MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_013222	A	6	6	930381	930386	100 %	0 %	0 %	0 %	260061431
17502	NC_013222	T	6	6	930426	930431	0 %	100 %	0 %	0 %	260061431
17503	NC_013222	CAC	2	6	930435	930440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061431
17504	NC_013222	CCT	2	6	930512	930517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061431
17505	NC_013222	CGT	2	6	930518	930523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061431
17506	NC_013222	TGA	2	6	930530	930535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061431
17507	NC_013222	GCA	2	6	930557	930562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061431
17508	NC_013222	TCCA	2	8	930580	930587	25 %	25 %	0 %	50 %	260061431
17509	NC_013222	GCC	2	6	930810	930815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061431
17510	NC_013222	CAC	2	6	930819	930824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061431
17511	NC_013222	GCA	2	6	930857	930862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061431
17512	NC_013222	TCC	2	6	930886	930891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061431
17513	NC_013222	C	7	7	930959	930965	0 %	0 %	0 %	100 %	260061431
17514	NC_013222	AAT	2	6	931030	931035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061431
17515	NC_013222	TGC	2	6	931062	931067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17516	NC_013222	CGG	2	6	931166	931171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061432
17517	NC_013222	C	6	6	931178	931183	0 %	0 %	0 %	100 %	260061432
17518	NC_013222	CCAG	2	8	931232	931239	25 %	0 %	25 %	50 %	260061432
17519	NC_013222	ACG	2	6	931248	931253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061432
17520	NC_013222	GGTT	2	8	931274	931281	0 %	50 %	50 %	0 %	260061432
17521	NC_013222	TCC	2	6	931288	931293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061432
17522	NC_013222	T	6	6	931308	931313	0 %	100 %	0 %	0 %	260061432
17523	NC_013222	GAT	2	6	931353	931358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061432
17524	NC_013222	TGC	2	6	931364	931369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061432
17525	NC_013222	TGG	2	6	931450	931455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061432
17526	NC_013222	GGC	2	6	931521	931526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061432
17527	NC_013222	GGCC	2	8	931552	931559	0 %	0 %	50 %	50 %	260061432
17528	NC_013222	GTT	2	6	931571	931576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061432
17529	NC_013222	TTC	2	6	931600	931605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061432
17530	NC_013222	GGGAA	2	10	931658	931667	40 %	0 %	60 %	0 %	260061432
17531	NC_013222	T	6	6	931704	931709	0 %	100 %	0 %	0 %	260061432
17532	NC_013222	T	6	6	931740	931745	0 %	100 %	0 %	0 %	260061432
17533	NC_013222	CTG	2	6	931894	931899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061433
17534	NC_013222	ATG	2	6	931901	931906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061433
17535	NC_013222	CAC	2	6	931975	931980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061433
17536	NC_013222	AGGC	2	8	932022	932029	25 %	0 %	50 %	25 %	260061433
17537	NC_013222	GGAT	2	8	932039	932046	25 %	25 %	50 %	0 %	260061433
17538	NC_013222	TGA	2	6	932049	932054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061433
17539	NC_013222	GCA	2	6	932139	932144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061433
17540	NC_013222	CCG	2	6	932156	932161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061433
17541	NC_013222	GGC	2	6	932173	932178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061433
17542	NC_013222	ACC	2	6	932225	932230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061433
17543	NC_013222	GTT	2	6	932242	932247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061433
17544	NC_013222	ATG	2	6	932339	932344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061433
17545	NC_013222	TGT	2	6	932362	932367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17546	NC_013222	CAA	2	6	932480	932485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17547	NC_013222	TTTAAA	2	12	932486	932497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17548	NC_013222	TTG	2	6	932542	932547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061434
17549	NC_013222	GGT	2	6	932573	932578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061434
17550	NC_013222	AAGC	2	8	932584	932591	50 %	0 %	25 %	25 %	260061434
17551	NC_013222	GAG	2	6	932727	932732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061434
17552	NC_013222	TCAA	2	8	932753	932760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17553	NC_013222	T	8	8	932804	932811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17554	NC_013222	CAG	2	6	932831	932836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17555	NC_013222	AGT	3	9	932868	932876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061435
17556	NC_013222	GAA	2	6	932937	932942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061435
17557	NC_013222	T	6	6	933037	933042	0 %	100 %	0 %	0 %	260061435
17558	NC_013222	AGG	2	6	933050	933055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061435
17559	NC_013222	CGG	2	6	933180	933185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061435
17560	NC_013222	T	6	6	933253	933258	0 %	100 %	0 %	0 %	260061435
17561	NC_013222	GAT	2	6	933267	933272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061435
17562	NC_013222	GAT	2	6	933366	933371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061435
17563	NC_013222	GTC	2	6	933412	933417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061435
17564	NC_013222	CGG	2	6	933420	933425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061435
17565	NC_013222	GGC	2	6	933432	933437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061435
17566	NC_013222	CATG	2	8	933471	933478	25 %	25 %	25 %	25 %	260061435
17567	NC_013222	GGC	2	6	933559	933564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061435
17568	NC_013222	GGT	2	6	933627	933632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061435
17569	NC_013222	CGG	3	9	933633	933641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061435
17570	NC_013222	AGC	2	6	933646	933651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061435
17571	NC_013222	C	6	6	933671	933676	0 %	0 %	0 %	100 %	260061435
17572	NC_013222	GGT	2	6	933693	933698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061435
17573	NC_013222	CTGC	2	8	933714	933721	0 %	25 %	25 %	50 %	260061435
17574	NC_013222	GAA	2	6	933742	933747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061435
17575	NC_013222	C	6	6	933779	933784	0 %	0 %	0 %	100 %	260061435
17576	NC_013222	CCA	2	6	933857	933862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061435
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17578	NC_013222	C	6	6	933945	933950	0 %	0 %	0 %	100 %	260061435
17579	NC_013222	GGT	2	6	933966	933971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061435
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17581	NC_013222	AGG	2	6	934149	934154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061436
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17583	NC_013222	GC	3	6	934222	934227	0 %	0 %	50 %	50 %	260061436
17584	NC_013222	TCC	2	6	934230	934235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061436
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17586	NC_013222	CAA	2	6	934246	934251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061436
17587	NC_013222	CAT	2	6	934321	934326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061436
17588	NC_013222	CCG	2	6	934353	934358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061436
17589	NC_013222	GAAC	2	8	934414	934421	50 %	0 %	25 %	25 %	260061436
17590	NC_013222	AAC	2	6	934602	934607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061436
17591	NC_013222	GAATTT	2	12	934670	934681	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	260061436
17592	NC_013222	AAG	2	6	934778	934783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061436
17593	NC_013222	GAA	2	6	934790	934795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061436
17594	NC_013222	ACT	2	6	934951	934956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061437
17595	NC_013222	GCG	2	6	935037	935042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061437
17596	NC_013222	GGA	2	6	935049	935054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061437
17597	NC_013222	GCCGG	2	10	935158	935167	0 %	0 %	60 %	40 %	260061437
17598	NC_013222	A	7	7	935222	935228	100 %	0 %	0 %	0 %	260061437
17599	NC_013222	ACT	2	6	935237	935242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061437
17600	NC_013222	GGA	2	6	935259	935264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061437
17601	NC_013222	A	6	6	935303	935308	100 %	0 %	0 %	0 %	260061437
17602	NC_013222	CGGCC	2	10	935416	935425	0 %	0 %	40 %	60 %	260061438
17603	NC_013222	GAT	2	6	935452	935457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061438
17604	NC_013222	CCGGAT	2	12	935521	935532	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260061438
17605	NC_013222	GAA	2	6	935549	935554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061438
17606	NC_013222	GGT	3	9	935626	935634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061438
17607	NC_013222	GAG	2	6	935690	935695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061438
17608	NC_013222	TCC	2	6	935748	935753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061438
17609	NC_013222	GAC	2	6	935756	935761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061438
17610	NC_013222	GGGC	2	8	935827	935834	0 %	0 %	75 %	25 %	260061438
17611	NC_013222	AAG	2	6	935846	935851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061438
17612	NC_013222	CGAACA	2	12	935865	935876	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260061438
17613	NC_013222	CAA	2	6	936004	936009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061438
17614	NC_013222	ATC	2	6	936032	936037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061438
17615	NC_013222	ACA	2	6	936066	936071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061438
17616	NC_013222	TCG	2	6	936081	936086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061438
17617	NC_013222	AGG	2	6	936144	936149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061438
17618	NC_013222	A	6	6	936185	936190	100 %	0 %	0 %	0 %	260061438
17619	NC_013222	GAT	2	6	936220	936225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061438
17620	NC_013222	GAT	2	6	936232	936237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061438
17621	NC_013222	TCA	2	6	936402	936407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061438
17622	NC_013222	AT	3	6	936445	936450	50 %	50 %	0 %	0 %	260061438
17623	NC_013222	GC	3	6	936567	936572	0 %	0 %	50 %	50 %	260061438
17624	NC_013222	TAC	2	6	936644	936649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061438
17625	NC_013222	CAA	2	6	936688	936693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061438
17626	NC_013222	TCA	2	6	936735	936740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061438
17627	NC_013222	GGC	2	6	936745	936750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061438
17628	NC_013222	GCCT	2	8	936842	936849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17629	NC_013222	C	6	6	936861	936866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17630	NC_013222	GCCC	2	8	936896	936903	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17631	NC_013222	TCC	2	6	936944	936949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061439
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17634	NC_013222	CGG	2	6	937178	937183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061439
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17636	NC_013222	CTG	2	6	937283	937288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061439
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17638	NC_013222	ACC	2	6	937319	937324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061439
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17643	NC_013222	G	6	6	937499	937504	0 %	0 %	100 %	0 %	260061439
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17651	NC_013222	A	6	6	937954	937959	100 %	0 %	0 %	0 %	260061439
17652	NC_013222	GAT	2	6	937978	937983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061439
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17655	NC_013222	TCC	2	6	938282	938287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061440
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17664	NC_013222	GCCG	2	8	939011	939018	0 %	0 %	50 %	50 %	260061441
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17670	NC_013222	CCGG	2	8	939524	939531	0 %	0 %	50 %	50 %	260061442
17671	NC_013222	TGT	2	6	939556	939561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061442
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17674	NC_013222	GGTC	2	8	939616	939623	0 %	25 %	50 %	25 %	260061442
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17676	NC_013222	CCGGG	2	10	939650	939659	0 %	0 %	60 %	40 %	260061442
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17679	NC_013222	A	7	7	939971	939977	100 %	0 %	0 %	0 %	260061442
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17686	NC_013222	TCC	2	6	940432	940437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061443
17687	NC_013222	GGA	2	6	940444	940449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061443
17688	NC_013222	G	6	6	940466	940471	0 %	0 %	100 %	0 %	260061443
17689	NC_013222	TGG	2	6	940501	940506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061443
17690	NC_013222	GAA	2	6	940511	940516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061443
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17701	NC_013222	TGT	2	6	941089	941094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061443
17702	NC_013222	CCA	2	6	941098	941103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061443
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17704	NC_013222	GCA	2	6	941271	941276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061443
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17713	NC_013222	GCT	2	6	941478	941483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061443
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17721	NC_013222	AT	3	6	941727	941732	50 %	50 %	0 %	0 %	260061443
17722	NC_013222	AGGCCG	2	12	941748	941759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260061443
17723	NC_013222	CGT	2	6	941824	941829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061443
17724	NC_013222	GAT	2	6	941837	941842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061443
17725	NC_013222	GAT	2	6	941849	941854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061443
17726	NC_013222	C	6	6	941909	941914	0 %	0 %	0 %	100 %	260061443
17727	NC_013222	TGA	2	6	941935	941940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061443
17728	NC_013222	GGCCAG	2	12	941993	942004	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260061443
17729	NC_013222	CGA	2	6	942013	942018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061443
17730	NC_013222	CGG	2	6	942022	942027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061443
17731	NC_013222	GGTTGC	2	12	942077	942088	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17732	NC_013222	AGA	2	6	942099	942104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17733	NC_013222	ACAA	2	8	942106	942113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17734	NC_013222	A	6	6	942112	942117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17735	NC_013222	GTGC	2	8	942138	942145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17736	NC_013222	T	6	6	942150	942155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17737	NC_013222	TGCTC	2	10	942286	942295	0 %	40 %	20 %	40 %	260061444
17738	NC_013222	TTG	2	6	942420	942425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061444
17739	NC_013222	GC	3	6	942449	942454	0 %	0 %	50 %	50 %	260061444
17740	NC_013222	ACC	2	6	942501	942506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061444
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17742	NC_013222	TGG	2	6	942661	942666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061444
17743	NC_013222	TTG	2	6	942734	942739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061444
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17745	NC_013222	CGG	2	6	942888	942893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061445
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17784	NC_013222	GAT	2	6	944298	944303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061445
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17862	NC_013222	AGC	2	6	948419	948424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061450
17863	NC_013222	C	6	6	948537	948542	0 %	0 %	0 %	100 %	260061450
17864	NC_013222	T	6	6	948550	948555	0 %	100 %	0 %	0 %	260061450
17865	NC_013222	GATGGG	2	12	948583	948594	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260061450
17866	NC_013222	TCC	2	6	948689	948694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061450
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17955	NC_013222	T	6	6	953193	953198	0 %	100 %	0 %	0 %	260061454
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17964	NC_013222	TTGT	2	8	953912	953919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17965	NC_013222	ATTT	2	8	953956	953963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17966	NC_013222	ACTG	2	8	953964	953971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17967	NC_013222	ATG	2	6	954015	954020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17968	NC_013222	AGC	2	6	954048	954053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17969	NC_013222	AG	3	6	954073	954078	50 %	0 %	50 %	0 %	260061455
17970	NC_013222	CAT	2	6	954082	954087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061455
17971	NC_013222	G	6	6	954105	954110	0 %	0 %	100 %	0 %	260061455
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17973	NC_013222	GCC	2	6	954224	954229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061455
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17975	NC_013222	GGA	2	6	954265	954270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061455
17976	NC_013222	TGC	2	6	954420	954425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061455
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17980	NC_013222	CGG	2	6	954795	954800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061455
17981	NC_013222	GTG	2	6	954812	954817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061455
17982	NC_013222	CAC	2	6	954820	954825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061455
17983	NC_013222	GGA	2	6	954880	954885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061455
17984	NC_013222	GCT	2	6	954905	954910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061455
17985	NC_013222	CCGGG	2	10	954977	954986	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17986	NC_013222	CCA	2	6	955035	955040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061456
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17988	NC_013222	CGGC	2	8	955102	955109	0 %	0 %	50 %	50 %	260061456
17989	NC_013222	G	6	6	955110	955115	0 %	0 %	100 %	0 %	260061456
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17992	NC_013222	AGG	2	6	955287	955292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061456
17993	NC_013222	GAC	2	6	955301	955306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061456
17994	NC_013222	CCT	2	6	955396	955401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061456
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17997	NC_013222	GCCG	2	8	955671	955678	0 %	0 %	50 %	50 %	260061456
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