MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47004	NC_013222	GGA	2	6	2543829	2543834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062891
47005	NC_013222	GCA	2	6	2543865	2543870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062891
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47007	NC_013222	GATG	2	8	2543917	2543924	25 %	25 %	50 %	0 %	260062891
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47009	NC_013222	GGAT	2	8	2544017	2544024	25 %	25 %	50 %	0 %	260062892
47010	NC_013222	G	6	6	2544038	2544043	0 %	0 %	100 %	0 %	260062892
47011	NC_013222	A	6	6	2544087	2544092	100 %	0 %	0 %	0 %	260062892
47012	NC_013222	AGG	2	6	2544133	2544138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062892
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47014	NC_013222	CGGGA	2	10	2544179	2544188	20 %	0 %	60 %	20 %	260062892
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47019	NC_013222	CGTGT	2	10	2544408	2544417	0 %	40 %	40 %	20 %	260062892
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47110	NC_013222	GCCA	2	8	2549573	2549580	25 %	0 %	25 %	50 %	260062897
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47118	NC_013222	AGGT	2	8	2549886	2549893	25 %	25 %	50 %	0 %	260062898
47119	NC_013222	GT	3	6	2550003	2550008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47120	NC_013222	GTC	2	6	2550018	2550023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47121	NC_013222	TTCCT	2	10	2550190	2550199	0 %	60 %	0 %	40 %	260062899
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47123	NC_013222	AACGGC	2	12	2550235	2550246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062899
47124	NC_013222	CCTGGG	2	12	2550249	2550260	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260062899
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47138	NC_013222	CGCA	2	8	2551236	2551243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47139	NC_013222	C	6	6	2551264	2551269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47140	NC_013222	T	8	8	2551277	2551284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47141	NC_013222	TA	3	6	2551320	2551325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47142	NC_013222	CTG	2	6	2551509	2551514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062900
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47149	NC_013222	CCGAT	2	10	2552145	2552154	20 %	20 %	20 %	40 %	260062901
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47183	NC_013222	CGTC	2	8	2554573	2554580	0 %	25 %	25 %	50 %	260062905
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47219	NC_013222	T	6	6	2557004	2557009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47220	NC_013222	GAA	2	6	2557066	2557071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47221	NC_013222	CAA	2	6	2557091	2557096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47222	NC_013222	TAA	2	6	2557104	2557109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062907
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47225	NC_013222	CAGG	2	8	2557292	2557299	25 %	0 %	50 %	25 %	260062907
47226	NC_013222	TCT	2	6	2557338	2557343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062907
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47230	NC_013222	ACG	2	6	2557770	2557775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062907
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47232	NC_013222	CGG	2	6	2557883	2557888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062907
47233	NC_013222	TGGT	2	8	2557931	2557938	0 %	50 %	50 %	0 %	260062907
47234	NC_013222	GTC	2	6	2558003	2558008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062907
47235	NC_013222	GATTGC	2	12	2558018	2558029	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260062907
47236	NC_013222	GTT	2	6	2558036	2558041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47237	NC_013222	TCC	2	6	2558093	2558098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062908
47238	NC_013222	GCCT	2	8	2558110	2558117	0 %	25 %	25 %	50 %	260062908
47239	NC_013222	GGC	2	6	2558137	2558142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062908
47240	NC_013222	TGC	2	6	2558217	2558222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062908
47241	NC_013222	T	6	6	2558250	2558255	0 %	100 %	0 %	0 %	260062908
47242	NC_013222	TCT	2	6	2558409	2558414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062908
47243	NC_013222	GTA	2	6	2558464	2558469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062908
47244	NC_013222	AGT	2	6	2558504	2558509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062908
47245	NC_013222	T	6	6	2558548	2558553	0 %	100 %	0 %	0 %	260062908
47246	NC_013222	GGC	2	6	2558572	2558577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47247	NC_013222	TAAG	2	8	2558663	2558670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47248	NC_013222	GAA	2	6	2558694	2558699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47249	NC_013222	CCTGA	2	10	2558972	2558981	20 %	20 %	20 %	40 %	260062909
47250	NC_013222	TGA	2	6	2559025	2559030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062909
47251	NC_013222	TGG	2	6	2559065	2559070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062909
47252	NC_013222	A	7	7	2559158	2559164	100 %	0 %	0 %	0 %	260062909
47253	NC_013222	AGA	2	6	2559208	2559213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062909
47254	NC_013222	TTCG	2	8	2559336	2559343	0 %	50 %	25 %	25 %	260062909
47255	NC_013222	TTA	2	6	2559451	2559456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260062909
47256	NC_013222	TGACC	2	10	2559508	2559517	20 %	20 %	20 %	40 %	260062909
47257	NC_013222	CCA	2	6	2559565	2559570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062909
47258	NC_013222	A	7	7	2559646	2559652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47259	NC_013222	T	6	6	2559669	2559674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47260	NC_013222	AC	3	6	2559679	2559684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47261	NC_013222	CTG	2	6	2559707	2559712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062910
47262	NC_013222	CAG	2	6	2559724	2559729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062910
47263	NC_013222	TTCA	2	8	2559733	2559740	25 %	50 %	0 %	25 %	260062910
47264	NC_013222	ATTC	2	8	2559858	2559865	25 %	50 %	0 %	25 %	260062911
47265	NC_013222	CT	3	6	2559886	2559891	0 %	50 %	0 %	50 %	260062911
47266	NC_013222	GGA	2	6	2560012	2560017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47267	NC_013222	TTG	3	9	2560047	2560055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47268	NC_013222	GGT	2	6	2560072	2560077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47269	NC_013222	TTC	2	6	2560191	2560196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062912
47270	NC_013222	A	6	6	2560246	2560251	100 %	0 %	0 %	0 %	260062912
47271	NC_013222	TCCCGG	2	12	2560391	2560402	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260062912
47272	NC_013222	GTA	2	6	2560432	2560437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062912
47273	NC_013222	GCC	2	6	2560503	2560508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062912
47274	NC_013222	CAGC	2	8	2560974	2560981	25 %	0 %	25 %	50 %	260062912
47275	NC_013222	GCC	2	6	2561028	2561033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062912
47276	NC_013222	CAG	2	6	2561074	2561079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062912
47277	NC_013222	GCC	2	6	2561120	2561125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062912
47278	NC_013222	GGCCG	2	10	2561137	2561146	0 %	0 %	60 %	40 %	260062912
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47280	NC_013222	ATC	2	6	2561279	2561284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062913
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47282	NC_013222	CCG	2	6	2561307	2561312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062913
47283	NC_013222	C	6	6	2561347	2561352	0 %	0 %	0 %	100 %	260062913
47284	NC_013222	CTG	2	6	2561469	2561474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062913
47285	NC_013222	CGC	2	6	2561599	2561604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062913
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47290	NC_013222	GCC	2	6	2561824	2561829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062913
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47292	NC_013222	C	6	6	2561900	2561905	0 %	0 %	0 %	100 %	260062913
47293	NC_013222	TCC	2	6	2561976	2561981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062913
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47302	NC_013222	CAAA	2	8	2562461	2562468	75 %	0 %	0 %	25 %	260062913
47303	NC_013222	GCA	2	6	2562499	2562504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062913
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47305	NC_013222	GCT	2	6	2562747	2562752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062913
47306	NC_013222	CGA	2	6	2562872	2562877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062913
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47309	NC_013222	GCG	2	6	2562938	2562943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062913
47310	NC_013222	TCCGA	2	10	2563055	2563064	20 %	20 %	20 %	40 %	260062913
47311	NC_013222	GCTT	2	8	2563139	2563146	0 %	50 %	25 %	25 %	260062913
47312	NC_013222	AAGA	2	8	2563320	2563327	75 %	0 %	25 %	0 %	260062913
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47318	NC_013222	CAG	2	6	2563512	2563517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062913
47319	NC_013222	GGA	2	6	2563696	2563701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062914
47320	NC_013222	ACC	3	9	2563706	2563714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062914
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47324	NC_013222	A	6	6	2563867	2563872	100 %	0 %	0 %	0 %	260062914
47325	NC_013222	GCCA	2	8	2563943	2563950	25 %	0 %	25 %	50 %	260062914
47326	NC_013222	AAC	2	6	2563958	2563963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260062914
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47330	NC_013222	TCC	2	6	2564195	2564200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062914
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47333	NC_013222	AAT	2	6	2564272	2564277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062914
47334	NC_013222	GCCA	2	8	2564354	2564361	25 %	0 %	25 %	50 %	260062914
47335	NC_013222	TTC	2	6	2564363	2564368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062914
47336	NC_013222	GT	3	6	2564459	2564464	0 %	50 %	50 %	0 %	260062914
47337	NC_013222	CAC	2	6	2564479	2564484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062914
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47339	NC_013222	C	6	6	2564646	2564651	0 %	0 %	0 %	100 %	260062914
47340	NC_013222	CCA	2	6	2564715	2564720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062914
47341	NC_013222	ATC	2	6	2564734	2564739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062914
47342	NC_013222	TGC	2	6	2564742	2564747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062914
47343	NC_013222	CGT	2	6	2564748	2564753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062914
47344	NC_013222	TAC	2	6	2564755	2564760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062914
47345	NC_013222	AAT	2	6	2564845	2564850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062914
47346	NC_013222	TGGA	2	8	2564921	2564928	25 %	25 %	50 %	0 %	260062914
47347	NC_013222	TGG	2	6	2564934	2564939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062914
47348	NC_013222	ATG	2	6	2564951	2564956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062914
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47350	NC_013222	AAC	2	6	2564984	2564989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260062914
47351	NC_013222	GGTT	2	8	2565071	2565078	0 %	50 %	50 %	0 %	260062915
47352	NC_013222	TCC	2	6	2565195	2565200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062915
47353	NC_013222	TCT	2	6	2565366	2565371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062915
47354	NC_013222	GGC	2	6	2565386	2565391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062915
47355	NC_013222	TCCC	2	8	2565467	2565474	0 %	25 %	0 %	75 %	260062915
47356	NC_013222	GCC	2	6	2565480	2565485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062915
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47363	NC_013222	CTC	2	6	2565806	2565811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062915
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47374	NC_013222	TGC	2	6	2566407	2566412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062915
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47381	NC_013222	A	6	6	2566920	2566925	100 %	0 %	0 %	0 %	260062915
47382	NC_013222	CCG	2	6	2566941	2566946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062915
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47387	NC_013222	C	7	7	2567332	2567338	0 %	0 %	0 %	100 %	260062916
47388	NC_013222	TCG	2	6	2567375	2567380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062916
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47390	NC_013222	TTTTC	2	10	2567397	2567406	0 %	80 %	0 %	20 %	260062916
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47392	NC_013222	TCG	2	6	2567487	2567492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062917
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47403	NC_013222	ATCAGG	2	12	2568030	2568041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260062917
47404	NC_013222	TTC	2	6	2568051	2568056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062917
47405	NC_013222	CTTCC	2	10	2568176	2568185	0 %	40 %	0 %	60 %	260062917
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47407	NC_013222	C	6	6	2568315	2568320	0 %	0 %	0 %	100 %	260062917
47408	NC_013222	GAT	2	6	2568329	2568334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062917
47409	NC_013222	T	8	8	2568334	2568341	0 %	100 %	0 %	0 %	260062917
47410	NC_013222	C	7	7	2568392	2568398	0 %	0 %	0 %	100 %	260062917
47411	NC_013222	TCA	2	6	2568562	2568567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062917
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47414	NC_013222	TGC	2	6	2569104	2569109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062917
47415	NC_013222	AGG	2	6	2569110	2569115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062917
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47417	NC_013222	TTG	2	6	2569251	2569256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47418	NC_013222	CTT	2	6	2569298	2569303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062918
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47425	NC_013222	CTA	2	6	2569754	2569759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062918
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47444	NC_013222	TCG	2	6	2570868	2570873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062919
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47448	NC_013222	AAAT	2	8	2571066	2571073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47449	NC_013222	GGA	2	6	2571117	2571122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47450	NC_013222	CGA	2	6	2571216	2571221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062920
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47453	NC_013222	CTTCGT	2	12	2571453	2571464	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260062920
47454	NC_013222	TGG	2	6	2571546	2571551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062920
47455	NC_013222	A	6	6	2571556	2571561	100 %	0 %	0 %	0 %	260062920
47456	NC_013222	GCC	2	6	2571577	2571582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062920
47457	NC_013222	TCC	2	6	2571683	2571688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062920
47458	NC_013222	CAA	2	6	2571732	2571737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260062920
47459	NC_013222	AGC	2	6	2571764	2571769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062920
47460	NC_013222	GGC	2	6	2571832	2571837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062920
47461	NC_013222	CGT	2	6	2571849	2571854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062920
47462	NC_013222	ACC	2	6	2571860	2571865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062920
47463	NC_013222	ATT	2	6	2571871	2571876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260062920
47464	NC_013222	AGG	2	6	2571890	2571895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062920
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47466	NC_013222	GCCG	2	8	2571913	2571920	0 %	0 %	50 %	50 %	260062920
47467	NC_013222	CACTG	2	10	2571928	2571937	20 %	20 %	20 %	40 %	260062920
47468	NC_013222	CGG	2	6	2571975	2571980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062920
47469	NC_013222	AGG	2	6	2571989	2571994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062920
47470	NC_013222	GGC	2	6	2572144	2572149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062920
47471	NC_013222	GC	3	6	2572258	2572263	0 %	0 %	50 %	50 %	260062920
47472	NC_013222	GTA	2	6	2572288	2572293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062920
47473	NC_013222	CTG	2	6	2572388	2572393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062920
47474	NC_013222	CAG	2	6	2572417	2572422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062920
47475	NC_013222	GCC	2	6	2572481	2572486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062920
47476	NC_013222	TCC	2	6	2572657	2572662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47477	NC_013222	T	6	6	2572722	2572727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47478	NC_013222	TCC	2	6	2572747	2572752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47479	NC_013222	A	7	7	2572842	2572848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47480	NC_013222	GAA	2	6	2572939	2572944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062921
47481	NC_013222	CCT	2	6	2572989	2572994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062921
47482	NC_013222	A	7	7	2573057	2573063	100 %	0 %	0 %	0 %	260062921
47483	NC_013222	GGA	2	6	2573148	2573153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062921
47484	NC_013222	GAT	2	6	2573196	2573201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062921
47485	NC_013222	GTT	2	6	2573238	2573243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062921
47486	NC_013222	AGC	2	6	2573264	2573269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062921
47487	NC_013222	TCA	2	6	2573304	2573309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062922
47488	NC_013222	AAAT	2	8	2573403	2573410	75 %	25 %	0 %	0 %	260062922
47489	NC_013222	TCCAGT	2	12	2573549	2573560	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260062922
47490	NC_013222	GTA	2	6	2573644	2573649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062922
47491	NC_013222	CGC	2	6	2573652	2573657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062922
47492	NC_013222	CCCG	2	8	2573669	2573676	0 %	0 %	25 %	75 %	260062922
47493	NC_013222	TCG	2	6	2573801	2573806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062922
47494	NC_013222	TGT	2	6	2573871	2573876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062922
47495	NC_013222	TTAATA	2	12	2574021	2574032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47496	NC_013222	ATC	2	6	2574079	2574084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062923
47497	NC_013222	CA	3	6	2574098	2574103	50 %	0 %	0 %	50 %	260062923
47498	NC_013222	ACG	2	6	2574135	2574140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062923
47499	NC_013222	GAA	2	6	2574145	2574150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062923
47500	NC_013222	TGG	2	6	2574239	2574244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062923

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