MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63501	NC_013222	TCAA	2	8	3446232	3446239	50 %	25 %	0 %	25 %	260063719
63502	NC_013222	GTT	2	6	3446258	3446263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063719
63503	NC_013222	TCC	2	6	3446318	3446323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063719
63504	NC_013222	C	6	6	3446485	3446490	0 %	0 %	0 %	100 %	260063719
63505	NC_013222	AAG	2	6	3446612	3446617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063719
63506	NC_013222	TTCA	2	8	3446629	3446636	25 %	50 %	0 %	25 %	260063719
63507	NC_013222	CGG	2	6	3446792	3446797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063719
63508	NC_013222	GGA	2	6	3446866	3446871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063719
63509	NC_013222	TA	3	6	3446935	3446940	50 %	50 %	0 %	0 %	260063719
63510	NC_013222	TCC	2	6	3447104	3447109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063719
63511	NC_013222	CGAC	2	8	3447126	3447133	25 %	0 %	25 %	50 %	260063719
63512	NC_013222	CCT	2	6	3447184	3447189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063720
63513	NC_013222	CAG	2	6	3447208	3447213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063720
63514	NC_013222	ATCA	2	8	3447311	3447318	50 %	25 %	0 %	25 %	260063720
63515	NC_013222	GGC	2	6	3447337	3447342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063720
63516	NC_013222	CCA	2	6	3447358	3447363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063720
63517	NC_013222	CGG	2	6	3447373	3447378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063720
63518	NC_013222	CCG	2	6	3447383	3447388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063720
63519	NC_013222	T	8	8	3447420	3447427	0 %	100 %	0 %	0 %	260063720
63520	NC_013222	CTG	2	6	3447434	3447439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063720
63521	NC_013222	CAGG	2	8	3447476	3447483	25 %	0 %	50 %	25 %	260063720
63522	NC_013222	TGA	2	6	3447502	3447507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063720
63523	NC_013222	ATA	2	6	3447561	3447566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063720
63524	NC_013222	GTT	2	6	3447628	3447633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63525	NC_013222	TAT	2	6	3447637	3447642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63526	NC_013222	AT	3	6	3447652	3447657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63527	NC_013222	ATT	2	6	3447662	3447667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63528	NC_013222	A	6	6	3447702	3447707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63529	NC_013222	TGCC	2	8	3447773	3447780	0 %	25 %	25 %	50 %	260063721
63530	NC_013222	TGG	2	6	3447844	3447849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063721
63531	NC_013222	CAG	2	6	3447873	3447878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63532	NC_013222	GAT	2	6	3447952	3447957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063722
63533	NC_013222	GGC	2	6	3447977	3447982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063722
63534	NC_013222	ATT	2	6	3448008	3448013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063722
63535	NC_013222	GAA	2	6	3448087	3448092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063722
63536	NC_013222	CTG	2	6	3448148	3448153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063722
63537	NC_013222	G	7	7	3448165	3448171	0 %	0 %	100 %	0 %	260063722
63538	NC_013222	CTG	2	6	3448181	3448186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063722
63539	NC_013222	AGT	2	6	3448207	3448212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063722
63540	NC_013222	TCA	2	6	3448224	3448229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063722
63541	NC_013222	TCA	2	6	3448296	3448301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063722
63542	NC_013222	CCA	2	6	3448341	3448346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063722
63543	NC_013222	TCGCCA	2	12	3448407	3448418	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260063722
63544	NC_013222	CAT	2	6	3448477	3448482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063722
63545	NC_013222	GA	3	6	3448488	3448493	50 %	0 %	50 %	0 %	260063722
63546	NC_013222	CTG	2	6	3448538	3448543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063722
63547	NC_013222	ATG	2	6	3448589	3448594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063722
63548	NC_013222	TGGC	3	12	3448623	3448634	0 %	25 %	50 %	25 %	260063722
63549	NC_013222	CCG	2	6	3448689	3448694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63550	NC_013222	TCG	2	6	3448722	3448727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063723
63551	NC_013222	TCC	2	6	3448808	3448813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063723
63552	NC_013222	GCCG	2	8	3448860	3448867	0 %	0 %	50 %	50 %	260063723
63553	NC_013222	TCA	2	6	3448881	3448886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063723
63554	NC_013222	GCC	2	6	3448967	3448972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063723
63555	NC_013222	GCG	2	6	3449005	3449010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063723
63556	NC_013222	ACGG	2	8	3449165	3449172	25 %	0 %	50 %	25 %	260063723
63557	NC_013222	CTTT	2	8	3449217	3449224	0 %	75 %	0 %	25 %	260063723
63558	NC_013222	CCT	2	6	3449229	3449234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063723
63559	NC_013222	ATCA	2	8	3449282	3449289	50 %	25 %	0 %	25 %	260063723
63560	NC_013222	C	7	7	3449315	3449321	0 %	0 %	0 %	100 %	260063723
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63562	NC_013222	CCA	2	6	3449396	3449401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063724
63563	NC_013222	GCA	2	6	3449474	3449479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063724
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63565	NC_013222	CGTG	2	8	3449612	3449619	0 %	25 %	50 %	25 %	260063724
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63567	NC_013222	TTCCT	2	10	3449764	3449773	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63568	NC_013222	GC	3	6	3449784	3449789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63569	NC_013222	CTT	2	6	3449806	3449811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63570	NC_013222	GGCC	2	8	3449854	3449861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63571	NC_013222	ACG	2	6	3450049	3450054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063725
63572	NC_013222	CACC	2	8	3450083	3450090	25 %	0 %	0 %	75 %	260063725
63573	NC_013222	TGA	2	6	3450193	3450198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063725
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63575	NC_013222	CG	3	6	3450335	3450340	0 %	0 %	50 %	50 %	260063725
63576	NC_013222	ACG	2	6	3450379	3450384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063725
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63579	NC_013222	ATT	2	6	3450677	3450682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63582	NC_013222	CCTGAT	2	12	3451002	3451013	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260063726
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63586	NC_013222	GCA	2	6	3451151	3451156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063726
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63588	NC_013222	ACC	2	6	3451243	3451248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063726
63589	NC_013222	GAA	2	6	3451276	3451281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063726
63590	NC_013222	TAC	2	6	3451303	3451308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063726
63591	NC_013222	AG	3	6	3451341	3451346	50 %	0 %	50 %	0 %	260063726
63592	NC_013222	GAC	2	6	3451348	3451353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063726
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63597	NC_013222	ACC	2	6	3451683	3451688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063727
63598	NC_013222	CGCC	2	8	3451711	3451718	0 %	0 %	25 %	75 %	260063727
63599	NC_013222	GCA	2	6	3451885	3451890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063727
63600	NC_013222	TGG	2	6	3451914	3451919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063727
63601	NC_013222	A	6	6	3451920	3451925	100 %	0 %	0 %	0 %	260063727
63602	NC_013222	GTTCGG	2	12	3451988	3451999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260063727
63603	NC_013222	ACC	2	6	3452073	3452078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063727
63604	NC_013222	ACCG	2	8	3452093	3452100	25 %	0 %	25 %	50 %	260063727
63605	NC_013222	CGG	2	6	3452155	3452160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063727
63606	NC_013222	GCT	2	6	3452176	3452181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063727
63607	NC_013222	ACC	2	6	3452199	3452204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063727
63608	NC_013222	TTA	2	6	3452233	3452238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063727
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63611	NC_013222	GAAAC	2	10	3452304	3452313	60 %	0 %	20 %	20 %	260063727
63612	NC_013222	ACC	2	6	3452325	3452330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063727
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63616	NC_013222	CTGCA	2	10	3452559	3452568	20 %	20 %	20 %	40 %	260063727
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63737	NC_013222	TCG	2	6	3459204	3459209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063734
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63970	NC_013222	TCC	2	6	3471112	3471117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063749
63971	NC_013222	GTA	2	6	3471204	3471209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063749
63972	NC_013222	ATC	2	6	3471312	3471317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063749
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63974	NC_013222	CGTT	2	8	3471613	3471620	0 %	50 %	25 %	25 %	260063750
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