MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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59002	NC_013501	GCC	2	6	2490109	2490114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317680
59003	NC_013501	GCA	2	6	2490164	2490169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317680
59004	NC_013501	TTC	2	6	2490180	2490185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317680
59005	NC_013501	GAT	2	6	2490256	2490261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59006	NC_013501	ATG	2	6	2490397	2490402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59007	NC_013501	TTA	2	6	2490413	2490418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59008	NC_013501	GGC	2	6	2490477	2490482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59009	NC_013501	CGG	2	6	2490510	2490515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59010	NC_013501	CCA	2	6	2490525	2490530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59011	NC_013501	ACG	2	6	2490575	2490580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59012	NC_013501	TGA	2	6	2490671	2490676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59013	NC_013501	CGC	2	6	2490719	2490724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59014	NC_013501	TCC	2	6	2490756	2490761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59015	NC_013501	GCG	2	6	2490762	2490767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59016	NC_013501	GGA	2	6	2490844	2490849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59017	NC_013501	GCT	2	6	2490876	2490881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317681
59018	NC_013501	CGC	2	6	2490959	2490964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317681
59019	NC_013501	GC	3	6	2490971	2490976	0 %	0 %	50 %	50 %	268317681
59020	NC_013501	GAC	2	6	2491089	2491094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317681
59021	NC_013501	GCG	2	6	2491095	2491100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317681
59022	NC_013501	TGG	2	6	2491112	2491117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317681
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59024	NC_013501	GCT	2	6	2491269	2491274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317681
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59028	NC_013501	CG	3	6	2491523	2491528	0 %	0 %	50 %	50 %	268317681
59029	NC_013501	CTG	2	6	2491645	2491650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317681
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59032	NC_013501	TCG	2	6	2491775	2491780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317681
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59043	NC_013501	CGCC	2	8	2492220	2492227	0 %	0 %	25 %	75 %	268317681
59044	NC_013501	GCC	2	6	2492242	2492247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317681
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59052	NC_013501	ACGGC	2	10	2492696	2492705	20 %	0 %	40 %	40 %	268317681
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59056	NC_013501	CCGC	2	8	2492867	2492874	0 %	0 %	25 %	75 %	268317681
59057	NC_013501	TTC	2	6	2492875	2492880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317681
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59060	NC_013501	GGC	2	6	2493002	2493007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317681
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59062	NC_013501	T	6	6	2493200	2493205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59063	NC_013501	GCC	2	6	2493367	2493372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317682
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59071	NC_013501	GAAA	2	8	2493821	2493828	75 %	0 %	25 %	0 %	268317682
59072	NC_013501	CGAT	2	8	2493840	2493847	25 %	25 %	25 %	25 %	268317682
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59082	NC_013501	GCCG	2	8	2494314	2494321	0 %	0 %	50 %	50 %	268317683
59083	NC_013501	GCA	3	9	2494338	2494346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317683
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59085	NC_013501	TCGTAG	2	12	2494445	2494456	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268317683
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59088	NC_013501	CTC	2	6	2494591	2494596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317683
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59092	NC_013501	CG	3	6	2494724	2494729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59093	NC_013501	GATC	2	8	2494783	2494790	25 %	25 %	25 %	25 %	268317684
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59101	NC_013501	GCC	2	6	2495019	2495024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317684
59102	NC_013501	CAA	2	6	2495038	2495043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268317684
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59104	NC_013501	GCT	2	6	2495140	2495145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317684
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59108	NC_013501	CAT	2	6	2495191	2495196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317684
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59112	NC_013501	CTG	2	6	2495468	2495473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317684
59113	NC_013501	CTGC	2	8	2495549	2495556	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59114	NC_013501	CTG	2	6	2495579	2495584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317685
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59117	NC_013501	GCGG	2	8	2495689	2495696	0 %	0 %	75 %	25 %	268317685
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59232	NC_013501	CGCTGG	2	12	2500895	2500906	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268317691
59233	NC_013501	CGA	2	6	2500929	2500934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317691
59234	NC_013501	GCCAC	2	10	2500955	2500964	20 %	0 %	20 %	60 %	268317691
59235	NC_013501	CAG	2	6	2500975	2500980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317691
59236	NC_013501	CGGC	2	8	2501013	2501020	0 %	0 %	50 %	50 %	268317691
59237	NC_013501	GCC	2	6	2501047	2501052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59238	NC_013501	TGG	2	6	2501298	2501303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317692
59239	NC_013501	CTG	2	6	2501427	2501432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317692
59240	NC_013501	GCC	2	6	2501445	2501450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317692
59241	NC_013501	CG	3	6	2501490	2501495	0 %	0 %	50 %	50 %	268317692
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59244	NC_013501	GGCAT	2	10	2501657	2501666	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59245	NC_013501	T	6	6	2501680	2501685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59246	NC_013501	AAC	2	6	2501691	2501696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59247	NC_013501	CAT	2	6	2501747	2501752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59248	NC_013501	ACC	2	6	2501758	2501763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59249	NC_013501	CTG	2	6	2501776	2501781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317693
59250	NC_013501	TGC	3	9	2501786	2501794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317693
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59252	NC_013501	CGG	2	6	2501865	2501870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317693
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59259	NC_013501	A	6	6	2502250	2502255	100 %	0 %	0 %	0 %	268317693
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59261	NC_013501	GC	3	6	2502403	2502408	0 %	0 %	50 %	50 %	268317694
59262	NC_013501	GC	3	6	2502410	2502415	0 %	0 %	50 %	50 %	268317694
59263	NC_013501	TC	3	6	2502418	2502423	0 %	50 %	0 %	50 %	268317694
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59279	NC_013501	AGGG	2	8	2503242	2503249	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59280	NC_013501	AG	3	6	2503259	2503264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59281	NC_013501	TGC	2	6	2503275	2503280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59282	NC_013501	CCA	3	9	2503302	2503310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59283	NC_013501	TGG	2	6	2503440	2503445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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59286	NC_013501	CACCT	2	10	2503587	2503596	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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59289	NC_013501	TTCA	2	8	2503647	2503654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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59291	NC_013501	ATC	2	6	2503708	2503713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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59303	NC_013501	GCC	2	6	2504258	2504263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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59332	NC_013501	CTG	2	6	2505450	2505455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317697
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59347	NC_013501	ATC	2	6	2505897	2505902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317697
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59467	NC_013501	GAG	2	6	2510951	2510956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317703
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59489	NC_013501	CTGG	2	8	2511905	2511912	0 %	25 %	50 %	25 %	268317704
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59498	NC_013501	CTG	2	6	2512269	2512274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317704
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59500	NC_013501	GGC	2	6	2512344	2512349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317704

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