MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_013222	CGA	2	6	2961553	2961558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063295
54502	NC_013222	ATC	2	6	2961560	2961565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063295
54503	NC_013222	T	6	6	2961594	2961599	0 %	100 %	0 %	0 %	260063295
54504	NC_013222	A	6	6	2961603	2961608	100 %	0 %	0 %	0 %	260063295
54505	NC_013222	CAT	2	6	2961661	2961666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063295
54506	NC_013222	CCG	2	6	2961716	2961721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063295
54507	NC_013222	CGG	2	6	2961796	2961801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063295
54508	NC_013222	ATC	2	6	2961863	2961868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063295
54509	NC_013222	AGG	2	6	2962005	2962010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063295
54510	NC_013222	TCA	2	6	2962113	2962118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063295
54511	NC_013222	CTG	2	6	2962157	2962162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063295
54512	NC_013222	GTG	2	6	2962220	2962225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063295
54513	NC_013222	CCT	2	6	2962300	2962305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063295
54514	NC_013222	CTT	2	6	2962330	2962335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063295
54515	NC_013222	TGT	2	6	2962341	2962346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063295
54516	NC_013222	CAC	3	9	2962495	2962503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063295
54517	NC_013222	GGCA	2	8	2962594	2962601	25 %	0 %	50 %	25 %	260063295
54518	NC_013222	ATGACG	2	12	2962614	2962625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260063295
54519	NC_013222	GAC	2	6	2962646	2962651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063295
54520	NC_013222	CCTGCG	2	12	2962693	2962704	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260063295
54521	NC_013222	GC	3	6	2962736	2962741	0 %	0 %	50 %	50 %	260063295
54522	NC_013222	CAC	2	6	2962810	2962815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063295
54523	NC_013222	CACC	2	8	2962876	2962883	25 %	0 %	0 %	75 %	260063295
54524	NC_013222	CCA	2	6	2962966	2962971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063295
54525	NC_013222	GGA	2	6	2963017	2963022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063295
54526	NC_013222	GAC	2	6	2963045	2963050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063295
54527	NC_013222	ATC	2	6	2963069	2963074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063295
54528	NC_013222	CGA	2	6	2963134	2963139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063295
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54530	NC_013222	TCGG	2	8	2963205	2963212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54531	NC_013222	CAA	2	6	2963262	2963267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54532	NC_013222	AACC	2	8	2963292	2963299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54533	NC_013222	CTG	2	6	2963364	2963369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54534	NC_013222	GAA	2	6	2963433	2963438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063296
54535	NC_013222	CGGGA	2	10	2963574	2963583	20 %	0 %	60 %	20 %	260063296
54536	NC_013222	CGA	2	6	2963768	2963773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063296
54537	NC_013222	GCA	2	6	2963788	2963793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063296
54538	NC_013222	CAG	2	6	2963846	2963851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063296
54539	NC_013222	ATGCC	2	10	2963891	2963900	20 %	20 %	20 %	40 %	260063296
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54542	NC_013222	GCG	2	6	2963986	2963991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063296
54543	NC_013222	CCAAA	2	10	2964002	2964011	60 %	0 %	0 %	40 %	260063296
54544	NC_013222	A	6	6	2964009	2964014	100 %	0 %	0 %	0 %	260063296
54545	NC_013222	TCA	2	6	2964061	2964066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54546	NC_013222	CTG	2	6	2964084	2964089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54547	NC_013222	T	6	6	2964114	2964119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54548	NC_013222	TAC	2	6	2964129	2964134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54549	NC_013222	CCA	2	6	2964179	2964184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063297
54550	NC_013222	GCCT	2	8	2964249	2964256	0 %	25 %	25 %	50 %	260063297
54551	NC_013222	CGG	2	6	2964263	2964268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063297
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54553	NC_013222	CCG	2	6	2964511	2964516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063297
54554	NC_013222	A	6	6	2964565	2964570	100 %	0 %	0 %	0 %	260063297
54555	NC_013222	GGAC	2	8	2964622	2964629	25 %	0 %	50 %	25 %	260063297
54556	NC_013222	GCA	2	6	2964659	2964664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063297
54557	NC_013222	CG	3	6	2964728	2964733	0 %	0 %	50 %	50 %	260063297
54558	NC_013222	AGC	2	6	2964766	2964771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063297
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54567	NC_013222	CGC	2	6	2965364	2965369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063298
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54575	NC_013222	GGAA	2	8	2965720	2965727	50 %	0 %	50 %	0 %	260063298
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54582	NC_013222	CTTC	2	8	2966130	2966137	0 %	50 %	0 %	50 %	260063298
54583	NC_013222	CTG	2	6	2966217	2966222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063298
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54586	NC_013222	TTA	2	6	2966371	2966376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54587	NC_013222	A	6	6	2966401	2966406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54588	NC_013222	T	7	7	2966420	2966426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54589	NC_013222	C	7	7	2966465	2966471	0 %	0 %	0 %	100 %	260063299
54590	NC_013222	CAGG	2	8	2966568	2966575	25 %	0 %	50 %	25 %	260063299
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54618	NC_013222	CGG	2	6	2967856	2967861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063300
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54620	NC_013222	TCGCT	2	10	2968033	2968042	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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54622	NC_013222	GCC	2	6	2968086	2968091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54623	NC_013222	C	6	6	2968216	2968221	0 %	0 %	0 %	100 %	260063301
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54677	NC_013222	AGGA	2	8	2971908	2971915	50 %	0 %	50 %	0 %	260063303
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54721	NC_013222	TTC	2	6	2975659	2975664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063307
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54725	NC_013222	ATG	2	6	2975750	2975755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063307
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54727	NC_013222	GCA	2	6	2975787	2975792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063307
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54730	NC_013222	TC	3	6	2975841	2975846	0 %	50 %	0 %	50 %	260063307
54731	NC_013222	CCT	2	6	2975871	2975876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063307
54732	NC_013222	AGGT	2	8	2975915	2975922	25 %	25 %	50 %	0 %	260063307
54733	NC_013222	ACC	2	6	2975930	2975935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063307
54734	NC_013222	TCG	2	6	2975939	2975944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063307
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54736	NC_013222	GAA	2	6	2976037	2976042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063307
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54853	NC_013222	GCC	2	6	2983338	2983343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063311
54854	NC_013222	CTTC	2	8	2983405	2983412	0 %	50 %	0 %	50 %	260063311
54855	NC_013222	CCA	2	6	2983417	2983422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063311
54856	NC_013222	CTTTT	2	10	2983436	2983445	0 %	80 %	0 %	20 %	260063311
54857	NC_013222	GCC	2	6	2983475	2983480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063311
54858	NC_013222	AACA	2	8	2983529	2983536	75 %	0 %	0 %	25 %	260063311
54859	NC_013222	GTG	2	6	2983572	2983577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063311
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54861	NC_013222	ATT	2	6	2983649	2983654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54862	NC_013222	G	6	6	2983696	2983701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54863	NC_013222	GTA	2	6	2983724	2983729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54864	NC_013222	ACC	2	6	2983797	2983802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063312
54865	NC_013222	TCA	2	6	2983882	2983887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063312
54866	NC_013222	TGG	2	6	2984116	2984121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063312
54867	NC_013222	TTTA	2	8	2984169	2984176	25 %	75 %	0 %	0 %	260063312
54868	NC_013222	CTGC	2	8	2984177	2984184	0 %	25 %	25 %	50 %	260063312
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54872	NC_013222	CTGGG	2	10	2984430	2984439	0 %	20 %	60 %	20 %	260063312
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54879	NC_013222	TGA	2	6	2984575	2984580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063312
54880	NC_013222	TGG	2	6	2984689	2984694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063312
54881	NC_013222	TCCTGG	2	12	2984704	2984715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063312
54882	NC_013222	GGT	2	6	2984744	2984749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063312
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54889	NC_013222	TGG	2	6	2984995	2985000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063312
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54892	NC_013222	CGCCC	2	10	2985197	2985206	0 %	0 %	20 %	80 %	260063313
54893	NC_013222	GTGCC	2	10	2985234	2985243	0 %	20 %	40 %	40 %	260063313
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54918	NC_013222	G	7	7	2986476	2986482	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54919	NC_013222	CTG	2	6	2986543	2986548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063314
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54923	NC_013222	GGA	2	6	2986719	2986724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063314
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54926	NC_013222	GCCC	2	8	2986860	2986867	0 %	0 %	25 %	75 %	260063314
54927	NC_013222	G	6	6	2986868	2986873	0 %	0 %	100 %	0 %	260063314
54928	NC_013222	GCA	2	6	2986942	2986947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063314
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54953	NC_013222	C	7	7	2988264	2988270	0 %	0 %	0 %	100 %	260063314
54954	NC_013222	ACGGG	2	10	2988276	2988285	20 %	0 %	60 %	20 %	260063314
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54958	NC_013222	CGGG	2	8	2988435	2988442	0 %	0 %	75 %	25 %	260063314
54959	NC_013222	ATT	2	6	2988444	2988449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063314
54960	NC_013222	ATT	2	6	2988470	2988475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063314
54961	NC_013222	GAGAA	2	10	2988530	2988539	60 %	0 %	40 %	0 %	260063314
54962	NC_013222	GGA	2	6	2988564	2988569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063314
54963	NC_013222	CCT	2	6	2988581	2988586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063314
54964	NC_013222	TTACT	2	10	2988588	2988597	20 %	60 %	0 %	20 %	260063314
54965	NC_013222	GCC	2	6	2988622	2988627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063314
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54967	NC_013222	GAG	2	6	2988703	2988708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063314
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54969	NC_013222	TAT	2	6	2988757	2988762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063314
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54971	NC_013222	CCGG	2	8	2988871	2988878	0 %	0 %	50 %	50 %	260063314
54972	NC_013222	A	6	6	2988899	2988904	100 %	0 %	0 %	0 %	260063314
54973	NC_013222	GATC	2	8	2988930	2988937	25 %	25 %	25 %	25 %	260063314
54974	NC_013222	CGG	2	6	2988941	2988946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063314
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54976	NC_013222	CCT	2	6	2989085	2989090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54981	NC_013222	GCCG	2	8	2989649	2989656	0 %	0 %	50 %	50 %	260063315
54982	NC_013222	TGC	2	6	2989723	2989728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063315
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54999	NC_013222	GTCC	2	8	2990680	2990687	0 %	25 %	25 %	50 %	260063316
55000	NC_013222	GCC	2	6	2990696	2990701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063316

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