MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012858	GCCT	2	8	441258	441265	0 %	25 %	25 %	50 %	241666912
10002	NC_012858	CGA	2	6	441277	441282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666912
10003	NC_012858	TCC	2	6	441330	441335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666912
10004	NC_012858	CG	3	6	441367	441372	0 %	0 %	50 %	50 %	241666912
10005	NC_012858	CAG	2	6	441506	441511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666912
10006	NC_012858	TGT	2	6	441535	441540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666912
10007	NC_012858	GCA	2	6	441581	441586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666912
10008	NC_012858	AAG	2	6	441641	441646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666912
10009	NC_012858	CAG	2	6	441719	441724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666912
10010	NC_012858	TCA	2	6	441780	441785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666912
10011	NC_012858	TGG	2	6	441790	441795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666912
10012	NC_012858	CAA	2	6	441796	441801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666912
10013	NC_012858	GCA	2	6	441904	441909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666912
10014	NC_012858	CGG	2	6	441991	441996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_012858	GAT	2	6	442455	442460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_012858	CAT	2	6	442465	442470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_012858	GC	3	6	442503	442508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_012858	GCGA	2	8	442525	442532	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10019	NC_012858	ATG	2	6	442533	442538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_012858	AAGG	2	8	442562	442569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_012858	GCC	2	6	442621	442626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_012858	AAT	2	6	442684	442689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_012858	ATT	2	6	442783	442788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_012858	AGG	2	6	442801	442806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_012858	AGT	2	6	442816	442821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_012858	ACC	2	6	442855	442860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10027	NC_012858	C	6	6	442859	442864	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10028	NC_012858	GGA	2	6	442918	442923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_012858	GTT	2	6	442962	442967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_012858	GGAA	2	8	442973	442980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_012858	GT	3	6	442988	442993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_012858	T	7	7	443033	443039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_012858	GCCG	2	8	443114	443121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10034	NC_012858	CG	3	6	443195	443200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10035	NC_012858	CTC	2	6	443270	443275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666914
10036	NC_012858	CTT	2	6	443423	443428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666914
10037	NC_012858	AAG	2	6	443442	443447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666914
10038	NC_012858	CTG	2	6	443556	443561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666914
10039	NC_012858	TGG	2	6	443632	443637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666914
10040	NC_012858	TCC	2	6	443648	443653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_012858	TTC	2	6	443731	443736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_012858	GGC	2	6	443769	443774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_012858	TGT	2	6	443873	443878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_012858	GCG	2	6	443889	443894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_012858	TGCGG	2	10	443898	443907	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10046	NC_012858	CTG	2	6	443959	443964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_012858	TGG	3	9	444003	444011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_012858	ACC	2	6	444246	444251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666915
10049	NC_012858	GTG	2	6	444257	444262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666915
10050	NC_012858	GAT	2	6	444290	444295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666915
10051	NC_012858	TCG	2	6	444300	444305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666915
10052	NC_012858	T	8	8	444480	444487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_012858	GGA	2	6	444521	444526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_012858	AGG	2	6	444548	444553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_012858	GCC	2	6	444606	444611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_012858	TGG	2	6	444678	444683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_012858	CGT	2	6	444820	444825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_012858	CAA	2	6	444853	444858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_012858	CCGG	2	8	444862	444869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_012858	CGG	3	9	444949	444957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_012858	TCGTT	2	10	444959	444968	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10062	NC_012858	GC	3	6	445014	445019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10063	NC_012858	AGC	2	6	445024	445029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_012858	CGA	2	6	445073	445078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_012858	TGCA	2	8	445096	445103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10066	NC_012858	GCCG	2	8	445127	445134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_012858	CGC	2	6	445153	445158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_012858	GAT	2	6	445164	445169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_012858	CAG	2	6	445199	445204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_012858	TCC	2	6	445227	445232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_012858	CGG	2	6	445258	445263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_012858	CTT	2	6	445373	445378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_012858	GCC	2	6	445379	445384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10074	NC_012858	CCGC	2	8	445385	445392	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10075	NC_012858	TTG	2	6	445400	445405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_012858	CAG	2	6	445406	445411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_012858	GCC	2	6	445526	445531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10078	NC_012858	CGGCTT	2	12	445624	445635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_012858	CGG	2	6	445768	445773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_012858	GCC	2	6	445783	445788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10081	NC_012858	TAA	2	6	445822	445827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_012858	ACA	2	6	446099	446104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666916
10083	NC_012858	GAG	2	6	446129	446134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666916
10084	NC_012858	TTG	2	6	446147	446152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666916
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10087	NC_012858	AGG	2	6	446398	446403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_012858	AAT	2	6	446466	446471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_012858	GC	3	6	446511	446516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10090	NC_012858	ATT	2	6	446566	446571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_012858	CCTA	2	8	446646	446653	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10092	NC_012858	TTTC	2	8	446674	446681	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10093	NC_012858	GGA	2	6	446700	446705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_012858	GTT	2	6	446745	446750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_012858	GGAA	2	8	446756	446763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_012858	GT	3	6	446771	446776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_012858	CGG	2	6	446807	446812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_012858	T	6	6	446817	446822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_012858	CTC	2	6	446858	446863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_012858	C	6	6	446900	446905	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10101	NC_012858	CCG	2	6	446961	446966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10102	NC_012858	TTC	2	6	446980	446985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_012858	CAC	2	6	447006	447011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10104	NC_012858	CT	3	6	447076	447081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10105	NC_012858	GCCG	2	8	447165	447172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10106	NC_012858	CTTC	2	8	447179	447186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10107	NC_012858	CTT	2	6	447233	447238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_012858	CCG	2	6	447245	447250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_012858	GCC	2	6	447295	447300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_012858	ATG	2	6	447325	447330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_012858	T	6	6	447392	447397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_012858	CTC	2	6	447401	447406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10113	NC_012858	TTC	2	6	447432	447437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_012858	TGC	2	6	447490	447495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_012858	TCG	2	6	447540	447545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_012858	GCC	2	6	447547	447552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666917
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10119	NC_012858	GAT	2	6	447719	447724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666918
10120	NC_012858	CGGC	2	8	447784	447791	0 %	0 %	50 %	50 %	241666918
10121	NC_012858	CCG	2	6	447847	447852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666918
10122	NC_012858	GC	4	8	447867	447874	0 %	0 %	50 %	50 %	241666918
10123	NC_012858	CAC	2	6	447902	447907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666918
10124	NC_012858	CAT	2	6	447941	447946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666918
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10126	NC_012858	GGA	2	6	448023	448028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_012858	CAG	2	6	448122	448127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666919
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10129	NC_012858	TCGA	2	8	448192	448199	25 %	25 %	25 %	25 %	241666919
10130	NC_012858	CGT	2	6	448203	448208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666919
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10134	NC_012858	CACG	2	8	448298	448305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10138	NC_012858	AACG	2	8	448444	448451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10143	NC_012858	AC	3	6	448630	448635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10144	NC_012858	TGGG	2	8	448700	448707	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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10253	NC_012858	GCC	2	6	452703	452708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10254	NC_012858	CGG	2	6	452743	452748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_012858	AT	3	6	452886	452891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_012858	CG	3	6	452956	452961	0 %	0 %	50 %	50 %	241666923
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10277	NC_012858	GTG	2	6	454064	454069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10499	NC_012858	GAAG	2	8	464404	464411	50 %	0 %	50 %	0 %	241666936
10500	NC_012858	TCGAGA	2	12	464427	464438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666936

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