MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012858	CGG	2	6	572236	572241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13002	NC_012858	CAC	2	6	572309	572314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241667039
13003	NC_012858	CGCT	3	12	572349	572360	0 %	25 %	25 %	50 %	241667039
13004	NC_012858	AGCTGC	2	12	572386	572397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13005	NC_012858	CGA	2	6	572428	572433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13006	NC_012858	CGA	2	6	572435	572440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13007	NC_012858	CCG	2	6	572461	572466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667039
13008	NC_012858	CGG	2	6	572482	572487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13009	NC_012858	CGCC	2	8	572494	572501	0 %	0 %	25 %	75 %	241667039
13010	NC_012858	CG	3	6	572551	572556	0 %	0 %	50 %	50 %	241667039
13011	NC_012858	GCA	2	6	572595	572600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13012	NC_012858	GCC	2	6	572734	572739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667039
13013	NC_012858	CGG	2	6	572757	572762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13014	NC_012858	CGG	2	6	572786	572791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13015	NC_012858	CCCA	2	8	572808	572815	25 %	0 %	0 %	75 %	241667039
13016	NC_012858	CCA	2	6	572881	572886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241667039
13017	NC_012858	CGA	2	6	572900	572905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13018	NC_012858	CGA	2	6	572974	572979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13019	NC_012858	GCC	2	6	573015	573020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667039
13020	NC_012858	CGT	3	9	573041	573049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13021	NC_012858	CGA	2	6	573101	573106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13022	NC_012858	GCGA	2	8	573111	573118	25 %	0 %	50 %	25 %	241667039
13023	NC_012858	CGA	2	6	573155	573160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13024	NC_012858	GCT	2	6	573215	573220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13025	NC_012858	AGG	2	6	573247	573252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241667039
13026	NC_012858	GGC	2	6	573255	573260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13027	NC_012858	GAA	2	6	573293	573298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667039
13028	NC_012858	GC	3	6	573302	573307	0 %	0 %	50 %	50 %	241667039
13029	NC_012858	CGA	2	6	573335	573340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13030	NC_012858	CCG	2	6	573499	573504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667039
13031	NC_012858	CGA	2	6	573532	573537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13032	NC_012858	CGG	2	6	573542	573547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13033	NC_012858	TCGACC	2	12	573657	573668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241667039
13034	NC_012858	GGC	2	6	573756	573761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13035	NC_012858	CGG	2	6	573775	573780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13036	NC_012858	CGG	2	6	573827	573832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13037	NC_012858	GC	4	8	573974	573981	0 %	0 %	50 %	50 %	241667039
13038	NC_012858	TGC	2	6	574012	574017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13039	NC_012858	CG	3	6	574018	574023	0 %	0 %	50 %	50 %	241667039
13040	NC_012858	GGCG	2	8	574049	574056	0 %	0 %	75 %	25 %	241667039
13041	NC_012858	GCC	2	6	574089	574094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667039
13042	NC_012858	CCG	2	6	574131	574136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667039
13043	NC_012858	GGA	2	6	574142	574147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241667039
13044	NC_012858	GCCAGC	2	12	574159	574170	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241667039
13045	NC_012858	GCC	2	6	574198	574203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667039
13046	NC_012858	CGG	2	6	574244	574249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13047	NC_012858	GGC	2	6	574254	574259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13048	NC_012858	CCG	2	6	574281	574286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667039
13049	NC_012858	TCG	2	6	574297	574302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13050	NC_012858	CTT	2	6	574304	574309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667039
13051	NC_012858	AAGGC	2	10	574336	574345	40 %	0 %	40 %	20 %	241667039
13052	NC_012858	ACGGC	2	10	574375	574384	20 %	0 %	40 %	40 %	241667039
13053	NC_012858	TCA	2	6	574441	574446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667039
13054	NC_012858	GTG	2	6	574461	574466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667039
13055	NC_012858	CT	3	6	574488	574493	0 %	50 %	0 %	50 %	241667039
13056	NC_012858	GCCG	2	8	574541	574548	0 %	0 %	50 %	50 %	241667039
13057	NC_012858	GAA	2	6	574593	574598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667039
13058	NC_012858	CCT	2	6	574759	574764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667039
13059	NC_012858	CTG	2	6	574830	574835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13060	NC_012858	TGC	2	6	574846	574851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13061	NC_012858	GCT	2	6	574907	574912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13062	NC_012858	ACC	2	6	574953	574958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241667039
13063	NC_012858	GCT	2	6	574973	574978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13064	NC_012858	GAC	3	9	575016	575024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13065	NC_012858	GAA	2	6	575030	575035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667039
13066	NC_012858	CGGC	2	8	575080	575087	0 %	0 %	50 %	50 %	241667039
13067	NC_012858	TGAAA	2	10	575165	575174	60 %	20 %	20 %	0 %	241667039
13068	NC_012858	ACG	2	6	575176	575181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13069	NC_012858	ACC	2	6	575238	575243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241667039
13070	NC_012858	CAA	2	6	575297	575302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241667039
13071	NC_012858	CTA	2	6	575327	575332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667039
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13078	NC_012858	GCCG	2	8	575551	575558	0 %	0 %	50 %	50 %	241667039
13079	NC_012858	GCA	2	6	575611	575616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667039
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13083	NC_012858	CGCTGA	2	12	575767	575778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667039
13084	NC_012858	CGG	2	6	575803	575808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
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13088	NC_012858	GCG	2	6	575851	575856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667039
13089	NC_012858	GAAC	2	8	575927	575934	50 %	0 %	25 %	25 %	241667039
13090	NC_012858	CGT	3	9	575939	575947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667039
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13092	NC_012858	TCG	2	6	576037	576042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667039
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13097	NC_012858	CCGG	2	8	576236	576243	0 %	0 %	50 %	50 %	241667039
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13101	NC_012858	GCC	2	6	576374	576379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667040
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13117	NC_012858	CG	3	6	576952	576957	0 %	0 %	50 %	50 %	241667040
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13227	NC_012858	CGGCG	2	10	582137	582146	0 %	0 %	60 %	40 %	241667042
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13234	NC_012858	TCG	2	6	582413	582418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667042
13235	NC_012858	CGG	2	6	582494	582499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667042
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13238	NC_012858	TCA	2	6	582593	582598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667042
13239	NC_012858	GC	3	6	582611	582616	0 %	0 %	50 %	50 %	241667042
13240	NC_012858	CGGGG	2	10	582653	582662	0 %	0 %	80 %	20 %	241667042
13241	NC_012858	TCG	2	6	582731	582736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667042
13242	NC_012858	TCG	2	6	582782	582787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667042
13243	NC_012858	GCT	2	6	582813	582818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667042
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13251	NC_012858	CGA	2	6	583133	583138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667042
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13283	NC_012858	T	6	6	584538	584543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13284	NC_012858	CGC	2	6	584565	584570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13285	NC_012858	CGCT	3	12	584648	584659	0 %	25 %	25 %	50 %	241667045
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13317	NC_012858	GAG	2	6	585891	585896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13318	NC_012858	CGA	2	6	585956	585961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667047
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13341	NC_012858	CGC	2	6	586843	586848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13350	NC_012858	TCGC	2	8	587346	587353	0 %	25 %	25 %	50 %	241667049
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13353	NC_012858	GCC	2	6	587455	587460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667049
13354	NC_012858	TCG	2	6	587470	587475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667049
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13357	NC_012858	AGC	2	6	587623	587628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667049
13358	NC_012858	CTT	2	6	587634	587639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667049
13359	NC_012858	TCA	2	6	587657	587662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13360	NC_012858	TGC	2	6	587664	587669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13361	NC_012858	CCGG	2	8	587678	587685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13362	NC_012858	CTG	2	6	587692	587697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13363	NC_012858	CGC	2	6	587773	587778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667050
13364	NC_012858	CGG	2	6	587804	587809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667050
13365	NC_012858	CAT	2	6	587962	587967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667050
13366	NC_012858	CGC	2	6	587997	588002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667050
13367	NC_012858	CCATCG	2	12	588021	588032	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241667050
13368	NC_012858	CCAC	2	8	588131	588138	25 %	0 %	0 %	75 %	241667051
13369	NC_012858	TCA	2	6	588202	588207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667051
13370	NC_012858	TGG	2	6	588256	588261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667051
13371	NC_012858	CTT	2	6	588297	588302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667051
13372	NC_012858	CAT	2	6	588303	588308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667051
13373	NC_012858	CAT	2	6	588315	588320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667051
13374	NC_012858	GCC	2	6	588390	588395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667051
13375	NC_012858	CATGTC	2	12	588417	588428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241667051
13376	NC_012858	TCG	2	6	588458	588463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667051
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13379	NC_012858	GGTT	2	8	588570	588577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13380	NC_012858	GCG	2	6	588606	588611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667052
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13386	NC_012858	CGA	3	9	588870	588878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667052
13387	NC_012858	CCA	2	6	588933	588938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13388	NC_012858	CG	3	6	588945	588950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13389	NC_012858	GCA	2	6	588951	588956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13390	NC_012858	GGC	2	6	588985	588990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13391	NC_012858	TC	3	6	589050	589055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13392	NC_012858	A	6	6	589062	589067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13393	NC_012858	TGA	2	6	589070	589075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13402	NC_012858	GC	3	6	589334	589339	0 %	0 %	50 %	50 %	241667053
13403	NC_012858	TCG	2	6	589399	589404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667053
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13414	NC_012858	CAGGA	2	10	589703	589712	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13415	NC_012858	AAG	3	9	589900	589908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13419	NC_012858	GCG	3	9	589999	590007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13422	NC_012858	GCC	2	6	590119	590124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13423	NC_012858	CATAT	2	10	590129	590138	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13424	NC_012858	CAGC	2	8	590157	590164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13425	NC_012858	CGTC	2	8	590248	590255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13426	NC_012858	AGCA	2	8	590290	590297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13427	NC_012858	GC	3	6	590325	590330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13428	NC_012858	CCGC	2	8	590397	590404	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13429	NC_012858	TCC	2	6	590432	590437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13430	NC_012858	TCG	2	6	590500	590505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13431	NC_012858	GAT	2	6	590569	590574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667054
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13433	NC_012858	GC	3	6	590640	590645	0 %	0 %	50 %	50 %	241667054
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13440	NC_012858	CGAT	2	8	590792	590799	25 %	25 %	25 %	25 %	241667054
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13442	NC_012858	CG	3	6	590868	590873	0 %	0 %	50 %	50 %	241667054
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13462	NC_012858	CGG	2	6	591555	591560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667054
13463	NC_012858	GAA	2	6	591565	591570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667054
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13466	NC_012858	CAA	2	6	591788	591793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13467	NC_012858	GAAG	2	8	591803	591810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13468	NC_012858	CGAG	2	8	591945	591952	25 %	0 %	50 %	25 %	241667055
13469	NC_012858	CGC	2	6	591957	591962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667055
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13472	NC_012858	GGC	2	6	592048	592053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667055
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13475	NC_012858	CGA	2	6	592182	592187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667055
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13477	NC_012858	CGG	2	6	592231	592236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667055
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13479	NC_012858	TATG	2	8	592329	592336	25 %	50 %	25 %	0 %	241667055
13480	NC_012858	T	6	6	592368	592373	0 %	100 %	0 %	0 %	241667055
13481	NC_012858	CAG	2	6	592435	592440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667055
13482	NC_012858	GCG	2	6	592465	592470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667055
13483	NC_012858	GGC	2	6	592618	592623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667055
13484	NC_012858	GCC	2	6	592634	592639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667055
13485	NC_012858	GC	4	8	592658	592665	0 %	0 %	50 %	50 %	241667055
13486	NC_012858	GCG	2	6	592720	592725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667055
13487	NC_012858	GAT	2	6	592759	592764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667055
13488	NC_012858	CCA	2	6	592776	592781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241667055
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13490	NC_012858	CGT	2	6	592804	592809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667055
13491	NC_012858	GCCAT	2	10	592814	592823	20 %	20 %	20 %	40 %	241667055
13492	NC_012858	GCT	2	6	592839	592844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667055
13493	NC_012858	GAC	2	6	592858	592863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667055
13494	NC_012858	TTC	2	6	592889	592894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667055
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13496	NC_012858	CTTG	2	8	593027	593034	0 %	50 %	25 %	25 %	241667055
13497	NC_012858	ATCG	2	8	593057	593064	25 %	25 %	25 %	25 %	241667055
13498	NC_012858	ACC	2	6	593134	593139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13499	NC_012858	CGG	2	6	593219	593224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13500	NC_012858	T	6	6	593239	593244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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