MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63001	NC_013222	GGGA	2	8	3420896	3420903	25 %	0 %	75 %	0 %	260063697
63002	NC_013222	TTA	2	6	3420976	3420981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063697
63003	NC_013222	GGCC	2	8	3421148	3421155	0 %	0 %	50 %	50 %	260063697
63004	NC_013222	ACGG	2	8	3421299	3421306	25 %	0 %	50 %	25 %	260063697
63005	NC_013222	CAA	2	6	3421397	3421402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063697
63006	NC_013222	GAA	2	6	3421424	3421429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63007	NC_013222	GC	3	6	3421430	3421435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63008	NC_013222	GCCCTG	2	12	3421465	3421476	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260063698
63009	NC_013222	CCT	2	6	3421491	3421496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063698
63010	NC_013222	TGG	2	6	3421565	3421570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063698
63011	NC_013222	TGG	2	6	3421577	3421582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063698
63012	NC_013222	CGGA	2	8	3421597	3421604	25 %	0 %	50 %	25 %	260063698
63013	NC_013222	CGGG	2	8	3421610	3421617	0 %	0 %	75 %	25 %	260063698
63014	NC_013222	GCC	2	6	3421705	3421710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063698
63015	NC_013222	ACCG	2	8	3421765	3421772	25 %	0 %	25 %	50 %	260063698
63016	NC_013222	GCC	2	6	3421798	3421803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063698
63017	NC_013222	ATG	2	6	3421885	3421890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063698
63018	NC_013222	GGA	2	6	3421911	3421916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063698
63019	NC_013222	CCG	2	6	3422028	3422033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063699
63020	NC_013222	GAA	2	6	3422040	3422045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063699
63021	NC_013222	GGC	2	6	3422110	3422115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063699
63022	NC_013222	GGTA	2	8	3422207	3422214	25 %	25 %	50 %	0 %	260063699
63023	NC_013222	GGAA	2	8	3422246	3422253	50 %	0 %	50 %	0 %	260063699
63024	NC_013222	GC	3	6	3422255	3422260	0 %	0 %	50 %	50 %	260063699
63025	NC_013222	CGA	2	6	3422285	3422290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063699
63026	NC_013222	ACC	2	6	3422292	3422297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063699
63027	NC_013222	CGC	2	6	3422436	3422441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063699
63028	NC_013222	CGC	2	6	3422444	3422449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063699
63029	NC_013222	GGC	2	6	3422464	3422469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063699
63030	NC_013222	CGC	2	6	3422616	3422621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063699
63031	NC_013222	GC	4	8	3422678	3422685	0 %	0 %	50 %	50 %	260063699
63032	NC_013222	GGT	2	6	3422694	3422699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063699
63033	NC_013222	CGG	2	6	3422750	3422755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063699
63034	NC_013222	GTC	2	6	3422778	3422783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063699
63035	NC_013222	ACCC	2	8	3422790	3422797	25 %	0 %	0 %	75 %	260063699
63036	NC_013222	GGCC	2	8	3422837	3422844	0 %	0 %	50 %	50 %	260063699
63037	NC_013222	AGG	2	6	3422861	3422866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063699
63038	NC_013222	ATC	2	6	3422889	3422894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063699
63039	NC_013222	ATC	2	6	3422941	3422946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063699
63040	NC_013222	GCT	2	6	3422947	3422952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063699
63041	NC_013222	GCC	3	9	3422975	3422983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063699
63042	NC_013222	GCC	2	6	3422988	3422993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063699
63043	NC_013222	TCA	3	9	3423005	3423013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063699
63044	NC_013222	TCT	2	6	3423020	3423025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063699
63045	NC_013222	CCA	2	6	3423182	3423187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063699
63046	NC_013222	GCC	2	6	3423193	3423198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063699
63047	NC_013222	CG	3	6	3423232	3423237	0 %	0 %	50 %	50 %	260063699
63048	NC_013222	CAG	2	6	3423258	3423263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063699
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63050	NC_013222	CTT	2	6	3423336	3423341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063699
63051	NC_013222	TGCA	2	8	3423346	3423353	25 %	25 %	25 %	25 %	260063699
63052	NC_013222	ATC	2	6	3423382	3423387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063699
63053	NC_013222	CGG	2	6	3423522	3423527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063699
63054	NC_013222	CCA	2	6	3423533	3423538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063699
63055	NC_013222	GTCC	2	8	3423624	3423631	0 %	25 %	25 %	50 %	260063699
63056	NC_013222	TCC	2	6	3423670	3423675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063699
63057	NC_013222	GCA	3	9	3423691	3423699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063699
63058	NC_013222	TGA	2	6	3423742	3423747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063699
63059	NC_013222	GGT	2	6	3423762	3423767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063699
63060	NC_013222	CCT	2	6	3423770	3423775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063699
63061	NC_013222	G	6	6	3423917	3423922	0 %	0 %	100 %	0 %	260063699
63062	NC_013222	CAAT	2	8	3423946	3423953	50 %	25 %	0 %	25 %	260063699
63063	NC_013222	CGA	2	6	3423968	3423973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063699
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63066	NC_013222	TCG	2	6	3424081	3424086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063699
63067	NC_013222	GGC	2	6	3424110	3424115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063699
63068	NC_013222	AGG	2	6	3424127	3424132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063699
63069	NC_013222	CAT	2	6	3424152	3424157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063699
63070	NC_013222	C	6	6	3424162	3424167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63071	NC_013222	CGT	2	6	3424195	3424200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63072	NC_013222	GATG	2	8	3424203	3424210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63073	NC_013222	TC	3	6	3424295	3424300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63074	NC_013222	CAG	2	6	3424327	3424332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063700
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63079	NC_013222	AAC	2	6	3424871	3424876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63080	NC_013222	AAAC	2	8	3424901	3424908	75 %	0 %	0 %	25 %	260063701
63081	NC_013222	CGG	2	6	3424937	3424942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063701
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63100	NC_013222	ACA	2	6	3426307	3426312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063702
63101	NC_013222	A	6	6	3426327	3426332	100 %	0 %	0 %	0 %	260063702
63102	NC_013222	TGA	2	6	3426340	3426345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063702
63103	NC_013222	ACT	2	6	3426356	3426361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063702
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63105	NC_013222	CGG	2	6	3426457	3426462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063702
63106	NC_013222	CACGC	2	10	3426528	3426537	20 %	0 %	20 %	60 %	260063702
63107	NC_013222	CAC	2	6	3426539	3426544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063702
63108	NC_013222	GTAC	2	8	3426598	3426605	25 %	25 %	25 %	25 %	260063702
63109	NC_013222	GCA	2	6	3426633	3426638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063702
63110	NC_013222	GATCG	2	10	3426683	3426692	20 %	20 %	40 %	20 %	260063702
63111	NC_013222	CGC	2	6	3426875	3426880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063702
63112	NC_013222	A	6	6	3426906	3426911	100 %	0 %	0 %	0 %	260063702
63113	NC_013222	TCA	2	6	3426916	3426921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063702
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63115	NC_013222	GGC	3	9	3427077	3427085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063702
63116	NC_013222	G	6	6	3427093	3427098	0 %	0 %	100 %	0 %	260063702
63117	NC_013222	CCGGA	2	10	3427173	3427182	20 %	0 %	40 %	40 %	260063702
63118	NC_013222	GCA	2	6	3427198	3427203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063702
63119	NC_013222	CTG	2	6	3427227	3427232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063702
63120	NC_013222	ATT	2	6	3427246	3427251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063702
63121	NC_013222	GCG	2	6	3427254	3427259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063702
63122	NC_013222	TCA	2	6	3427264	3427269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063702
63123	NC_013222	GAC	2	6	3427356	3427361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063702
63124	NC_013222	GAA	2	6	3427377	3427382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063702
63125	NC_013222	CAG	2	6	3427384	3427389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063702
63126	NC_013222	CTG	2	6	3427407	3427412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063702
63127	NC_013222	AACC	2	8	3427466	3427473	50 %	0 %	0 %	50 %	260063702
63128	NC_013222	G	7	7	3427479	3427485	0 %	0 %	100 %	0 %	260063702
63129	NC_013222	G	6	6	3427557	3427562	0 %	0 %	100 %	0 %	260063702
63130	NC_013222	CGGTTA	2	12	3427585	3427596	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260063702
63131	NC_013222	TGGC	2	8	3427602	3427609	0 %	25 %	50 %	25 %	260063702
63132	NC_013222	GCC	2	6	3427629	3427634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63133	NC_013222	GCCG	2	8	3427638	3427645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63134	NC_013222	CGC	2	6	3427776	3427781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063703
63135	NC_013222	CCGG	2	8	3427832	3427839	0 %	0 %	50 %	50 %	260063703
63136	NC_013222	GTC	2	6	3427875	3427880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063703
63137	NC_013222	GCA	2	6	3427913	3427918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063703
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63139	NC_013222	TGC	2	6	3428063	3428068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063703
63140	NC_013222	TCG	2	6	3428095	3428100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063703
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63144	NC_013222	GAT	2	6	3428355	3428360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063703
63145	NC_013222	C	6	6	3428397	3428402	0 %	0 %	0 %	100 %	260063703
63146	NC_013222	GCC	2	6	3428503	3428508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063703
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63148	NC_013222	TCC	2	6	3428675	3428680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063704
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63152	NC_013222	CCTG	2	8	3428826	3428833	0 %	25 %	25 %	50 %	260063704
63153	NC_013222	GGAC	2	8	3428838	3428845	25 %	0 %	50 %	25 %	260063704
63154	NC_013222	CGT	2	6	3428925	3428930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063704
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63164	NC_013222	CTG	2	6	3429784	3429789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063705
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63183	NC_013222	ATC	2	6	3430657	3430662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063705
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63186	NC_013222	CTG	2	6	3430915	3430920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063706
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63192	NC_013222	GTT	2	6	3431414	3431419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063707
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63202	NC_013222	GTTC	2	8	3431934	3431941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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63226	NC_013222	GCC	2	6	3432843	3432848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063708
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63228	NC_013222	CAT	2	6	3432925	3432930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063708
63229	NC_013222	CGGGC	2	10	3432959	3432968	0 %	0 %	60 %	40 %	260063708
63230	NC_013222	TCC	2	6	3432999	3433004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063708
63231	NC_013222	GAT	2	6	3433013	3433018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063708
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63233	NC_013222	CTG	2	6	3433049	3433054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063708
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63464	NC_013222	GTA	2	6	3444222	3444227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063717
63465	NC_013222	GTC	2	6	3444279	3444284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063717
63466	NC_013222	TTC	2	6	3444436	3444441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063717
63467	NC_013222	AGC	2	6	3444442	3444447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063717
63468	NC_013222	CCT	2	6	3444539	3444544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063717
63469	NC_013222	TGA	2	6	3444545	3444550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063717
63470	NC_013222	CCAGG	2	10	3444645	3444654	20 %	0 %	40 %	40 %	260063717
63471	NC_013222	ACC	2	6	3444665	3444670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063717
63472	NC_013222	GAT	2	6	3444798	3444803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063717
63473	NC_013222	GGA	2	6	3444822	3444827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063717
63474	NC_013222	CCA	2	6	3444926	3444931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063717
63475	NC_013222	CCA	2	6	3444944	3444949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063717
63476	NC_013222	TCC	2	6	3444955	3444960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063717
63477	NC_013222	GCC	2	6	3444964	3444969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063717
63478	NC_013222	GTA	2	6	3445038	3445043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063717
63479	NC_013222	TACCG	2	10	3445113	3445122	20 %	20 %	20 %	40 %	260063717
63480	NC_013222	TGG	2	6	3445162	3445167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063717
63481	NC_013222	AAT	2	6	3445227	3445232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063717
63482	NC_013222	C	6	6	3445298	3445303	0 %	0 %	0 %	100 %	260063717
63483	NC_013222	TCA	2	6	3445357	3445362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063717
63484	NC_013222	GCT	2	6	3445424	3445429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063717
63485	NC_013222	GAT	2	6	3445434	3445439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063717
63486	NC_013222	CCCT	2	8	3445440	3445447	0 %	25 %	0 %	75 %	260063717
63487	NC_013222	CCA	2	6	3445517	3445522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063717
63488	NC_013222	TTG	2	6	3445537	3445542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063717
63489	NC_013222	GCT	2	6	3445562	3445567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063717
63490	NC_013222	TAA	2	6	3445570	3445575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063717
63491	NC_013222	CAG	2	6	3445698	3445703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063717
63492	NC_013222	ACC	2	6	3445828	3445833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063717
63493	NC_013222	TTC	2	6	3445888	3445893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063717
63494	NC_013222	ATT	2	6	3445928	3445933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063718
63495	NC_013222	CGG	2	6	3445939	3445944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063718
63496	NC_013222	CTTC	2	8	3445968	3445975	0 %	50 %	0 %	50 %	260063718
63497	NC_013222	GCC	2	6	3446072	3446077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063718
63498	NC_013222	T	6	6	3446089	3446094	0 %	100 %	0 %	0 %	260063718
63499	NC_013222	GCA	2	6	3446099	3446104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063718
63500	NC_013222	ATG	2	6	3446120	3446125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063718

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