MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_013222	ACA	2	6	3342286	3342291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063626
61502	NC_013222	CCT	2	6	3342337	3342342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063626
61503	NC_013222	ACC	2	6	3342345	3342350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063626
61504	NC_013222	C	6	6	3342361	3342366	0 %	0 %	0 %	100 %	260063626
61505	NC_013222	CAG	2	6	3342399	3342404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063626
61506	NC_013222	ACC	2	6	3342414	3342419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063626
61507	NC_013222	GGCG	2	8	3342475	3342482	0 %	0 %	75 %	25 %	260063626
61508	NC_013222	GCC	2	6	3342486	3342491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063626
61509	NC_013222	TC	3	6	3342554	3342559	0 %	50 %	0 %	50 %	260063626
61510	NC_013222	T	6	6	3342706	3342711	0 %	100 %	0 %	0 %	260063626
61511	NC_013222	TCGA	2	8	3342732	3342739	25 %	25 %	25 %	25 %	260063626
61512	NC_013222	TTA	2	6	3342752	3342757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063626
61513	NC_013222	GTG	2	6	3342789	3342794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063626
61514	NC_013222	CAG	2	6	3342842	3342847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063626
61515	NC_013222	AGG	2	6	3342984	3342989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063627
61516	NC_013222	GC	3	6	3343019	3343024	0 %	0 %	50 %	50 %	260063627
61517	NC_013222	GAC	2	6	3343040	3343045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61518	NC_013222	GAA	2	6	3343061	3343066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063627
61519	NC_013222	GGC	2	6	3343075	3343080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063627
61520	NC_013222	GAG	2	6	3343091	3343096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063627
61521	NC_013222	TGGACA	2	12	3343152	3343163	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260063627
61522	NC_013222	AGG	2	6	3343164	3343169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063627
61523	NC_013222	CAA	2	6	3343183	3343188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063627
61524	NC_013222	CGC	2	6	3343195	3343200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063627
61525	NC_013222	GGA	2	6	3343210	3343215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063627
61526	NC_013222	CGG	2	6	3343236	3343241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063627
61527	NC_013222	ACT	2	6	3343245	3343250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063627
61528	NC_013222	GGAA	2	8	3343276	3343283	50 %	0 %	50 %	0 %	260063627
61529	NC_013222	CTT	2	6	3343285	3343290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063627
61530	NC_013222	CTG	2	6	3343427	3343432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61531	NC_013222	CTG	2	6	3343604	3343609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61532	NC_013222	CCA	2	6	3343656	3343661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063627
61533	NC_013222	AT	3	6	3343747	3343752	50 %	50 %	0 %	0 %	260063627
61534	NC_013222	GAG	2	6	3343778	3343783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063627
61535	NC_013222	ATT	2	6	3343853	3343858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063627
61536	NC_013222	AAC	2	6	3343886	3343891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063627
61537	NC_013222	TGC	2	6	3343917	3343922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61538	NC_013222	CGC	2	6	3343945	3343950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063627
61539	NC_013222	TGC	2	6	3343957	3343962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61540	NC_013222	CACC	2	8	3344047	3344054	25 %	0 %	0 %	75 %	260063627
61541	NC_013222	CTG	2	6	3344057	3344062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61542	NC_013222	AGC	2	6	3344082	3344087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61543	NC_013222	CTG	2	6	3344126	3344131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61544	NC_013222	TCC	2	6	3344148	3344153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063627
61545	NC_013222	CAA	2	6	3344158	3344163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063627
61546	NC_013222	GAA	2	6	3344209	3344214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063627
61547	NC_013222	TGA	2	6	3344229	3344234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063627
61548	NC_013222	TGA	2	6	3344310	3344315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063627
61549	NC_013222	GGAA	2	8	3344415	3344422	50 %	0 %	50 %	0 %	260063627
61550	NC_013222	GAC	2	6	3344423	3344428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61551	NC_013222	TCCA	2	8	3344519	3344526	25 %	25 %	0 %	50 %	260063627
61552	NC_013222	CTG	2	6	3344579	3344584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61553	NC_013222	GCA	2	6	3344595	3344600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61554	NC_013222	CTT	3	9	3344638	3344646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063627
61555	NC_013222	GAC	2	6	3344669	3344674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61556	NC_013222	GGA	2	6	3344746	3344751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063627
61557	NC_013222	CAA	2	6	3344752	3344757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063627
61558	NC_013222	CAA	2	6	3344818	3344823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063627
61559	NC_013222	ACG	2	6	3344862	3344867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61560	NC_013222	ATC	2	6	3344951	3344956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063627
61561	NC_013222	GAC	2	6	3344978	3344983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61562	NC_013222	ACG	2	6	3345015	3345020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063627
61563	NC_013222	AGA	2	6	3345057	3345062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063627
61564	NC_013222	CAG	2	6	3345115	3345120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61565	NC_013222	CCCGG	2	10	3345142	3345151	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61566	NC_013222	GCC	2	6	3345160	3345165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61567	NC_013222	CGC	2	6	3345168	3345173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61568	NC_013222	GGT	2	6	3345303	3345308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063628
61569	NC_013222	CTG	2	6	3345322	3345327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063628
61570	NC_013222	GGT	3	9	3345359	3345367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063628
61571	NC_013222	CTC	2	6	3345474	3345479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063628
61572	NC_013222	ACC	2	6	3345487	3345492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063628
61573	NC_013222	AGGCG	2	10	3345521	3345530	20 %	0 %	60 %	20 %	260063628
61574	NC_013222	ACC	2	6	3345538	3345543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063628
61575	NC_013222	CCGC	2	8	3345581	3345588	0 %	0 %	25 %	75 %	260063628
61576	NC_013222	CCG	2	6	3345639	3345644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063628
61577	NC_013222	CCCG	2	8	3345672	3345679	0 %	0 %	25 %	75 %	260063628
61578	NC_013222	CGGA	2	8	3345734	3345741	25 %	0 %	50 %	25 %	260063628
61579	NC_013222	CGT	2	6	3345764	3345769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063628
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61581	NC_013222	GGTG	2	8	3345797	3345804	0 %	25 %	75 %	0 %	260063628
61582	NC_013222	CTG	2	6	3345955	3345960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063628
61583	NC_013222	GCG	2	6	3345987	3345992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063628
61584	NC_013222	CCA	2	6	3346004	3346009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063628
61585	NC_013222	CGG	2	6	3346124	3346129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063628
61586	NC_013222	AGC	2	6	3346153	3346158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063628
61587	NC_013222	TTTA	2	8	3346190	3346197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61588	NC_013222	A	6	6	3346213	3346218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61589	NC_013222	GAA	2	6	3346260	3346265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063629
61590	NC_013222	TGG	2	6	3346312	3346317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063629
61591	NC_013222	GGA	2	6	3346367	3346372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063629
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61602	NC_013222	CACCT	2	10	3346827	3346836	20 %	20 %	0 %	60 %	260063629
61603	NC_013222	ACC	2	6	3346882	3346887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063629
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61606	NC_013222	CTG	2	6	3347001	3347006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063629
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61612	NC_013222	GGC	2	6	3347174	3347179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063629
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61616	NC_013222	A	6	6	3347260	3347265	100 %	0 %	0 %	0 %	260063629
61617	NC_013222	TAT	2	6	3347316	3347321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063629
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61624	NC_013222	AGA	2	6	3347712	3347717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063630
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61643	NC_013222	ATGAAC	2	12	3348898	3348909	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	260063631
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61662	NC_013222	A	6	6	3349713	3349718	100 %	0 %	0 %	0 %	260063632
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61678	NC_013222	CGGTC	2	10	3350378	3350387	0 %	20 %	40 %	40 %	260063633
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61682	NC_013222	CGGGG	2	10	3350512	3350521	0 %	0 %	80 %	20 %	260063633
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61687	NC_013222	A	7	7	3350708	3350714	100 %	0 %	0 %	0 %	260063633
61688	NC_013222	CTGG	2	8	3350727	3350734	0 %	25 %	50 %	25 %	260063633
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61726	NC_013222	TA	3	6	3352937	3352942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61734	NC_013222	TTG	2	6	3353440	3353445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063635
61735	NC_013222	GTC	3	9	3353493	3353501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063635
61736	NC_013222	TCC	2	6	3353530	3353535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063635
61737	NC_013222	T	7	7	3353571	3353577	0 %	100 %	0 %	0 %	260063635
61738	NC_013222	AAT	2	6	3353611	3353616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61739	NC_013222	TGC	2	6	3353656	3353661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61740	NC_013222	CAA	2	6	3353697	3353702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61741	NC_013222	CTG	2	6	3353728	3353733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063636
61742	NC_013222	CTG	2	6	3353735	3353740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063636
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61755	NC_013222	TGCC	2	8	3354408	3354415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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61816	NC_013222	A	6	6	3357630	3357635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61817	NC_013222	GCC	2	6	3357677	3357682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063640
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61819	NC_013222	GAT	2	6	3357754	3357759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063640
61820	NC_013222	CCA	3	9	3357766	3357774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063640
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61835	NC_013222	TTGG	2	8	3358501	3358508	0 %	50 %	50 %	0 %	260063641
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61840	NC_013222	TTC	2	6	3358857	3358862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063642
61841	NC_013222	AGG	2	6	3358900	3358905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063642
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61844	NC_013222	A	6	6	3359054	3359059	100 %	0 %	0 %	0 %	260063642
61845	NC_013222	TAA	2	6	3359074	3359079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063642
61846	NC_013222	ATTGC	2	10	3359086	3359095	20 %	40 %	20 %	20 %	260063642
61847	NC_013222	A	7	7	3359132	3359138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61848	NC_013222	T	8	8	3359168	3359175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61849	NC_013222	TGT	3	9	3359247	3359255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063643
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61851	NC_013222	CCA	2	6	3359289	3359294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063643
61852	NC_013222	CTG	2	6	3359311	3359316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063643
61853	NC_013222	GGA	2	6	3359317	3359322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063643
61854	NC_013222	CTC	3	9	3359348	3359356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063643
61855	NC_013222	G	6	6	3359366	3359371	0 %	0 %	100 %	0 %	260063643
61856	NC_013222	CCCG	2	8	3359434	3359441	0 %	0 %	25 %	75 %	260063643
61857	NC_013222	GC	3	6	3359489	3359494	0 %	0 %	50 %	50 %	260063643
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61862	NC_013222	GGT	2	6	3359731	3359736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063643
61863	NC_013222	TCC	2	6	3359783	3359788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063643
61864	NC_013222	GAA	2	6	3359797	3359802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063643
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61867	NC_013222	TTCC	2	8	3360073	3360080	0 %	50 %	0 %	50 %	260063643
61868	NC_013222	TCCA	2	8	3360128	3360135	25 %	25 %	0 %	50 %	260063643
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61878	NC_013222	CAT	2	6	3360469	3360474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063643
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61881	NC_013222	TCG	2	6	3360611	3360616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063643
61882	NC_013222	CAT	2	6	3360646	3360651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063643
61883	NC_013222	CCT	2	6	3360666	3360671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063643
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61887	NC_013222	GC	3	6	3360886	3360891	0 %	0 %	50 %	50 %	260063643
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61899	NC_013222	TGGT	2	8	3361385	3361392	0 %	50 %	50 %	0 %	260063643
61900	NC_013222	CTC	2	6	3361420	3361425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063643
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61907	NC_013222	TAT	2	6	3361577	3361582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063644
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61918	NC_013222	GCC	2	6	3362237	3362242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61919	NC_013222	GCCG	2	8	3362257	3362264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61920	NC_013222	ATT	2	6	3362335	3362340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063645
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61944	NC_013222	ATAAAG	2	12	3363882	3363893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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61946	NC_013222	GGCA	2	8	3363923	3363930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61947	NC_013222	GCACCT	2	12	3364021	3364032	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61948	NC_013222	CGGG	2	8	3364042	3364049	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61949	NC_013222	TAT	2	6	3364115	3364120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61950	NC_013222	TTTG	2	8	3364122	3364129	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61951	NC_013222	ACG	2	6	3364173	3364178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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61955	NC_013222	CTG	2	6	3364288	3364293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063647
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61960	NC_013222	ACA	2	6	3364658	3364663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063647
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61965	NC_013222	ACG	2	6	3364805	3364810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063647
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61968	NC_013222	CGG	2	6	3364962	3364967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063647
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