MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_013222	TCAGGT	2	12	3473554	3473565	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260063752
64002	NC_013222	TCA	2	6	3473575	3473580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063752
64003	NC_013222	GAT	2	6	3473684	3473689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063752
64004	NC_013222	GTT	3	9	3473702	3473710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063752
64005	NC_013222	CTG	2	6	3473755	3473760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063752
64006	NC_013222	CCG	2	6	3473824	3473829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063752
64007	NC_013222	TCC	2	6	3473838	3473843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063752
64008	NC_013222	GGA	2	6	3473887	3473892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063752
64009	NC_013222	ACC	2	6	3473913	3473918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063752
64010	NC_013222	TCC	2	6	3473925	3473930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063752
64011	NC_013222	GGT	3	9	3473956	3473964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063752
64012	NC_013222	GAT	2	6	3473987	3473992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063752
64013	NC_013222	ATG	2	6	3474030	3474035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063752
64014	NC_013222	CCA	2	6	3474127	3474132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063752
64015	NC_013222	TGG	2	6	3474171	3474176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063752
64016	NC_013222	A	9	9	3474246	3474254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64017	NC_013222	TA	3	6	3474281	3474286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64018	NC_013222	A	6	6	3474323	3474328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64019	NC_013222	A	7	7	3474334	3474340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64020	NC_013222	GTG	2	6	3474360	3474365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64021	NC_013222	TGCC	2	8	3474410	3474417	0 %	25 %	25 %	50 %	260063753
64022	NC_013222	A	7	7	3474438	3474444	100 %	0 %	0 %	0 %	260063753
64023	NC_013222	GAT	2	6	3474456	3474461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063753
64024	NC_013222	T	6	6	3474468	3474473	0 %	100 %	0 %	0 %	260063753
64025	NC_013222	CAGG	2	8	3474513	3474520	25 %	0 %	50 %	25 %	260063753
64026	NC_013222	GTG	2	6	3474697	3474702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063754
64027	NC_013222	TGA	2	6	3474740	3474745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063754
64028	NC_013222	ACC	2	6	3474754	3474759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063754
64029	NC_013222	CGG	2	6	3474782	3474787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063754
64030	NC_013222	TGG	2	6	3474947	3474952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063754
64031	NC_013222	A	7	7	3474982	3474988	100 %	0 %	0 %	0 %	260063754
64032	NC_013222	CGC	2	6	3475029	3475034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063754
64033	NC_013222	ACG	2	6	3475078	3475083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063754
64034	NC_013222	A	6	6	3475142	3475147	100 %	0 %	0 %	0 %	260063754
64035	NC_013222	AAG	2	6	3475175	3475180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063754
64036	NC_013222	CAA	2	6	3475212	3475217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063754
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64038	NC_013222	G	6	6	3475353	3475358	0 %	0 %	100 %	0 %	260063754
64039	NC_013222	CAAC	2	8	3475428	3475435	50 %	0 %	0 %	50 %	260063754
64040	NC_013222	TGG	2	6	3475555	3475560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063755
64041	NC_013222	GAGTCC	2	12	3475656	3475667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260063755
64042	NC_013222	ACA	2	6	3475804	3475809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063755
64043	NC_013222	GAGG	2	8	3475814	3475821	25 %	0 %	75 %	0 %	260063755
64044	NC_013222	GAG	2	6	3475835	3475840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063755
64045	NC_013222	TTG	2	6	3475896	3475901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063755
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64049	NC_013222	TTTG	2	8	3476229	3476236	0 %	75 %	25 %	0 %	260063755
64050	NC_013222	TGT	2	6	3476379	3476384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063756
64051	NC_013222	GGC	2	6	3476439	3476444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063756
64052	NC_013222	CTC	3	9	3476448	3476456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063756
64053	NC_013222	GTT	2	6	3476580	3476585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063756
64054	NC_013222	CAT	2	6	3476598	3476603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063756
64055	NC_013222	GGT	2	6	3476616	3476621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063756
64056	NC_013222	AGG	2	6	3476633	3476638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063756
64057	NC_013222	TGA	2	6	3476639	3476644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063756
64058	NC_013222	GGCC	2	8	3476681	3476688	0 %	0 %	50 %	50 %	260063756
64059	NC_013222	TGC	2	6	3476735	3476740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063756
64060	NC_013222	TGG	3	9	3476746	3476754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063756
64061	NC_013222	ACGG	2	8	3476923	3476930	25 %	0 %	50 %	25 %	260063756
64062	NC_013222	CCT	2	6	3477044	3477049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063756
64063	NC_013222	CAT	2	6	3477162	3477167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64064	NC_013222	A	7	7	3477185	3477191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64065	NC_013222	GCCGG	2	10	3477216	3477225	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64066	NC_013222	TCT	2	6	3477295	3477300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063757
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64068	NC_013222	CGG	2	6	3477361	3477366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063757
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64071	NC_013222	GGA	2	6	3477655	3477660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063757
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64076	NC_013222	T	8	8	3477949	3477956	0 %	100 %	0 %	0 %	260063757
64077	NC_013222	C	6	6	3478007	3478012	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64078	NC_013222	AATGC	2	10	3478045	3478054	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64079	NC_013222	TTGA	2	8	3478068	3478075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64080	NC_013222	CCCG	2	8	3478170	3478177	0 %	0 %	25 %	75 %	260063758
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64083	NC_013222	CAGC	2	8	3478260	3478267	25 %	0 %	25 %	50 %	260063758
64084	NC_013222	A	6	6	3478292	3478297	100 %	0 %	0 %	0 %	260063758
64085	NC_013222	C	6	6	3478307	3478312	0 %	0 %	0 %	100 %	260063758
64086	NC_013222	CGG	2	6	3478340	3478345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063758
64087	NC_013222	CA	3	6	3478481	3478486	50 %	0 %	0 %	50 %	260063758
64088	NC_013222	GCT	2	6	3478611	3478616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063758
64089	NC_013222	GTC	2	6	3478771	3478776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063758
64090	NC_013222	GCG	2	6	3478865	3478870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063758
64091	NC_013222	TGG	2	6	3478874	3478879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063758
64092	NC_013222	GC	3	6	3478915	3478920	0 %	0 %	50 %	50 %	260063758
64093	NC_013222	GTC	2	6	3478927	3478932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063758
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64099	NC_013222	GAA	2	6	3479204	3479209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063758
64100	NC_013222	A	6	6	3479208	3479213	100 %	0 %	0 %	0 %	260063758
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64103	NC_013222	CCGG	2	8	3479297	3479304	0 %	0 %	50 %	50 %	260063759
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64106	NC_013222	CCCG	2	8	3479402	3479409	0 %	0 %	25 %	75 %	260063759
64107	NC_013222	CGG	2	6	3479471	3479476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063759
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64110	NC_013222	TCAGCG	2	12	3479597	3479608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260063759
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64115	NC_013222	CCT	2	6	3479936	3479941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063759
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64117	NC_013222	TGA	2	6	3480181	3480186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063760
64118	NC_013222	AGA	2	6	3480319	3480324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063760
64119	NC_013222	A	6	6	3480382	3480387	100 %	0 %	0 %	0 %	260063760
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64122	NC_013222	TGA	2	6	3480482	3480487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063760
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64133	NC_013222	AGAA	2	8	3481085	3481092	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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64136	NC_013222	A	6	6	3481163	3481168	100 %	0 %	0 %	0 %	260063761
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64145	NC_013222	C	6	6	3481739	3481744	0 %	0 %	0 %	100 %	260063761
64146	NC_013222	TCC	2	6	3481804	3481809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063761
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64216	NC_013222	CGG	2	6	3485533	3485538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063762
64217	NC_013222	GTT	2	6	3485696	3485701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063762
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64219	NC_013222	TGTTT	2	10	3485847	3485856	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64220	NC_013222	CTT	2	6	3486011	3486016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64221	NC_013222	A	7	7	3486166	3486172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64222	NC_013222	GCCAA	2	10	3486203	3486212	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64223	NC_013222	CTT	2	6	3486247	3486252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063763
64224	NC_013222	T	6	6	3486251	3486256	0 %	100 %	0 %	0 %	260063763
64225	NC_013222	TCA	2	6	3486310	3486315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063763
64226	NC_013222	ACC	2	6	3486336	3486341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063763
64227	NC_013222	GCC	2	6	3486366	3486371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063763
64228	NC_013222	TTA	2	6	3486471	3486476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063763
64229	NC_013222	GAC	3	9	3486608	3486616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063763
64230	NC_013222	GCC	2	6	3486687	3486692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063763
64231	NC_013222	ATTC	2	8	3486733	3486740	25 %	50 %	0 %	25 %	260063763
64232	NC_013222	CGG	2	6	3486763	3486768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063763
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64352	NC_013222	GGA	2	6	3494966	3494971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063770
64353	NC_013222	TCG	2	6	3494972	3494977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063770
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64451	NC_013222	CCCAA	2	10	3500484	3500493	40 %	0 %	0 %	60 %	260063774
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64454	NC_013222	CGA	2	6	3500866	3500871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063774
64455	NC_013222	GGA	2	6	3500896	3500901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063774
64456	NC_013222	ACC	2	6	3500928	3500933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063774
64457	NC_013222	CCA	2	6	3500941	3500946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063774
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64461	NC_013222	C	7	7	3501068	3501074	0 %	0 %	0 %	100 %	260063774
64462	NC_013222	TGCC	2	8	3501094	3501101	0 %	25 %	25 %	50 %	260063774
64463	NC_013222	CAC	2	6	3501134	3501139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063774
64464	NC_013222	TGC	2	6	3501175	3501180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063774
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64466	NC_013222	ATG	2	6	3501261	3501266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063774
64467	NC_013222	GCC	2	6	3501267	3501272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063774
64468	NC_013222	ACC	2	6	3501354	3501359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063774
64469	NC_013222	ATC	2	6	3501363	3501368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063774
64470	NC_013222	CAG	2	6	3501407	3501412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063774
64471	NC_013222	GGC	2	6	3501413	3501418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063774
64472	NC_013222	C	6	6	3501491	3501496	0 %	0 %	0 %	100 %	260063774
64473	NC_013222	CAAT	2	8	3501577	3501584	50 %	25 %	0 %	25 %	260063774
64474	NC_013222	TGC	2	6	3501621	3501626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063774
64475	NC_013222	AATGC	2	10	3501657	3501666	40 %	20 %	20 %	20 %	260063774
64476	NC_013222	ATT	2	6	3501743	3501748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64477	NC_013222	A	7	7	3501762	3501768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64478	NC_013222	GTTC	2	8	3501787	3501794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64479	NC_013222	AGG	2	6	3501818	3501823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64480	NC_013222	TCC	2	6	3501833	3501838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063775
64481	NC_013222	ACC	2	6	3501839	3501844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063775
64482	NC_013222	T	6	6	3501853	3501858	0 %	100 %	0 %	0 %	260063775
64483	NC_013222	TCC	2	6	3501926	3501931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063775
64484	NC_013222	CCT	2	6	3501948	3501953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063775
64485	NC_013222	TGG	3	9	3501978	3501986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063775
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64487	NC_013222	GCC	2	6	3502073	3502078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063775
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64490	NC_013222	ATC	2	6	3502250	3502255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063775
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64492	NC_013222	CAG	2	6	3502396	3502401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063775
64493	NC_013222	GGC	2	6	3502552	3502557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063775
64494	NC_013222	CGG	2	6	3502586	3502591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063775
64495	NC_013222	ATC	2	6	3502601	3502606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063775
64496	NC_013222	GGC	2	6	3502612	3502617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063775
64497	NC_013222	GCA	2	6	3502659	3502664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063775
64498	NC_013222	CCA	2	6	3502671	3502676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063775
64499	NC_013222	AGGGCC	2	12	3502751	3502762	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260063775
64500	NC_013222	GGC	2	6	3502768	3502773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063775

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