MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_013222	CTT	2	6	880945	880950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061387
16502	NC_013222	AATG	2	8	880979	880986	50 %	25 %	25 %	0 %	260061387
16503	NC_013222	ACA	2	6	881031	881036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061387
16504	NC_013222	AGG	2	6	881049	881054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061387
16505	NC_013222	AATATG	2	12	881066	881077	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	260061387
16506	NC_013222	TAGT	2	8	881165	881172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16507	NC_013222	AGTT	2	8	881179	881186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_013222	AG	3	6	881187	881192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_013222	TGT	2	6	881207	881212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061388
16510	NC_013222	ATA	2	6	881272	881277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061388
16511	NC_013222	ATT	2	6	881338	881343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061388
16512	NC_013222	AC	3	6	881412	881417	50 %	0 %	0 %	50 %	260061388
16513	NC_013222	CGG	2	6	881438	881443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061388
16514	NC_013222	TGG	2	6	881470	881475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061388
16515	NC_013222	TGG	2	6	881638	881643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061388
16516	NC_013222	TGG	2	6	881719	881724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061388
16517	NC_013222	GTAC	2	8	881864	881871	25 %	25 %	25 %	25 %	260061388
16518	NC_013222	GCG	2	6	881877	881882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061388
16519	NC_013222	CCCA	2	8	881886	881893	25 %	0 %	0 %	75 %	260061388
16520	NC_013222	AAG	2	6	881905	881910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061388
16521	NC_013222	ATT	2	6	882034	882039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061388
16522	NC_013222	GGA	2	6	882068	882073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061388
16523	NC_013222	CCA	2	6	882152	882157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061388
16524	NC_013222	GGAT	2	8	882229	882236	25 %	25 %	50 %	0 %	260061388
16525	NC_013222	TCC	2	6	882267	882272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061388
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16527	NC_013222	TCTCC	2	10	882517	882526	0 %	40 %	0 %	60 %	260061388
16528	NC_013222	AAT	2	6	882541	882546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061388
16529	NC_013222	GCG	2	6	882547	882552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061389
16530	NC_013222	GCT	2	6	882553	882558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061389
16531	NC_013222	GTA	2	6	882591	882596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061389
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16533	NC_013222	C	6	6	882635	882640	0 %	0 %	0 %	100 %	260061389
16534	NC_013222	CTGACC	2	12	882692	882703	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260061389
16535	NC_013222	ACC	2	6	882710	882715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061389
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16539	NC_013222	TGG	2	6	882846	882851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061389
16540	NC_013222	T	7	7	882913	882919	0 %	100 %	0 %	0 %	260061389
16541	NC_013222	CGG	2	6	882924	882929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061389
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16543	NC_013222	TGGAA	2	10	883131	883140	40 %	20 %	40 %	0 %	260061389
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16546	NC_013222	ACGGC	2	10	883464	883473	20 %	0 %	40 %	40 %	260061389
16547	NC_013222	TCC	2	6	883658	883663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061389
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16553	NC_013222	GTA	2	6	884082	884087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061390
16554	NC_013222	TCC	2	6	884092	884097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061390
16555	NC_013222	CGGGG	2	10	884099	884108	0 %	0 %	80 %	20 %	260061390
16556	NC_013222	GCA	2	6	884146	884151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061390
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16562	NC_013222	TGC	2	6	884416	884421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061390
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16564	NC_013222	GGT	2	6	884540	884545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061390
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16566	NC_013222	TGC	2	6	884668	884673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061390
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16568	NC_013222	A	6	6	884691	884696	100 %	0 %	0 %	0 %	260061390
16569	NC_013222	CTG	2	6	884726	884731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16570	NC_013222	AGT	2	6	884753	884758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16572	NC_013222	GTG	2	6	884891	884896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061391
16573	NC_013222	AGGA	2	8	884904	884911	50 %	0 %	50 %	0 %	260061391
16574	NC_013222	CTC	2	6	884912	884917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061391
16575	NC_013222	T	6	6	884960	884965	0 %	100 %	0 %	0 %	260061391
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16583	NC_013222	GGT	2	6	885268	885273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061391
16584	NC_013222	GCC	2	6	885365	885370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061391
16585	NC_013222	CCG	2	6	885421	885426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061391
16586	NC_013222	GCCAT	2	10	885471	885480	20 %	20 %	20 %	40 %	260061391
16587	NC_013222	CCG	2	6	885560	885565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16588	NC_013222	AAT	2	6	885623	885628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16589	NC_013222	CGG	2	6	885669	885674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061392
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16591	NC_013222	CGG	2	6	885692	885697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061392
16592	NC_013222	TCG	2	6	885715	885720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061392
16593	NC_013222	CCAG	2	8	885723	885730	25 %	0 %	25 %	50 %	260061392
16594	NC_013222	ATCG	2	8	885796	885803	25 %	25 %	25 %	25 %	260061392
16595	NC_013222	TGA	2	6	885843	885848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061392
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16598	NC_013222	TGGG	2	8	885995	886002	0 %	25 %	75 %	0 %	260061392
16599	NC_013222	CCA	2	6	886027	886032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061392
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16601	NC_013222	GGC	2	6	886063	886068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061392
16602	NC_013222	CCCA	2	8	886106	886113	25 %	0 %	0 %	75 %	260061392
16603	NC_013222	C	6	6	886129	886134	0 %	0 %	0 %	100 %	260061392
16604	NC_013222	ATC	2	6	886136	886141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061392
16605	NC_013222	GGA	2	6	886146	886151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061392
16606	NC_013222	TGA	2	6	886155	886160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061392
16607	NC_013222	GGT	2	6	886182	886187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061392
16608	NC_013222	ACC	2	6	886214	886219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061392
16609	NC_013222	CAG	2	6	886231	886236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061392
16610	NC_013222	GC	3	6	886249	886254	0 %	0 %	50 %	50 %	260061392
16611	NC_013222	CAGGGC	2	12	886258	886269	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260061392
16612	NC_013222	CGG	2	6	886290	886295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061392
16613	NC_013222	CAG	2	6	886339	886344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061392
16614	NC_013222	AGG	2	6	886382	886387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061392
16615	NC_013222	TTGG	2	8	886398	886405	0 %	50 %	50 %	0 %	260061392
16616	NC_013222	A	6	6	886429	886434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16617	NC_013222	AT	3	6	886437	886442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16618	NC_013222	TAACCA	2	12	886450	886461	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16619	NC_013222	CAGCT	2	10	886469	886478	20 %	20 %	20 %	40 %	260061393
16620	NC_013222	ATC	2	6	886496	886501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061393
16621	NC_013222	TTC	2	6	886505	886510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061393
16622	NC_013222	TCG	2	6	886533	886538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061393
16623	NC_013222	TTTCC	2	10	886573	886582	0 %	60 %	0 %	40 %	260061393
16624	NC_013222	TGG	2	6	886598	886603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061393
16625	NC_013222	TGG	2	6	886620	886625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061393
16626	NC_013222	CCA	2	6	886626	886631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061393
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16631	NC_013222	TCTA	2	8	886844	886851	25 %	50 %	0 %	25 %	260061393
16632	NC_013222	CAT	2	6	886870	886875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061393
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16640	NC_013222	GAT	2	6	887041	887046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061393
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16650	NC_013222	GAG	2	6	887429	887434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061393
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16655	NC_013222	GCT	3	9	887686	887694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061393
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16663	NC_013222	TGG	2	6	887946	887951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061393
16664	NC_013222	TGGT	2	8	887963	887970	0 %	50 %	50 %	0 %	260061393
16665	NC_013222	CTG	2	6	887978	887983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061393
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16667	NC_013222	A	7	7	888023	888029	100 %	0 %	0 %	0 %	260061393
16668	NC_013222	A	6	6	888107	888112	100 %	0 %	0 %	0 %	260061393
16669	NC_013222	TGC	2	6	888141	888146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061393
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16676	NC_013222	AACC	2	8	888358	888365	50 %	0 %	0 %	50 %	260061394
16677	NC_013222	AAAC	2	8	888371	888378	75 %	0 %	0 %	25 %	260061394
16678	NC_013222	TGA	2	6	888438	888443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061394
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16683	NC_013222	GT	3	6	888720	888725	0 %	50 %	50 %	0 %	260061394
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16690	NC_013222	TGC	2	6	889056	889061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061394
16691	NC_013222	GGC	2	6	889069	889074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061394
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16695	NC_013222	CGGC	2	8	889155	889162	0 %	0 %	50 %	50 %	260061394
16696	NC_013222	CTA	2	6	889189	889194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061394
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16698	NC_013222	GGCT	2	8	889334	889341	0 %	25 %	50 %	25 %	260061394
16699	NC_013222	TCC	2	6	889385	889390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061394
16700	NC_013222	TGG	2	6	889436	889441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061394
16701	NC_013222	TTCCGG	2	12	889506	889517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16702	NC_013222	AGC	2	6	889531	889536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16703	NC_013222	GC	3	6	889573	889578	0 %	0 %	50 %	50 %	260061395
16704	NC_013222	TG	3	6	889645	889650	0 %	50 %	50 %	0 %	260061395
16705	NC_013222	GAT	2	6	889666	889671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061395
16706	NC_013222	CGGCC	2	10	889757	889766	0 %	0 %	40 %	60 %	260061395
16707	NC_013222	GGCG	2	8	889869	889876	0 %	0 %	75 %	25 %	260061395
16708	NC_013222	TGC	2	6	889935	889940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061395
16709	NC_013222	CGG	2	6	889959	889964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061395
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16712	NC_013222	GAT	2	6	890125	890130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061395
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16717	NC_013222	GCCA	2	8	890477	890484	25 %	0 %	25 %	50 %	260061396
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16719	NC_013222	AC	3	6	890617	890622	50 %	0 %	0 %	50 %	260061396
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16722	NC_013222	GCC	2	6	890942	890947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061396
16723	NC_013222	CGCT	2	8	891033	891040	0 %	25 %	25 %	50 %	260061396
16724	NC_013222	AAGGC	2	10	891126	891135	40 %	0 %	40 %	20 %	260061396
16725	NC_013222	GGAG	2	8	891192	891199	25 %	0 %	75 %	0 %	260061396
16726	NC_013222	AAT	2	6	891285	891290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16727	NC_013222	A	7	7	891302	891308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16728	NC_013222	GA	3	6	891337	891342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16729	NC_013222	GAA	2	6	891348	891353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061397
16730	NC_013222	CAT	2	6	891397	891402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061397
16731	NC_013222	ACG	2	6	891446	891451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061397
16732	NC_013222	GTC	2	6	891475	891480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061397
16733	NC_013222	ATG	2	6	891505	891510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061397
16734	NC_013222	ACG	2	6	891629	891634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061397
16735	NC_013222	GCCGT	2	10	891715	891724	0 %	20 %	40 %	40 %	260061397
16736	NC_013222	AAC	2	6	891808	891813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061397
16737	NC_013222	TTA	2	6	891859	891864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061397
16738	NC_013222	A	6	6	891871	891876	100 %	0 %	0 %	0 %	260061397
16739	NC_013222	GCG	2	6	891928	891933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061398
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16741	NC_013222	ACC	2	6	891999	892004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061398
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