MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012858	TCG	2	6	44920	44925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666534
1002	NC_012858	CCT	2	6	44944	44949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666534
1003	NC_012858	GAG	2	6	44952	44957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666534
1004	NC_012858	ATG	2	6	44992	44997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666534
1005	NC_012858	GC	3	6	45002	45007	0 %	0 %	50 %	50 %	241666534
1006	NC_012858	GGT	2	6	45059	45064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666534
1007	NC_012858	CGC	2	6	45065	45070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666534
1008	NC_012858	CCG	2	6	45152	45157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666534
1009	NC_012858	CTT	2	6	45158	45163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666534
1010	NC_012858	TCG	2	6	45175	45180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666534
1011	NC_012858	CAA	2	6	45200	45205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666534
1012	NC_012858	TCA	2	6	45242	45247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_012858	GATC	2	8	45283	45290	25 %	25 %	25 %	25 %	241666535
1014	NC_012858	GGC	2	6	45302	45307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666535
1015	NC_012858	CTG	2	6	45338	45343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666535
1016	NC_012858	ATG	2	6	45462	45467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666535
1017	NC_012858	GAA	2	6	45626	45631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666535
1018	NC_012858	GC	3	6	45682	45687	0 %	0 %	50 %	50 %	241666535
1019	NC_012858	CGG	2	6	45730	45735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666535
1020	NC_012858	CGA	2	6	45786	45791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666535
1021	NC_012858	TGG	2	6	45840	45845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666535
1022	NC_012858	AGGA	2	8	45854	45861	50 %	0 %	50 %	0 %	241666535
1023	NC_012858	GTG	2	6	45893	45898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666535
1024	NC_012858	TCGC	2	8	45932	45939	0 %	25 %	25 %	50 %	241666535
1025	NC_012858	CGG	2	6	45952	45957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666535
1026	NC_012858	CCCGAT	2	12	45983	45994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666535
1027	NC_012858	CTG	2	6	46022	46027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666535
1028	NC_012858	CAG	2	6	46028	46033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666535
1029	NC_012858	CTT	2	6	46042	46047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666535
1030	NC_012858	CGG	2	6	46061	46066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666535
1031	NC_012858	TTCC	2	8	46093	46100	0 %	50 %	0 %	50 %	241666535
1032	NC_012858	GC	3	6	46119	46124	0 %	0 %	50 %	50 %	241666535
1033	NC_012858	GGCG	2	8	46153	46160	0 %	0 %	75 %	25 %	241666535
1034	NC_012858	GTC	2	6	46250	46255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666535
1035	NC_012858	GAAAA	2	10	46345	46354	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012858	GCT	2	6	46448	46453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666536
1037	NC_012858	GC	3	6	46512	46517	0 %	0 %	50 %	50 %	241666536
1038	NC_012858	AC	3	6	46552	46557	50 %	0 %	0 %	50 %	241666536
1039	NC_012858	TCG	2	6	46609	46614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666536
1040	NC_012858	GAG	2	6	46684	46689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666536
1041	NC_012858	CGC	2	6	46696	46701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666536
1042	NC_012858	GAA	2	6	46742	46747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666536
1043	NC_012858	CAGC	2	8	46777	46784	25 %	0 %	25 %	50 %	241666536
1044	NC_012858	GTC	2	6	46925	46930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666536
1045	NC_012858	ATG	2	6	46998	47003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666536
1046	NC_012858	GCG	2	6	47028	47033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666536
1047	NC_012858	GAC	2	6	47047	47052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666536
1048	NC_012858	GCC	2	6	47063	47068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666536
1049	NC_012858	TTC	2	6	47243	47248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_012858	CG	3	6	47266	47271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_012858	CGG	2	6	47280	47285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_012858	GGTC	2	8	47465	47472	0 %	25 %	50 %	25 %	241666537
1053	NC_012858	TCT	2	6	47494	47499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666537
1054	NC_012858	GCA	2	6	47514	47519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666537
1055	NC_012858	TCG	2	6	47527	47532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666537
1056	NC_012858	GCG	2	6	47549	47554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666537
1057	NC_012858	CTGC	2	8	47562	47569	0 %	25 %	25 %	50 %	241666537
1058	NC_012858	CGC	3	9	47642	47650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666537
1059	NC_012858	TCT	2	6	47680	47685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666537
1060	NC_012858	GC	3	6	47715	47720	0 %	0 %	50 %	50 %	241666537
1061	NC_012858	CTT	2	6	47723	47728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666537
1062	NC_012858	GCTTCT	2	12	47783	47794	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241666537
1063	NC_012858	GTC	2	6	47811	47816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666537
1064	NC_012858	TTC	2	6	47871	47876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666537
1065	NC_012858	GCC	2	6	48033	48038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666537
1066	NC_012858	ATCGG	2	10	48057	48066	20 %	20 %	40 %	20 %	241666537
1067	NC_012858	CAC	2	6	48077	48082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666537
1068	NC_012858	CTC	2	6	48110	48115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666537
1069	NC_012858	GC	3	6	48116	48121	0 %	0 %	50 %	50 %	241666537
1070	NC_012858	TCG	2	6	48148	48153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666537
1071	NC_012858	GGCC	2	8	48308	48315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_012858	GCG	3	9	48402	48410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666538
1073	NC_012858	ATC	2	6	48444	48449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666538
1074	NC_012858	CCGC	2	8	48460	48467	0 %	0 %	25 %	75 %	241666538
1075	NC_012858	TGC	2	6	48541	48546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666538
1076	NC_012858	CGC	2	6	48646	48651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666538
1077	NC_012858	TCG	2	6	48675	48680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666538
1078	NC_012858	GAC	2	6	48681	48686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666538
1079	NC_012858	CTC	2	6	48689	48694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666538
1080	NC_012858	CGGC	2	8	48727	48734	0 %	0 %	50 %	50 %	241666538
1081	NC_012858	CGA	2	6	48793	48798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666538
1082	NC_012858	TTG	2	6	48822	48827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666538
1083	NC_012858	CCG	2	6	48879	48884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666538
1084	NC_012858	GCT	2	6	48951	48956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666538
1085	NC_012858	CAT	2	6	48964	48969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666538
1086	NC_012858	GTG	2	6	49062	49067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666538
1087	NC_012858	CAG	2	6	49109	49114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666538
1088	NC_012858	CCT	2	6	49138	49143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666538
1089	NC_012858	GC	4	8	49217	49224	0 %	0 %	50 %	50 %	241666538
1090	NC_012858	GA	3	6	49236	49241	50 %	0 %	50 %	0 %	241666538
1091	NC_012858	GC	3	6	49260	49265	0 %	0 %	50 %	50 %	241666538
1092	NC_012858	GGC	2	6	49267	49272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666538
1093	NC_012858	CG	3	6	49300	49305	0 %	0 %	50 %	50 %	241666538
1094	NC_012858	GAT	2	6	49322	49327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666538
1095	NC_012858	CG	3	6	49336	49341	0 %	0 %	50 %	50 %	241666538
1096	NC_012858	TGGGA	2	10	49356	49365	20 %	20 %	60 %	0 %	241666538
1097	NC_012858	CGA	2	6	49393	49398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666538
1098	NC_012858	CGC	2	6	49442	49447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666538
1099	NC_012858	GC	3	6	49446	49451	0 %	0 %	50 %	50 %	241666538
1100	NC_012858	CAC	2	6	49484	49489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666538
1101	NC_012858	TTC	2	6	49606	49611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_012858	AGG	2	6	49662	49667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666539
1103	NC_012858	GAT	2	6	49670	49675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666539
1104	NC_012858	CGG	2	6	49744	49749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666539
1105	NC_012858	GC	3	6	49759	49764	0 %	0 %	50 %	50 %	241666539
1106	NC_012858	CCGG	2	8	49816	49823	0 %	0 %	50 %	50 %	241666539
1107	NC_012858	TGA	2	6	49861	49866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666539
1108	NC_012858	GCAA	2	8	49887	49894	50 %	0 %	25 %	25 %	241666539
1109	NC_012858	GAT	2	6	49958	49963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666539
1110	NC_012858	CTGTC	2	10	49988	49997	0 %	40 %	20 %	40 %	241666539
1111	NC_012858	CG	3	6	50001	50006	0 %	0 %	50 %	50 %	241666539
1112	NC_012858	GAT	2	6	50021	50026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666539
1113	NC_012858	GAC	2	6	50030	50035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666539
1114	NC_012858	CGA	2	6	50047	50052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666539
1115	NC_012858	CGA	2	6	50056	50061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666539
1116	NC_012858	GCA	2	6	50091	50096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666539
1117	NC_012858	GCA	2	6	50113	50118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666539
1118	NC_012858	GC	3	6	50203	50208	0 %	0 %	50 %	50 %	241666539
1119	NC_012858	GAT	2	6	50221	50226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666539
1120	NC_012858	CTG	2	6	50230	50235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666539
1121	NC_012858	CGCT	2	8	50249	50256	0 %	25 %	25 %	50 %	241666539
1122	NC_012858	GAT	2	6	50273	50278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666539
1123	NC_012858	GCA	2	6	50323	50328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666539
1124	NC_012858	CAG	3	9	50345	50353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666539
1125	NC_012858	GC	3	6	50397	50402	0 %	0 %	50 %	50 %	241666539
1126	NC_012858	CG	4	8	50453	50460	0 %	0 %	50 %	50 %	241666539
1127	NC_012858	CAG	2	6	50471	50476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666539
1128	NC_012858	GCA	2	6	50506	50511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666539
1129	NC_012858	TGA	2	6	50518	50523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666539
1130	NC_012858	CGG	2	6	50530	50535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666539
1131	NC_012858	CGA	2	6	50566	50571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666539
1132	NC_012858	CAGG	2	8	50579	50586	25 %	0 %	50 %	25 %	241666539
1133	NC_012858	ATC	2	6	50592	50597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666539
1134	NC_012858	TGA	2	6	50647	50652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666539
1135	NC_012858	CCG	3	9	50662	50670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666539
1136	NC_012858	AGGA	2	8	50682	50689	50 %	0 %	50 %	0 %	241666539
1137	NC_012858	GAT	2	6	50726	50731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666539
1138	NC_012858	GATC	2	8	50845	50852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1139	NC_012858	CTC	2	6	50878	50883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1140	NC_012858	CG	3	6	50929	50934	0 %	0 %	50 %	50 %	241666540
1141	NC_012858	GGCCT	2	10	50940	50949	0 %	20 %	40 %	40 %	241666540
1142	NC_012858	CAGG	2	8	50969	50976	25 %	0 %	50 %	25 %	241666540
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1148	NC_012858	GAC	2	6	51282	51287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666540
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1150	NC_012858	CCGC	2	8	51365	51372	0 %	0 %	25 %	75 %	241666540
1151	NC_012858	CGT	2	6	51384	51389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666540
1152	NC_012858	CG	3	6	51405	51410	0 %	0 %	50 %	50 %	241666540
1153	NC_012858	GCA	2	6	51412	51417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666540
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1156	NC_012858	CGG	2	6	51455	51460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666540
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1165	NC_012858	ACG	2	6	51899	51904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666541
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1188	NC_012858	ATC	2	6	52732	52737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666542
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1193	NC_012858	ATT	2	6	52994	52999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1194	NC_012858	CG	3	6	53159	53164	0 %	0 %	50 %	50 %	241666543
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1243	NC_012858	TCG	2	6	55037	55042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666544
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1247	NC_012858	AGGC	2	8	55109	55116	25 %	0 %	50 %	25 %	241666545
1248	NC_012858	TC	3	6	55131	55136	0 %	50 %	0 %	50 %	241666545
1249	NC_012858	CGC	2	6	55139	55144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666545
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1251	NC_012858	GGCT	2	8	55166	55173	0 %	25 %	50 %	25 %	241666545
1252	NC_012858	CCGC	2	8	55224	55231	0 %	0 %	25 %	75 %	241666545
1253	NC_012858	GCC	2	6	55276	55281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666545
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1256	NC_012858	AGTGA	2	10	55444	55453	40 %	20 %	40 %	0 %	241666545
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1262	NC_012858	CGG	2	6	55605	55610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666545
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1273	NC_012858	GC	3	6	56290	56295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1274	NC_012858	TGAG	2	8	56339	56346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_012858	GCAGTT	2	12	56413	56424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1278	NC_012858	GTC	2	6	56529	56534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1280	NC_012858	TTG	2	6	56614	56619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1281	NC_012858	GCC	2	6	56705	56710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666546
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