MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_013222	AC	3	6	905381	905386	50 %	0 %	0 %	50 %	260061411
17002	NC_013222	CGA	2	6	905412	905417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061411
17003	NC_013222	GAT	2	6	905488	905493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061411
17004	NC_013222	A	7	7	905575	905581	100 %	0 %	0 %	0 %	260061411
17005	NC_013222	AGA	2	6	905588	905593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061411
17006	NC_013222	T	6	6	905630	905635	0 %	100 %	0 %	0 %	260061411
17007	NC_013222	GAAGG	2	10	905636	905645	40 %	0 %	60 %	0 %	260061411
17008	NC_013222	ATG	2	6	905670	905675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061411
17009	NC_013222	GAG	2	6	905702	905707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061411
17010	NC_013222	ATG	2	6	905718	905723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061411
17011	NC_013222	AATCC	2	10	905734	905743	40 %	20 %	0 %	40 %	260061411
17012	NC_013222	A	6	6	905776	905781	100 %	0 %	0 %	0 %	260061411
17013	NC_013222	AAG	2	6	905879	905884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061411
17014	NC_013222	ATC	2	6	905916	905921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061411
17015	NC_013222	CTC	2	6	905929	905934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061411
17016	NC_013222	GATTT	2	10	905945	905954	20 %	60 %	20 %	0 %	260061411
17017	NC_013222	GATAA	2	10	905969	905978	60 %	20 %	20 %	0 %	260061411
17018	NC_013222	TTA	2	6	906008	906013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061411
17019	NC_013222	CTA	2	6	906075	906080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061411
17020	NC_013222	ATC	2	6	906144	906149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061411
17021	NC_013222	GAA	2	6	906227	906232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061411
17022	NC_013222	ATG	2	6	906267	906272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061411
17023	NC_013222	T	7	7	906303	906309	0 %	100 %	0 %	0 %	260061411
17024	NC_013222	ATA	2	6	906333	906338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061411
17025	NC_013222	GAA	2	6	906370	906375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061411
17026	NC_013222	T	6	6	906404	906409	0 %	100 %	0 %	0 %	260061411
17027	NC_013222	TTGAAA	2	12	906423	906434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	260061411
17028	NC_013222	C	6	6	906443	906448	0 %	0 %	0 %	100 %	260061411
17029	NC_013222	AAT	2	6	906475	906480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061411
17030	NC_013222	TAA	2	6	906561	906566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061411
17031	NC_013222	ATG	2	6	906690	906695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061411
17032	NC_013222	ATT	2	6	906739	906744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061411
17033	NC_013222	AG	3	6	906881	906886	50 %	0 %	50 %	0 %	260061412
17034	NC_013222	GCC	2	6	906941	906946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061412
17035	NC_013222	GCC	2	6	906980	906985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061412
17036	NC_013222	GGC	2	6	907000	907005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061412
17037	NC_013222	CGG	2	6	907086	907091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061412
17038	NC_013222	TGC	2	6	907134	907139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061412
17039	NC_013222	ATC	2	6	907151	907156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061412
17040	NC_013222	GGCC	2	8	907231	907238	0 %	0 %	50 %	50 %	260061412
17041	NC_013222	TCA	2	6	907283	907288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061412
17042	NC_013222	A	7	7	907389	907395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17043	NC_013222	CCA	2	6	907405	907410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061413
17044	NC_013222	TCACG	2	10	907412	907421	20 %	20 %	20 %	40 %	260061413
17045	NC_013222	GCTG	2	8	907426	907433	0 %	25 %	50 %	25 %	260061413
17046	NC_013222	CAA	2	6	907454	907459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061413
17047	NC_013222	ACC	2	6	907651	907656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061413
17048	NC_013222	TTCCAC	2	12	907686	907697	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	260061413
17049	NC_013222	CAG	2	6	907870	907875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17050	NC_013222	GCCA	2	8	907892	907899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17051	NC_013222	A	6	6	907936	907941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_013222	CCTG	2	8	907951	907958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17053	NC_013222	TCCATG	2	12	907981	907992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260061414
17054	NC_013222	GGGA	2	8	908023	908030	25 %	0 %	75 %	0 %	260061414
17055	NC_013222	AGC	2	6	908031	908036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061414
17056	NC_013222	CTG	2	6	908083	908088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061414
17057	NC_013222	CCGG	2	8	908133	908140	0 %	0 %	50 %	50 %	260061414
17058	NC_013222	GATGCA	2	12	908163	908174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260061414
17059	NC_013222	ACG	2	6	908249	908254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061414
17060	NC_013222	GGGA	2	8	908342	908349	25 %	0 %	75 %	0 %	260061414
17061	NC_013222	TCG	2	6	908405	908410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061414
17062	NC_013222	ACC	3	9	908486	908494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061414
17063	NC_013222	CCCCTA	2	12	908553	908564	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260061414
17064	NC_013222	TTGCGG	2	12	908574	908585	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260061414
17065	NC_013222	GCG	2	6	908619	908624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061414
17066	NC_013222	ACCTGG	2	12	908654	908665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260061414
17067	NC_013222	CGG	2	6	908748	908753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061414
17068	NC_013222	CG	3	6	908770	908775	0 %	0 %	50 %	50 %	260061414
17069	NC_013222	C	6	6	908834	908839	0 %	0 %	0 %	100 %	260061414
17070	NC_013222	GCC	2	6	908848	908853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061414
17071	NC_013222	GCA	2	6	908862	908867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061414
17072	NC_013222	GGA	2	6	908871	908876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061414
17073	NC_013222	CCCGG	2	10	908904	908913	0 %	0 %	40 %	60 %	260061414
17074	NC_013222	CGA	2	6	908928	908933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061414
17075	NC_013222	AATCG	2	10	908934	908943	40 %	20 %	20 %	20 %	260061414
17076	NC_013222	CAGC	2	8	908949	908956	25 %	0 %	25 %	50 %	260061414
17077	NC_013222	CGA	2	6	908982	908987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061414
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17080	NC_013222	GCG	2	6	909134	909139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061414
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17083	NC_013222	CGG	2	6	909225	909230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061414
17084	NC_013222	AC	3	6	909231	909236	50 %	0 %	0 %	50 %	260061414
17085	NC_013222	CGC	2	6	909240	909245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061414
17086	NC_013222	GGT	2	6	909300	909305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061414
17087	NC_013222	TCAG	2	8	909401	909408	25 %	25 %	25 %	25 %	260061414
17088	NC_013222	TGG	2	6	909461	909466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061414
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17090	NC_013222	T	6	6	909614	909619	0 %	100 %	0 %	0 %	260061414
17091	NC_013222	GAG	2	6	909625	909630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061414
17092	NC_013222	GGCAG	2	10	909638	909647	20 %	0 %	60 %	20 %	260061414
17093	NC_013222	GATT	2	8	909694	909701	25 %	50 %	25 %	0 %	260061414
17094	NC_013222	GTA	2	6	909758	909763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061415
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17100	NC_013222	CG	3	6	910171	910176	0 %	0 %	50 %	50 %	260061415
17101	NC_013222	CTT	2	6	910204	910209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061415
17102	NC_013222	TCCA	2	8	910221	910228	25 %	25 %	0 %	50 %	260061415
17103	NC_013222	GGTC	2	8	910270	910277	0 %	25 %	50 %	25 %	260061415
17104	NC_013222	CAC	2	6	910319	910324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061415
17105	NC_013222	GCG	2	6	910377	910382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061415
17106	NC_013222	GCCAC	2	10	910402	910411	20 %	0 %	20 %	60 %	260061415
17107	NC_013222	GGT	2	6	910459	910464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061415
17108	NC_013222	CTT	2	6	910484	910489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061415
17109	NC_013222	GCC	2	6	910490	910495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061415
17110	NC_013222	TGC	3	9	910527	910535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061415
17111	NC_013222	GTA	2	6	910540	910545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_013222	GGT	2	6	910561	910566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17113	NC_013222	CCA	3	9	910693	910701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061416
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17116	NC_013222	ACC	2	6	910824	910829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061416
17117	NC_013222	TTC	2	6	910845	910850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061416
17118	NC_013222	GGT	2	6	910930	910935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061416
17119	NC_013222	CGT	2	6	910966	910971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061416
17120	NC_013222	GGAA	2	8	911068	911075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17121	NC_013222	A	7	7	911119	911125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17241	NC_013222	GCT	2	6	917739	917744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061423
17242	NC_013222	TAC	2	6	917772	917777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061423
17243	NC_013222	T	6	6	917807	917812	0 %	100 %	0 %	0 %	260061423
17244	NC_013222	CCA	2	6	917836	917841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061423
17245	NC_013222	GTG	2	6	917850	917855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061423
17246	NC_013222	GGC	2	6	917867	917872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061423
17247	NC_013222	CAA	3	9	917942	917950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061423
17248	NC_013222	CTG	2	6	918015	918020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061423
17249	NC_013222	ATA	2	6	918076	918081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061423
17250	NC_013222	GGGC	2	8	918097	918104	0 %	0 %	75 %	25 %	260061424
17251	NC_013222	CAG	2	6	918135	918140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17252	NC_013222	GGA	2	6	918149	918154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061424
17253	NC_013222	G	6	6	918206	918211	0 %	0 %	100 %	0 %	260061424
17254	NC_013222	ACC	2	6	918262	918267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061424
17255	NC_013222	CAGG	2	8	918278	918285	25 %	0 %	50 %	25 %	260061424
17256	NC_013222	TCCG	2	8	918352	918359	0 %	25 %	25 %	50 %	260061424
17257	NC_013222	CCT	2	6	918443	918448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061424
17258	NC_013222	TGC	2	6	918484	918489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17259	NC_013222	TGC	2	6	918595	918600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17260	NC_013222	GGA	2	6	918602	918607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061424
17261	NC_013222	T	6	6	918658	918663	0 %	100 %	0 %	0 %	260061424
17262	NC_013222	TTC	2	6	918756	918761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061424
17263	NC_013222	TCC	2	6	918808	918813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061424
17264	NC_013222	TCC	2	6	918817	918822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061424
17265	NC_013222	CAG	2	6	918858	918863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17266	NC_013222	AAG	2	6	918933	918938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061424
17267	NC_013222	CAC	2	6	919107	919112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061424
17268	NC_013222	GCG	2	6	919113	919118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061424
17269	NC_013222	AGC	2	6	919129	919134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17270	NC_013222	AGG	2	6	919217	919222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061424
17271	NC_013222	AGT	2	6	919366	919371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061424
17272	NC_013222	T	6	6	919540	919545	0 %	100 %	0 %	0 %	260061424
17273	NC_013222	CGG	2	6	919569	919574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061424
17274	NC_013222	AGC	2	6	919579	919584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17275	NC_013222	GCA	2	6	919880	919885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17276	NC_013222	CAG	2	6	919893	919898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17277	NC_013222	CAG	2	6	919965	919970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061424
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17279	NC_013222	CTG	2	6	920190	920195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17280	NC_013222	CCG	2	6	920210	920215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061424
17281	NC_013222	ACGT	2	8	920247	920254	25 %	25 %	25 %	25 %	260061424
17282	NC_013222	C	6	6	920255	920260	0 %	0 %	0 %	100 %	260061424
17283	NC_013222	AGG	2	6	920273	920278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061424
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17285	NC_013222	TTC	2	6	920374	920379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061424
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17287	NC_013222	TGC	3	9	920411	920419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17288	NC_013222	GGC	2	6	920451	920456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061424
17289	NC_013222	AGG	2	6	920518	920523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061424
17290	NC_013222	CAGG	2	8	920580	920587	25 %	0 %	50 %	25 %	260061424
17291	NC_013222	CAG	2	6	920604	920609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17292	NC_013222	A	6	6	920724	920729	100 %	0 %	0 %	0 %	260061424
17293	NC_013222	AAAC	2	8	920756	920763	75 %	0 %	0 %	25 %	260061424
17294	NC_013222	GTC	2	6	920793	920798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061424
17295	NC_013222	TA	3	6	920883	920888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17296	NC_013222	TGA	2	6	920900	920905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061425
17297	NC_013222	GTT	2	6	920949	920954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061425
17298	NC_013222	GC	3	6	921046	921051	0 %	0 %	50 %	50 %	260061425
17299	NC_013222	TGC	2	6	921080	921085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061425
17300	NC_013222	CTT	2	6	921245	921250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061425
17301	NC_013222	GTT	2	6	921270	921275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061425
17302	NC_013222	TCG	2	6	921304	921309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061425
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17306	NC_013222	GGCA	2	8	921467	921474	25 %	0 %	50 %	25 %	260061425
17307	NC_013222	GGCA	2	8	921548	921555	25 %	0 %	50 %	25 %	260061425
17308	NC_013222	TCCGTC	2	12	921573	921584	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260061425
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17310	NC_013222	ACCGTC	2	12	921654	921665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260061425
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17314	NC_013222	TCG	2	6	921937	921942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061425
17315	NC_013222	AT	3	6	922012	922017	50 %	50 %	0 %	0 %	260061425
17316	NC_013222	TGG	2	6	922124	922129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061425
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17320	NC_013222	AAT	2	6	922231	922236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061425
17321	NC_013222	TTTAAG	2	12	922263	922274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17322	NC_013222	TTA	2	6	922278	922283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17323	NC_013222	GTT	2	6	922297	922302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17324	NC_013222	TTA	2	6	922308	922313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17325	NC_013222	T	7	7	922331	922337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17326	NC_013222	ATG	2	6	922406	922411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061426
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17328	NC_013222	CAG	2	6	922522	922527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061426
17329	NC_013222	CGT	2	6	922557	922562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061426
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17333	NC_013222	ACA	2	6	922683	922688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061426
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17338	NC_013222	TGA	2	6	922845	922850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061426
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17343	NC_013222	CAG	2	6	922990	922995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061426
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17345	NC_013222	TCC	2	6	923072	923077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061426
17346	NC_013222	GAT	2	6	923140	923145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061426
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17352	NC_013222	T	6	6	923287	923292	0 %	100 %	0 %	0 %	260061426
17353	NC_013222	CGGA	2	8	923321	923328	25 %	0 %	50 %	25 %	260061426
17354	NC_013222	GGC	2	6	923365	923370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061426
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17356	NC_013222	TGA	2	6	923475	923480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061426
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17358	NC_013222	TCC	2	6	923516	923521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061426
17359	NC_013222	CAG	2	6	923604	923609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061427
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17362	NC_013222	ATG	2	6	923773	923778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061427
17363	NC_013222	GTG	2	6	923832	923837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061427
17364	NC_013222	CAG	2	6	923850	923855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061427
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17446	NC_013222	A	6	6	927984	927989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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