MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_013222	TGC	2	6	2990747	2990752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063316
55002	NC_013222	CTT	2	6	2990840	2990845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063316
55003	NC_013222	GGT	2	6	2990854	2990859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063316
55004	NC_013222	CCGG	2	8	2990908	2990915	0 %	0 %	50 %	50 %	260063316
55005	NC_013222	A	6	6	2990922	2990927	100 %	0 %	0 %	0 %	260063316
55006	NC_013222	CCCGG	2	10	2990942	2990951	0 %	0 %	40 %	60 %	260063316
55007	NC_013222	GGC	2	6	2991032	2991037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063316
55008	NC_013222	TTC	2	6	2991065	2991070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063316
55009	NC_013222	TCCCCA	2	12	2991076	2991087	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260063316
55010	NC_013222	TGG	2	6	2991109	2991114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063316
55011	NC_013222	GGA	2	6	2991227	2991232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063316
55012	NC_013222	CGCC	2	8	2991271	2991278	0 %	0 %	25 %	75 %	260063316
55013	NC_013222	GGC	2	6	2991314	2991319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063316
55014	NC_013222	ACC	2	6	2991406	2991411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063316
55015	NC_013222	TCA	2	6	2991439	2991444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55016	NC_013222	GCC	2	6	2991504	2991509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55017	NC_013222	TCC	2	6	2991521	2991526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063317
55018	NC_013222	CGG	2	6	2991577	2991582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063317
55019	NC_013222	A	7	7	2991622	2991628	100 %	0 %	0 %	0 %	260063317
55020	NC_013222	GCG	2	6	2991660	2991665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063317
55021	NC_013222	GTC	2	6	2991701	2991706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063317
55022	NC_013222	AAT	2	6	2991763	2991768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063317
55023	NC_013222	CCGT	2	8	2991801	2991808	0 %	25 %	25 %	50 %	260063317
55024	NC_013222	CGG	2	6	2991955	2991960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063317
55025	NC_013222	GCC	2	6	2992018	2992023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063317
55026	NC_013222	TTCC	2	8	2992085	2992092	0 %	50 %	0 %	50 %	260063317
55027	NC_013222	GGCT	2	8	2992281	2992288	0 %	25 %	50 %	25 %	260063317
55028	NC_013222	CCG	2	6	2992304	2992309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063317
55029	NC_013222	GCCG	2	8	2992382	2992389	0 %	0 %	50 %	50 %	260063317
55030	NC_013222	TGC	2	6	2992407	2992412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063317
55031	NC_013222	A	7	7	2992434	2992440	100 %	0 %	0 %	0 %	260063317
55032	NC_013222	TTC	2	6	2992458	2992463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063317
55033	NC_013222	TCT	2	6	2992480	2992485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063317
55034	NC_013222	GCCA	2	8	2992502	2992509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55035	NC_013222	ATC	2	6	2992519	2992524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55036	NC_013222	AACCG	2	10	2992573	2992582	40 %	0 %	20 %	40 %	260063318
55037	NC_013222	TCCGT	2	10	2992612	2992621	0 %	40 %	20 %	40 %	260063318
55038	NC_013222	CTT	2	6	2992991	2992996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063318
55039	NC_013222	CCA	2	6	2993060	2993065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063318
55040	NC_013222	T	7	7	2993150	2993156	0 %	100 %	0 %	0 %	260063318
55041	NC_013222	CCT	2	6	2993245	2993250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063318
55042	NC_013222	CGG	2	6	2993293	2993298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063318
55043	NC_013222	TCG	2	6	2993425	2993430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063318
55044	NC_013222	CCG	2	6	2993566	2993571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063318
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55046	NC_013222	GCA	2	6	2993620	2993625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063318
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55050	NC_013222	GCC	2	6	2993995	2994000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063318
55051	NC_013222	T	6	6	2994207	2994212	0 %	100 %	0 %	0 %	260063318
55052	NC_013222	TTC	2	6	2994216	2994221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063318
55053	NC_013222	CGT	2	6	2994230	2994235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063318
55054	NC_013222	ATC	2	6	2994250	2994255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063318
55055	NC_013222	ACC	2	6	2994313	2994318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063318
55056	NC_013222	GC	3	6	2994363	2994368	0 %	0 %	50 %	50 %	260063318
55057	NC_013222	GGCA	2	8	2994378	2994385	25 %	0 %	50 %	25 %	260063318
55058	NC_013222	GAT	2	6	2994429	2994434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063318
55059	NC_013222	GCG	2	6	2994507	2994512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063318
55060	NC_013222	CTT	2	6	2994518	2994523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063318
55061	NC_013222	ACC	2	6	2994607	2994612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063318
55062	NC_013222	GGTC	2	8	2994665	2994672	0 %	25 %	50 %	25 %	260063318
55063	NC_013222	TTC	2	6	2994732	2994737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063318
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55070	NC_013222	CCG	2	6	2995201	2995206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063318
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55077	NC_013222	CTTC	2	8	2995556	2995563	0 %	50 %	0 %	50 %	260063318
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55083	NC_013222	CTG	2	6	2995812	2995817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063318
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55085	NC_013222	GTTT	2	8	2995884	2995891	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55086	NC_013222	TGTT	2	8	2995900	2995907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55087	NC_013222	GCTG	2	8	2995978	2995985	0 %	25 %	50 %	25 %	260063319
55088	NC_013222	AATTG	2	10	2995990	2995999	40 %	40 %	20 %	0 %	260063319
55089	NC_013222	CCGG	2	8	2996092	2996099	0 %	0 %	50 %	50 %	260063319
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55091	NC_013222	CG	3	6	2996318	2996323	0 %	0 %	50 %	50 %	260063319
55092	NC_013222	GCCG	2	8	2996332	2996339	0 %	0 %	50 %	50 %	260063319
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55102	NC_013222	GTC	2	6	2997128	2997133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063319
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55107	NC_013222	CAGT	2	8	2997507	2997514	25 %	25 %	25 %	25 %	260063319
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55118	NC_013222	TGC	2	6	2998147	2998152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063319
55119	NC_013222	T	6	6	2998284	2998289	0 %	100 %	0 %	0 %	260063319
55120	NC_013222	GCA	2	6	2998297	2998302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063319
55121	NC_013222	CGT	2	6	2998312	2998317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063319
55122	NC_013222	CTG	2	6	2998319	2998324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063319
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55238	NC_013222	TTA	2	6	3005816	3005821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063325
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55273	NC_013222	GTA	2	6	3008119	3008124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55275	NC_013222	GCGG	2	8	3008199	3008206	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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55300	NC_013222	GAAAAC	2	12	3009584	3009595	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	260063327
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55348	NC_013222	GAC	3	9	3012549	3012557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063328
55349	NC_013222	CAA	2	6	3012626	3012631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063328
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55354	NC_013222	GC	3	6	3012858	3012863	0 %	0 %	50 %	50 %	260063328
55355	NC_013222	GGC	2	6	3012875	3012880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063328
55356	NC_013222	GACC	2	8	3012929	3012936	25 %	0 %	25 %	50 %	260063328
55357	NC_013222	GGGA	2	8	3012942	3012949	25 %	0 %	75 %	0 %	260063328
55358	NC_013222	ACGC	2	8	3012987	3012994	25 %	0 %	25 %	50 %	260063329
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55362	NC_013222	GGAC	2	8	3013104	3013111	25 %	0 %	50 %	25 %	260063329
55363	NC_013222	AGA	2	6	3013119	3013124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063329
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55365	NC_013222	TGGA	2	8	3013235	3013242	25 %	25 %	50 %	0 %	260063329
55366	NC_013222	C	6	6	3013259	3013264	0 %	0 %	0 %	100 %	260063329
55367	NC_013222	AGA	2	6	3013299	3013304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063329
55368	NC_013222	GCC	2	6	3013315	3013320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063329
55369	NC_013222	GGCCC	2	10	3013410	3013419	0 %	0 %	40 %	60 %	260063329
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55381	NC_013222	TCG	2	6	3014120	3014125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063329
55382	NC_013222	CGG	2	6	3014157	3014162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063329
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55386	NC_013222	GAG	2	6	3014483	3014488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063330
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55399	NC_013222	CGA	2	6	3015219	3015224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063330
55400	NC_013222	CCGC	2	8	3015226	3015233	0 %	0 %	25 %	75 %	260063330
55401	NC_013222	GC	3	6	3015236	3015241	0 %	0 %	50 %	50 %	260063330
55402	NC_013222	TGG	2	6	3015276	3015281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063330
55403	NC_013222	TCCGG	2	10	3015296	3015305	0 %	20 %	40 %	40 %	260063330
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55432	NC_013222	A	8	8	3017098	3017105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55433	NC_013222	CCGG	2	8	3017110	3017117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55434	NC_013222	TCC	2	6	3017155	3017160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063332
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55471	NC_013222	CGC	2	6	3019304	3019309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063332
55472	NC_013222	GCC	2	6	3019323	3019328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063332
55473	NC_013222	CCA	2	6	3019329	3019334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063332
55474	NC_013222	GCCG	2	8	3019372	3019379	0 %	0 %	50 %	50 %	260063332
55475	NC_013222	CGGT	2	8	3019384	3019391	0 %	25 %	50 %	25 %	260063332
55476	NC_013222	TGG	2	6	3019411	3019416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063332
55477	NC_013222	TGTT	2	8	3019417	3019424	0 %	75 %	25 %	0 %	260063332
55478	NC_013222	TAA	2	6	3019450	3019455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063332
55479	NC_013222	TAAA	2	8	3019476	3019483	75 %	25 %	0 %	0 %	260063332
55480	NC_013222	CTG	2	6	3019552	3019557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063332
55481	NC_013222	GCA	2	6	3019559	3019564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063332
55482	NC_013222	CAG	2	6	3019599	3019604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063332
55483	NC_013222	A	6	6	3019673	3019678	100 %	0 %	0 %	0 %	260063332
55484	NC_013222	CTG	2	6	3019770	3019775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063332
55485	NC_013222	GTT	2	6	3019827	3019832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063332
55486	NC_013222	CTCC	2	8	3019879	3019886	0 %	25 %	0 %	75 %	260063332
55487	NC_013222	TCC	2	6	3019918	3019923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063332
55488	NC_013222	CAG	2	6	3020214	3020219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063332
55489	NC_013222	TCC	2	6	3020311	3020316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063332
55490	NC_013222	CCG	2	6	3020320	3020325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063332
55491	NC_013222	C	6	6	3020339	3020344	0 %	0 %	0 %	100 %	260063332
55492	NC_013222	CCG	2	6	3020540	3020545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063332
55493	NC_013222	GGGA	2	8	3020698	3020705	25 %	0 %	75 %	0 %	260063332
55494	NC_013222	ACA	2	6	3020717	3020722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063332
55495	NC_013222	TCA	2	6	3020792	3020797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55496	NC_013222	GGCG	2	8	3020812	3020819	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55497	NC_013222	TC	3	6	3020940	3020945	0 %	50 %	0 %	50 %	260063333
55498	NC_013222	TCC	2	6	3020955	3020960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063333
55499	NC_013222	ACA	2	6	3021057	3021062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063333
55500	NC_013222	CTGG	2	8	3021094	3021101	0 %	25 %	50 %	25 %	260063333

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