MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_013222	GTT	2	6	2657253	2657258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49002	NC_013222	T	6	6	2657267	2657272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49003	NC_013222	T	6	6	2657274	2657279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49004	NC_013222	AGC	2	6	2657389	2657394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063009
49005	NC_013222	CGC	2	6	2657404	2657409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063009
49006	NC_013222	CGTAAA	2	12	2657536	2657547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	260063009
49007	NC_013222	CAT	2	6	2657635	2657640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063009
49008	NC_013222	TAC	2	6	2657663	2657668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063009
49009	NC_013222	ACT	2	6	2657670	2657675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063009
49010	NC_013222	GGCCT	2	10	2657723	2657732	0 %	20 %	40 %	40 %	260063009
49011	NC_013222	C	6	6	2657763	2657768	0 %	0 %	0 %	100 %	260063009
49012	NC_013222	GTAT	2	8	2657818	2657825	25 %	50 %	25 %	0 %	260063009
49013	NC_013222	ACA	2	6	2657943	2657948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063009
49014	NC_013222	C	6	6	2657991	2657996	0 %	0 %	0 %	100 %	260063009
49015	NC_013222	GCC	2	6	2658224	2658229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063009
49016	NC_013222	CAAC	2	8	2658256	2658263	50 %	0 %	0 %	50 %	260063009
49017	NC_013222	GCA	2	6	2658330	2658335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063009
49018	NC_013222	GCA	2	6	2658375	2658380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063009
49019	NC_013222	GAC	2	6	2658385	2658390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063009
49020	NC_013222	GC	3	6	2658410	2658415	0 %	0 %	50 %	50 %	260063009
49021	NC_013222	CAA	2	6	2658465	2658470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063009
49022	NC_013222	AGC	2	6	2658629	2658634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063009
49023	NC_013222	CAA	2	6	2658679	2658684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063009
49024	NC_013222	GGTT	2	8	2658714	2658721	0 %	50 %	50 %	0 %	260063010
49025	NC_013222	GGA	2	6	2658739	2658744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063010
49026	NC_013222	TCT	2	6	2658749	2658754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063010
49027	NC_013222	T	6	6	2658765	2658770	0 %	100 %	0 %	0 %	260063010
49028	NC_013222	GCC	2	6	2658844	2658849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063010
49029	NC_013222	AAC	2	6	2658907	2658912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063010
49030	NC_013222	GGC	2	6	2659014	2659019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063010
49031	NC_013222	AGC	2	6	2659041	2659046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063010
49032	NC_013222	TGA	2	6	2659094	2659099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063010
49033	NC_013222	CCAGGC	2	12	2659103	2659114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260063010
49034	NC_013222	ACC	2	6	2659224	2659229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063010
49035	NC_013222	TCA	2	6	2659271	2659276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063010
49036	NC_013222	CAG	2	6	2659281	2659286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063010
49037	NC_013222	TA	3	6	2659288	2659293	50 %	50 %	0 %	0 %	260063010
49038	NC_013222	CGC	2	6	2659299	2659304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063010
49039	NC_013222	CAG	2	6	2659308	2659313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063010
49040	NC_013222	CGG	2	6	2659376	2659381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063010
49041	NC_013222	AGG	2	6	2659540	2659545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063010
49042	NC_013222	GC	3	6	2659550	2659555	0 %	0 %	50 %	50 %	260063010
49043	NC_013222	CAG	2	6	2659638	2659643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063010
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49048	NC_013222	CAA	2	6	2659914	2659919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063010
49049	NC_013222	GGA	2	6	2659937	2659942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063010
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49053	NC_013222	GCCG	2	8	2660233	2660240	0 %	0 %	50 %	50 %	260063011
49054	NC_013222	CTC	2	6	2660269	2660274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063011
49055	NC_013222	CCGG	2	8	2660275	2660282	0 %	0 %	50 %	50 %	260063011
49056	NC_013222	CATC	2	8	2660406	2660413	25 %	25 %	0 %	50 %	260063011
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49061	NC_013222	GGA	2	6	2660680	2660685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063011
49062	NC_013222	GAG	2	6	2660729	2660734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063011
49063	NC_013222	CCA	2	6	2660749	2660754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063011
49064	NC_013222	CGGG	2	8	2660822	2660829	0 %	0 %	75 %	25 %	260063011
49065	NC_013222	CTGG	2	8	2660861	2660868	0 %	25 %	50 %	25 %	260063011
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49082	NC_013222	TGCC	2	8	2661709	2661716	0 %	25 %	25 %	50 %	260063012
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49088	NC_013222	C	6	6	2662130	2662135	0 %	0 %	0 %	100 %	260063012
49089	NC_013222	TGG	2	6	2662142	2662147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063012
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49103	NC_013222	GTT	2	6	2662933	2662938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063012
49104	NC_013222	C	7	7	2663028	2663034	0 %	0 %	0 %	100 %	260063012
49105	NC_013222	T	6	6	2663422	2663427	0 %	100 %	0 %	0 %	260063012
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49107	NC_013222	AGGT	2	8	2663519	2663526	25 %	25 %	50 %	0 %	260063012
49108	NC_013222	GCA	2	6	2663581	2663586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063012
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49111	NC_013222	GC	4	8	2663689	2663696	0 %	0 %	50 %	50 %	260063012
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49116	NC_013222	GTT	2	6	2664000	2664005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063013
49117	NC_013222	GCGG	2	8	2664007	2664014	0 %	0 %	75 %	25 %	260063013
49118	NC_013222	CTG	2	6	2664047	2664052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063013
49119	NC_013222	TCC	2	6	2664059	2664064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063013
49120	NC_013222	TCC	2	6	2664108	2664113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063013
49121	NC_013222	GCC	2	6	2664144	2664149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063013
49122	NC_013222	GAGCAG	2	12	2664151	2664162	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260063013
49123	NC_013222	TAG	2	6	2664167	2664172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063013
49124	NC_013222	ATA	2	6	2664277	2664282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49125	NC_013222	TCA	2	6	2664392	2664397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063014
49126	NC_013222	AAC	2	6	2664479	2664484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063014
49127	NC_013222	GCT	2	6	2664549	2664554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063014
49128	NC_013222	AACCAG	2	12	2664589	2664600	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260063014
49129	NC_013222	CAA	2	6	2664708	2664713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063014
49130	NC_013222	CAA	2	6	2664738	2664743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063014
49131	NC_013222	A	6	6	2664756	2664761	100 %	0 %	0 %	0 %	260063014
49132	NC_013222	G	7	7	2664787	2664793	0 %	0 %	100 %	0 %	260063014
49133	NC_013222	TGG	2	6	2664857	2664862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063014
49134	NC_013222	GCG	2	6	2665052	2665057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063014
49135	NC_013222	CAA	2	6	2665290	2665295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063014
49136	NC_013222	A	6	6	2665294	2665299	100 %	0 %	0 %	0 %	260063014
49137	NC_013222	A	6	6	2665304	2665309	100 %	0 %	0 %	0 %	260063014
49138	NC_013222	CGA	2	6	2665311	2665316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063014
49139	NC_013222	ACT	2	6	2665371	2665376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49140	NC_013222	AGA	2	6	2665437	2665442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063015
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49142	NC_013222	GAG	2	6	2665534	2665539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063015
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49144	NC_013222	CAT	2	6	2665641	2665646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063015
49145	NC_013222	CGGTT	2	10	2665687	2665696	0 %	40 %	40 %	20 %	260063015
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49148	NC_013222	CG	3	6	2665916	2665921	0 %	0 %	50 %	50 %	260063015
49149	NC_013222	TTA	2	6	2666165	2666170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063015
49150	NC_013222	AGACGA	2	12	2666196	2666207	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260063015
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49154	NC_013222	TAC	2	6	2666401	2666406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063015
49155	NC_013222	CGT	2	6	2666502	2666507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063015
49156	NC_013222	AAC	2	6	2666534	2666539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063015
49157	NC_013222	TTCC	2	8	2666593	2666600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49158	NC_013222	TAA	2	6	2666610	2666615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49159	NC_013222	GCA	2	6	2666684	2666689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063016
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49161	NC_013222	AG	3	6	2666698	2666703	50 %	0 %	50 %	0 %	260063016
49162	NC_013222	TG	3	6	2666779	2666784	0 %	50 %	50 %	0 %	260063016
49163	NC_013222	GAT	2	6	2667130	2667135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063016
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49177	NC_013222	AT	3	6	2667915	2667920	50 %	50 %	0 %	0 %	260063016
49178	NC_013222	GGA	2	6	2668044	2668049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49179	NC_013222	TGC	2	6	2668122	2668127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063017
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49188	NC_013222	TCC	2	6	2668458	2668463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063017
49189	NC_013222	TTC	2	6	2668491	2668496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063017
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49195	NC_013222	TGA	2	6	2668876	2668881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063017
49196	NC_013222	GGT	2	6	2668919	2668924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063017
49197	NC_013222	TGC	2	6	2668936	2668941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063017
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49199	NC_013222	GTA	2	6	2669039	2669044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063017
49200	NC_013222	GCCG	2	8	2669057	2669064	0 %	0 %	50 %	50 %	260063017
49201	NC_013222	G	6	6	2669086	2669091	0 %	0 %	100 %	0 %	260063017
49202	NC_013222	T	8	8	2669204	2669211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49203	NC_013222	CCG	2	6	2669297	2669302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063018
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49222	NC_013222	CAC	2	6	2670274	2670279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063018
49223	NC_013222	ATA	2	6	2670280	2670285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063018
49224	NC_013222	A	6	6	2670424	2670429	100 %	0 %	0 %	0 %	260063018
49225	NC_013222	TCG	2	6	2670506	2670511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063018
49226	NC_013222	ATG	2	6	2670560	2670565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063018
49227	NC_013222	ACGT	2	8	2670590	2670597	25 %	25 %	25 %	25 %	260063018
49228	NC_013222	TCC	2	6	2670614	2670619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063018
49229	NC_013222	A	7	7	2670711	2670717	100 %	0 %	0 %	0 %	260063018
49230	NC_013222	CCG	2	6	2670746	2670751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063018
49231	NC_013222	TCC	2	6	2670779	2670784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063018
49232	NC_013222	CAGC	2	8	2670849	2670856	25 %	0 %	25 %	50 %	260063018
49233	NC_013222	T	6	6	2670961	2670966	0 %	100 %	0 %	0 %	260063018
49234	NC_013222	TTCC	2	8	2670985	2670992	0 %	50 %	0 %	50 %	260063018
49235	NC_013222	TTC	2	6	2671087	2671092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063018
49236	NC_013222	AGT	2	6	2671188	2671193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063018
49237	NC_013222	T	6	6	2671207	2671212	0 %	100 %	0 %	0 %	260063018
49238	NC_013222	GGC	2	6	2671253	2671258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063018
49239	NC_013222	CGGGC	2	10	2671348	2671357	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49240	NC_013222	A	6	6	2671361	2671366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49241	NC_013222	GA	3	6	2671382	2671387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49242	NC_013222	A	6	6	2671393	2671398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49243	NC_013222	GAT	2	6	2671428	2671433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063019
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49245	NC_013222	CTG	2	6	2671522	2671527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063019
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49252	NC_013222	GGA	2	6	2671877	2671882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063020
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49256	NC_013222	CCGG	2	8	2672108	2672115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49257	NC_013222	GCATC	2	10	2672237	2672246	20 %	20 %	20 %	40 %	260063021
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49259	NC_013222	TGCCC	2	10	2672279	2672288	0 %	20 %	20 %	60 %	260063021
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49265	NC_013222	TCCA	2	8	2672712	2672719	25 %	25 %	0 %	50 %	260063021
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49272	NC_013222	CCT	2	6	2672953	2672958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063021
49273	NC_013222	TTGG	2	8	2673033	2673040	0 %	50 %	50 %	0 %	260063021
49274	NC_013222	TTC	2	6	2673099	2673104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063021
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49320	NC_013222	ATC	2	6	2676084	2676089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063024
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49323	NC_013222	GGT	2	6	2676197	2676202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063024
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49327	NC_013222	ATC	2	6	2676300	2676305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063024
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49331	NC_013222	CTG	2	6	2676471	2676476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063024
49332	NC_013222	GGT	2	6	2676515	2676520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063024
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49337	NC_013222	GAC	2	6	2676810	2676815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063024
49338	NC_013222	ATT	2	6	2676843	2676848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063024
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49340	NC_013222	GCGG	2	8	2676972	2676979	0 %	0 %	75 %	25 %	260063024
49341	NC_013222	C	6	6	2677051	2677056	0 %	0 %	0 %	100 %	260063024
49342	NC_013222	GCCCA	2	10	2677068	2677077	20 %	0 %	20 %	60 %	260063024
49343	NC_013222	AGG	2	6	2677193	2677198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063024
49344	NC_013222	CG	3	6	2677204	2677209	0 %	0 %	50 %	50 %	260063024
49345	NC_013222	A	6	6	2677218	2677223	100 %	0 %	0 %	0 %	260063024
49346	NC_013222	GCG	2	6	2677252	2677257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063024
49347	NC_013222	TCC	2	6	2677387	2677392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063025
49348	NC_013222	TGG	2	6	2677454	2677459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063025
49349	NC_013222	CGA	2	6	2677473	2677478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063025
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49351	NC_013222	CG	3	6	2677563	2677568	0 %	0 %	50 %	50 %	260063025
49352	NC_013222	GATCT	2	10	2677591	2677600	20 %	40 %	20 %	20 %	260063025
49353	NC_013222	CCT	2	6	2677746	2677751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063025
49354	NC_013222	ATC	2	6	2677771	2677776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063025
49355	NC_013222	ATG	2	6	2677777	2677782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063025
49356	NC_013222	GCT	2	6	2677902	2677907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063025
49357	NC_013222	ATG	2	6	2677930	2677935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063025
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49362	NC_013222	T	7	7	2678404	2678410	0 %	100 %	0 %	0 %	260063026
49363	NC_013222	G	6	6	2678420	2678425	0 %	0 %	100 %	0 %	260063026
49364	NC_013222	ACC	2	6	2678461	2678466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063026
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49367	NC_013222	CG	3	6	2678871	2678876	0 %	0 %	50 %	50 %	260063026
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49372	NC_013222	CAG	2	6	2679121	2679126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063026
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49374	NC_013222	AGG	2	6	2679243	2679248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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49376	NC_013222	GAC	2	6	2679322	2679327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49377	NC_013222	GCC	2	6	2679334	2679339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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49401	NC_013222	GCCG	2	8	2680628	2680635	0 %	0 %	50 %	50 %	260063028
49402	NC_013222	GTTT	2	8	2680675	2680682	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49403	NC_013222	AACA	2	8	2680701	2680708	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49404	NC_013222	CGG	2	6	2680853	2680858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063029
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49425	NC_013222	A	6	6	2681926	2681931	100 %	0 %	0 %	0 %	260063030
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49454	NC_013222	T	6	6	2683875	2683880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49455	NC_013222	GGC	2	6	2683929	2683934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063031
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49458	NC_013222	C	6	6	2683985	2683990	0 %	0 %	0 %	100 %	260063031
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49461	NC_013222	ATC	2	6	2684024	2684029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063031
49462	NC_013222	CAC	2	6	2684111	2684116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49463	NC_013222	CAAAT	2	10	2684145	2684154	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49464	NC_013222	A	8	8	2684157	2684164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49465	NC_013222	TC	3	6	2684167	2684172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49466	NC_013222	CCG	2	6	2684282	2684287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063032
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49468	NC_013222	GCC	2	6	2684340	2684345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063032
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49470	NC_013222	GCC	2	6	2684398	2684403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063032
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49497	NC_013222	GCT	2	6	2685636	2685641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063032
49498	NC_013222	GCC	2	6	2685677	2685682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49499	NC_013222	T	8	8	2685696	2685703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49500	NC_013222	GT	3	6	2685718	2685723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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