MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_012858	CGA	2	6	394517	394522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_012858	TCC	2	6	394549	394554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_012858	GAC	2	6	394717	394722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_012858	GGCTT	2	10	394727	394736	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9005	NC_012858	GGC	2	6	394764	394769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_012858	GCCG	2	8	394815	394822	0 %	0 %	50 %	50 %	241666855
9007	NC_012858	CTT	2	6	394858	394863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666855
9008	NC_012858	CCTT	2	8	394895	394902	0 %	50 %	0 %	50 %	241666855
9009	NC_012858	CG	3	6	394948	394953	0 %	0 %	50 %	50 %	241666855
9010	NC_012858	TGA	2	6	394999	395004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_012858	CCG	2	6	395153	395158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9012	NC_012858	GCC	2	6	395165	395170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9013	NC_012858	CGC	2	6	395195	395200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9014	NC_012858	CGA	2	6	395245	395250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_012858	GCT	2	6	395271	395276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_012858	CGC	2	6	395339	395344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666856
9017	NC_012858	TCG	2	6	395363	395368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666856
9018	NC_012858	GC	3	6	395380	395385	0 %	0 %	50 %	50 %	241666856
9019	NC_012858	TGG	2	6	395467	395472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666856
9020	NC_012858	GACGCC	2	12	395496	395507	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666856
9021	NC_012858	TGG	2	6	395584	395589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666856
9022	NC_012858	GAA	2	6	395649	395654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666856
9023	NC_012858	CAC	2	6	395694	395699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666856
9024	NC_012858	AG	3	6	395721	395726	50 %	0 %	50 %	0 %	241666856
9025	NC_012858	GGC	2	6	395760	395765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666856
9026	NC_012858	CTG	2	6	395781	395786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666856
9027	NC_012858	CGA	2	6	395795	395800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666856
9028	NC_012858	GTC	2	6	395829	395834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666856
9029	NC_012858	GGT	2	6	395838	395843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666856
9030	NC_012858	AGG	2	6	395935	395940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666856
9031	NC_012858	CGG	2	6	395942	395947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666856
9032	NC_012858	CGGATA	2	12	396035	396046	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666857
9033	NC_012858	G	6	6	396057	396062	0 %	0 %	100 %	0 %	241666857
9034	NC_012858	TAG	2	6	396066	396071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666857
9035	NC_012858	GCC	2	6	396084	396089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666857
9036	NC_012858	GCC	2	6	396135	396140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666857
9037	NC_012858	GCC	2	6	396155	396160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666857
9038	NC_012858	GC	4	8	396210	396217	0 %	0 %	50 %	50 %	241666857
9039	NC_012858	GCC	2	6	396302	396307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666857
9040	NC_012858	GCT	2	6	396362	396367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666857
9041	NC_012858	TCG	2	6	396379	396384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666857
9042	NC_012858	CGG	2	6	396389	396394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666857
9043	NC_012858	TGA	2	6	396433	396438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666857
9044	NC_012858	CCG	2	6	396546	396551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666857
9045	NC_012858	GCGA	2	8	396564	396571	25 %	0 %	50 %	25 %	241666857
9046	NC_012858	CGC	2	6	396644	396649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666857
9047	NC_012858	CAGG	2	8	396665	396672	25 %	0 %	50 %	25 %	241666857
9048	NC_012858	TCC	2	6	396716	396721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9049	NC_012858	CGG	2	6	396772	396777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666858
9050	NC_012858	CTC	2	6	396806	396811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666858
9051	NC_012858	GTC	2	6	396855	396860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666858
9052	NC_012858	GT	3	6	396936	396941	0 %	50 %	50 %	0 %	241666858
9053	NC_012858	CGA	2	6	396943	396948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666858
9054	NC_012858	GAT	2	6	396976	396981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666858
9055	NC_012858	CGATGG	2	12	397027	397038	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666858
9056	NC_012858	CGA	2	6	397060	397065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666858
9057	NC_012858	CGC	3	9	397130	397138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666858
9058	NC_012858	TTC	2	6	397139	397144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666858
9059	NC_012858	CAC	2	6	397202	397207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666858
9060	NC_012858	ATGG	2	8	397234	397241	25 %	25 %	50 %	0 %	241666858
9061	NC_012858	CAG	3	9	397250	397258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666858
9062	NC_012858	CGG	2	6	397261	397266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666858
9063	NC_012858	TGGCC	2	10	397345	397354	0 %	20 %	40 %	40 %	241666859
9064	NC_012858	CG	3	6	397372	397377	0 %	0 %	50 %	50 %	241666859
9065	NC_012858	CAGG	2	8	397388	397395	25 %	0 %	50 %	25 %	241666859
9066	NC_012858	CAC	2	6	397415	397420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666859
9067	NC_012858	ACG	2	6	397465	397470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666859
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9069	NC_012858	CTT	2	6	397607	397612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666859
9070	NC_012858	CCT	2	6	397716	397721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666859
9071	NC_012858	TCTGGT	2	12	397727	397738	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241666859
9072	NC_012858	TCG	2	6	397769	397774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666859
9073	NC_012858	CGCA	2	8	397787	397794	25 %	0 %	25 %	50 %	241666859
9074	NC_012858	CGC	2	6	397870	397875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666859
9075	NC_012858	ACG	2	6	397877	397882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666859
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9077	NC_012858	CGC	2	6	397980	397985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666860
9078	NC_012858	CACG	2	8	398001	398008	25 %	0 %	25 %	50 %	241666860
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9081	NC_012858	GAA	3	9	398082	398090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666860
9082	NC_012858	GAA	2	6	398105	398110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666860
9083	NC_012858	AGC	2	6	398190	398195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9084	NC_012858	GCG	2	6	398196	398201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9085	NC_012858	ACA	2	6	398205	398210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9086	NC_012858	GA	3	6	398225	398230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_012858	CCG	2	6	398239	398244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9088	NC_012858	GGTG	2	8	398253	398260	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_012858	CGG	2	6	398310	398315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9090	NC_012858	GCG	2	6	398321	398326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9091	NC_012858	GGC	2	6	398435	398440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9092	NC_012858	CGG	2	6	398452	398457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9093	NC_012858	AC	3	6	398489	398494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9094	NC_012858	GAA	2	6	398605	398610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_012858	CGA	2	6	398696	398701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9096	NC_012858	CTT	2	6	398723	398728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_012858	ACGA	2	8	398796	398803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9098	NC_012858	GGC	2	6	398829	398834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_012858	GCC	2	6	398855	398860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9100	NC_012858	GTCG	2	8	398882	398889	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9101	NC_012858	GTA	2	6	398957	398962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_012858	GCA	2	6	399004	399009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9103	NC_012858	CCG	2	6	399024	399029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_012858	ATA	3	9	399059	399067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_012858	GC	3	6	399101	399106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9106	NC_012858	TCT	2	6	399137	399142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9107	NC_012858	GAT	2	6	399215	399220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_012858	TTCG	2	8	399225	399232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9109	NC_012858	ATT	2	6	399276	399281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_012858	CGG	3	9	399330	399338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_012858	CGT	3	9	399396	399404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9113	NC_012858	CGG	2	6	399501	399506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_012858	CAG	2	6	399510	399515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_012858	CCCTTG	2	12	399526	399537	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9116	NC_012858	GCG	2	6	399608	399613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_012858	GCGAAT	2	12	399692	399703	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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9119	NC_012858	GGCC	2	8	399752	399759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9120	NC_012858	CGC	2	6	399818	399823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9121	NC_012858	CGT	2	6	399863	399868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9123	NC_012858	CGC	2	6	399981	399986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9124	NC_012858	C	6	6	399986	399991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9125	NC_012858	CAG	2	6	399999	400004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_012858	TCG	2	6	400031	400036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9251	NC_012858	GGC	2	6	405164	405169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666865
9252	NC_012858	CG	3	6	405189	405194	0 %	0 %	50 %	50 %	241666865
9253	NC_012858	CGA	2	6	405214	405219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666865
9254	NC_012858	GCG	2	6	405287	405292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666865
9255	NC_012858	GAAGC	2	10	405323	405332	40 %	0 %	40 %	20 %	241666865
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9259	NC_012858	GCG	2	6	405582	405587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9369	NC_012858	CG	3	6	411090	411095	0 %	0 %	50 %	50 %	241666872
9370	NC_012858	GTA	2	6	411221	411226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666872
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