MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_013222	GGAA	2	8	561995	562002	50 %	0 %	50 %	0 %	260061098
10502	NC_013222	CGATC	2	10	562004	562013	20 %	20 %	20 %	40 %	260061098
10503	NC_013222	TGG	2	6	562101	562106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061098
10504	NC_013222	CAC	2	6	562208	562213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061098
10505	NC_013222	TGGG	2	8	562218	562225	0 %	25 %	75 %	0 %	260061098
10506	NC_013222	CTC	2	6	562262	562267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061098
10507	NC_013222	ACG	2	6	562327	562332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061098
10508	NC_013222	CGA	2	6	562355	562360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061098
10509	NC_013222	CGG	3	9	562391	562399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061098
10510	NC_013222	CAT	2	6	562424	562429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061098
10511	NC_013222	CCT	2	6	562460	562465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061098
10512	NC_013222	T	6	6	562970	562975	0 %	100 %	0 %	0 %	260061099
10513	NC_013222	TGG	2	6	562995	563000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061099
10514	NC_013222	TTG	2	6	563028	563033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061099
10515	NC_013222	GCC	2	6	563063	563068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061099
10516	NC_013222	CCCGG	2	10	563099	563108	0 %	0 %	40 %	60 %	260061099
10517	NC_013222	ACC	2	6	563169	563174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061099
10518	NC_013222	GAT	2	6	563252	563257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061099
10519	NC_013222	CCA	2	6	563398	563403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061099
10520	NC_013222	T	6	6	563457	563462	0 %	100 %	0 %	0 %	260061099
10521	NC_013222	TGA	2	6	563464	563469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061099
10522	NC_013222	CAGG	2	8	563504	563511	25 %	0 %	50 %	25 %	260061099
10523	NC_013222	CAG	2	6	563536	563541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061099
10524	NC_013222	GCC	2	6	563580	563585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061099
10525	NC_013222	CAG	2	6	563615	563620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061099
10526	NC_013222	TTG	2	6	563784	563789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061099
10527	NC_013222	TCC	2	6	563871	563876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061099
10528	NC_013222	GCT	2	6	563881	563886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061099
10529	NC_013222	CCG	2	6	564034	564039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10530	NC_013222	CGG	2	6	564063	564068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_013222	CTT	2	6	564113	564118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061100
10532	NC_013222	GTCCTC	2	12	564149	564160	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260061100
10533	NC_013222	CCA	2	6	564163	564168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061100
10534	NC_013222	GC	3	6	564194	564199	0 %	0 %	50 %	50 %	260061100
10535	NC_013222	GTTCCG	2	12	564266	564277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061100
10536	NC_013222	AGG	2	6	564385	564390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061100
10537	NC_013222	TTG	2	6	564423	564428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061100
10538	NC_013222	TGG	2	6	564489	564494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061100
10539	NC_013222	GCC	2	6	564515	564520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061100
10540	NC_013222	CTC	2	6	564557	564562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061100
10541	NC_013222	TGG	2	6	564666	564671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061100
10542	NC_013222	AGG	2	6	564844	564849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061100
10543	NC_013222	GCG	2	6	564917	564922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061100
10544	NC_013222	GCC	2	6	564954	564959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061100
10545	NC_013222	T	7	7	564999	565005	0 %	100 %	0 %	0 %	260061100
10546	NC_013222	CTT	2	6	565091	565096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061100
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10548	NC_013222	TAA	2	6	565179	565184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061100
10549	NC_013222	AAC	2	6	565317	565322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061100
10550	NC_013222	TTG	2	6	565482	565487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061100
10551	NC_013222	GGC	2	6	565595	565600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061100
10552	NC_013222	CAG	2	6	565601	565606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061100
10553	NC_013222	ATT	2	6	565651	565656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061101
10554	NC_013222	GTG	2	6	565695	565700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061101
10555	NC_013222	CCTT	2	8	565701	565708	0 %	50 %	0 %	50 %	260061101
10556	NC_013222	ACT	2	6	565769	565774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061101
10557	NC_013222	T	6	6	565827	565832	0 %	100 %	0 %	0 %	260061101
10558	NC_013222	GCAG	2	8	565852	565859	25 %	0 %	50 %	25 %	260061101
10559	NC_013222	TCC	2	6	565872	565877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061101
10560	NC_013222	GCC	2	6	565934	565939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061101
10561	NC_013222	ATC	2	6	565947	565952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061101
10562	NC_013222	CCCGGC	2	12	565960	565971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061101
10563	NC_013222	TGGC	2	8	566055	566062	0 %	25 %	50 %	25 %	260061101
10564	NC_013222	GGCCAG	2	12	566078	566089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260061101
10565	NC_013222	GCC	2	6	566096	566101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061101
10566	NC_013222	CGG	2	6	566122	566127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061101
10567	NC_013222	CCA	2	6	566152	566157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061101
10568	NC_013222	GCC	2	6	566184	566189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061101
10569	NC_013222	CTC	2	6	566201	566206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061101
10570	NC_013222	CAC	2	6	566273	566278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061101
10571	NC_013222	CAG	2	6	566384	566389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061101
10572	NC_013222	TCTG	2	8	566462	566469	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10573	NC_013222	GCC	2	6	566573	566578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061102
10574	NC_013222	GCT	2	6	566627	566632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061102
10575	NC_013222	CCA	2	6	566701	566706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061102
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10578	NC_013222	CCA	2	6	566914	566919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061102
10579	NC_013222	CTG	2	6	566936	566941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061102
10580	NC_013222	TGC	2	6	566980	566985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061102
10581	NC_013222	CTG	2	6	566999	567004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061102
10582	NC_013222	CGCT	2	8	567162	567169	0 %	25 %	25 %	50 %	260061102
10583	NC_013222	CG	3	6	567171	567176	0 %	0 %	50 %	50 %	260061102
10584	NC_013222	TCG	2	6	567201	567206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061102
10585	NC_013222	CAT	2	6	567407	567412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061102
10586	NC_013222	GCC	2	6	567540	567545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061102
10587	NC_013222	CAGA	2	8	567602	567609	50 %	0 %	25 %	25 %	260061102
10588	NC_013222	GAT	2	6	567695	567700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061102
10589	NC_013222	GTAG	2	8	567758	567765	25 %	25 %	50 %	0 %	260061102
10590	NC_013222	CTC	2	6	567803	567808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061102
10591	NC_013222	TGG	2	6	567828	567833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061102
10592	NC_013222	AGG	2	6	567903	567908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061102
10593	NC_013222	ATC	2	6	567909	567914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061102
10594	NC_013222	AAT	2	6	567982	567987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_013222	CAG	2	6	568083	568088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061103
10596	NC_013222	CGCCAA	2	12	568092	568103	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260061103
10597	NC_013222	ACC	2	6	568159	568164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061103
10598	NC_013222	GGT	2	6	568268	568273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061103
10599	NC_013222	AGC	2	6	568348	568353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061103
10600	NC_013222	CAC	2	6	568530	568535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061103
10601	NC_013222	CCG	2	6	568633	568638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061104
10602	NC_013222	GCA	2	6	568677	568682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061104
10603	NC_013222	AAC	2	6	568778	568783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061104
10604	NC_013222	ACC	2	6	568796	568801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061104
10605	NC_013222	G	7	7	568815	568821	0 %	0 %	100 %	0 %	260061104
10606	NC_013222	ACA	2	6	568881	568886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061104
10607	NC_013222	ATA	2	6	568907	568912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061104
10608	NC_013222	CG	3	6	569006	569011	0 %	0 %	50 %	50 %	260061104
10609	NC_013222	CAGGC	2	10	569054	569063	20 %	0 %	40 %	40 %	260061104
10610	NC_013222	CAG	2	6	569068	569073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061104
10611	NC_013222	AGC	2	6	569126	569131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061104
10612	NC_013222	CCT	2	6	569145	569150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061104
10613	NC_013222	ACCC	2	8	569156	569163	25 %	0 %	0 %	75 %	260061104
10614	NC_013222	CAA	2	6	569203	569208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061104
10615	NC_013222	CGC	2	6	569310	569315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061104
10616	NC_013222	CCG	2	6	569364	569369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061104
10617	NC_013222	CGG	2	6	569407	569412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061104
10618	NC_013222	TGC	2	6	569424	569429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061104
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10620	NC_013222	CAG	2	6	569449	569454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061104
10621	NC_013222	TCA	2	6	569505	569510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061104
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10623	NC_013222	GCGA	2	8	569624	569631	25 %	0 %	50 %	25 %	260061104
10624	NC_013222	T	6	6	569680	569685	0 %	100 %	0 %	0 %	260061104
10625	NC_013222	TGC	2	6	569700	569705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061104
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10629	NC_013222	G	6	6	569816	569821	0 %	0 %	100 %	0 %	260061104
10630	NC_013222	GCCC	2	8	569833	569840	0 %	0 %	25 %	75 %	260061104
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10633	NC_013222	TCG	2	6	569948	569953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10635	NC_013222	CGT	2	6	570000	570005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10667	NC_013222	TTA	2	6	571437	571442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10668	NC_013222	GAC	2	6	571546	571551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061107
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10862	NC_013222	GCA	2	6	581268	581273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061117
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10980	NC_013222	GAT	2	6	586889	586894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061123
10981	NC_013222	TCA	2	6	586921	586926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061123
10982	NC_013222	ACC	2	6	586935	586940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061123
10983	NC_013222	CCA	2	6	586942	586947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061123
10984	NC_013222	CCA	2	6	587032	587037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061123
10985	NC_013222	CTT	2	6	587105	587110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061123
10986	NC_013222	TCT	2	6	587149	587154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061123
10987	NC_013222	TA	3	6	587269	587274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10988	NC_013222	GAAA	2	8	587414	587421	75 %	0 %	25 %	0 %	260061124
10989	NC_013222	AATA	2	8	587422	587429	75 %	25 %	0 %	0 %	260061124
10990	NC_013222	G	6	6	587505	587510	0 %	0 %	100 %	0 %	260061124
10991	NC_013222	CCT	2	6	587520	587525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061124
10992	NC_013222	CCCA	2	8	587734	587741	25 %	0 %	0 %	75 %	260061124
10993	NC_013222	GGC	2	6	587746	587751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061124
10994	NC_013222	CAC	2	6	587815	587820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061124
10995	NC_013222	GC	3	6	587839	587844	0 %	0 %	50 %	50 %	260061124
10996	NC_013222	GGT	2	6	587859	587864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061124
10997	NC_013222	CCA	2	6	587931	587936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061124
10998	NC_013222	ACA	2	6	587946	587951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061124
10999	NC_013222	AGGCC	2	10	587955	587964	20 %	0 %	40 %	40 %	260061124
11000	NC_013222	T	6	6	587979	587984	0 %	100 %	0 %	0 %	260061124

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