MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59501	NC_013222	AAG	2	6	3236371	3236376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063534
59502	NC_013222	GGC	2	6	3236416	3236421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063534
59503	NC_013222	CAA	2	6	3236454	3236459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063534
59504	NC_013222	CCTATA	2	12	3236497	3236508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063534
59505	NC_013222	CTG	2	6	3236544	3236549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063534
59506	NC_013222	CCTG	2	8	3236599	3236606	0 %	25 %	25 %	50 %	260063534
59507	NC_013222	GAC	2	6	3236652	3236657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063534
59508	NC_013222	AAC	2	6	3236673	3236678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063534
59509	NC_013222	CAC	2	6	3236798	3236803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063534
59510	NC_013222	GCA	2	6	3236804	3236809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063534
59511	NC_013222	TA	3	6	3236900	3236905	50 %	50 %	0 %	0 %	260063535
59512	NC_013222	CCA	2	6	3236965	3236970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063535
59513	NC_013222	CCGG	2	8	3237237	3237244	0 %	0 %	50 %	50 %	260063535
59514	NC_013222	CATG	2	8	3237249	3237256	25 %	25 %	25 %	25 %	260063535
59515	NC_013222	AGC	2	6	3237287	3237292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063535
59516	NC_013222	CTG	2	6	3237307	3237312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063535
59517	NC_013222	AGG	2	6	3237415	3237420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063535
59518	NC_013222	GGT	2	6	3237457	3237462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063535
59519	NC_013222	CGG	2	6	3237545	3237550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063535
59520	NC_013222	CGG	3	9	3237615	3237623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063535
59521	NC_013222	TCCG	2	8	3237787	3237794	0 %	25 %	25 %	50 %	260063536
59522	NC_013222	CTG	2	6	3237814	3237819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063536
59523	NC_013222	CTG	2	6	3237826	3237831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063536
59524	NC_013222	TCGGT	2	10	3237860	3237869	0 %	40 %	40 %	20 %	260063536
59525	NC_013222	GGC	2	6	3237887	3237892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063536
59526	NC_013222	TAC	2	6	3237976	3237981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063536
59527	NC_013222	GAT	2	6	3238009	3238014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063536
59528	NC_013222	CTG	2	6	3238096	3238101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063536
59529	NC_013222	T	6	6	3238108	3238113	0 %	100 %	0 %	0 %	260063536
59530	NC_013222	GCT	2	6	3238119	3238124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063536
59531	NC_013222	GCG	2	6	3238136	3238141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063536
59532	NC_013222	GCG	2	6	3238202	3238207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063536
59533	NC_013222	CCGC	2	8	3238247	3238254	0 %	0 %	25 %	75 %	260063536
59534	NC_013222	T	6	6	3238357	3238362	0 %	100 %	0 %	0 %	260063536
59535	NC_013222	GAA	2	6	3238375	3238380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063536
59536	NC_013222	GCC	2	6	3238396	3238401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063536
59537	NC_013222	GAA	2	6	3238472	3238477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063536
59538	NC_013222	GAG	2	6	3238780	3238785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063536
59539	NC_013222	CG	3	6	3238798	3238803	0 %	0 %	50 %	50 %	260063536
59540	NC_013222	GTG	2	6	3238946	3238951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063536
59541	NC_013222	G	6	6	3239062	3239067	0 %	0 %	100 %	0 %	260063536
59542	NC_013222	GCC	2	6	3239108	3239113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063536
59543	NC_013222	GCC	2	6	3239152	3239157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063536
59544	NC_013222	ATT	2	6	3239270	3239275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063536
59545	NC_013222	GGC	2	6	3239283	3239288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063536
59546	NC_013222	GGT	2	6	3239349	3239354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063536
59547	NC_013222	CGT	2	6	3239616	3239621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063536
59548	NC_013222	GGA	2	6	3239626	3239631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063536
59549	NC_013222	ACC	2	6	3239692	3239697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063536
59550	NC_013222	ACA	2	6	3239702	3239707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063536
59551	NC_013222	C	6	6	3239732	3239737	0 %	0 %	0 %	100 %	260063536
59552	NC_013222	TGGG	2	8	3239755	3239762	0 %	25 %	75 %	0 %	260063536
59553	NC_013222	CCCT	2	8	3239822	3239829	0 %	25 %	0 %	75 %	260063536
59554	NC_013222	CTC	2	6	3239907	3239912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063536
59555	NC_013222	TTC	2	6	3239959	3239964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063536
59556	NC_013222	ATA	2	6	3240014	3240019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063536
59557	NC_013222	ATATA	2	10	3240092	3240101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59558	NC_013222	T	6	6	3240207	3240212	0 %	100 %	0 %	0 %	260063537
59559	NC_013222	CGGA	2	8	3240281	3240288	25 %	0 %	50 %	25 %	260063537
59560	NC_013222	GGA	2	6	3240309	3240314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063537
59561	NC_013222	GC	3	6	3240367	3240372	0 %	0 %	50 %	50 %	260063537
59562	NC_013222	TGT	2	6	3240392	3240397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063537
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59564	NC_013222	TA	3	6	3240415	3240420	50 %	50 %	0 %	0 %	260063537
59565	NC_013222	GAA	2	6	3240444	3240449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063537
59566	NC_013222	GCT	2	6	3240507	3240512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063537
59567	NC_013222	ACG	2	6	3240527	3240532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063537
59568	NC_013222	AGGG	2	8	3240577	3240584	25 %	0 %	75 %	0 %	260063537
59569	NC_013222	CGGG	2	8	3240593	3240600	0 %	0 %	75 %	25 %	260063537
59570	NC_013222	TAC	2	6	3240673	3240678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063537
59571	NC_013222	AGGTGG	2	12	3241028	3241039	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260063537
59572	NC_013222	AACC	2	8	3241050	3241057	50 %	0 %	0 %	50 %	260063537
59573	NC_013222	CCTG	2	8	3241077	3241084	0 %	25 %	25 %	50 %	260063537
59574	NC_013222	ACA	2	6	3241106	3241111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063537
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59578	NC_013222	CTT	2	6	3241269	3241274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063537
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59582	NC_013222	TTC	2	6	3241378	3241383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063537
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59584	NC_013222	TAC	2	6	3241498	3241503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063537
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59586	NC_013222	GGA	2	6	3241698	3241703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063537
59587	NC_013222	AC	4	8	3241715	3241722	50 %	0 %	0 %	50 %	260063537
59588	NC_013222	CCCA	2	8	3241756	3241763	25 %	0 %	0 %	75 %	260063537
59589	NC_013222	TCT	2	6	3241790	3241795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063537
59590	NC_013222	CGG	2	6	3241913	3241918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063537
59591	NC_013222	ACA	2	6	3241934	3241939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063537
59592	NC_013222	CGCC	2	8	3241965	3241972	0 %	0 %	25 %	75 %	260063537
59593	NC_013222	CAAC	2	8	3242211	3242218	50 %	0 %	0 %	50 %	260063537
59594	NC_013222	CGGT	2	8	3242329	3242336	0 %	25 %	50 %	25 %	260063537
59595	NC_013222	GC	3	6	3242373	3242378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59596	NC_013222	GGA	2	6	3242428	3242433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063538
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59599	NC_013222	GAA	2	6	3242527	3242532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063538
59600	NC_013222	TGT	2	6	3242559	3242564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063538
59601	NC_013222	T	6	6	3242583	3242588	0 %	100 %	0 %	0 %	260063538
59602	NC_013222	ATC	2	6	3242600	3242605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063538
59603	NC_013222	TGA	2	6	3242670	3242675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063538
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59605	NC_013222	GGC	2	6	3242813	3242818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063538
59606	NC_013222	GGGGC	2	10	3242874	3242883	0 %	0 %	80 %	20 %	260063538
59607	NC_013222	TGG	2	6	3242946	3242951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063538
59608	NC_013222	TCC	2	6	3242982	3242987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063538
59609	NC_013222	CCT	2	6	3243039	3243044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063538
59610	NC_013222	AAAGTC	2	12	3243059	3243070	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	260063538
59611	NC_013222	TCC	2	6	3243123	3243128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063538
59612	NC_013222	TA	3	6	3243176	3243181	50 %	50 %	0 %	0 %	260063538
59613	NC_013222	CGA	2	6	3243222	3243227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063538
59614	NC_013222	TCCT	2	8	3243236	3243243	0 %	50 %	0 %	50 %	260063538
59615	NC_013222	GAT	2	6	3243262	3243267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063538
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59617	NC_013222	CGG	2	6	3243346	3243351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063538
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59619	NC_013222	GTC	2	6	3243560	3243565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063538
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59728	NC_013222	A	8	8	3249772	3249779	100 %	0 %	0 %	0 %	260063546
59729	NC_013222	AG	3	6	3249911	3249916	50 %	0 %	50 %	0 %	260063546
59730	NC_013222	GTT	2	6	3249959	3249964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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59962	NC_013222	CAT	2	6	3261943	3261948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063549
59963	NC_013222	GGC	2	6	3261971	3261976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063549
59964	NC_013222	TGG	2	6	3262015	3262020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063549
59965	NC_013222	GTA	2	6	3262038	3262043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063549
59966	NC_013222	GGT	2	6	3262091	3262096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063549
59967	NC_013222	GTT	2	6	3262112	3262117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063549
59968	NC_013222	C	6	6	3262188	3262193	0 %	0 %	0 %	100 %	260063549
59969	NC_013222	GAA	2	6	3262209	3262214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063549
59970	NC_013222	TGG	2	6	3262249	3262254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063549
59971	NC_013222	ATG	2	6	3262287	3262292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063549
59972	NC_013222	TG	3	6	3262369	3262374	0 %	50 %	50 %	0 %	260063549
59973	NC_013222	GGT	2	6	3262403	3262408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063549
59974	NC_013222	TGG	2	6	3262552	3262557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063549
59975	NC_013222	TTG	2	6	3262623	3262628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063549
59976	NC_013222	GTG	2	6	3262653	3262658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063549
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59980	NC_013222	TCG	2	6	3262830	3262835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063549
59981	NC_013222	CGG	2	6	3262924	3262929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063549
59982	NC_013222	CGT	2	6	3263029	3263034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063549
59983	NC_013222	GCC	2	6	3263099	3263104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063549
59984	NC_013222	CCAG	2	8	3263190	3263197	25 %	0 %	25 %	50 %	260063549
59985	NC_013222	CTG	2	6	3263319	3263324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063549
59986	NC_013222	TGA	2	6	3263365	3263370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063549
59987	NC_013222	GTT	2	6	3263393	3263398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063549
59988	NC_013222	GTC	2	6	3263399	3263404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063549
59989	NC_013222	GGC	2	6	3263420	3263425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063549
59990	NC_013222	TTG	2	6	3263448	3263453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063549
59991	NC_013222	C	6	6	3263514	3263519	0 %	0 %	0 %	100 %	260063549
59992	NC_013222	CAG	2	6	3263537	3263542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063549
59993	NC_013222	GATGC	2	10	3263620	3263629	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59994	NC_013222	TGT	2	6	3263647	3263652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59995	NC_013222	TGT	2	6	3263689	3263694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59996	NC_013222	A	6	6	3263703	3263708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59997	NC_013222	AGT	2	6	3263743	3263748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59998	NC_013222	AGG	2	6	3263754	3263759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59999	NC_013222	ATA	2	6	3263775	3263780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063550
60000	NC_013222	GCG	2	6	3263789	3263794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063550

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