MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_012858	TCA	2	6	464451	464456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666936
10502	NC_012858	CCG	2	6	464475	464480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666936
10503	NC_012858	CAA	2	6	464494	464499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666936
10504	NC_012858	TCGAGG	2	12	464505	464516	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666936
10505	NC_012858	CGA	2	6	464539	464544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666936
10506	NC_012858	TAC	2	6	464564	464569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666936
10507	NC_012858	GCT	2	6	464603	464608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666936
10508	NC_012858	GCGAT	2	10	464613	464622	20 %	20 %	40 %	20 %	241666936
10509	NC_012858	GAA	2	6	464623	464628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666936
10510	NC_012858	ACTACG	2	12	464727	464738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666936
10511	NC_012858	GTTC	2	8	464741	464748	0 %	50 %	25 %	25 %	241666936
10512	NC_012858	GAG	2	6	464765	464770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666936
10513	NC_012858	CAT	2	6	464818	464823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666936
10514	NC_012858	AAG	2	6	464831	464836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666936
10515	NC_012858	CGA	2	6	464860	464865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666936
10516	NC_012858	GCC	2	6	464876	464881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666936
10517	NC_012858	CCGAAG	2	12	464924	464935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666936
10518	NC_012858	TCT	2	6	464962	464967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666936
10519	NC_012858	GAT	2	6	464992	464997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666936
10520	NC_012858	GCCAAT	2	12	465032	465043	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666936
10521	NC_012858	GGCA	2	8	465053	465060	25 %	0 %	50 %	25 %	241666936
10522	NC_012858	GC	3	6	465061	465066	0 %	0 %	50 %	50 %	241666936
10523	NC_012858	CG	4	8	465067	465074	0 %	0 %	50 %	50 %	241666936
10524	NC_012858	GCC	2	6	465089	465094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666936
10525	NC_012858	CCA	2	6	465215	465220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666937
10526	NC_012858	CAA	2	6	465252	465257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666937
10527	NC_012858	CGT	2	6	465273	465278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666937
10528	NC_012858	ATCGAC	2	12	465418	465429	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666937
10529	NC_012858	GAC	2	6	465493	465498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666937
10530	NC_012858	GCC	2	6	465581	465586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666937
10531	NC_012858	GCGG	2	8	465591	465598	0 %	0 %	75 %	25 %	241666937
10532	NC_012858	CGA	2	6	465651	465656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666937
10533	NC_012858	CGA	2	6	465690	465695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666937
10534	NC_012858	GCA	2	6	465726	465731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666937
10535	NC_012858	TCA	2	6	465734	465739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666937
10536	NC_012858	AGA	2	6	465743	465748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666937
10537	NC_012858	CG	3	6	465750	465755	0 %	0 %	50 %	50 %	241666937
10538	NC_012858	GTGA	2	8	465772	465779	25 %	25 %	50 %	0 %	241666937
10539	NC_012858	ATC	2	6	465805	465810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666937
10540	NC_012858	GAA	3	9	465816	465824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666937
10541	NC_012858	GGC	2	6	465843	465848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666937
10542	NC_012858	GGC	2	6	465858	465863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666937
10543	NC_012858	CAT	2	6	465894	465899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666937
10544	NC_012858	CGA	2	6	466021	466026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666938
10545	NC_012858	TGC	2	6	466063	466068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666938
10546	NC_012858	GGC	3	9	466136	466144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666938
10547	NC_012858	GCC	2	6	466166	466171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666938
10548	NC_012858	GAC	3	9	466187	466195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666938
10549	NC_012858	A	6	6	466255	466260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_012858	TCA	2	6	466286	466291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_012858	CTT	2	6	466296	466301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_012858	GCCAGT	2	12	466302	466313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_012858	A	7	7	466357	466363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_012858	GGCC	2	8	466423	466430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10555	NC_012858	TCG	2	6	466445	466450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_012858	TCG	2	6	466454	466459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_012858	GTG	2	6	466594	466599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_012858	ATG	2	6	466707	466712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_012858	CG	3	6	466740	466745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10560	NC_012858	ATCT	2	8	466795	466802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10561	NC_012858	GCA	2	6	466804	466809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_012858	AGGC	2	8	466834	466841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10563	NC_012858	GC	3	6	466840	466845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10564	NC_012858	CGA	2	6	466969	466974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666939
10565	NC_012858	GTC	2	6	466976	466981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666939
10566	NC_012858	GGTCG	2	10	466991	467000	0 %	20 %	60 %	20 %	241666939
10567	NC_012858	GTC	2	6	467150	467155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666939
10568	NC_012858	GAT	2	6	467249	467254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666939
10569	NC_012858	TCG	2	6	467271	467276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666939
10570	NC_012858	CTC	2	6	467310	467315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666939
10571	NC_012858	CAG	2	6	467324	467329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666939
10572	NC_012858	GAG	2	6	467349	467354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666939
10573	NC_012858	CCGG	2	8	467380	467387	0 %	0 %	50 %	50 %	241666939
10574	NC_012858	GAT	2	6	467426	467431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666939
10575	NC_012858	AT	3	6	467452	467457	50 %	50 %	0 %	0 %	241666939
10576	NC_012858	GCA	2	6	467506	467511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666939
10577	NC_012858	CGG	2	6	467515	467520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666939
10578	NC_012858	CGG	2	6	467587	467592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666939
10579	NC_012858	CCG	2	6	467663	467668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666939
10580	NC_012858	GC	3	6	467686	467691	0 %	0 %	50 %	50 %	241666939
10581	NC_012858	GGC	2	6	467756	467761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666939
10582	NC_012858	CCGA	2	8	467765	467772	25 %	0 %	25 %	50 %	241666939
10583	NC_012858	CGA	2	6	467794	467799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666939
10584	NC_012858	CCG	2	6	467834	467839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10585	NC_012858	TTG	2	6	467850	467855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_012858	GTTTT	2	10	467903	467912	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_012858	TTGGA	2	10	467983	467992	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_012858	ATC	2	6	468115	468120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10589	NC_012858	GGA	3	9	468145	468153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_012858	TTC	2	6	468171	468176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10591	NC_012858	TGA	2	6	468180	468185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_012858	CAT	2	6	468298	468303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_012858	ACC	2	6	468400	468405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10594	NC_012858	ATCC	2	8	468432	468439	25 %	25 %	0 %	50 %	241666940
10595	NC_012858	CGC	2	6	468483	468488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666940
10596	NC_012858	TCG	2	6	468494	468499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666940
10597	NC_012858	TCGTTG	2	12	468593	468604	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241666940
10598	NC_012858	TCG	2	6	468620	468625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666940
10599	NC_012858	CGA	2	6	468699	468704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666940
10600	NC_012858	CCT	2	6	468773	468778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666941
10601	NC_012858	CGGC	2	8	468791	468798	0 %	0 %	50 %	50 %	241666941
10602	NC_012858	TCG	2	6	468802	468807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666941
10603	NC_012858	ACG	2	6	468811	468816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666941
10604	NC_012858	GAAC	2	8	468818	468825	50 %	0 %	25 %	25 %	241666941
10605	NC_012858	GAA	2	6	468939	468944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666941
10606	NC_012858	GCC	2	6	468985	468990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666941
10607	NC_012858	GAT	2	6	468993	468998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666941
10608	NC_012858	AAG	2	6	469014	469019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666941
10609	NC_012858	CGG	2	6	469049	469054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666941
10610	NC_012858	TCGTT	2	10	469064	469073	0 %	60 %	20 %	20 %	241666941
10611	NC_012858	GC	3	6	469132	469137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10612	NC_012858	GGC	2	6	469210	469215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_012858	ATG	2	6	469244	469249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_012858	CAT	2	6	469307	469312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10615	NC_012858	AGG	2	6	469315	469320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_012858	CAC	2	6	469420	469425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666942
10617	NC_012858	CGT	2	6	469439	469444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666942
10618	NC_012858	ACC	2	6	469447	469452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666942
10619	NC_012858	TGG	2	6	469501	469506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666942
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10621	NC_012858	T	8	8	469613	469620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10989	NC_012858	GACG	2	8	488215	488222	25 %	0 %	50 %	25 %	241666962
10990	NC_012858	TCA	2	6	488224	488229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666962
10991	NC_012858	GCG	2	6	488263	488268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666962
10992	NC_012858	GGC	2	6	488269	488274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666962
10993	NC_012858	ATG	2	6	488291	488296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666962
10994	NC_012858	GC	3	6	488301	488306	0 %	0 %	50 %	50 %	241666962
10995	NC_012858	GATG	2	8	488356	488363	25 %	25 %	50 %	0 %	241666962
10996	NC_012858	CG	3	6	488422	488427	0 %	0 %	50 %	50 %	241666962
10997	NC_012858	GCT	2	6	488485	488490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666962
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10999	NC_012858	T	6	6	488682	488687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11000	NC_012858	CTG	2	6	488711	488716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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