MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47510	NC_013222	GCC	2	6	2574980	2574985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062924
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47555	NC_013222	AGCC	2	8	2577236	2577243	25 %	0 %	25 %	50 %	260062927
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47619	NC_013222	CGC	2	6	2580489	2580494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062930
47620	NC_013222	ACTC	2	8	2580510	2580517	25 %	25 %	0 %	50 %	260062930
47621	NC_013222	ATGCCG	2	12	2580569	2580580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260062930
47622	NC_013222	GATCC	2	10	2580668	2580677	20 %	20 %	20 %	40 %	260062930
47623	NC_013222	TCC	2	6	2580797	2580802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062930
47624	NC_013222	ATC	2	6	2580887	2580892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062930
47625	NC_013222	GTC	2	6	2580910	2580915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062930
47626	NC_013222	GTC	2	6	2581102	2581107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062930
47627	NC_013222	TGG	2	6	2581214	2581219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062930
47628	NC_013222	AGGC	2	8	2581284	2581291	25 %	0 %	50 %	25 %	260062930
47629	NC_013222	CTT	2	6	2581428	2581433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062930
47630	NC_013222	T	6	6	2581466	2581471	0 %	100 %	0 %	0 %	260062931
47631	NC_013222	GCC	2	6	2581638	2581643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062931
47632	NC_013222	TGT	2	6	2581645	2581650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062931
47633	NC_013222	ATC	2	6	2581670	2581675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062931
47634	NC_013222	GCAG	2	8	2581717	2581724	25 %	0 %	50 %	25 %	260062931
47635	NC_013222	CCGT	2	8	2581734	2581741	0 %	25 %	25 %	50 %	260062931
47636	NC_013222	CAG	2	6	2581781	2581786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062931
47637	NC_013222	CAT	2	6	2581876	2581881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062931
47638	NC_013222	ATC	2	6	2582013	2582018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062931
47639	NC_013222	GTC	2	6	2582066	2582071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062931
47640	NC_013222	ATCC	2	8	2582090	2582097	25 %	25 %	0 %	50 %	260062931
47641	NC_013222	GT	3	6	2582184	2582189	0 %	50 %	50 %	0 %	260062931
47642	NC_013222	GGT	2	6	2582218	2582223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062931
47643	NC_013222	TCC	2	6	2582370	2582375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062931
47644	NC_013222	TCG	2	6	2582430	2582435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062931
47645	NC_013222	TGA	2	6	2582506	2582511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062931
47646	NC_013222	AAG	2	6	2582566	2582571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062931
47647	NC_013222	CTTTT	2	10	2582584	2582593	0 %	80 %	0 %	20 %	260062931
47648	NC_013222	CAA	2	6	2582640	2582645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47649	NC_013222	TTCA	2	8	2582762	2582769	25 %	50 %	0 %	25 %	260062932
47650	NC_013222	TCG	2	6	2582781	2582786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062932
47651	NC_013222	CCT	2	6	2582818	2582823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062932
47652	NC_013222	AGT	2	6	2582862	2582867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062932
47653	NC_013222	C	7	7	2582890	2582896	0 %	0 %	0 %	100 %	260062932
47654	NC_013222	CTG	2	6	2582919	2582924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062932
47655	NC_013222	GAT	2	6	2582927	2582932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062932
47656	NC_013222	TCG	2	6	2582958	2582963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062932
47657	NC_013222	GGA	2	6	2583152	2583157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062932
47658	NC_013222	TGGC	2	8	2583232	2583239	0 %	25 %	50 %	25 %	260062932
47659	NC_013222	T	6	6	2583253	2583258	0 %	100 %	0 %	0 %	260062932
47660	NC_013222	CGGGAT	2	12	2583339	2583350	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260062933
47661	NC_013222	GCC	2	6	2583373	2583378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062933
47662	NC_013222	CCG	2	6	2583439	2583444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062933
47663	NC_013222	CGT	2	6	2583518	2583523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062933
47664	NC_013222	GCC	2	6	2583612	2583617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062933
47665	NC_013222	CCAT	3	12	2583640	2583651	25 %	25 %	0 %	50 %	260062933
47666	NC_013222	ACG	2	6	2583670	2583675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062933
47667	NC_013222	GCC	2	6	2583694	2583699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062933
47668	NC_013222	GACCG	2	10	2583721	2583730	20 %	0 %	40 %	40 %	260062933
47669	NC_013222	GAA	2	6	2583793	2583798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062933
47670	NC_013222	CGG	2	6	2583844	2583849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062933
47671	NC_013222	TCC	2	6	2583877	2583882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062933
47672	NC_013222	CAGG	2	8	2584017	2584024	25 %	0 %	50 %	25 %	260062933
47673	NC_013222	CGT	2	6	2584078	2584083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062934
47674	NC_013222	TGC	2	6	2584095	2584100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062934
47675	NC_013222	CACG	2	8	2584261	2584268	25 %	0 %	25 %	50 %	260062934
47676	NC_013222	TGC	2	6	2584308	2584313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062934
47677	NC_013222	GCA	2	6	2584402	2584407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062934
47678	NC_013222	TCT	2	6	2584536	2584541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062934
47679	NC_013222	ATCC	2	8	2584547	2584554	25 %	25 %	0 %	50 %	260062934
47680	NC_013222	CAT	2	6	2584714	2584719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062935
47681	NC_013222	CCG	2	6	2584720	2584725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062935
47682	NC_013222	TCC	2	6	2584869	2584874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062935
47683	NC_013222	GCC	2	6	2584988	2584993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062935
47684	NC_013222	GTC	2	6	2585033	2585038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062935
47685	NC_013222	TGG	2	6	2585221	2585226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062935
47686	NC_013222	TGC	2	6	2585340	2585345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062936
47687	NC_013222	T	6	6	2585346	2585351	0 %	100 %	0 %	0 %	260062936
47688	NC_013222	TCC	2	6	2585705	2585710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062936
47689	NC_013222	CTGC	2	8	2585726	2585733	0 %	25 %	25 %	50 %	260062936
47690	NC_013222	TGG	2	6	2585906	2585911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062937
47691	NC_013222	TCCGG	2	10	2585924	2585933	0 %	20 %	40 %	40 %	260062937
47692	NC_013222	A	6	6	2586061	2586066	100 %	0 %	0 %	0 %	260062937
47693	NC_013222	CCAG	2	8	2586128	2586135	25 %	0 %	25 %	50 %	260062937
47694	NC_013222	GTC	2	6	2586174	2586179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062937
47695	NC_013222	ATGGT	2	10	2586271	2586280	20 %	40 %	40 %	0 %	260062937
47696	NC_013222	A	6	6	2586363	2586368	100 %	0 %	0 %	0 %	260062937
47697	NC_013222	GAC	2	6	2586453	2586458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062937
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47699	NC_013222	TGCCCG	2	12	2586701	2586712	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260062937
47700	NC_013222	TCA	2	6	2586797	2586802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062937
47701	NC_013222	TGGT	2	8	2586862	2586869	0 %	50 %	50 %	0 %	260062937
47702	NC_013222	ACCAGG	2	12	2586871	2586882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062937
47703	NC_013222	GGA	2	6	2586932	2586937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062937
47704	NC_013222	TAT	2	6	2587005	2587010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260062937
47705	NC_013222	TTC	2	6	2587021	2587026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062937
47706	NC_013222	GCAG	2	8	2587123	2587130	25 %	0 %	50 %	25 %	260062938
47707	NC_013222	ACG	2	6	2587164	2587169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062938
47708	NC_013222	GC	3	6	2587196	2587201	0 %	0 %	50 %	50 %	260062938
47709	NC_013222	GC	3	6	2587362	2587367	0 %	0 %	50 %	50 %	260062938
47710	NC_013222	CGG	2	6	2587394	2587399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062938
47711	NC_013222	ACC	2	6	2587497	2587502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062938
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47714	NC_013222	CCCG	2	8	2587614	2587621	0 %	0 %	25 %	75 %	260062938
47715	NC_013222	GTT	2	6	2587643	2587648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062938
47716	NC_013222	GGC	2	6	2587794	2587799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062938
47717	NC_013222	GGC	2	6	2587808	2587813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062938
47718	NC_013222	AGA	2	6	2587831	2587836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062938
47719	NC_013222	TCG	2	6	2587860	2587865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062938
47720	NC_013222	AGC	2	6	2587881	2587886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062938
47721	NC_013222	CTC	2	6	2587889	2587894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062938
47722	NC_013222	CTT	2	6	2587922	2587927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062938
47723	NC_013222	TGG	2	6	2587938	2587943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062938
47724	NC_013222	CCGCTG	2	12	2588013	2588024	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260062938
47725	NC_013222	CTTC	2	8	2588108	2588115	0 %	50 %	0 %	50 %	260062939
47726	NC_013222	T	6	6	2588118	2588123	0 %	100 %	0 %	0 %	260062939
47727	NC_013222	CTCGGC	2	12	2588187	2588198	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260062939
47728	NC_013222	C	6	6	2588231	2588236	0 %	0 %	0 %	100 %	260062939
47729	NC_013222	TGG	2	6	2588315	2588320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062939
47730	NC_013222	GT	3	6	2588324	2588329	0 %	50 %	50 %	0 %	260062939
47731	NC_013222	GCA	2	6	2588411	2588416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062939
47732	NC_013222	TTC	2	6	2588421	2588426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062939
47733	NC_013222	GAT	2	6	2588439	2588444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062939
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47735	NC_013222	GGA	2	6	2588490	2588495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062939
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47737	NC_013222	ATC	2	6	2588506	2588511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062939
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47739	NC_013222	GCA	2	6	2588561	2588566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062939
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47769	NC_013222	TAAA	2	8	2590320	2590327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47770	NC_013222	A	7	7	2590325	2590331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47771	NC_013222	CAACA	2	10	2590371	2590380	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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47773	NC_013222	TG	3	6	2590422	2590427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47774	NC_013222	TTC	3	9	2590431	2590439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47844	NC_013222	TAT	2	6	2594363	2594368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47853	NC_013222	ATG	2	6	2594842	2594847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062944
47854	NC_013222	GCC	2	6	2594998	2595003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062944
47855	NC_013222	ATG	2	6	2595007	2595012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062944
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47860	NC_013222	CGA	2	6	2595146	2595151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062944
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47921	NC_013222	GTT	2	6	2598373	2598378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062948
47922	NC_013222	CCA	2	6	2598528	2598533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062948
47923	NC_013222	CGG	2	6	2598555	2598560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062948
47924	NC_013222	TAA	2	6	2598615	2598620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062948
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47927	NC_013222	A	6	6	2598679	2598684	100 %	0 %	0 %	0 %	260062948
47928	NC_013222	GGA	2	6	2598688	2598693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062948
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47934	NC_013222	TCG	2	6	2599134	2599139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062949
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47937	NC_013222	GT	3	6	2599290	2599295	0 %	50 %	50 %	0 %	260062949
47938	NC_013222	TG	3	6	2599312	2599317	0 %	50 %	50 %	0 %	260062949
47939	NC_013222	ATCTGG	2	12	2599320	2599331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260062949
47940	NC_013222	TGG	2	6	2599360	2599365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062949
47941	NC_013222	GTG	2	6	2599389	2599394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062949
47942	NC_013222	TCCC	2	8	2599527	2599534	0 %	25 %	0 %	75 %	260062949
47943	NC_013222	CAC	2	6	2599592	2599597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062949
47944	NC_013222	TCC	2	6	2599800	2599805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062949
47945	NC_013222	GTG	2	6	2599818	2599823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062949
47946	NC_013222	TTG	2	6	2599851	2599856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062949
47947	NC_013222	ATG	2	6	2599863	2599868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062949
47948	NC_013222	AGCC	2	8	2599927	2599934	25 %	0 %	25 %	50 %	260062949
47949	NC_013222	CTT	2	6	2599939	2599944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062949
47950	NC_013222	TAC	2	6	2600039	2600044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47951	NC_013222	GTG	2	6	2600061	2600066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47952	NC_013222	GGA	2	6	2600199	2600204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062950
47953	NC_013222	CTGC	2	8	2600298	2600305	0 %	25 %	25 %	50 %	260062950
47954	NC_013222	CTT	3	9	2600347	2600355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062950
47955	NC_013222	AGC	2	6	2600384	2600389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062950
47956	NC_013222	CGT	2	6	2600460	2600465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062950
47957	NC_013222	GCC	2	6	2600509	2600514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062950
47958	NC_013222	GCG	2	6	2600665	2600670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062950
47959	NC_013222	CGT	2	6	2600727	2600732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062950
47960	NC_013222	AAC	2	6	2600874	2600879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260062950
47961	NC_013222	CTC	2	6	2600956	2600961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062950
47962	NC_013222	GCA	2	6	2601027	2601032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062950
47963	NC_013222	TCC	3	9	2601056	2601064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062950
47964	NC_013222	CGG	2	6	2601086	2601091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062950
47965	NC_013222	GTG	2	6	2601136	2601141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062950
47966	NC_013222	TGA	2	6	2601152	2601157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062950
47967	NC_013222	CTG	2	6	2601248	2601253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062950
47968	NC_013222	GGC	2	6	2601320	2601325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062950
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47970	NC_013222	GAC	2	6	2601450	2601455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062951
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47973	NC_013222	GGT	2	6	2601653	2601658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062951
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47975	NC_013222	GAA	2	6	2601693	2601698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062951
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47998	NC_013222	CAG	2	6	2603017	2603022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47999	NC_013222	T	6	6	2603112	2603117	0 %	100 %	0 %	0 %	260062952
48000	NC_013222	ATC	2	6	2603202	2603207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062952

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