MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013222	CAG	2	6	665140	665145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061196
12502	NC_013222	GCCCAG	2	12	665146	665157	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260061196
12503	NC_013222	TCA	2	6	665169	665174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061196
12504	NC_013222	TGG	2	6	665229	665234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061196
12505	NC_013222	CCT	2	6	665235	665240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061196
12506	NC_013222	AAT	2	6	665328	665333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061196
12507	NC_013222	CGG	2	6	665543	665548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061196
12508	NC_013222	TCA	2	6	665766	665771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061196
12509	NC_013222	A	6	6	665776	665781	100 %	0 %	0 %	0 %	260061196
12510	NC_013222	CAG	3	9	665941	665949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061196
12511	NC_013222	TCC	2	6	665957	665962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061196
12512	NC_013222	AGA	2	6	665982	665987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061196
12513	NC_013222	CGT	2	6	666039	666044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061196
12514	NC_013222	ATCG	2	8	666121	666128	25 %	25 %	25 %	25 %	260061196
12515	NC_013222	GGT	2	6	666129	666134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061196
12516	NC_013222	AAT	2	6	666210	666215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_013222	G	6	6	666218	666223	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_013222	A	7	7	666247	666253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_013222	TGGT	3	12	666280	666291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_013222	T	6	6	666380	666385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_013222	T	6	6	666421	666426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_013222	CA	3	6	666458	666463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_013222	GCC	2	6	666524	666529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061197
12524	NC_013222	ACCCT	2	10	666539	666548	20 %	20 %	0 %	60 %	260061197
12525	NC_013222	ACA	2	6	666586	666591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061197
12526	NC_013222	GTG	2	6	666683	666688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061197
12527	NC_013222	GGC	2	6	666743	666748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061197
12528	NC_013222	ACA	2	6	666762	666767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061197
12529	NC_013222	TGGG	2	8	666854	666861	0 %	25 %	75 %	0 %	260061197
12530	NC_013222	AAC	2	6	666872	666877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061197
12531	NC_013222	GTC	2	6	666886	666891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061197
12532	NC_013222	G	7	7	666926	666932	0 %	0 %	100 %	0 %	260061197
12533	NC_013222	CCA	2	6	666964	666969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061197
12534	NC_013222	GTG	2	6	667013	667018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061197
12535	NC_013222	ACGG	2	8	667073	667080	25 %	0 %	50 %	25 %	260061197
12536	NC_013222	GAC	2	6	667112	667117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061197
12537	NC_013222	GAT	2	6	667126	667131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061197
12538	NC_013222	CGGGTA	2	12	667224	667235	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260061197
12539	NC_013222	TGA	2	6	667272	667277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061197
12540	NC_013222	CCG	2	6	667278	667283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061197
12541	NC_013222	TGGCC	2	10	667324	667333	0 %	20 %	40 %	40 %	260061197
12542	NC_013222	ACC	2	6	667341	667346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061197
12543	NC_013222	ACCT	2	8	667586	667593	25 %	25 %	0 %	50 %	260061197
12544	NC_013222	CGA	2	6	667699	667704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061197
12545	NC_013222	CTA	2	6	667723	667728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061197
12546	NC_013222	ACC	2	6	667854	667859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061197
12547	NC_013222	GAAG	2	8	667882	667889	50 %	0 %	50 %	0 %	260061197
12548	NC_013222	ACG	2	6	667908	667913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061197
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12550	NC_013222	CCGT	2	8	667967	667974	0 %	25 %	25 %	50 %	260061197
12551	NC_013222	CGG	2	6	668026	668031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061197
12552	NC_013222	ATT	2	6	668199	668204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061197
12553	NC_013222	CAA	2	6	668341	668346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061197
12554	NC_013222	CGA	2	6	668371	668376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061197
12555	NC_013222	GAC	2	6	668393	668398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061197
12556	NC_013222	ACC	2	6	668444	668449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061197
12557	NC_013222	CGA	2	6	668494	668499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061197
12558	NC_013222	CGG	3	9	668524	668532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061197
12559	NC_013222	GCA	2	6	668539	668544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061197
12560	NC_013222	GGC	2	6	668587	668592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061197
12561	NC_013222	CTC	2	6	668593	668598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061197
12562	NC_013222	GAC	2	6	668645	668650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061197
12563	NC_013222	TGG	2	6	668739	668744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061197
12564	NC_013222	TGG	2	6	668898	668903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061197
12565	NC_013222	CTC	2	6	669013	669018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061197
12566	NC_013222	G	6	6	669045	669050	0 %	0 %	100 %	0 %	260061197
12567	NC_013222	GC	3	6	669110	669115	0 %	0 %	50 %	50 %	260061197
12568	NC_013222	AGG	2	6	669207	669212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061197
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12570	NC_013222	CCCTG	2	10	669380	669389	0 %	20 %	20 %	60 %	260061198
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12572	NC_013222	CAT	2	6	669539	669544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061198
12573	NC_013222	T	6	6	669575	669580	0 %	100 %	0 %	0 %	260061198
12574	NC_013222	GCC	2	6	669585	669590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061198
12575	NC_013222	CGG	2	6	669853	669858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12576	NC_013222	CCT	2	6	669979	669984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061199
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12581	NC_013222	GCCT	2	8	670086	670093	0 %	25 %	25 %	50 %	260061199
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12590	NC_013222	CTGG	2	8	670451	670458	0 %	25 %	50 %	25 %	260061199
12591	NC_013222	CTG	2	6	670512	670517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061199
12592	NC_013222	GCG	2	6	670565	670570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061199
12593	NC_013222	CG	3	6	670574	670579	0 %	0 %	50 %	50 %	260061199
12594	NC_013222	CTT	2	6	670621	670626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12595	NC_013222	CGG	3	9	670651	670659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12596	NC_013222	CGC	2	6	670675	670680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12597	NC_013222	TTC	2	6	670739	670744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061200
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12604	NC_013222	CG	4	8	670971	670978	0 %	0 %	50 %	50 %	260061200
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12619	NC_013222	CAT	2	6	671763	671768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061201
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12621	NC_013222	CGG	2	6	671811	671816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061201
12622	NC_013222	G	7	7	671839	671845	0 %	0 %	100 %	0 %	260061201
12623	NC_013222	CTG	3	9	671893	671901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061201
12624	NC_013222	GCT	2	6	671903	671908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061201
12625	NC_013222	CCTGGT	2	12	671976	671987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061201
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12631	NC_013222	GC	3	6	672141	672146	0 %	0 %	50 %	50 %	260061201
12632	NC_013222	CGG	2	6	672151	672156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061201
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12646	NC_013222	GCT	2	6	672737	672742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061201
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12682	NC_013222	T	7	7	675031	675037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12683	NC_013222	TGA	2	6	675107	675112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061205
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12732	NC_013222	CGG	2	6	678013	678018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061208
12733	NC_013222	A	7	7	678112	678118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12734	NC_013222	A	6	6	678137	678142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12735	NC_013222	GTT	2	6	678171	678176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12738	NC_013222	TTTG	2	8	678330	678337	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12739	NC_013222	TTG	2	6	678397	678402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12740	NC_013222	TGT	3	9	678416	678424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12741	NC_013222	A	7	7	678425	678431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12742	NC_013222	CGA	2	6	678451	678456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12743	NC_013222	CGG	2	6	678467	678472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12744	NC_013222	CGA	2	6	678474	678479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12745	NC_013222	CAC	2	6	678518	678523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061210
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12769	NC_013222	AT	3	6	679566	679571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12770	NC_013222	GCT	2	6	679704	679709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061212
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12835	NC_013222	CAG	2	6	682630	682635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061213
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12839	NC_013222	GCATG	2	10	682847	682856	20 %	20 %	40 %	20 %	260061214
12840	NC_013222	TA	3	6	682871	682876	50 %	50 %	0 %	0 %	260061214
12841	NC_013222	ACG	2	6	682894	682899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061214
12842	NC_013222	GTTT	2	8	682916	682923	0 %	75 %	25 %	0 %	260061214
12843	NC_013222	GGT	2	6	683100	683105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061214
12844	NC_013222	TCC	2	6	683113	683118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061214
12845	NC_013222	GGT	2	6	683189	683194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12846	NC_013222	TAG	2	6	683223	683228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12847	NC_013222	T	6	6	683290	683295	0 %	100 %	0 %	0 %	260061215
12848	NC_013222	CTGTC	2	10	683336	683345	0 %	40 %	20 %	40 %	260061215
12849	NC_013222	TTG	2	6	683384	683389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061215
12850	NC_013222	CTC	2	6	683398	683403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061215
12851	NC_013222	T	6	6	683416	683421	0 %	100 %	0 %	0 %	260061215
12852	NC_013222	TTC	2	6	683432	683437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061215
12853	NC_013222	GTC	2	6	683488	683493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061215
12854	NC_013222	GTCG	2	8	683575	683582	0 %	25 %	50 %	25 %	260061215
12855	NC_013222	G	6	6	683582	683587	0 %	0 %	100 %	0 %	260061215
12856	NC_013222	GCA	2	6	683632	683637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061215
12857	NC_013222	CAG	2	6	683744	683749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061215
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12859	NC_013222	TGA	2	6	683853	683858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061215
12860	NC_013222	GTA	2	6	683890	683895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061215
12861	NC_013222	GGA	2	6	683955	683960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061215
12862	NC_013222	CTT	2	6	683983	683988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061215
12863	NC_013222	TTG	2	6	684002	684007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061215
12864	NC_013222	TCT	2	6	684090	684095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061215
12865	NC_013222	GACCG	2	10	684147	684156	20 %	0 %	40 %	40 %	260061215
12866	NC_013222	CCA	2	6	684168	684173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061215
12867	NC_013222	CTG	2	6	684224	684229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061215
12868	NC_013222	CTCCG	2	10	684262	684271	0 %	20 %	20 %	60 %	260061215
12869	NC_013222	CG	3	6	684357	684362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12870	NC_013222	AAC	2	6	684384	684389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12871	NC_013222	ATA	2	6	684456	684461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12872	NC_013222	AGG	2	6	684579	684584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061216
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12893	NC_013222	CTTT	2	8	685631	685638	0 %	75 %	0 %	25 %	260061216
12894	NC_013222	C	6	6	685687	685692	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12895	NC_013222	GCAG	2	8	685758	685765	25 %	0 %	50 %	25 %	260061217
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12899	NC_013222	CTT	3	9	685957	685965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12900	NC_013222	CTA	2	6	686034	686039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12902	NC_013222	AGC	2	6	686136	686141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061218
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12923	NC_013222	CCGG	2	8	687582	687589	0 %	0 %	50 %	50 %	260061219
12924	NC_013222	AACCG	2	10	687670	687679	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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12965	NC_013222	CCTC	2	8	690047	690054	0 %	25 %	0 %	75 %	260061222
12966	NC_013222	TCCGGC	2	12	690117	690128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260061222
12967	NC_013222	ATG	2	6	690146	690151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061222
12968	NC_013222	A	7	7	690165	690171	100 %	0 %	0 %	0 %	260061222
12969	NC_013222	CTT	2	6	690199	690204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061222
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12972	NC_013222	GTC	2	6	690515	690520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061222
12973	NC_013222	CGG	2	6	690548	690553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12974	NC_013222	C	6	6	690649	690654	0 %	0 %	0 %	100 %	260061223
12975	NC_013222	CCGG	2	8	690680	690687	0 %	0 %	50 %	50 %	260061223
12976	NC_013222	TCCT	2	8	690720	690727	0 %	50 %	0 %	50 %	260061223
12977	NC_013222	GCT	2	6	690898	690903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061223
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12980	NC_013222	GGC	2	6	691004	691009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061223
12981	NC_013222	ACG	2	6	691024	691029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061223
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12983	NC_013222	GGA	2	6	691283	691288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061223
12984	NC_013222	ACAG	2	8	691349	691356	50 %	0 %	25 %	25 %	260061223
12985	NC_013222	GC	3	6	691364	691369	0 %	0 %	50 %	50 %	260061223
12986	NC_013222	GAGG	2	8	691377	691384	25 %	0 %	75 %	0 %	260061223
12987	NC_013222	TAC	2	6	691467	691472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061223
12988	NC_013222	ACA	2	6	691475	691480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061223
12989	NC_013222	TGC	2	6	691546	691551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061223
12990	NC_013222	ACCG	2	8	691611	691618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12991	NC_013222	GGATC	2	10	691664	691673	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12992	NC_013222	GCC	2	6	691685	691690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12993	NC_013222	AAC	2	6	691718	691723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12994	NC_013222	GGT	2	6	691746	691751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12995	NC_013222	T	6	6	691755	691760	0 %	100 %	0 %	0 %	260061224
12996	NC_013222	C	6	6	691764	691769	0 %	0 %	0 %	100 %	260061224
12997	NC_013222	TGCA	2	8	691883	691890	25 %	25 %	25 %	25 %	260061224
12998	NC_013222	C	6	6	691981	691986	0 %	0 %	0 %	100 %	260061224
12999	NC_013222	C	6	6	692089	692094	0 %	0 %	0 %	100 %	260061224
13000	NC_013222	CTT	2	6	692121	692126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061224

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