MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013222	TGC	2	6	80546	80551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060657
1502	NC_013222	CCA	2	6	80555	80560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060657
1503	NC_013222	TGGG	2	8	80581	80588	0 %	25 %	75 %	0 %	260060657
1504	NC_013222	GGTC	2	8	80624	80631	0 %	25 %	50 %	25 %	260060657
1505	NC_013222	TCCAGG	2	12	80653	80664	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260060657
1506	NC_013222	ATA	2	6	80682	80687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060657
1507	NC_013222	CGC	2	6	80748	80753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060657
1508	NC_013222	TGA	2	6	80855	80860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060657
1509	NC_013222	GGT	2	6	80864	80869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060657
1510	NC_013222	TCC	2	6	80872	80877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060657
1511	NC_013222	TGC	2	6	80917	80922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060657
1512	NC_013222	GTA	2	6	80931	80936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060657
1513	NC_013222	AGG	2	6	80944	80949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060657
1514	NC_013222	GAC	2	6	80952	80957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060657
1515	NC_013222	TCCA	2	8	81013	81020	25 %	25 %	0 %	50 %	260060657
1516	NC_013222	CCT	2	6	81071	81076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060657
1517	NC_013222	AAAG	2	8	81211	81218	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013222	GGC	2	6	81232	81237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060658
1519	NC_013222	AT	3	6	81238	81243	50 %	50 %	0 %	0 %	260060658
1520	NC_013222	ACG	2	6	81250	81255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060658
1521	NC_013222	GTC	2	6	81438	81443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060658
1522	NC_013222	AAC	2	6	81508	81513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060658
1523	NC_013222	CTGG	2	8	81558	81565	0 %	25 %	50 %	25 %	260060658
1524	NC_013222	CGT	2	6	81566	81571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060658
1525	NC_013222	CAT	2	6	81576	81581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060658
1526	NC_013222	TCT	2	6	81620	81625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060658
1527	NC_013222	C	6	6	81671	81676	0 %	0 %	0 %	100 %	260060658
1528	NC_013222	CGGT	2	8	81685	81692	0 %	25 %	50 %	25 %	260060658
1529	NC_013222	CGGC	2	8	81704	81711	0 %	0 %	50 %	50 %	260060658
1530	NC_013222	GCC	2	6	81772	81777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060658
1531	NC_013222	TA	3	6	81823	81828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013222	AATC	2	8	81857	81864	50 %	25 %	0 %	25 %	260060659
1533	NC_013222	CAC	2	6	81931	81936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060659
1534	NC_013222	CGA	2	6	82059	82064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060659
1535	NC_013222	CTTG	2	8	82077	82084	0 %	50 %	25 %	25 %	260060659
1536	NC_013222	CCAT	2	8	82130	82137	25 %	25 %	0 %	50 %	260060659
1537	NC_013222	CTG	2	6	82228	82233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060659
1538	NC_013222	CACT	2	8	82308	82315	25 %	25 %	0 %	50 %	260060659
1539	NC_013222	TCC	2	6	82331	82336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060659
1540	NC_013222	TGC	2	6	82350	82355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060659
1541	NC_013222	CAG	2	6	82366	82371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060659
1542	NC_013222	AAT	2	6	82436	82441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013222	TGT	2	6	82454	82459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013222	GTT	2	6	82490	82495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013222	GGCC	2	8	82548	82555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_013222	AGAT	2	8	82708	82715	50 %	25 %	25 %	0 %	260060660
1547	NC_013222	GC	3	6	82777	82782	0 %	0 %	50 %	50 %	260060660
1548	NC_013222	CTG	2	6	82876	82881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060660
1549	NC_013222	CGT	2	6	82956	82961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060660
1550	NC_013222	GAGG	2	8	82996	83003	25 %	0 %	75 %	0 %	260060660
1551	NC_013222	T	6	6	83013	83018	0 %	100 %	0 %	0 %	260060660
1552	NC_013222	GGCAT	2	10	83200	83209	20 %	20 %	40 %	20 %	260060660
1553	NC_013222	CAT	2	6	83233	83238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060660
1554	NC_013222	ACC	2	6	83249	83254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060660
1555	NC_013222	GGC	2	6	83485	83490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060660
1556	NC_013222	TCC	2	6	83522	83527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060660
1557	NC_013222	CTCCC	2	10	83590	83599	0 %	20 %	0 %	80 %	260060660
1558	NC_013222	GGCCA	2	10	83626	83635	20 %	0 %	40 %	40 %	260060660
1559	NC_013222	GAC	2	6	83745	83750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060660
1560	NC_013222	GGAA	2	8	83769	83776	50 %	0 %	50 %	0 %	260060660
1561	NC_013222	GGC	2	6	83860	83865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060660
1562	NC_013222	CTG	2	6	83892	83897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060660
1563	NC_013222	TGC	2	6	83943	83948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060660
1564	NC_013222	CAG	2	6	84013	84018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060660
1565	NC_013222	CGGG	2	8	84116	84123	0 %	0 %	75 %	25 %	260060660
1566	NC_013222	CCTT	2	8	84143	84150	0 %	50 %	0 %	50 %	260060660
1567	NC_013222	TGC	2	6	84166	84171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060660
1568	NC_013222	A	6	6	84229	84234	100 %	0 %	0 %	0 %	260060660
1569	NC_013222	GCC	2	6	84290	84295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060660
1570	NC_013222	TTC	2	6	84304	84309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060660
1571	NC_013222	GCC	2	6	84311	84316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060660
1572	NC_013222	GGA	2	6	84372	84377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060660
1573	NC_013222	CAG	2	6	84451	84456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060660
1574	NC_013222	C	6	6	84463	84468	0 %	0 %	0 %	100 %	260060660
1575	NC_013222	CCAGGC	2	12	84531	84542	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260060660
1576	NC_013222	AGA	2	6	84560	84565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060660
1577	NC_013222	CCA	2	6	84627	84632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060660
1578	NC_013222	TGA	2	6	84636	84641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060660
1579	NC_013222	CAGGA	2	10	84685	84694	40 %	0 %	40 %	20 %	260060660
1580	NC_013222	A	6	6	84744	84749	100 %	0 %	0 %	0 %	260060660
1581	NC_013222	CAG	2	6	84805	84810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060660
1582	NC_013222	GAAC	2	8	84855	84862	50 %	0 %	25 %	25 %	260060660
1583	NC_013222	GGT	2	6	84903	84908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060660
1584	NC_013222	AGATAA	2	12	84909	84920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	260060660
1585	NC_013222	GCC	2	6	84926	84931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060660
1586	NC_013222	TGG	2	6	84974	84979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060660
1587	NC_013222	GTT	2	6	84987	84992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060660
1588	NC_013222	CGG	2	6	85021	85026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060660
1589	NC_013222	CTC	2	6	85160	85165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060660
1590	NC_013222	CAG	2	6	85294	85299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060660
1591	NC_013222	CGG	2	6	85372	85377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060660
1592	NC_013222	CAGA	2	8	85424	85431	50 %	0 %	25 %	25 %	260060660
1593	NC_013222	TCCA	2	8	85438	85445	25 %	25 %	0 %	50 %	260060660
1594	NC_013222	GAG	2	6	85522	85527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060660
1595	NC_013222	GAA	2	6	85528	85533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060660
1596	NC_013222	TTGG	2	8	85538	85545	0 %	50 %	50 %	0 %	260060660
1597	NC_013222	CGG	2	6	85565	85570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_013222	A	6	6	85590	85595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013222	A	6	6	85637	85642	100 %	0 %	0 %	0 %	260060661
1600	NC_013222	C	6	6	85653	85658	0 %	0 %	0 %	100 %	260060661
1601	NC_013222	G	6	6	85712	85717	0 %	0 %	100 %	0 %	260060661
1602	NC_013222	CTG	2	6	85734	85739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060661
1603	NC_013222	CCT	2	6	85760	85765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060661
1604	NC_013222	CCG	2	6	85790	85795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060661
1605	NC_013222	GGT	2	6	85803	85808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060661
1606	NC_013222	CCCT	2	8	85821	85828	0 %	25 %	0 %	75 %	260060661
1607	NC_013222	GAT	2	6	85839	85844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060661
1608	NC_013222	TTG	2	6	85858	85863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060661
1609	NC_013222	GTTCCC	2	12	85935	85946	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260060661
1610	NC_013222	AGC	2	6	85978	85983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060661
1611	NC_013222	G	6	6	85997	86002	0 %	0 %	100 %	0 %	260060661
1612	NC_013222	CGGC	2	8	86014	86021	0 %	0 %	50 %	50 %	260060661
1613	NC_013222	GGC	2	6	86031	86036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060661
1614	NC_013222	TCC	2	6	86038	86043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060661
1615	NC_013222	TGG	2	6	86084	86089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060661
1616	NC_013222	GTA	2	6	86106	86111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060661
1617	NC_013222	GC	3	6	86136	86141	0 %	0 %	50 %	50 %	260060661
1618	NC_013222	GTG	2	6	86173	86178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060661
1619	NC_013222	TCC	2	6	86287	86292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060661
1620	NC_013222	ACC	2	6	86293	86298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060661
1621	NC_013222	TCG	2	6	86317	86322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060661
1622	NC_013222	GGT	2	6	86448	86453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060661
1623	NC_013222	CGGG	2	8	86465	86472	0 %	0 %	75 %	25 %	260060661
1624	NC_013222	CCTG	2	8	86501	86508	0 %	25 %	25 %	50 %	260060661
1625	NC_013222	GCC	2	6	86515	86520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060661
1626	NC_013222	GC	3	6	86593	86598	0 %	0 %	50 %	50 %	260060661
1627	NC_013222	CTC	2	6	86610	86615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060661
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1749	NC_013222	AT	3	6	93602	93607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1750	NC_013222	TCG	2	6	93644	93649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1751	NC_013222	ATC	2	6	93658	93663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1878	NC_013222	CCT	2	6	99912	99917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060672
1879	NC_013222	GGT	2	6	99918	99923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060672
1880	NC_013222	GGAT	2	8	99955	99962	25 %	25 %	50 %	0 %	260060672
1881	NC_013222	GTC	2	6	99986	99991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060672
1882	NC_013222	TGA	2	6	99996	100001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060672
1883	NC_013222	CCTG	2	8	100155	100162	0 %	25 %	25 %	50 %	260060672
1884	NC_013222	GAT	2	6	100210	100215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060672
1885	NC_013222	GCC	2	6	100276	100281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060672
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1888	NC_013222	GGC	3	9	100465	100473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060672
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1899	NC_013222	CGC	2	6	100828	100833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060672
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1906	NC_013222	CGGCG	2	10	101142	101151	0 %	0 %	60 %	40 %	260060672
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1982	NC_013222	GGAT	2	8	105463	105470	25 %	25 %	50 %	0 %	260060675
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1993	NC_013222	TCC	2	6	106110	106115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060675
1994	NC_013222	CAG	2	6	106127	106132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060675
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1996	NC_013222	TCGA	2	8	106218	106225	25 %	25 %	25 %	25 %	260060675
1997	NC_013222	CGG	2	6	106237	106242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060675
1998	NC_013222	ATG	2	6	106323	106328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060675
1999	NC_013222	ATA	2	6	106350	106355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060675
2000	NC_013222	GGT	2	6	106358	106363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060675

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