MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012858	CTCA	2	8	613947	613954	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14002	NC_012858	CCGGGC	2	12	614122	614133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14003	NC_012858	CGC	2	6	614231	614236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14004	NC_012858	TCC	2	6	614295	614300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14005	NC_012858	CTT	3	9	614337	614345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_012858	T	6	6	614392	614397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_012858	GC	3	6	614415	614420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14008	NC_012858	GGC	2	6	614511	614516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667076
14009	NC_012858	GGGA	2	8	614518	614525	25 %	0 %	75 %	0 %	241667076
14010	NC_012858	CGC	2	6	614568	614573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667076
14011	NC_012858	GGC	2	6	614609	614614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667076
14012	NC_012858	GCT	2	6	614664	614669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14013	NC_012858	GC	3	6	614671	614676	0 %	0 %	50 %	50 %	241667076
14014	NC_012858	CCG	2	6	614693	614698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667076
14015	NC_012858	GCT	2	6	614709	614714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14016	NC_012858	CGG	2	6	614805	614810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667076
14017	NC_012858	CTG	2	6	614812	614817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14018	NC_012858	CGA	2	6	614895	614900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14019	NC_012858	CTG	2	6	614983	614988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14020	NC_012858	GCG	2	6	615061	615066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667076
14021	NC_012858	GAC	2	6	615103	615108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14022	NC_012858	GAA	2	6	615124	615129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667076
14023	NC_012858	CAC	2	6	615132	615137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241667076
14024	NC_012858	CGG	2	6	615167	615172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667076
14025	NC_012858	CAGCC	2	10	615185	615194	20 %	0 %	20 %	60 %	241667076
14026	NC_012858	TCGG	2	8	615217	615224	0 %	25 %	50 %	25 %	241667076
14027	NC_012858	CAT	3	9	615234	615242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667076
14028	NC_012858	GCC	2	6	615246	615251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667076
14029	NC_012858	CTT	2	6	615298	615303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667076
14030	NC_012858	CAGC	2	8	615324	615331	25 %	0 %	25 %	50 %	241667076
14031	NC_012858	TCGA	2	8	615385	615392	25 %	25 %	25 %	25 %	241667076
14032	NC_012858	CGA	2	6	615465	615470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14033	NC_012858	GAC	3	9	615501	615509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14034	NC_012858	AGA	2	6	615551	615556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667076
14035	NC_012858	CGG	2	6	615583	615588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667076
14036	NC_012858	CTCG	2	8	615597	615604	0 %	25 %	25 %	50 %	241667076
14037	NC_012858	CGC	2	6	615650	615655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667076
14038	NC_012858	GCA	2	6	615711	615716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14039	NC_012858	GCC	2	6	615775	615780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667076
14040	NC_012858	CG	4	8	615794	615801	0 %	0 %	50 %	50 %	241667076
14041	NC_012858	CGA	2	6	615849	615854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14042	NC_012858	GCA	2	6	615879	615884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14043	NC_012858	CGT	2	6	615943	615948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14044	NC_012858	CGA	2	6	615951	615956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14045	NC_012858	CAG	2	6	615973	615978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
14046	NC_012858	ATG	2	6	616040	616045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667076
14047	NC_012858	TCGA	2	8	616052	616059	25 %	25 %	25 %	25 %	241667076
14048	NC_012858	GCC	2	6	616101	616106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667076
14049	NC_012858	TAT	2	6	616111	616116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241667076
14050	NC_012858	CGG	2	6	616128	616133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667076
14051	NC_012858	GGCG	2	8	616236	616243	0 %	0 %	75 %	25 %	241667076
14052	NC_012858	GTG	2	6	616273	616278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667076
14053	NC_012858	GCA	2	6	616462	616467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_012858	ACC	2	6	616516	616521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241667077
14055	NC_012858	GCC	2	6	616555	616560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667077
14056	NC_012858	ATC	2	6	616702	616707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667078
14057	NC_012858	GGC	2	6	616759	616764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667078
14058	NC_012858	CG	3	6	616797	616802	0 %	0 %	50 %	50 %	241667078
14059	NC_012858	CCT	2	6	616807	616812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667078
14060	NC_012858	GCC	2	6	616910	616915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667078
14061	NC_012858	CGG	2	6	616923	616928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667078
14062	NC_012858	GCGG	2	8	617002	617009	0 %	0 %	75 %	25 %	241667078
14063	NC_012858	GAT	2	6	617020	617025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667078
14064	NC_012858	CGA	2	6	617056	617061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667078
14065	NC_012858	GCA	2	6	617112	617117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667078
14066	NC_012858	TGG	2	6	617132	617137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667078
14067	NC_012858	TCG	2	6	617139	617144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667078
14068	NC_012858	GCC	2	6	617167	617172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667078
14069	NC_012858	TGG	2	6	617250	617255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667078
14070	NC_012858	CCT	2	6	617325	617330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667078
14071	NC_012858	GACC	2	8	617356	617363	25 %	0 %	25 %	50 %	241667078
14072	NC_012858	CTG	3	9	617387	617395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667078
14073	NC_012858	GAC	2	6	617404	617409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667078
14074	NC_012858	TCA	2	6	617439	617444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667078
14075	NC_012858	CG	3	6	617473	617478	0 %	0 %	50 %	50 %	241667078
14076	NC_012858	GGCTGC	2	12	617498	617509	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241667078
14077	NC_012858	GC	3	6	617524	617529	0 %	0 %	50 %	50 %	241667078
14078	NC_012858	GC	3	6	617536	617541	0 %	0 %	50 %	50 %	241667078
14079	NC_012858	GCG	2	6	617552	617557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667078
14080	NC_012858	CGA	2	6	617590	617595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667078
14081	NC_012858	CGC	2	6	617601	617606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667078
14082	NC_012858	GCG	2	6	617633	617638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667078
14083	NC_012858	GCA	2	6	617641	617646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667078
14084	NC_012858	CGC	2	6	617702	617707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667078
14085	NC_012858	CGA	2	6	617712	617717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667078
14086	NC_012858	GGC	2	6	617752	617757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667078
14087	NC_012858	TCG	3	9	617775	617783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667078
14088	NC_012858	CGT	2	6	617815	617820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667078
14089	NC_012858	AT	3	6	617863	617868	50 %	50 %	0 %	0 %	241667078
14090	NC_012858	GC	3	6	617881	617886	0 %	0 %	50 %	50 %	241667078
14091	NC_012858	GAG	2	6	617901	617906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241667078
14092	NC_012858	TCG	2	6	617927	617932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667079
14093	NC_012858	GCA	2	6	617959	617964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667079
14094	NC_012858	TCC	2	6	617974	617979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667079
14095	NC_012858	GCC	2	6	617994	617999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667079
14096	NC_012858	GGC	2	6	618000	618005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667079
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14098	NC_012858	ATG	2	6	618122	618127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667079
14099	NC_012858	CGG	2	6	618138	618143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667079
14100	NC_012858	GC	3	6	618155	618160	0 %	0 %	50 %	50 %	241667079
14101	NC_012858	GCTCG	2	10	618198	618207	0 %	20 %	40 %	40 %	241667079
14102	NC_012858	GCT	2	6	618234	618239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667079
14103	NC_012858	CGA	3	9	618240	618248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667079
14104	NC_012858	GGCT	2	8	618283	618290	0 %	25 %	50 %	25 %	241667079
14105	NC_012858	TCGC	2	8	618358	618365	0 %	25 %	25 %	50 %	241667079
14106	NC_012858	GCCG	2	8	618388	618395	0 %	0 %	50 %	50 %	241667079
14107	NC_012858	CGA	2	6	618435	618440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667079
14108	NC_012858	GCCGC	2	10	618456	618465	0 %	0 %	40 %	60 %	241667079
14109	NC_012858	CGC	2	6	618477	618482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667079
14110	NC_012858	CGG	2	6	618664	618669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_012858	ATG	2	6	618681	618686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_012858	AAC	2	6	618731	618736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241667080
14113	NC_012858	GCT	2	6	618777	618782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667080
14114	NC_012858	AGG	3	9	618794	618802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241667080
14115	NC_012858	GCT	2	6	618849	618854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667080
14116	NC_012858	GTC	2	6	618859	618864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667080
14117	NC_012858	GCA	2	6	618926	618931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667080
14118	NC_012858	GATC	2	8	618975	618982	25 %	25 %	25 %	25 %	241667080
14119	NC_012858	TTG	2	6	619024	619029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_012858	TCT	2	6	619134	619139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667081
14121	NC_012858	CGC	2	6	619171	619176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667081
14122	NC_012858	CG	3	6	619194	619199	0 %	0 %	50 %	50 %	241667081
14123	NC_012858	GTC	2	6	619258	619263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667081
14124	NC_012858	GAA	2	6	619264	619269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667081
14125	NC_012858	GC	3	6	619290	619295	0 %	0 %	50 %	50 %	241667081
14126	NC_012858	CTG	2	6	619357	619362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667081
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14128	NC_012858	CAA	2	6	619529	619534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14129	NC_012858	TTGC	2	8	619564	619571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14130	NC_012858	T	6	6	619604	619609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_012858	A	6	6	619625	619630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_012858	GCATG	2	10	619750	619759	20 %	20 %	40 %	20 %	241667082
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14146	NC_012858	TCGGTC	2	12	620325	620336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667082
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14151	NC_012858	GAT	2	6	620486	620491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667082
14152	NC_012858	TC	3	6	620519	620524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14153	NC_012858	GAC	2	6	620620	620625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667083
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14174	NC_012858	TCC	2	6	621661	621666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14175	NC_012858	AG	3	6	621676	621681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14230	NC_012858	CAG	2	6	624158	624163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14231	NC_012858	CTG	2	6	624252	624257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667086
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14238	NC_012858	ATG	2	6	624388	624393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667086
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14245	NC_012858	GC	3	6	624771	624776	0 %	0 %	50 %	50 %	241667086
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14358	NC_012858	GAT	2	6	629452	629457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14359	NC_012858	TAA	2	6	629474	629479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14360	NC_012858	ATG	2	6	629511	629516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14361	NC_012858	CAT	2	6	629545	629550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14362	NC_012858	ATC	2	6	629656	629661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14363	NC_012858	TGGAA	2	10	629696	629705	40 %	20 %	40 %	0 %	241667090
14364	NC_012858	CG	3	6	629749	629754	0 %	0 %	50 %	50 %	241667090
14365	NC_012858	CAGC	2	8	629792	629799	25 %	0 %	25 %	50 %	241667090
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14372	NC_012858	GTC	2	6	630193	630198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667090
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14377	NC_012858	CCTT	2	8	630399	630406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14378	NC_012858	A	6	6	630482	630487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14379	NC_012858	GAC	2	6	630568	630573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14380	NC_012858	CTG	2	6	630614	630619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667091
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14384	NC_012858	GGC	2	6	630730	630735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667091
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14388	NC_012858	AAT	2	6	631051	631056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14389	NC_012858	CCCT	2	8	631063	631070	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14390	NC_012858	CAAG	2	8	631071	631078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14391	NC_012858	CAGT	2	8	631104	631111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14392	NC_012858	AGG	2	6	631150	631155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14400	NC_012858	CGGT	2	8	631512	631519	0 %	25 %	50 %	25 %	241667092
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14469	NC_012858	AG	3	6	633615	633620	50 %	0 %	50 %	0 %	241667093
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14477	NC_012858	GC	3	6	633881	633886	0 %	0 %	50 %	50 %	241667093
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14479	NC_012858	GGC	2	6	633918	633923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667093
14480	NC_012858	ACGGCG	2	12	633932	633943	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241667093
14481	NC_012858	GCC	2	6	633950	633955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667093
14482	NC_012858	ACCA	2	8	633997	634004	50 %	0 %	0 %	50 %	241667093
14483	NC_012858	GCCC	2	8	634028	634035	0 %	0 %	25 %	75 %	241667093
14484	NC_012858	CG	3	6	634051	634056	0 %	0 %	50 %	50 %	241667093
14485	NC_012858	GTC	2	6	634057	634062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667093
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