MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012858	AGCATC	2	12	170037	170048	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666653
4002	NC_012858	TGC	2	6	170054	170059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666653
4003	NC_012858	GC	3	6	170254	170259	0 %	0 %	50 %	50 %	241666653
4004	NC_012858	CAC	2	6	170270	170275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666653
4005	NC_012858	GGC	2	6	170320	170325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666653
4006	NC_012858	GC	3	6	170328	170333	0 %	0 %	50 %	50 %	241666653
4007	NC_012858	GGAT	2	8	170334	170341	25 %	25 %	50 %	0 %	241666653
4008	NC_012858	TCCGC	2	10	170344	170353	0 %	20 %	20 %	60 %	241666653
4009	NC_012858	GCG	2	6	170370	170375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666653
4010	NC_012858	GCA	2	6	170430	170435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666653
4011	NC_012858	CAA	2	6	170446	170451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666653
4012	NC_012858	CCTG	2	8	170530	170537	0 %	25 %	25 %	50 %	241666653
4013	NC_012858	GAA	2	6	170643	170648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666653
4014	NC_012858	AAC	2	6	170660	170665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666653
4015	NC_012858	CAG	2	6	170751	170756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666654
4016	NC_012858	CG	3	6	170836	170841	0 %	0 %	50 %	50 %	241666654
4017	NC_012858	CTC	2	6	170886	170891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666654
4018	NC_012858	GGT	2	6	170919	170924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666654
4019	NC_012858	GAG	2	6	170988	170993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666654
4020	NC_012858	CGGT	2	8	171037	171044	0 %	25 %	50 %	25 %	241666654
4021	NC_012858	CGG	2	6	171045	171050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666654
4022	NC_012858	CTG	2	6	171096	171101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666654
4023	NC_012858	GCA	2	6	171181	171186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666654
4024	NC_012858	GAT	2	6	171194	171199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666654
4025	NC_012858	CGC	2	6	171265	171270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666654
4026	NC_012858	GC	4	8	171288	171295	0 %	0 %	50 %	50 %	241666654
4027	NC_012858	TC	3	6	171319	171324	0 %	50 %	0 %	50 %	241666654
4028	NC_012858	AGC	2	6	171393	171398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666654
4029	NC_012858	CCCG	2	8	171614	171621	0 %	0 %	25 %	75 %	241666654
4030	NC_012858	GAA	2	6	171677	171682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666654
4031	NC_012858	CAT	2	6	171813	171818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666654
4032	NC_012858	ATT	2	6	171831	171836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012858	TGCTC	2	10	171852	171861	0 %	40 %	20 %	40 %	241666655
4034	NC_012858	CGGT	2	8	171876	171883	0 %	25 %	50 %	25 %	241666655
4035	NC_012858	GCCA	2	8	171921	171928	25 %	0 %	25 %	50 %	241666655
4036	NC_012858	TTC	2	6	172007	172012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666655
4037	NC_012858	GCA	2	6	172065	172070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666655
4038	NC_012858	CGG	2	6	172175	172180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666655
4039	NC_012858	GCC	2	6	172201	172206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666655
4040	NC_012858	CAA	2	6	172248	172253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666655
4041	NC_012858	CGA	2	6	172260	172265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666655
4042	NC_012858	GAT	2	6	172270	172275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666655
4043	NC_012858	CTT	2	6	172369	172374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666655
4044	NC_012858	TCG	2	6	172397	172402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666655
4045	NC_012858	CGA	2	6	172449	172454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666655
4046	NC_012858	TGA	2	6	172455	172460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666655
4047	NC_012858	AGC	2	6	172493	172498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666655
4048	NC_012858	CGA	2	6	172588	172593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666655
4049	NC_012858	CGA	2	6	172660	172665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_012858	GAG	2	6	172688	172693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_012858	CGA	2	6	172790	172795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666656
4052	NC_012858	CGC	2	6	172838	172843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666656
4053	NC_012858	CGA	2	6	172851	172856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666656
4054	NC_012858	GTC	2	6	172891	172896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666656
4055	NC_012858	TCGATC	2	12	172942	172953	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241666656
4056	NC_012858	TGC	2	6	172989	172994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666656
4057	NC_012858	CT	3	6	173014	173019	0 %	50 %	0 %	50 %	241666656
4058	NC_012858	TGC	2	6	173035	173040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666656
4059	NC_012858	GTTT	2	8	173102	173109	0 %	75 %	25 %	0 %	241666656
4060	NC_012858	TGG	2	6	173156	173161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666656
4061	NC_012858	CAT	2	6	173162	173167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666656
4062	NC_012858	AGATCG	2	12	173191	173202	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666656
4063	NC_012858	TCG	2	6	173255	173260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666656
4064	NC_012858	TCA	2	6	173284	173289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666656
4065	NC_012858	ATCGGG	2	12	173307	173318	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666656
4066	NC_012858	CGC	2	6	173478	173483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666656
4067	NC_012858	GGA	2	6	173668	173673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666656
4068	NC_012858	TCCG	2	8	173718	173725	0 %	25 %	25 %	50 %	241666656
4069	NC_012858	TCT	2	6	173806	173811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666656
4070	NC_012858	CAA	2	6	173874	173879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_012858	GCC	2	6	173953	173958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_012858	AAC	2	6	173970	173975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_012858	CA	4	8	173988	173995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_012858	ATT	2	6	174055	174060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_012858	ATA	2	6	174132	174137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_012858	AAG	2	6	174160	174165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_012858	AT	3	6	174171	174176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_012858	GCCT	2	8	174195	174202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_012858	GTA	2	6	174222	174227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_012858	GATT	2	8	174291	174298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_012858	TAT	2	6	174375	174380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_012858	GAA	2	6	174382	174387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_012858	GAT	2	6	174481	174486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_012858	ATT	2	6	174521	174526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_012858	AAC	2	6	174554	174559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666657
4086	NC_012858	T	6	6	174590	174595	0 %	100 %	0 %	0 %	241666657
4087	NC_012858	TCGC	2	8	174603	174610	0 %	25 %	25 %	50 %	241666657
4088	NC_012858	CGG	2	6	174627	174632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666657
4089	NC_012858	CGC	2	6	174668	174673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666657
4090	NC_012858	TCG	2	6	174759	174764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666657
4091	NC_012858	GC	3	6	174802	174807	0 %	0 %	50 %	50 %	241666657
4092	NC_012858	GC	3	6	174855	174860	0 %	0 %	50 %	50 %	241666657
4093	NC_012858	T	6	6	174877	174882	0 %	100 %	0 %	0 %	241666657
4094	NC_012858	TGC	2	6	174894	174899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666657
4095	NC_012858	GCC	2	6	174908	174913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666657
4096	NC_012858	CTCG	2	8	174928	174935	0 %	25 %	25 %	50 %	241666657
4097	NC_012858	CAG	2	6	174950	174955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666657
4098	NC_012858	TGTCGC	2	12	174960	174971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666657
4099	NC_012858	AGG	2	6	174975	174980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666657
4100	NC_012858	CGT	2	6	174991	174996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666657
4101	NC_012858	CGA	2	6	175000	175005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666657
4102	NC_012858	ACC	2	6	175047	175052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666657
4103	NC_012858	CG	3	6	175068	175073	0 %	0 %	50 %	50 %	241666657
4104	NC_012858	CCA	2	6	175245	175250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666657
4105	NC_012858	CGGCCT	2	12	175255	175266	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666657
4106	NC_012858	TTC	2	6	175283	175288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666657
4107	NC_012858	TGC	2	6	175317	175322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666657
4108	NC_012858	CG	3	6	175386	175391	0 %	0 %	50 %	50 %	241666657
4109	NC_012858	GC	3	6	175393	175398	0 %	0 %	50 %	50 %	241666657
4110	NC_012858	GCG	2	6	175428	175433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666657
4111	NC_012858	GC	3	6	175439	175444	0 %	0 %	50 %	50 %	241666657
4112	NC_012858	GCC	2	6	175450	175455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666657
4113	NC_012858	CCG	3	9	175464	175472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666657
4114	NC_012858	ACT	2	6	175504	175509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666657
4115	NC_012858	G	6	6	175589	175594	0 %	0 %	100 %	0 %	241666658
4116	NC_012858	GCC	2	6	175607	175612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666658
4117	NC_012858	ATCG	2	8	175637	175644	25 %	25 %	25 %	25 %	241666658
4118	NC_012858	TG	3	6	175684	175689	0 %	50 %	50 %	0 %	241666658
4119	NC_012858	CCA	2	6	175735	175740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666658
4120	NC_012858	CAT	2	6	175742	175747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666658
4121	NC_012858	ATG	2	6	175764	175769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666658
4122	NC_012858	GAC	2	6	175775	175780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666658
4123	NC_012858	GAC	2	6	175836	175841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666658
4124	NC_012858	CCT	2	6	175849	175854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_012858	ATCG	2	8	175864	175871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4126	NC_012858	CCG	2	6	175934	175939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_012858	GAG	2	6	175993	175998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_012858	GCA	2	6	176009	176014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666659
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4130	NC_012858	TGG	2	6	176053	176058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666659
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4134	NC_012858	GCT	2	6	176413	176418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666659
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4150	NC_012858	CGG	2	6	177050	177055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666659
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4153	NC_012858	ATC	2	6	177150	177155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666659
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4155	NC_012858	GCC	2	6	177200	177205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4156	NC_012858	GACGC	2	10	177280	177289	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4157	NC_012858	GAC	2	6	177350	177355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4158	NC_012858	CATG	2	8	177380	177387	25 %	25 %	25 %	25 %	241666660
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4172	NC_012858	CGA	2	6	177985	177990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666661
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4195	NC_012858	A	7	7	179031	179037	100 %	0 %	0 %	0 %	241666661
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4197	NC_012858	CGA	2	6	179069	179074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666661
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4204	NC_012858	CTG	2	6	179359	179364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666662
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4216	NC_012858	ATG	2	6	179900	179905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4231	NC_012858	ACC	2	6	180772	180777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666663
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4234	NC_012858	TAA	2	6	180847	180852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241666663
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4236	NC_012858	TTCC	2	8	180997	181004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4237	NC_012858	CAA	2	6	181099	181104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4238	NC_012858	TA	3	6	181220	181225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_012858	GTC	2	6	181234	181239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4240	NC_012858	GA	3	6	181281	181286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_012858	ATC	2	6	181294	181299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4242	NC_012858	GGC	2	6	181321	181326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NC_012858	TGTCT	2	10	181341	181350	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4244	NC_012858	AAG	2	6	181357	181362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_012858	AAC	2	6	181363	181368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4246	NC_012858	ATG	2	6	181382	181387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_012858	TTC	2	6	181418	181423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_012858	ACG	2	6	181474	181479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4249	NC_012858	CGG	2	6	181707	181712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666664
4250	NC_012858	GCG	2	6	181733	181738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666664
4251	NC_012858	TGC	2	6	181847	181852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666664
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4255	NC_012858	CCCG	2	8	181941	181948	0 %	0 %	25 %	75 %	241666664
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4280	NC_012858	TCGG	2	8	182977	182984	0 %	25 %	50 %	25 %	241666664
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4283	NC_012858	CGG	2	6	183060	183065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666664
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4317	NC_012858	CG	3	6	184425	184430	0 %	0 %	50 %	50 %	241666666
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4322	NC_012858	CTCGC	2	10	184563	184572	0 %	20 %	20 %	60 %	241666666
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4354	NC_012858	CCA	2	6	185686	185691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666667
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4358	NC_012858	CCAG	2	8	185914	185921	25 %	0 %	25 %	50 %	241666667
4359	NC_012858	CGC	2	6	185954	185959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666667
4360	NC_012858	CGA	2	6	185965	185970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666667
4361	NC_012858	GCCG	2	8	185987	185994	0 %	0 %	50 %	50 %	241666667
4362	NC_012858	TGA	2	6	186089	186094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666667
4363	NC_012858	AGA	2	6	186128	186133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666667
4364	NC_012858	TTC	2	6	186239	186244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4365	NC_012858	GAC	2	6	186334	186339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666668
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4367	NC_012858	GTC	2	6	186502	186507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4368	NC_012858	CGT	2	6	186513	186518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
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4472	NC_012858	CAT	2	6	190340	190345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4473	NC_012858	A	6	6	190346	190351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4474	NC_012858	TCG	3	9	190434	190442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666671
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4483	NC_012858	CTT	2	6	190873	190878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666671
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4485	NC_012858	GCCG	2	8	190898	190905	0 %	0 %	50 %	50 %	241666671
4486	NC_012858	GTC	2	6	190947	190952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666671
4487	NC_012858	CGC	2	6	190978	190983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666671
4488	NC_012858	GTC	2	6	190988	190993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666671
4489	NC_012858	CCA	2	6	190997	191002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666671
4490	NC_012858	TCG	2	6	191079	191084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666671
4491	NC_012858	TGA	2	6	191101	191106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666671
4492	NC_012858	CGTAC	2	10	191117	191126	20 %	20 %	20 %	40 %	241666671
4493	NC_012858	TGACC	2	10	191152	191161	20 %	20 %	20 %	40 %	241666671
4494	NC_012858	CTG	2	6	191198	191203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666671
4495	NC_012858	CCG	2	6	191232	191237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666671
4496	NC_012858	CCG	2	6	191326	191331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666671
4497	NC_012858	GGC	2	6	191375	191380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666671
4498	NC_012858	GGA	2	6	191571	191576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_012858	A	7	7	191586	191592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_012858	CAGC	2	8	191606	191613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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