GGC	2	6	2515949	2515954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317710
59584	NC_013501	TTC	2	6	2515969	2515974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317710
59585	NC_013501	ACC	2	6	2516009	2516014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317710
59586	NC_013501	TGG	2	6	2516051	2516056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317710
59587	NC_013501	CGA	2	6	2516103	2516108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317710
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59589	NC_013501	GTC	2	6	2516182	2516187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317710
59590	NC_013501	GC	4	8	2516215	2516222	0 %	0 %	50 %	50 %	268317710
59591	NC_013501	CTG	2	6	2516245	2516250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317710
59592	NC_013501	ACC	2	6	2516255	2516260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317710
59593	NC_013501	TGCG	2	8	2516434	2516441	0 %	25 %	50 %	25 %	268317710
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59595	NC_013501	CAT	2	6	2516478	2516483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317710
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59597	NC_013501	GAT	2	6	2516533	2516538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317710
59598	NC_013501	GC	3	6	2516576	2516581	0 %	0 %	50 %	50 %	268317710
59599	NC_013501	GC	3	6	2516608	2516613	0 %	0 %	50 %	50 %	268317710
59600	NC_013501	CGATCA	2	12	2516639	2516650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268317710
59601	NC_013501	CTA	2	6	2516673	2516678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317710
59602	NC_013501	TCG	2	6	2516699	2516704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317710
59603	NC_013501	GC	4	8	2516713	2516720	0 %	0 %	50 %	50 %	268317710
59604	NC_013501	CGA	2	6	2516751	2516756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317710
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59608	NC_013501	GGCT	2	8	2517022	2517029	0 %	25 %	50 %	25 %	268317710
59609	NC_013501	CGA	2	6	2517036	2517041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317710
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59612	NC_013501	GCG	2	6	2517122	2517127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317710
59613	NC_013501	GAC	2	6	2517154	2517159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317710
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59615	NC_013501	ACA	2	6	2517224	2517229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268317710
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59965	NC_013501	CTG	2	6	2531063	2531068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317723
59966	NC_013501	CCG	2	6	2531126	2531131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317723
59967	NC_013501	CGT	3	9	2531161	2531169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317723
59968	NC_013501	TCG	2	6	2531172	2531177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317723
59969	NC_013501	CGT	2	6	2531272	2531277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317723
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59976	NC_013501	TCG	2	6	2531522	2531527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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59980	NC_013501	CGC	2	6	2531622	2531627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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59988	NC_013501	CGG	2	6	2531927	2531932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317724
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