MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_012858	AGC	3	9	488743	488751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_012858	CAC	2	6	488776	488781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11003	NC_012858	CCCG	2	8	488839	488846	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11004	NC_012858	ACA	2	6	488861	488866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_012858	T	6	6	488900	488905	0 %	100 %	0 %	0 %	241666963
11006	NC_012858	CAT	2	6	488914	488919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666963
11007	NC_012858	GCA	2	6	488922	488927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666963
11008	NC_012858	GCC	2	6	488928	488933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666963
11009	NC_012858	TGA	2	6	488975	488980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666963
11010	NC_012858	CT	3	6	489055	489060	0 %	50 %	0 %	50 %	241666963
11011	NC_012858	ACA	2	6	489076	489081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666963
11012	NC_012858	GCA	2	6	489095	489100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666963
11013	NC_012858	GCT	2	6	489104	489109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666963
11014	NC_012858	TTC	2	6	489165	489170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666963
11015	NC_012858	CGG	2	6	489227	489232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666963
11016	NC_012858	TCAT	2	8	489235	489242	25 %	50 %	0 %	25 %	241666963
11017	NC_012858	GAC	2	6	489264	489269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666963
11018	NC_012858	GCG	2	6	489385	489390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666963
11019	NC_012858	ACG	2	6	489397	489402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666963
11020	NC_012858	CG	3	6	489409	489414	0 %	0 %	50 %	50 %	241666963
11021	NC_012858	GCT	2	6	489449	489454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_012858	AGT	2	6	489467	489472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_012858	CG	3	6	489508	489513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11024	NC_012858	TGA	2	6	489567	489572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_012858	TCT	2	6	489674	489679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_012858	GCA	2	6	489738	489743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_012858	ACG	2	6	489773	489778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_012858	GC	3	6	489800	489805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11029	NC_012858	CTT	2	6	489817	489822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_012858	GCT	2	6	489836	489841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_012858	GCC	2	6	489858	489863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666964
11032	NC_012858	ACGGC	2	10	489901	489910	20 %	0 %	40 %	40 %	241666964
11033	NC_012858	GC	3	6	489915	489920	0 %	0 %	50 %	50 %	241666964
11034	NC_012858	ATCG	2	8	489956	489963	25 %	25 %	25 %	25 %	241666964
11035	NC_012858	GCC	2	6	489976	489981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666964
11036	NC_012858	ACG	2	6	490002	490007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666964
11037	NC_012858	ACC	2	6	490128	490133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666964
11038	NC_012858	GAT	2	6	490139	490144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666964
11039	NC_012858	CG	3	6	490150	490155	0 %	0 %	50 %	50 %	241666964
11040	NC_012858	GCCG	2	8	490201	490208	0 %	0 %	50 %	50 %	241666964
11041	NC_012858	AGC	2	6	490212	490217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666964
11042	NC_012858	GC	3	6	490227	490232	0 %	0 %	50 %	50 %	241666964
11043	NC_012858	TCT	2	6	490285	490290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666964
11044	NC_012858	CGA	3	9	490309	490317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666964
11045	NC_012858	GCT	2	6	490339	490344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666964
11046	NC_012858	ATG	2	6	490428	490433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666964
11047	NC_012858	CGG	2	6	490469	490474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666964
11048	NC_012858	CCG	2	6	490651	490656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666964
11049	NC_012858	GCTG	2	8	490657	490664	0 %	25 %	50 %	25 %	241666964
11050	NC_012858	CGG	2	6	490678	490683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666964
11051	NC_012858	ATC	2	6	490755	490760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666964
11052	NC_012858	AATA	2	8	490792	490799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_012858	AGG	2	6	490840	490845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_012858	ACG	2	6	490873	490878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666965
11055	NC_012858	ATT	2	6	490896	490901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241666965
11056	NC_012858	CCG	2	6	490909	490914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666965
11057	NC_012858	GTG	2	6	490977	490982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666965
11058	NC_012858	TCG	2	6	491058	491063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666965
11059	NC_012858	CCG	2	6	491174	491179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666965
11060	NC_012858	CG	3	6	491193	491198	0 %	0 %	50 %	50 %	241666965
11061	NC_012858	CGC	2	6	491258	491263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666965
11062	NC_012858	A	7	7	491269	491275	100 %	0 %	0 %	0 %	241666965
11063	NC_012858	TCG	2	6	491290	491295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666965
11064	NC_012858	CGCC	2	8	491320	491327	0 %	0 %	25 %	75 %	241666965
11065	NC_012858	CCG	2	6	491330	491335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666965
11066	NC_012858	GCCA	2	8	491380	491387	25 %	0 %	25 %	50 %	241666965
11067	NC_012858	CGC	2	6	491402	491407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666965
11068	NC_012858	CGA	2	6	491464	491469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666965
11069	NC_012858	TCG	2	6	491476	491481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666965
11070	NC_012858	CGC	2	6	491500	491505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666965
11071	NC_012858	GC	3	6	491569	491574	0 %	0 %	50 %	50 %	241666965
11072	NC_012858	AGC	2	6	491590	491595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666965
11073	NC_012858	ATC	2	6	491613	491618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666965
11074	NC_012858	ATGA	2	8	491660	491667	50 %	25 %	25 %	0 %	241666965
11075	NC_012858	TCC	3	9	491675	491683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666966
11076	NC_012858	CGC	2	6	491711	491716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666966
11077	NC_012858	CGC	2	6	491746	491751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666966
11078	NC_012858	GCC	2	6	491801	491806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666966
11079	NC_012858	GAT	2	6	491854	491859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666966
11080	NC_012858	GAC	2	6	491891	491896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666966
11081	NC_012858	CATG	2	8	491905	491912	25 %	25 %	25 %	25 %	241666966
11082	NC_012858	GC	3	6	491914	491919	0 %	0 %	50 %	50 %	241666966
11083	NC_012858	GCT	2	6	491962	491967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666966
11084	NC_012858	CGC	2	6	491995	492000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666966
11085	NC_012858	GGC	2	6	492055	492060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666966
11086	NC_012858	GAGG	2	8	492063	492070	25 %	0 %	75 %	0 %	241666966
11087	NC_012858	CGG	2	6	492106	492111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666967
11088	NC_012858	CTT	2	6	492112	492117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666967
11089	NC_012858	TGC	2	6	492174	492179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666967
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11091	NC_012858	GC	4	8	492190	492197	0 %	0 %	50 %	50 %	241666967
11092	NC_012858	CCGGT	2	10	492231	492240	0 %	20 %	40 %	40 %	241666967
11093	NC_012858	GAT	2	6	492253	492258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666967
11094	NC_012858	CAT	2	6	492325	492330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666967
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11097	NC_012858	AAGA	2	8	492425	492432	75 %	0 %	25 %	0 %	241666967
11098	NC_012858	GGC	2	6	492442	492447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666967
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11100	NC_012858	CGA	2	6	492487	492492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666967
11101	NC_012858	GAT	2	6	492646	492651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666967
11102	NC_012858	TCG	2	6	492666	492671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666967
11103	NC_012858	GGC	2	6	492688	492693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666967
11104	NC_012858	AGC	2	6	492699	492704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666967
11105	NC_012858	CGC	2	6	492711	492716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666967
11106	NC_012858	GCC	2	6	492780	492785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666967
11107	NC_012858	CGA	2	6	492789	492794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666967
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11109	NC_012858	CGG	2	6	492866	492871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666968
11110	NC_012858	TCACCG	2	12	492980	492991	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666968
11111	NC_012858	GGCGCA	2	12	493006	493017	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666968
11112	NC_012858	ACA	2	6	493070	493075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666968
11113	NC_012858	GCC	2	6	493096	493101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666968
11114	NC_012858	TCG	2	6	493235	493240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666968
11115	NC_012858	CGC	2	6	493302	493307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666968
11116	NC_012858	GAT	2	6	493353	493358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666968
11117	NC_012858	CATC	2	8	493392	493399	25 %	25 %	0 %	50 %	241666968
11118	NC_012858	GGGC	2	8	493438	493445	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11119	NC_012858	ACCCT	2	10	493494	493503	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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11121	NC_012858	CGC	2	6	493558	493563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11122	NC_012858	GGC	2	6	493595	493600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11242	NC_012858	GAA	2	6	498156	498161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666974
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11244	NC_012858	CGC	2	6	498191	498196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666974
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11479	NC_012858	CG	3	6	509065	509070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11482	NC_012858	GCTT	2	8	509148	509155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11483	NC_012858	CCGAA	2	10	509157	509166	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11484	NC_012858	CTT	3	9	509190	509198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11485	NC_012858	CTG	2	6	509249	509254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11486	NC_012858	GAA	2	6	509307	509312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11487	NC_012858	GAC	2	6	509317	509322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666986
11488	NC_012858	CGG	2	6	509395	509400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666986
11489	NC_012858	GAT	2	6	509440	509445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666986
11490	NC_012858	TTC	2	6	509519	509524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666986
11491	NC_012858	CAT	2	6	509545	509550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666986
11492	NC_012858	TTC	2	6	509561	509566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666986
11493	NC_012858	TAT	2	6	509576	509581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241666986
11494	NC_012858	TCA	2	6	509655	509660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666986
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11496	NC_012858	CGA	2	6	509700	509705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666986
11497	NC_012858	TCAAGA	2	12	509757	509768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241666986
11498	NC_012858	GCG	2	6	509790	509795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666986
11499	NC_012858	ATG	2	6	509891	509896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666986
11500	NC_012858	TCG	2	6	509910	509915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666986

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