MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_013222	TGG	2	6	3315973	3315978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063598
61002	NC_013222	TA	3	6	3315994	3315999	50 %	50 %	0 %	0 %	260063598
61003	NC_013222	G	6	6	3316004	3316009	0 %	0 %	100 %	0 %	260063598
61004	NC_013222	GC	3	6	3316080	3316085	0 %	0 %	50 %	50 %	260063598
61005	NC_013222	CA	3	6	3316235	3316240	50 %	0 %	0 %	50 %	260063598
61006	NC_013222	CAA	2	6	3316244	3316249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063598
61007	NC_013222	G	6	6	3316254	3316259	0 %	0 %	100 %	0 %	260063598
61008	NC_013222	G	6	6	3316266	3316271	0 %	0 %	100 %	0 %	260063598
61009	NC_013222	GC	3	6	3316314	3316319	0 %	0 %	50 %	50 %	260063598
61010	NC_013222	C	6	6	3316361	3316366	0 %	0 %	0 %	100 %	260063598
61011	NC_013222	GAT	2	6	3316442	3316447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063598
61012	NC_013222	TGG	2	6	3316525	3316530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063598
61013	NC_013222	GCTGG	2	10	3316604	3316613	0 %	20 %	60 %	20 %	260063598
61014	NC_013222	CAT	2	6	3316793	3316798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063598
61015	NC_013222	GTG	2	6	3316818	3316823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063598
61016	NC_013222	AAC	2	6	3316839	3316844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063598
61017	NC_013222	ACC	2	6	3316872	3316877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063598
61018	NC_013222	CCT	2	6	3316888	3316893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063598
61019	NC_013222	ATCGC	2	10	3316894	3316903	20 %	20 %	20 %	40 %	260063598
61020	NC_013222	CAG	2	6	3316920	3316925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063598
61021	NC_013222	CCG	2	6	3316966	3316971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063598
61022	NC_013222	TGG	2	6	3317005	3317010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063598
61023	NC_013222	TTC	2	6	3317091	3317096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063598
61024	NC_013222	TCC	2	6	3317104	3317109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063598
61025	NC_013222	GAG	2	6	3317142	3317147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063598
61026	NC_013222	A	6	6	3317187	3317192	100 %	0 %	0 %	0 %	260063598
61027	NC_013222	AGC	2	6	3317282	3317287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063598
61028	NC_013222	TAAA	2	8	3317327	3317334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61029	NC_013222	TTC	2	6	3317460	3317465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063599
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61033	NC_013222	TCT	2	6	3317664	3317669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063599
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61038	NC_013222	T	6	6	3317879	3317884	0 %	100 %	0 %	0 %	260063599
61039	NC_013222	CGT	2	6	3317917	3317922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063599
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61050	NC_013222	CGTC	2	8	3318311	3318318	0 %	25 %	25 %	50 %	260063600
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61070	NC_013222	A	7	7	3319894	3319900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61071	NC_013222	TAA	2	6	3319901	3319906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61072	NC_013222	ATTG	2	8	3319961	3319968	25 %	50 %	25 %	0 %	260063603
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61112	NC_013222	A	7	7	3321669	3321675	100 %	0 %	0 %	0 %	260063604
61113	NC_013222	CGC	2	6	3321728	3321733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063604
61114	NC_013222	C	6	6	3321733	3321738	0 %	0 %	0 %	100 %	260063604
61115	NC_013222	CCTG	2	8	3321791	3321798	0 %	25 %	25 %	50 %	260063604
61116	NC_013222	CTG	2	6	3321807	3321812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063604
61117	NC_013222	TG	3	6	3321841	3321846	0 %	50 %	50 %	0 %	260063604
61118	NC_013222	GGA	2	6	3321855	3321860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063604
61119	NC_013222	GC	4	8	3321936	3321943	0 %	0 %	50 %	50 %	260063604
61120	NC_013222	TTC	2	6	3321998	3322003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063604
61121	NC_013222	CG	3	6	3322097	3322102	0 %	0 %	50 %	50 %	260063604
61122	NC_013222	AAG	2	6	3322119	3322124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063604
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61124	NC_013222	TTG	2	6	3322158	3322163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063604
61125	NC_013222	AAG	2	6	3322168	3322173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063604
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61138	NC_013222	AGG	2	6	3322671	3322676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063605
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61148	NC_013222	TGG	2	6	3322893	3322898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063605
61149	NC_013222	ATC	2	6	3322922	3322927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063605
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61151	NC_013222	ACC	2	6	3322988	3322993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063605
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61153	NC_013222	GGA	2	6	3323056	3323061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063605
61154	NC_013222	GAGG	2	8	3323073	3323080	25 %	0 %	75 %	0 %	260063606
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61161	NC_013222	CGG	2	6	3323415	3323420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063606
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61166	NC_013222	GTGG	2	8	3323673	3323680	0 %	25 %	75 %	0 %	260063606
61167	NC_013222	G	6	6	3323788	3323793	0 %	0 %	100 %	0 %	260063606
61168	NC_013222	ATT	2	6	3323847	3323852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063606
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61172	NC_013222	CTGATC	2	12	3323996	3324007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260063607
61173	NC_013222	TGA	2	6	3324052	3324057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063607
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61175	NC_013222	GAA	2	6	3324095	3324100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063607
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61178	NC_013222	ACC	2	6	3324275	3324280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063607
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61181	NC_013222	CAG	2	6	3324383	3324388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063607
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61183	NC_013222	GAT	2	6	3324524	3324529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063607
61184	NC_013222	CAGG	2	8	3324554	3324561	25 %	0 %	50 %	25 %	260063608
61185	NC_013222	CTA	2	6	3324626	3324631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063608
61186	NC_013222	CAA	2	6	3324641	3324646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063608
61187	NC_013222	CCG	2	6	3324805	3324810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063609
61188	NC_013222	CAG	2	6	3324830	3324835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063609
61189	NC_013222	CACT	2	8	3324925	3324932	25 %	25 %	0 %	50 %	260063609
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61191	NC_013222	C	6	6	3325006	3325011	0 %	0 %	0 %	100 %	260063609
61192	NC_013222	GCA	2	6	3325048	3325053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063609
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61196	NC_013222	CAT	2	6	3325261	3325266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063609
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61198	NC_013222	GGTTCA	2	12	3325291	3325302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260063609
61199	NC_013222	ACC	3	9	3325359	3325367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063609
61200	NC_013222	GGT	2	6	3325447	3325452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063609
61201	NC_013222	TA	3	6	3325538	3325543	50 %	50 %	0 %	0 %	260063609
61202	NC_013222	CCGGGT	2	12	3325670	3325681	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260063610
61203	NC_013222	AAAT	2	8	3325686	3325693	75 %	25 %	0 %	0 %	260063610
61204	NC_013222	CCG	2	6	3325797	3325802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063610
61205	NC_013222	GC	3	6	3325809	3325814	0 %	0 %	50 %	50 %	260063610
61206	NC_013222	TCAA	2	8	3325821	3325828	50 %	25 %	0 %	25 %	260063610
61207	NC_013222	GCCC	2	8	3325888	3325895	0 %	0 %	25 %	75 %	260063610
61208	NC_013222	CGG	2	6	3326022	3326027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063610
61209	NC_013222	CAG	2	6	3326153	3326158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063610
61210	NC_013222	GGC	2	6	3326201	3326206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063610
61211	NC_013222	GTG	2	6	3326330	3326335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063610
61212	NC_013222	AGCC	2	8	3326373	3326380	25 %	0 %	25 %	50 %	260063610
61213	NC_013222	CGGC	2	8	3326476	3326483	0 %	0 %	50 %	50 %	260063610
61214	NC_013222	AGC	3	9	3326484	3326492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063610
61215	NC_013222	TTC	2	6	3326552	3326557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063610
61216	NC_013222	GCT	2	6	3326558	3326563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063610
61217	NC_013222	GTG	2	6	3326564	3326569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063610
61218	NC_013222	CCA	2	6	3326653	3326658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063610
61219	NC_013222	GGATA	2	10	3326715	3326724	40 %	20 %	40 %	0 %	260063610
61220	NC_013222	GAC	2	6	3326729	3326734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063610
61221	NC_013222	TGC	2	6	3326782	3326787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063610
61222	NC_013222	CAG	3	9	3326855	3326863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063610
61223	NC_013222	A	7	7	3326864	3326870	100 %	0 %	0 %	0 %	260063610
61224	NC_013222	ACA	2	6	3326881	3326886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063610
61225	NC_013222	TC	3	6	3326939	3326944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61226	NC_013222	G	6	6	3326961	3326966	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61227	NC_013222	TAT	2	6	3327176	3327181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063611
61228	NC_013222	CGG	2	6	3327227	3327232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063611
61229	NC_013222	AAT	2	6	3327298	3327303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063611
61230	NC_013222	T	6	6	3327362	3327367	0 %	100 %	0 %	0 %	260063611
61231	NC_013222	ATT	2	6	3327408	3327413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063611
61232	NC_013222	AAAT	2	8	3327422	3327429	75 %	25 %	0 %	0 %	260063611
61233	NC_013222	ATC	2	6	3327603	3327608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063611
61234	NC_013222	CTT	2	6	3327689	3327694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063611
61235	NC_013222	TCG	2	6	3327700	3327705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063611
61236	NC_013222	ATC	2	6	3327736	3327741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063611
61237	NC_013222	T	6	6	3327755	3327760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61238	NC_013222	TTC	2	6	3327788	3327793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61239	NC_013222	T	8	8	3327824	3327831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61240	NC_013222	TTC	2	6	3327836	3327841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61241	NC_013222	GTC	2	6	3327914	3327919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063612
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61249	NC_013222	T	6	6	3328238	3328243	0 %	100 %	0 %	0 %	260063612
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61469	NC_013222	AGAACG	2	12	3340450	3340461	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260063624
61470	NC_013222	TGC	2	6	3340582	3340587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063624
61471	NC_013222	ACGCAA	2	12	3340592	3340603	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260063624
61472	NC_013222	ACA	2	6	3340621	3340626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063624
61473	NC_013222	GAC	2	6	3340656	3340661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063624
61474	NC_013222	TCA	2	6	3340684	3340689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063624
61475	NC_013222	TTC	2	6	3340767	3340772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063624
61476	NC_013222	GCT	2	6	3340838	3340843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063624
61477	NC_013222	AAG	2	6	3340851	3340856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063624
61478	NC_013222	CAC	2	6	3340957	3340962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063625
61479	NC_013222	AAG	2	6	3341033	3341038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063625
61480	NC_013222	G	6	6	3341124	3341129	0 %	0 %	100 %	0 %	260063625
61481	NC_013222	GT	3	6	3341162	3341167	0 %	50 %	50 %	0 %	260063625
61482	NC_013222	GCG	2	6	3341187	3341192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063625
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61484	NC_013222	GAC	2	6	3341300	3341305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063625
61485	NC_013222	AAC	2	6	3341412	3341417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063625
61486	NC_013222	TGC	2	6	3341613	3341618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063625
61487	NC_013222	TCA	2	6	3341712	3341717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063625
61488	NC_013222	GGCC	2	8	3341746	3341753	0 %	0 %	50 %	50 %	260063625
61489	NC_013222	GCG	2	6	3341781	3341786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063625
61490	NC_013222	A	7	7	3341889	3341895	100 %	0 %	0 %	0 %	260063626
61491	NC_013222	CTG	2	6	3341946	3341951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063626
61492	NC_013222	GTC	2	6	3341973	3341978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063626
61493	NC_013222	CCT	2	6	3342017	3342022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063626
61494	NC_013222	CAGA	2	8	3342093	3342100	50 %	0 %	25 %	25 %	260063626
61495	NC_013222	AAC	2	6	3342101	3342106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063626
61496	NC_013222	G	6	6	3342142	3342147	0 %	0 %	100 %	0 %	260063626
61497	NC_013222	GTG	2	6	3342165	3342170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063626
61498	NC_013222	G	6	6	3342223	3342228	0 %	0 %	100 %	0 %	260063626
61499	NC_013222	A	6	6	3342231	3342236	100 %	0 %	0 %	0 %	260063626
61500	NC_013222	TGG	2	6	3342277	3342282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063626

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